2.rok 2010 1. kateri kov. ioni so v proteinih: hemoglobin, citokrom, klorofil. 2. kako lahko krokodil zdrži več kot pol ure pod vodo? 3. karbonatni pufer; henderson-hasselbachova enačba. 4. glukoza-6-fosfat<->glukoza-1-fosfat; izračunaj K' in sprem. G. 5.kateri proteini za delovanje potrebujejo kvartarno zgradbo? izbriaš medhemoglobinom, mioglobinom, keratinom, inzulinom, citokromom c,... 6. imaš dve polipeptidni verigi, ki ju obdelaš s CNBr in tripsinom; koliko peptidnih ostankov dobiš? 7. obkroži pravilne trditve o translaciji. 8. obkroži pravilne trditve o dekstranu. 9. kaj so cimogeni? obkroži. 10. naštej 4 izhodne spojine za sintezo AK. 11. nariši alfa in beta anomer glukoze v haworthovi projekciji. 13. Grafi linearizacije michaelis mentenove enačbe, imel sinarisane 3 različne, opisano situacijo z encimom in substratom (konc.enega se spreminja, drugega pa ne oz nekaj takega) in si moralobkrožit, kateri je pravi in utemeljit. 14. Razvrsti molekule po hitrosti prehajanja celične membrane: voda, kisik, glukoza 15. Obkroži nekaj v zvezi z ATP (za kaj se porablja se mi zdi) 16. Za obkrožit nekaj v zvezi z NAD 17. Narisana je bila molekula, moral si jo prepoznat in opisat njeno funkcijo (če se prav spomnim, je bila cAMP) 12. konvergenca metabolizma(do acetil-CoA).
1.rok 2011 1. Napiši monomere polimerov ( nukleinska kislina, hemoglobin, DNK, celuloza, hitin, ...) 2.Kateri kovinski ioni so v hemoglobinu, mioglobinu, vitaminu b12, katalazi, klorofilu? 3.Kako se naprej prenese kemijski potencila, ko se hormon veže na receptor? 4.Kateri so fibrilarni proteini? obkroži.. 5.Izračunaj razmerje med ogljikovo kislino in bikarbonatom.. 6.Graf hemoglobina, Bohrov efekt... 7.Grafi odvisnosti hitrosti rkc. od koncentracije substrata, nekompetitivna, kompetitivna, akompetitivna inhibicija... 8.Kaj ugotovimo z Edmanovo metodo? 9.Obkroži tri encime, ki sodelujejo pri fosforilaciji na ravni substrata?-mel si v oklepaju tut kje sodelujejo (mal drugač vprašanje sam neki v tej smeri) 10.Obkrožit kaj nastane pri oksidaciji piruvata.. 11.Kaj velja za ß-oksidacijo (katabolni proces, v mitohondriju, da se odceplajo C2 fragmenti postopoma...) 12.4 vloge integralnih proteinov 13.Shema poteka energije pri katabolnih in anabolnih procesih... 14.Kako se prepisuje DNK? za okrožit od 5proti 3.. 15.Obkroži kaj je negativna zveza- če se veže akceptor, je tranksripcija; če se veže represor, ni transkripcije... 16.kakšne so vezi pri amilozi, nariši dve monomeri te... 17.Kaj so cimogeni? 18.Razlika pri prepisovanju na mRNK pri evkariontih in prokariontih? 19.Obkroži, kaj velja za oksidacijo substrata, če....ne vem kaj je blo kle točn.. 20. Katere trditve veljajo za spontan proces, ki je entropijsko voden?
2.rok 2011 1. podana standardna G za reakcijo, T, pH(nepomemben) in koncentracije produktov in reaktantov. Ali reakcija poteka spontano pri teh koncentracijah? 2. Kaj potemi, da hidroliza ATP poteka v dveh korakih? 3. Primarni aktivni in sekundarni aktivni transport; opiši, razlike 4. podana odsek DNK, napiši mRNK, cDNK (komplementarna DNK) 5. podano eno zaporedje nukleotidov; kako ga prepiše REVERZNA transkiptaza 6. H2CO3, podan imaš pKa1 in PKa2. Kakšno je razmerje med H2CO3 in HCO3pri dveh različnih pH (vrednosti se ne spomnim) 7. kakšna je PROSTORSKA struktura lizina pri pH 7 in pH 13. Razloži. 8. za narisat amilopektin (si imel podano kakšne so vezi in katere molekule ga sestavljajo). Koliko reducirajočih OH skupin ima molekula iz 1000 monomerov? Le enega. 9. v čem se razlikujeta neka dva gena; iz seminarja o prionskih boleznih 10. Obkroževanja; *kaj velja za spontano entalpijsko vodeno reakcijo (npr nastanek vode iz H in O)? DeltaG<0 in glavni vir spontanosti je sproščanje toplote *dekstran; treba je bilo vedet katere vezi ima in kje ga najdemo *ATP sintaza; kaj izkorišča (gradient protonov), kje se nahaja, kaj je... *Anaprotični metabolni procesi *kateri procesi uravnajo koncentracijo glukoze? glikoliza, glukoneogeneza, glikogenoliza, sinteza glikogena *kaj velja za oksidativno dekarboksiliranje piruvata? 11. dolociti na koliko delov se razdeli spojina ob encimu tripsinu in se enemu. Kateri drugi primer enicma je bil? 12. naloge ponavadi da za zracunat s Henderson-Hasselbachovo enacbo? Eden je primer, da zracunas razmerje med kislino in konjugirano bazo. Drugi? Druga spojina je bla CNBr, maš na strani 91 v Boyerju, kar se pa HandersenHasselbachove tiče maš pa v knjigi še ostale primere. Drugih ne dajejo notr...
