IRB Barcelona Memoria Anual 2009 by IRB Barcelona

2009 Memoria Anual IRB Barcelona

Centres de Recerca de Catalunya

Créditos © Copyright 2010 Producción: Oficina de Comunicación y Relaciones Externas Instituto de Investigación Biomédica — IRB Barcelona Baldiri Reixac, 10 08028 Barcelona www.irbbarcelona.org Edición y maquetación: Anna Alsina Diseño: Nicola Graf Fotografía: Raimon Solà (fotos de grupo), Maj Britt Hansen, Marta Pérez (págs. 43, 65, 66), Roland Pache (pág. 67), Oficina de Comunicación y Relaciones Externas Impresión: Puresa/La Trama Depósito legal: B-7912-2010

Este documento se ha imprimido con papel ecológico procedente de plantaciones de gestión forestal sostenible.

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Prólogo............. 6

Índice Ciencia en el IRB Barcelona

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Programa de Biología Celular y del Desarrollo.....................

Programa de Biología Estructural y Computacional................

Programa de Medicina Molecular.....................................

Programa de Química y Farmacología Molecular...................

Programa de Oncología.................................................

Plataformas Científicas.................................................

MetCentre................................................................

Datos del IRB Barcelona Patronato.................................................................

Junta de Gobierno.......................................................

Comité Científico Internacional.......................................

Fuentes de Financiación................................................

Resumen de la Producción Científica.................................

Formación Académica...................................................

Actividades de Transferencia de Tecnología.........................

Seminarios Barcelona BioMed..........................................

Actos Institucionales....................................................

Actividades de Divulgación.............................................

El IRB Barcelona en los Medios........................................

Organigrama del IRB Barcelona........................................

Personal de Dirección y Administración..............................

Estadísticas de Recursos Humanos....................................

Afiliaciones de los Investigadores.....................................

Parque Científico de Barcelona.......................................

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Prólogo

El IRB Barcelona hace avanzar la frontera en investigación biomédica

sta es la Memoria Anual del Instituto de Investigación Biomédica (IRB Barcelona), un centro de investigación joven y dinámico creado en el año 2005 y situado en el corazón de Cataluña. El objetivo del documento es ofrecer una visión general de las actividades de investigación del centro durante el año 2009. La edición va acompañada de un DVD con una selección de las publicaciones del IRB Barcelona, que incluye la Memoria Científica del 2009 (un recopilatorio detallado de los trabajos realizados por nuestros grupos de investigación y plataformas científicas), la publicación ‘Science Stories from IRB Barcelona’ (dirigida al público general y en la que se destaca una selección de proyectos científicos llevados a cabo por investigadores del Instituto) y otros documentos que ofrecen una pincelada de la vida dentro de los laboratorios. El 2009 fue un año de crecimiento y mejoras para el IRB Barcelona. El programa de Oncología se amplió en

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mayo con la llegada del investigador Travis Stracker, procedente del Memorial Sloan-Kettering Cancer Center de Nueva York. El grupo liderado por Stracker, que centra su investigación en la inestabilidad genómica y el cáncer, tiene como objetivo incrementar el conocimiento sobre cómo las respuestas al daño en el ADN afectan a los componentes clave en las vías de transducción de señales, y cómo las alteraciones en estos componentes pueden desarrollar tumores. La Plataforma Científica de Microscopía Digital Avanzada (ADM), una iniciativa conjunta entre el IRB Barcelona y el Parque Científico de Barcelona, se inauguró oficialmente en abril. La plataforma, dirigida por Julien Colombelli (previamente en el European Molecular Biology Laboratory en Alemania), ofrece un amplio abanico de servicios de microscopía de luz dirigidos a grupos de investigación del IRB Barcelona, a científicos del PCB, así como a investigadores visitantes. La incorporación de la ADM eleva a seis el número de plataformas cientí-

