Programa Educativo Licenciatura en Biomedicina Área: Terminal Microbiología Asignatura: Ecología Microbiana Código: LBMM-40 CREDITOS:4 SILVIA MARIA DEL CARMEN GARCIA GARCIA
Unidad I.-El Crecimiento Microbiano y su regulación
Unidad
Objetivo Específi co Explicará los diferente s factores que modifica n el crecimie nto bacterian o
Objetivo
Contenido Temático/Activid ades de aprendizaje
Bibliografía Básica
1
1Factores que modifican el crecimiento microbiano,agua presión pH, temperatura.
Microbiology and Introduction. Gerard J Tortora; Berdell R. Fuke; Cristine L Case. 2000 Benjamin Cummings.
2Efecto de compuestos toxicos ambientales sobre el crecimiento microbiano
2
3 Aspectos fisiológicos de la esporulación
3 Microbial
Contenido
Microbiología de los Microorganis mos. Madigan Michel T. Martinko John M Parker. Jack Brock. 8° Editión Prentice Hall.
Complementari a
Localization and extinction of bacterial populations under inhomogeneous growth conditions. Lin AL, Mann BA, TorresOviedo G. Lincoln B, Kas J, Swinney HL. Biophys J. 2004 Jul;87 (1): 75-80
El papel de los tapetes microbianos en la biorrecuperación de zonas litorales sometidas a la contaminación por vertidos de petróleo .,M. Martínez-Alonso, N. Gaju
Ecology and Infectious disease. Eugene Rosenberg. 1999 ASM Press Bibliografía
Específi co II.Interacción de iones metálicos con microorganis mos
Explicará los diferente s factores que modifica n el crecimie nto bacterian o
Temático/Activid ades de aprendizaje
1Factores que afectan la toxicidad con metales.
Básica
Complementari a
1 Ingolf F. Nes, Dzung B. Diep, 1 and Helge Holo. Microbiología 2007., de los Bacteriocin Microorganis Diversity in mos. Madigan Streptococcus and Michel T. Martinko John Enterococcus. M Parker. Jaurnal of Jack Brock. Bacteriology. 8° Editión 189.1189-1198 Prentice Hall.
2 Resistencia bacteriana hacia los metales pesados
2 ATLAS, R.M.& BARTHA, R, (1998) (4th ed).Microbial Ecology: Fundamentals and Applications. The BenjaminCummings Sci. Pub.-
2 Morten Hentzer, Gail M. Teitzel, Grant J. Balzer, Arne Heydorn, Soren Molin, Michel Givskov, AND Mattew R. Parsek.2001., Alginate Overproduction Affects Pseudomonas aeruginosa Biofilm Structure and Function. Jaurnal of Bacteriology, 183. 5395–5401.
3 Transporte de metales a través de las membranas: Ionóforos sideróforosde bacterias y
3 CAMPBELL, R. (1987). Ecología microbiana. Limusa
3 Rosa O. CañizaresVillanu eva. 2000. Biosorción de metales pesados mediante el uso de biomasa
Unidad
Unidad III.- El microorga nismo y su microambi ente
Objetivo Específi co
Objetivo Específico Explicará los diferentes factores que modifican el crecimiento microbiano
Contenido Temático/Activid ades de aprendizaje hongos.
Contenido Temático/Acti vidades de aprendizaje
1Fisicos: Radiación solar, Presion osmótica, Presión hidrostática.
2 .- Químicos: Ph, disponibilidad gaseosa (O2,CO2)
Bibliografía Básica
Complementari a Microbiana. Revista Latinoamericana de Microbiología (2000) 42:131143
Bibliografía Básica
1 Microbial Ecology and Infectious disease. Eugene Rosenberg. 1999 ASM Press.
DIXON, B. (1994). Power unseen: How Microbes Rule the World. W.H.Freeman
Complementaria
1 Bonin, P., Cravo-Laureau, C., Michotey, V. y Hirschler-Réa, A. 2004. The anaerobic hydrocarbon biodegrading bacteria: an overview. Ophelia 58: 243254 2 Raghukumar,C., Vipparty, V.,David, J.J. y Chandramohan, D. 2001. Degradation of crude oil by marine cyanobacteria. Appl Microbiol Biotechnol 57: 433-436.
Unidad
Unidad IV.Habitats Microbian os
Objetivo Específico
Contenido Temático/Acti vidades de aprendizaje 3.- Biológicos: Factores que favorecen selectivamente la colonización. Factores que inhiben selectivamente la colonización
Contenido Objetivo Temático/Acti Específico vidades de aprendizaje Esquematiz 1.-Ambiente ará los Atmosférico diferentes interiores y hábitats exteriores microbiano s
2.-Ambientes Acuáticos, Agua dulce agua salada
Bibliografía Básica
Complementaria
3 FENCHEL, T., KING, G.M. & Blackburn, T.H. (1998). Bacterial Biogeochemistry: The Ecophysiology of Mineral Cycling. Academic Press
3 MartínezAlonso, M., García de Oteyza, T., Llirós, M., Munill, X., Muyzer, G., Esteve, I., Grimalt, J.O. y Gaju, N. 2004. Diversity shifts and crude oil transformation in polluted microbial mat microcosms. Ophelia 58: 205216.
