Durante su gobierno afrontó la inestabilidad política de los comienzos de la república y la Guerra contra la Gran Colombia (1828 - 1829), fue depuesto en Piura el 7 de junio de 1829 y desterrado a Costa Rica donde murió.
Luchó por la independencia del Perú. Fue Jefe Supremo del Perú por un breve periodo entre junio y septiembre de 1829.
Fue el primer mandatario elegido por elecciones populares y el primer presidente del Perú que concluyó su período presidencial. Hecho: -El Tratado de Paz y Amistad, finaliza el litigio con Colombia que originó la guerra