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La prioridad principal del IRB Barcelona es continuar impulsando la excelencia en investigación a través de la mejora de los programas existentes y la incorporación de nuevos grupos punteros de investigación

ficas dentro del IRB Barcelona, un recurso clave para la investigación creado en beneficio de la comunidad científica del Parque Científico de Barcelona. El nuevo departamento de Innovación y Proyectos Estratégicos, liderado por Jorge Domínguez, inició sus actividades en marzo. El departamento tiene como objetivo asesorar a los miembros del IRB Barcelona en la identificación, la protección, el desarrollo y la comercialización de sus investigaciones y asegurar así que la investigación llegue también a la sociedad. En diciembre, Màrius Rubiralta renunció a su cargo de jefe de grupo dentro del programa de Química y Farmacología Molecular para asumir una nueva responsabilidad dentro del gobierno español. El IRB Barcelona agradece los esfuerzos del Dr. Rubiralta y su papel clave en la creación del Parque Científico de Barcelona y de nuestro Instituto. Por otra parte, el grupo de investigación liderado por Elena Sancho se fusionó en 2009 con el de Eduard Batlle para impulsar la investigación conjunta en cáncer de colon.

está en proceso de incorporar un nuevo jefe de grupo. El IRB Barcelona finalizó también durante el 2009 la primera ronda del proceso de pre-evaluación de los jefes de grupo que llevan más de tres años trabajando en el Instituto. Los comentarios recibidos por parte de los evaluadores han servido para identificar puntos fuertes y puntos débiles orientados a continuar mejorando e impulsando los programas de investigación del Instituto.

En el camino correcto El Comité Científico Internacional del IRB Barcelona, un grupo de 15 destacados científicos internacionales que nos orientan en el diseño de la estrategia y las actividades de investigación, se reunió por segunda vez a principios de mayo. Los objetivos de la reunión eran revisar la implementación de las recomendaciones anteriores,

La prioridad principal del IRB Barcelona es seguir impulsando la excelencia en investigación a través de la mejora de los programas existentes y la incorporación de nuevos grupos punteros de investigación. En este sentido, el Programa de Oncología se verá reforzado y ampliado con la incorporación, a principios del 2010, del científico Ángel Nebreda, procedente del Centro Nacional de Investigaciones Oncológicas en Madrid. Por otro lado, el Programa de Medicina Molecular también

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Los investigadores del IRB Barcelona lograron aumentar con éxito los recursos para la investigación gracias a la concesión de proyectos científicos procedentes de la Unión Europea

evaluar los programas de Biología Celular y del Desarrollo y de Biología Estructural y Computacional, familiarizarse con la investigación de los nuevos jefes de grupo, así como orientar al IRB Barcelona en el desarrollo del futuro plan estratégico. El Comité evaluó la implementación de sus recomendaciones en un amplio abanico de áreas y nos animó a continuar centrando esfuerzos en los puntos fuertes de nuestros programas y en el potencial formativo para posicionar al IRB Barcelona en la vanguardia de la investigación biomédica. El Comité también estudió y aprobó el Plan Estratégico, que guiará el crecimiento del Instituto durante los próximos seis años.

Competitividad para atraer recursos Los investigadores del IRB Barcelona lograron aumentar con éxito los recursos para la investigación gracias a la concesión de proyectos científicos procedentes de la Unión Europea. En el ámbito de la salud, el 7º Programa Marco destinó más de cinco millones de euros a repartir en tres años a dos proyectos coordinados por investigadores del IRB Barcelona: Mephitis, liderado por el jefe de grupo Lluís Ribas de Pouplana y que estudiará la síntesis de las proteínas en el parásito responsable de la transmisión de la malaria, y MITIN, un proyecto pionero liderado por el jefe de grupo Antonio Zorzano que utilizará la bioinformática para obtener nuevos datos sobre la diabetes. Zorzano lidera también el consorcio DIOMED (Diabetes, Obesidad y Medicina) que forma parte

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del programa de la UE Interreg IV B SUDOE y que tiene como objetivo promover el desarrollo tecnológico en el sur de Europa. DIOMED recibirá más de 800.000 euros durante los próximos tres años. El IRB Barcelona también participó durante el 2009 en varias redes nacionales de investigación (CONSOLIDER, CIBERBBN, CIBERDEM, CIBERER, CIBERNED y RETIC).