Bibliografía Básica
Complementaria
Microbial Ecology and Infectious disease. Eugene Rosenberg. 1999 ASM Press.
Gregor Reid and Jo-Anne Hammond.2005 Probiotics: Some evidence of their effectiveness Can Fam Physician. 51: 1487–1493.
2 ATLAS, R.M.& BARTHA, R, (1998) (4th ed).Microbial Ecology: Fundamentals and Applications.
2 Bradley C. Johnston, Alison L. Supina, and Sunita Vohra.,2006 Probiotics for pediatric
Unidad
Objetivo Específico
Contenido Temático/Acti vidades de aprendizaje
Bibliografía Básica
Complementaria
The Benjamin- antibioticCummings Sci. associated Pub.diarrhea: a metaanalysis of randomized placebocontrolled trials 17: 377–383. 3.- Ambientes terrestres.Suelo ,rocas ígneas la rizhosfera
3 ATLAS, R.M. (1990) Microbiología: Fundamentos y aplicaciones. CECSA, México
3 Kirillina O, Fetherston JD, Bobrov AG, Abney J, Perry RD. HmsP, a putative phosphodiesteras e, and HmsT, a putative diguanylate cyclase, control Hms-dependent biofilm formation in Yersinia pestis. Mol Microbiol 2004; 54: 75-88.
4.- Ambientes biológicos:
4 BROCK,T.D.,B ROCK, K. & WARD, D.(1986).Basic Microbiology with Applications. Prentice Hall
4 Probiotics, prebiotics, and synmbiotics: approaches for modulating the microbial ecology of gut. M. David Collins and Glenn R. Gibson Am J Clin Ntr 1999;69(suppl):1 052S-7S
La ecología genómica y su importancia en los diferentes hábitats microbianos. La Ecología y los agentes prebióticos, probióticos y simbióticos. El Cuerpo
Unidad
v.Biofilms Bacterian os
Objetivo Específico
Contenido Temático/Acti vidades de aprendizaje Humano,Mucos as placa dental Rumen 5.- Señales ambientales que controlan la expresión génica Quorum Sensing Modelos Mecanismos de señalización en simbiósis
Biofilms Bacterianos: Como medida de supervivencia procariota.. Los biofilms en la naturaleza,indu stria, placa dental
Bibliografía Básica
Complementaria
CAMPBELL, R. (1987). Ecología microbiana. Limusa
Microbial Biofilms: from Ecology to Molecular Genetics Mary Ellen Davey and George A. Otoole Microbiology and Molecular Biology Reviews, Dec 2000, p847-867
CAMPBELL, R. (1987). Ecología Structure and microbiana. Species Limusa Composition of MercuryReducing Microbial Biofilms. Ecology and I. WagnerInfectious disease. Eugene Dobler., H. Rosenberg. 1999 Lunsdorf, T. Lubbehu sen, H. ASM Press F. Von Canstein, and Li. American Society for Microbiology. Oct. 2008, p. 4559–4563 Vol. 66, No. 10
Unidad
Objetivo Específico
Contenido Temático/Acti vidades de aprendizaje
Bibliografía Básica
Complementaria
Bacterial communication: a common cause of persistent infections Néstor J. Oviedo,Laborator io de Bioenergética Celular,Centro de Biofísica y Bioquímica, Instituto Venezolano de investigaciones Científicas (IVIC) AP 21827, Caracas 1020 A. Venezuela. Microbial Biofilms: from Ecology to Molecular Genetics Mary Ellen Davey and George A. Otoole Microbiology and Molecular Biology Reviews, Dec 2000, p847-867
Unidad VI.Interaccion es
Objetivo Específico
Contenido Temático/Acti vidades de aprendizaje
Describirá los diferentes
1.-competencia
Bibliografía Básica
Muñoz-Rojas
Complementaria
The Role of Innate Immune
Unidad microbianas
Objetivo Específico
Contenido Temático/Acti vidades de aprendizaje
tipos de interacción microbiana
Bibliografía Básica J., 2008. Bacteriocinas: una estrategia de competencia microbiana propuesta como alternativa de antibióticos dirigidos para el futuro humano. In: Martínez E. & Martínez J., eds. Microbio en línea, http: www.microbiol ogía.orgmx/microbiose nlínea, (28/07/08). .
Complementaria Responses in the Outcome of Interspecies Competition for Colonization of Mucosal Surfaces Elena S. Lysenko, Adam J. Ratner, Aaron L. Nelson, Jeffrey N. Weiser. PLoS Pathogens.Septe mber 2005 ;Volume p.1 .0030011 1 Pathologic and Physiologic interactions of bacteria with the gastrointestinal epithelium. Am J.Clin Nutr 2001: 73 ( sippl): 1124S-30S.
POSTGATE, J. (1992) (3th). Microbes and Man. Cambrigde University Press.