1. rok 2012 1. Imel smo zaporednje aminkislin, ki si jih enkrat cepil z CNBr pa si dobil, in drugič isto verigo si cepil z tripsinom pa kimotripsinom in si dobil mal drugače razrezano... (oboje je bilo napisano in pol si primerju razcepljene dele, da si sestavu kaka je bila veriga na začetku ;) npr. Leu-Arg-Trp-Met Gly-Ser-Met Lys 2. Izračunat razmerje ogljikove kisline in dikarbonata v telesu pri pH=7,4. In imel si podan pKa1 in pKa2. In si mogu uporabit pravega pa zračunat. 3. Nariši/opiši shemo pretoka energije (anabolizem, katabolizem) 4. Poveži glukoza, maščobna kislina, Ac-CoA in ketonska telesa v shemo. 5. Kaj so promotorji? 6. Obkroži neke trditve o Okazakijevih fragmentih. 7. Obroži polarne in nabite AK pri fiziološkem pH 8. Nariši dve monomerni enoti celuloze (glukoze). Kaka vez je med njima in jo obkroži na sliki. 9. Napiši metabolične reakcije kjer je glukoza začetni ali končni produkt. 10. Napiši posttraslacijske modifikacije proteinov. 11. Napiši vseh 6 vlog integralnih membranskih proteinov.
Opiši vlogo adenilat ciklaze pri prenosu signalov. Razlika v delovanju kompetitivnih in nekompetitivnih encimskih inhibitorjev. Kateri kovinski ioni so potrebni za biološko aktivnost pri hemoglobinu, klorofilu, vitaminu B12, citokromu in mioglobinu? Kaj se zgodi pri oksidativni karboksilaciji? (za obkroževat) Obkroži ene trditve o NADH Za katere izmed naštetih molekul so aminokisline neposredni biosintezni prekurzorji: purinske in pirimidinske baze, glutation, NO, sterolni estri,hem,pa še neki Napiši 5 reakcij kjer je glukoza substrat ali končni produkt Opiši prostorsko strukturo poliglutamata pri ph 3 in ph 7 in opiši razlike. Pa vse tri pKa si mel dane. Kaj ti pove redoks število C atomov v hranilih? In kako to izkorišča organizem? Neko vprašanje o nekih reakcijah, k se začnejo na a? sprašval je kje so prisotne, nemorm se spomnt kašne so ble, k sm prvič slišala zanje...:s anaplerotične reakcije
2. rok 2012 1. obkroži biološke polimere 2. narisana molekula cAMP, napisat katera spojina je in njena vloga 3. michaelis mentenov graf narisan s tremi krivuljami, napisat katera je brez inhibitorja katera z kompetitivnim in nekompetitivnim, pri vsaki označiti km 4. obkrožit v zvezi z Edmanovo razgradnjo 5. narisana 2 dela polimera in si mogu povezat vse možne disulfidne vezi, potem je blo ločevanje z gelsko metodo in si mogu napisat kok lis bo pri nereducirajočih pogojih in kok pri reducirajočih 6. citratni ciklus si mogu narisat v obliki shemem s tem da si uporabljal samo oznake C2, C3, C4, C5, C6, CO2 7. za obkrožit u vezi z citratnim ciklom 8. imeu si NAD+ in si mogu narisat shemo z prenosom elektronov in proonov 9. za obkrožit o dekstranu 10. bistvena razlika med ATPazo in ATP sintazo 11. kaj je sprememba g in kaj ti pove 12. vloga ATP-tRNA sintetaza (uglavnm tist encim k povezuje AK z tRNA) pa koliko različnih je v organizmu 13. za obkrozit o fosfolipidih 14. za obkrozit o glikolipidih 15. za zračunat ph, ime3l si podano pka pa 40% laktata in 60% kisline.. 16. za zračunat K' in spremembo g. meu si podan R, T, obe koncentraciji 17.obkorzit o ribocimih 18. narisat graf vpliv h+ in co2 na afiniteto vezave kisika, in to razložit