Centrados en la formación Las actividades de formación en el IRB Barcelona gozan de una posición privilegiada. En septiembre, diez estudiantes procedentes de nueve países diferentes se incorporaron al Programa Internacional de Doctorado “La Caixa”/IRB Barcelona y destinarán los próximos cuatro años llevando a cabo su investigación doctoral en uno de nuestros laboratorios. La convocatoria anual “La Caixa” se complementó en el año 2009 con una segunda convocatoria a nivel nacional que permitió la incorporación de cinco estudiantes de doctorado nuevos. Esta iniciativa es una oportunidad única para los estudiantes porque brinda la posibilidad de empezar sus estudios doctorales en el IRB Barcelona antes de hacerse públicas las convocatorias nacionales de becas. Durante el año 2009, nuestros estudiantes de doctorado organizaron un gran número de actividades, incluyendo seminarios científicos, reuniones de carácter social denominadas ‘cool off’ y una liga de fútbol, orientadas todas ellas a fomentar las interacciones científicas y personales entre los miembros de nuestra

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Las actividades de formación en el IRB Barcelona gozan de una posición privilegiada

comunidad. Una de las actividades más destacadas fue el Primer Simposio de Estudiantes de Doctorado, ‘La Arquitectura de la Vida’, que se celebró en Barcelona los días 2 y 3 de noviembre. El evento, organizado en su totalidad por el Comité del Simposio de Estudiantes de Doctorado, contó con la participación de científicos reconocidos, incluyendo a Ada Yonath, Premio Nobel de Física del año 2009. El Simposio fue un gran éxito y representa uno de los hitos más importantes alcanzados por nuestros estudiantes. La formación postdoctoral también recibió un impulso importante durante el año 2009 con la incorporación de cuatro nuevos investigadores postdoctorales como resultado de una convocatoria interdisciplinaria abierta en el año 2008. La iniciativa está orientada a promover las colaboraciones entre las distintas áreas de investigación del IRB Barcelona. Los candidatos seleccionados están actualmente llevando a cabo proyectos de investigación multidisciplinarios que incluyen dos de los programas del Instituto. Las oportunidades postdoctorales que ofrece el IRB Barcelona aumentarán aún más en un futuro gracias al Programa Marie Curie de la Unión Europea, que destinará cerca de un millón de euros a contratar investigadores postdoctorales de alto nivel. Esperamos incorporar a los primeros científicos durante el año 2011. Los investigadores postdoctorales, siguiendo el ejemplo de los estudiantes de doctorado, también promovieron actuaciones encaminadas a dar soporte a su comuni-

dad durante esta etapa crítica de sus carreras. Entre las actividades impulsadas destaca la creación de un consejo destinado a facilitar la interacción social y científica entre los postdoctorados y que actuará como mediador con la dirección del Instituto en las gestiones relacionadas con su comunidad. El colectivo también participó durante el 2009 en la organización de actividades vinculadas a la formación y las salidas profesionales.

Creación del MetCentre La iniciativa MetCentre, un nuevo proyecto científico del IRB Barcelona, se presentó oficialmente en julio durante la visita a nuestro Instituto del Presidente de la Generalitat de Catalunya, José Montilla. El MetCentre es una supraestructura donde la investigación básica y la clíni-

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ca aunarán esfuerzos para combatir los distintos factores implicados en la metástasis. El coordinador científico del MetCentre es Joan Massagué, Director Adjunto del IRB Barcelona. Desde su creación, el MetCentre ha empezado a organizar de forma regular seminarios y grupos de discusión en los que participan investigadores del Hospital Clínic de Barcelona, el Hospital Vall d’Hebrón, el Hospital del Mar, el Hospital de Sant Pau y el IRB Barcelona.

cional. El ciclo de conferencias ‘Barcelona BioMed’ que se inició en el año 2006, se ha establecido firmemente a nivel internacional y continúa atrayendo a ponentes de primera línea en un amplio abanico de disciplinas. Por otra parte, la organización durante el año de diversos talleres científicos y el fórum ‘Creatividad, Ciencia y Arte’ han consolidado la capacidad de nuestro Instituto para llegar a un amplio espectro de audiencias.