2.- Mutualismo
LYNCH, I.M. & POOLE, M.J. (1984 )Microbial Ecology: A Conceptual Approach
2 Xenorhabdus nematophilus as a Model for Host.BacteriumInt eractions: rpoS Is Necessary for Mutualism with Nematodes.,
Unidad
Objetivo Específico
Contenido Temático/Acti vidades de aprendizaje
Bibliografía Básica
Complementaria Eugenio E. Vivas and Heidi Goodrich-Blair Journal and Bacteriology. Aug. 201 p4687-4693 Host Symbiont Recognition in the Environmentaly Transmitted Sepioli SquidVibrio Mutualism; M.K. Nishiguchi. Microbial Ecology DOI: 10.1007/s00248002-002-y20002 Springer-Verlag New York Inc.
3.- Parasitismo
4.Antagonismo
Microbial Ecology and Infectious disease. Eugene Rosenberg. 1999 ASM Press.
3 Impact of oil contamination and biostimulation on the diversity of indigenous baterial communities in soil microcosms. Evans, F.F et al., FEMS Microbiol Ecol 49: 295305.2004
Bacteriocin Production in VancomycinResistant and VancomycinSusceptible Enterococcus
Unidad
Objetivo Específico
Contenido Temático/Acti vidades de aprendizaje
Bibliografía Básica
Complementaria Isolates of Different Origins. Rosa del Campo; Carmen Tenorio, Rufino JiménezDiáz, Carmen Rubio,Rafael Gomez-Lus, Fernando Baquero, and Carmen Torres. Antimicrobial Agents and Chemotherapy, Mar. 2001, p. 905–912 Vol. 45, No. 3
5.Amensalismo 6.- Simbiosis Temperature Affects Species Distribution in Symbiotic Populations of Vibrio spp. Michele K. Nishiguchi ;Applied and e Environmental Microbiology, Aug. 2007, p. 3550– 3555 Vol. 66, No. 8
4Bacterial biofilms. Julio Nazar C. Rev. Otorrinolaringol. Cir. Cabeza
Unidad
Objetivo Específico
Contenido Temático/Acti vidades de aprendizaje
Bibliografía Básica
Complementaria Cuello 2007; 67: 61-72
VII.Microbiolo gía de alimentos fermentado s (café, pulque, chocolate)
Conocer los microorgani smos presentes en las etapas de elaboración de los alimentos fermentado s y su influencia en la calidad y propiedade s del producto
Microorganism os que intervienen en las diferentes etapas dell proceso de elaboración del “Café”.
Microorganism os que intervienen en las diferentes etapas del proceso de elaboración del “Pulque”. Microorganism os que intervienen en las diferentes etapas dell proceso de elaboración del “Chocolate”.
Microbiological and Biochemical Study of Coffee FermentationSylvi e Avallone;Bernard Guyot, Jean-Marc Brillouet; Eugenia Olguinand Joseph-Pierre Guiraud. CURRENT MICROBIOLOGY Vol. 42 (2001), pp. 252–256 Succession of bacterial and fungal communities during natural coffee (Coffea arabica) fermentation. Cristina Ferreira Silva; Luis Roberto Batista; Lucas Magalhaes Abreu; Eustaquio Souza Dias; Rosane Freitas Schwan. Food Microbiology 25 (2008) 951–957.
Unidad
Objetivo Específico
Contenido Temático/Acti vidades de aprendizaje
Bibliografía Básica
Complementaria
Involvement of pectolytic microorganisms in coffee fermentation.Sylvi e Avallone; Jean M. Brillouet;Bernard Guyot; Eugenia Olguin and Joseph P. Guiraud.Internatio nal Journal of Food Science and Technology 2002, 37, 191±198 El pulque: características microbiológicas y contenido alcohólico mediante espectroscopia Raman.Mario CervantesContreras y Aura Marina PedrozaRodríguez. NOVA - PUBLICACIÓN CIENTÍFICA EN CIENCIAS BIOMÉDICAS ISSN:1794-2470 VOL.5 No. 8 JULIO DICIEMBRE DE 2007:101-212 Microorganismos y chocolate. María del Carmen
Unidad
Objetivo Específico
Contenido Temático/Acti vidades de aprendizaje
Bibliografía Básica
Complementaria Wacher Rodarte. Revista Digital Universitaria,1 de abril 2011 • Volumen 12 Número 4 • ISSN: 1067-6079 Enemas rituales en mesoamérica. Taube, K, (1998). Arqueología Mexicana. VI. 3845. Characterization of bacterial diversity in Pulque, a traditional Mexican alcoholic fermented beverage, as determined by 16S rDNA analysis. Escalante, A, Rodriguez. M, Martinez, A, López-Munguia, A. Bolivar, F. FEMS Microbiology Letters. 235.2004: 273-279. Mitsuoka, T, (1982). Bifidobacteria and Microflora, Mitsuoka, T.Recent Trends in Research on Intestinal Flora. 1(1),1982:3-24.
Unidad
Objetivo Específico
Contenido Temático/Acti vidades de aprendizaje
Bibliografía Básica
Complementaria Ritual enemas, Natural History, Furst, T, Coe, M, 1977:86 (3) 88-91.