Ampliación de colaboraciones

Una mirada hacia el futuro

Aparte de las colaboraciones formales que el IRB Barcelona mantiene con la Universidad de Barcelona y con el Centro Nacional de Supercomputación (BSC), el Instituto impulsó en el año 2009 nuevas colaboraciones científicas con el objetivo de acercar la investigación básica y la clínica realizada en otros centros de Barcelona. En este sentido, el IRB Barcelona y el Instituto de Investigaciones Sanitarias Hospital Clínic-IDIBAPS impulsaron conjuntamente un ciclo de reuniones orientadas a intercambiar información sobre los últimos avances en investigación en una extensa variedad de temas relacionados con la salud humana. Las reuniones realizadas durante el año 2009 trataron tópicos como el cáncer, la neurociencia, las enfermedades metabólicas y del hígado, las enfermedades infecciosas y la salud a escala global.

En sólo cuatro años, el IRB Barcelona ha conseguido notables resultados en el ámbito de la biomedicina, un hecho que queda reflejado en el éxito obtenido a la hora de contratar investigadores internacionales de primera línea, en el nivel y el ritmo de publicaciones del Instituto, en la capacidad para atraer recursos procedentes de fuentes de financiación competitivas, en la creación de infraestructuras y actividades necesarias para promover la excelencia científica y formativa, y en el establecimiento de colaboraciones estratégicas. El año 2009 no fue una excepción y no hay duda de que hemos emprendido las acciones necesarias para conseguir nuestros objetivos.

Un paso más allá El IRB Barcelona continuó impulsando durante el 2009 actividades dirigidas a la comunidad científica interna-

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Joan J Guinovart

Joan Massagué

Director

Director Adjunto

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Ciencia en el IRB Barcelona Programa de Biología Celular y del Desarrollo Programa de Biología Estructural y Computacional Programa de Medicina Molecular Programa de Química y Farmacología Molecular Programa de Oncología Plataformas Científicas MetCentre

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Programa de Biología Celular y del Desarrollo

n una escala que abarca desde el tamaño de una molécula individual hasta el cuerpo humano, la célula, que se encuentra aproximadamente a medio camino, hace de enlace entre los dos niveles. A partir de la traducción de la información que la célula hace de su genoma en forma de proteínas y otras moléculas, ésta sabe cuándo debe dividirse, qué forma debe adoptar y cómo ha de comportarse para construir un organismo completo. Es posible comprender qué le ha pasado a un organismo sano o enfermo a partir de lo que ocurre en el interior de las células.

en lo más profundo de las células para estudiar cómo surgen las estructuras y cómo contribuyen a la formación de un organismo. Hasta hace un par de décadas, estas incógnitas se estudiaban en disciplinas que caminaban por separado, pero desde entonces se han ido acercando y creciendo de manera conjunta. Los biólogos celulares están empezando a comprender cómo controlar los procesos que permiten a las células crear estructuras más grandes y los biólogos del desarrollo, por su parte, están centrando su interés en los mecanismos celulares que rigen el crecimiento de los embriones.

El programa de Biología Celular y del Desarrollo investiga el vínculo entre los dos niveles y lo hace mirando

Para unir estas dos áreas hacen falta aproximaciones experimentales multidisciplinarias que engloben desde la biología molecular moderna, la genética clásica, la bioquímica y la microscopía avanzada, hasta métodos de tecnología punta de la genómica y la proteómica. Los grupos del programa centran su investigación en cómo se transmiten las señales en el interior de las células y entre ellas, qué controla la migración celular, cómo se forman las fronteras entre tejidos durante el desarrollo y cómo se controla el crecimiento de los tejidos. Otros temas que exploran son la organización microtubular, la división celular en el desarrollo y en la enfermedad, la regulación epigenética y la función de la cromatina, así como la manipulación de la traducción genética con fines terapéuticos. Los modelos utilizados por los diversos grupos de investigación del programa incluyen levaduras, Drosophila, ranas, ratones y parásitos humanos.

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Dentro del núcleo: estructura y función de la cromatina Ninguna célula tiene la capacidad de producir siempre ARNs y proteínas de todos sus genes, en parte porque el ADN dentro del núcleo está envuelto entre proteínas y otras moléculas en una forma llamada cromatina. Estas moléculas desempeñan un papel decisivo porque ayudan a empacar una gran cantidad de ADN en el espacio reducido del núcleo. Otra función de estas moléculas es hacer los genes accesibles (o inaccesibles) a las estructuras funcionales que los transforman en otras moléculas. El laboratorio de Ferran Azorín estudia los procesos que estructuran las cromatina para controlar sus efectos biológicos. La cuestión principal que quieren resolver es cómo los bloques largos de ADN se vuelven inactivos y cómo las células los pueden mantener silenciados. Hay regiones del ADN que están casi siempre silenciadas, mientras que otras se activan o inactivan para conseguir determinados efectos en el desarrollo. Azorín y su grupo están estudiando estos dos tipos de regiones.

Grupo de Investigación I Jefe de Grupo: Ferran Azorín I Investigadores Asociados: Jordi Bernués, Maria Lluïsa Espinàs I Investigadores Postdoctorales: Martí Badal, Anne Daulny, Joan Font, Olga Moreno, Mónica Torras I Estudiantes de Doctorado: Marta Batlle, Marta Blanch, Sergi Cuartero, Roman Kessler, Marta Lloret, Sonia Medina, Olivera Vujatovic I Ayudantes de Investigación: Carles Bonet, Gemma Molla, Alicia Vera I Técnico de Laboratorio: Ester Fuentes I Estudiante Visitante: Nina Schuback (Alemania)

Señales que organizan las células en las estructuras del cuerpo Construir un organismo complejo requiere que las células se especialicen y cambien la forma, la conducta y la manera que tienen de dividirse. Los cambios morfogenéticos están coordinados por indicaciones del entorno como, por ejemplo, moléculas secretadas por otras células. Las indicaciones tienen que ser interpretadas correctamente dentro de la célula, lo que implica que la información debe pasar por una vía de moléculas de señalización. Los efectos de una misma señal pueden variar según cuándo y en qué parte del cuerpo se produzcan. Muchas de estas vías han facilitado que estudios con organismos modelo puedan revelar información sobre la evolución en los humanos y otros animales. El laboratorio de Jordi Casanova centra su estudio en este proceso, utilizando como modelos el desarrollo de la tráquea y la vía de señalización del receptor Torso en la mosca de la fruta.

Grupo de Investigación I Jefe de Grupo: Jordi Casanova I Investigadores Asociados: Sofia Araújo, Andreu Casali, Xavier Franch, Marc Furriols I Investigadores Postdoctorales: Kyra Campbell, Louis Gervais, Gaelle Le Breton I Estudiantes de Doctorado: Elisenda Buti, Gaylord Darras, Marco Grillo, Oscar Martorell I Ayudante de Investigación: Nicolas Martin I Técnicos de Laboratorio: Nuria Molist, Yolanda Rivera Memoria Anual IRB Barcelona 2009 19

Las bases de la división celular Las células nuevas en el organismo proceden de células progenitoras que se han dividido. La división celular, que implica la sincronización perfecta de múltiples sucesos, funciona de manera distinta en células embrionarias, en células madre especializadas en sangre, en neuronas y centenares de otros tipos celulares, y en tumores de crecimiento rápido. El laboratorio de Cayetano González combina la genética, la biología molecular y la microscopía avanzada in vivo para estudiar la división celular. Como sistemas modelo, el grupo utiliza la Drosophila y células cultivadas de vertebrados. Algunos de los proyectos que el grupo tiene en marcha incluyen el estudio del huso mitótico, el estudio de las proteínas que construyen estructuras llamadas centrosomas y la modelización del cáncer en la mosca de la fruta.

Grupo de Investigación I Jefe de Grupo: Cayetano González I Investigador Asociado: Elena Rebollo I Investigadores Postdoctorales: Jens

Januschke, Bart Lesage, José Reina, Fabrizio Rossi, Zhanna Shcheprova I Estudiante de Doctorado: Ana Janic I Ayudantes de Investigación: Jan Peter Heinen, Salud Llamazares I Técnico de Laboratorio: Nuria López

El citoesqueleto microtubular: una cuestión de organización Los microtúbulos unen los husos que conducen a la segregación cromosómica durante las divisiones celulares meióticas para producir óvulos y espermatozoides y también para proporcionar movimiento al esperma. Los microtúbulos son necesarios para promover la proliferación celular, la segregación cromosómica y la división celular. Cuando las células se diferencian, los microtúbulos establecen polaridad, participan en la comunicación entre las células y también desempeñan un papel en la migración celular. Para llevar a cabo funciones tan diversas, los microtúbulos se organizan en redes complejas de variada forma y tamaño. Una incorrecta organización microtubular se ha vinculado a enfermedades como el cáncer y a defectos del desarrollo. El laboratorio de Jens Lüders, que utiliza el cultivo de tejidos celulares y el extracto de huevos de Xenopus laevis como sistemas modelo, estudia los mecanismos moleculares que determinan dónde y cuándo se forman los microtúbulos. 20 Memoria Anual IRB Barcelona 2009

Grupo de Investigación I Jefe de Grupo: Jens Lüders I Investigadores Postdoctorales: Marco Archinti, Neus Teixidó I Estudiantes de Doctorado: Florian Baier, Sabine Klischies, Nicolas Lecland I Ayudante de Investigación: Cristina Lacasa

Formación de extremidades: señales, compartimentos y límites Las estructuras complejas en el embrión, como por ejemplo las extremidades, se inician como un grupo de células idénticas pero que enseguida se subdividen en territorios más reducidos llamados compartimentos. El laboratorio de Marco Milán está aprovechando cerca de 100 años de trabajos en genética con la mosca de la fruta para estudiar las señales que guían el desarrollo de las extremidades. Los compartimentos, tal como demuestran investigaciones anteriores, surgen debido a mecanismos que evitan la mezcla de diferentes tipos de células, hecho que lleva al desarrollo de subterritorios y límites compartimentales entre tejidos. Las células que se encuentran en estos límites secretan moléculas señalizadoras que guían el patrón y el crecimiento de toda la extremidad. Milán y su grupo estudian cómo estas moléculas controlan procesos tan complejos como la generación de extremidades adultas con un tamaño, forma y patrón específicos de especie.

Grupo de Investigación I Jefe de Grupo: Marco Milán I Investigadores Postdoctorales: Isabelle Becam, Fernando Bejarano, Andrés Dekanty, UllaMaj Fiuza, Héctor Herranz, Florencia Tevy I Estudiantes de Doctorado: Lara Barrio, Laura Boulan, Duarte Mesquita, Neus Rafel, Georgina Sorrosal I Ayudante de Investigación: Lidia Pérez I Estudiante Visitante: Thomas Oliver (Alemania)

Traducción genética y enfermedades Las células, para sobrevivir, han de transformar la información de su genoma en ARN y en proteínas. Para llevar a cabo este último paso, llamado traducción, es necesaria una compleja red de moléculas que los científicos muy recientemente han empezado a comprender en detalle. Las interacciones que se producen van desde el proceso de fabricación de proteínas hasta otras vías reguladoras en las células. Los desequilibrios causados por las alteraciones de estas interacciones se encuentran en el origen de varias enfermedades. El laboratorio de Lluís Ribas de Pouplana está explorando estas redes de interacción en células humanas y en protozoos que infectan a los humanos. El grupo también estudia la evolución de la maquinaria de traducción genética, que experimentó cambios significativos con la evolución de las células eucariotas. El equipo también espera alcanzar un mayor entendimiento sobre la evolución de este tipo de células a partir del estudio de moléculas vinculadas a la traducción.

Grupo de Investigación I Jefe de Grupo: Lluís Ribas de Pouplana I Investigador Asociado: Alfred Cortés I Investigadores Postdoctorales: Laia Cubells, Francesc Miró I Estudiantes de Doctorado: Manuel Castro, Valerie Crowley, Tanit Guitart, Eva Novoa I Técnicos de Laboratorio: Noelia Camacho, Nuria Rovira, Anna Tor I Investigador Visitante: Cristina Bancells (España)

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Construcción y reconstrucción del cerebro El desarrollo del cerebro incluye diversas etapas: primero se tienen que formar las regiones, después se tienen que desarrollar los distintos tipos de células nerviosas, que tienen que migrar a los lugares correspondientes y, finalmente, conectarse adecuadamente entre sí. Una vez conectadas, es preciso que respondan correctamente a la estimulación, que debe permitir adquirir la capacidad de aprendizaje y de memoria. Para llevar a cabo este proceso, las células han de inactivar genes específicos en el momento idóneo, saber interpretar las señales de las moléculas que se encuentran en la superficie de otras células y responder en consecuencia. El laboratorio de Eduardo Soriano centra parte de su investigación en identificar nuevos genes que actúan en estos procesos. El grupo también trabaja en el estudio de las diferencias entre las células del cerebro en el embrión, durante la infancia y en etapa adulta. La observación de los mecanismos durante los primeros años de desarrollo del cerebro podrá ayudar a los científicos a diseñar terapias regenerativas para reparar lesiones en el cerebro adulto.

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Grupo de Investigación I Jefe de Grupo: Eduardo Soriano I Investigadores Asociados: Ferran Burgaya, Albert Martínez, Marta Pascual, Alexander Ulloa, Jesús Ureña I Investigadores Postdoctorales: Tiziana Cotrufo, Guillermo López, Lluís Pujadas, Catia Teixeira I Estudiantes de Doctorado: Carles Bosch, Giulia Fuschini, Beatriz García, Maria del Mar Masdeu, Serena Mirra, Mª Esther Pérez, Oriol Ros, Daniela Rossi, Esmeralda Rubio, Román Serrat I Estudiante de Máster: Nuria Masachs I Ayudante de Investigación: Ashraf Muhaisen I Técnicos de Laboratorio: Lucas Brunso, Sandra Mas, Natalia Ruiz I Asistente Administrativo: Jan Vara

Programa de Biología Estructural y Computacional

a física y la vida tienen su punto de encuentro a nivel de las moléculas individuales, que rigen su comportamiento a partir de la forma y las propiedades químicas que tienen. El ADN, el ARN, las proteínas y otros tipos de moléculas interactúan entre sí y se transforman para crear organismos vivos. Para adquirir una comprensión detallada de la vida hace falta encontrar la relación entre el comportamiento de todos estos componentes y sus estructuras. Esta perspectiva es crucial para el estudio de las enfermedades genéticas, a menudo causadas por pequeños cambios estructurales en las moléculas, así como para la mejora y creación de nuevos fármacos.

Un fármaco acostumbra a ser una molécula pequeña que actúa cuando se une a una proteína y altera su comportamiento. Sin una fotografía estructural de esta interacción, sería casi imposible comprender su funcionamiento. El programa de Biología Estructural y Computacional agrupa a un gran número de expertos que investigan estos aspectos de la vida. Los avances conseguidos en las últimas tres décadas en técnicas como la cristalografía de rayos X y la RMN -plataformas disponibles en el IRB Barcelona- han permitido obtener mapas detallados de la estructura de muchas moléculas biológicas clave. Todavía, sin embargo, quedan muchas por explorar y hasta ahora ha sido difícil poder observar el funcionamiento interno de las ‘máquinas moleculares’ formadas por un gran número de moléculas. En muchos casos, se puede obtener información estructural de proteínas nuevas y sus interacciones a partir de la comparación entre secuencias de estas proteínas y de otras moléculas ya conocidas. Se trata de un proceso que requiere el uso de herramientas computacionales innovadoras, el potencial de las cuales ha crecido enormemente en los últimos años gracias a la riqueza de información que se ha generado con los proyectos de genómica.

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Diagramas del interior de las máquinas La secuenciación de diversos genomas ha proporcionado listas casi completas de las moléculas que pueden ser producidas por un organismo. Las técnicas post-genómicas están revelando, gradualmente, qué componentes se utilizan para construir determinadas máquinas dentro de la célula. Lo que aún falta, sin embargo, es conseguir tener una visión detallada de cómo se unen las piezas que forman la máquina. El grupo de Patrick Aloy está diseñando nuevos métodos bioinformáticos para combinar información de los genomas (secuencias de proteínas) con las listas de los comportamientos de las máquinas (obtenidas a través de la espectrometría de masas y otras técnicas) y información sobre las interacciones entre superficies o componentes de moléculas (con rayos X o RMN) con diagramas de la construcción detallada de los complejos. Esta información se puede utilizar para mostrar los puntos débiles de un complejo, que podrían ser dianas para experimentos o para diseñar nuevos fármacos.

Grupo de Investigación I Jefe de Grupo: Patrick Aloy I Investigador Asociado: Roberto Mosca I Investigadores Postdoctorales: Arnaud Ceol, Albert Pujol, Guillermo Suñé, Andreas Zanzoni I Estudiantes de Doctorado: Manuel Alonso, Rodrigo Arroyo, Clara Berenguer, Marc Duocastella, Roland Pache, Amelie Stein I Ayudante de Investigación: Ricart Lluís I Estudiantes Visitantes: Rafael Pedret (España), Joan Marc Seoane (España), Francesc Tresserres (España), Josep Lluís Villanueva (España)

Moléculas que se unen al ADN El grupo liderado por Miquel Coll estudia cómo se comporta el ADN una vez se une a proteínas y a otras moléculas. El método se basa en el uso de rayos X de alta intensidad para estudiar moléculas cristalizadas. El equipo investiga cómo las proteínas se unen al ADN para controlar la actividad de los genes, un paso clave en la mayoría de procesos biológicos. También estudian un fenómeno llamado transferencia horizontal de genes, un proceso en el que determinadas células traspasan ADN a otras células. Este proceso requiere mecanismos complejos para transportar el ADN a través de las membranas. Otros temas de investigación incluyen el estudio de estructuras singulares de ADN y de nuevos medicamentos que puedan acoplarse al ADN en lugar de a las proteínas. 24 Memoria Anual IRB Barcelona 2009

Grupo de Investigación I Jefe de Grupo: Miquel Coll I Investigadores Asociados: Albert Canals, Maria Solà, Cristina Vega I Investigadores Postdoctorales: Carme Arnan, Daniel Badia, Roeland Boer, Carlo Carolis, Lionel Costenaro, José Fernández, Robert Janowski, Joan Pous, Fabio Sessa

I Estudiantes de Doctorado: Juliana Amodio, Pablo Fernández, Nereida Jiménez, Zuzanna Kaczmarska, Diana Martínez, Marta Nadal, Esther Peña, Radoslaw Pluta, Anna Rubio, Silvia Russi I Estudiante de Máster: Nayibe Guarín I Ayudantes de Investigación: Leonor Alloza, Maïlys Boutin, María Pérez I Técnico de Laboratorio: Esther Ferrando I Estudiante Visitante: Alejandra Herrera (Chile)

Estrés oxidativo: proteínas de membrana Las proteínas, que desempeñan un papel clave en la mayoría de procesos biológicos, casi nunca actúan solas. Normalmente una molécula se une a docenas de proteínas, al ARN o a otras moléculas para llevar a cabo una función determinada. Observar al detalle las estructuras internas de las proteínas y descubrir dónde actúan dentro de la célula no es una tarea fácil. El laboratorio de Ignasi Fita combina cristalografía de rayos X y criomicroscopía electrónica para estudiar la biología estructural del peroxisoma, uno de los orgánulos eucarióticos más pequeños delimitado por una membrana. El grupo centra esfuerzos en estudiar los complejos que intervienen en la aparición de enfermedades y en las proteínas que se unen a la membrana del orgánulo. Los investigadores colaboran en el estudio de complejos de proteínas eucarióticas y de virus ligados a proteínas receptoras necesarias para entrar en la célula. El trabajo de inves-

Grupo de Investigación I Jefe de Grupo: Ignasi Fita I Investigadores Postdoctorales: Xavi Carpena, Antonio Rodríguez I Estudiantes de Doctorado: David Aparicio, Bárbara Machado, Luca Martinelli I Técnico de Laboratorio: Mª Queralt Garcia I Estudiante Visitante: Maria Adell (España)

tigación también se centra en el estudio de diferentes tipos de enzimas vinculados al estrés oxidativo.

La RMN y la purificación de estructuras La resonancia magnética nuclear (RMN) es una técnica potente para determinar estructuras tridimensionales a partir de la aplicación de campos magnéticos a disoluciones de proteínas. La técnica permite obtener señales que se correlacionan con las distancias entre átomos para obtener familias de estructuras representativas. El laboratorio de María Macias se ha especializado en el uso de esta técnica para analizar estructuras de proteínas y sus mecanismos de plegamiento. El grupo ha implantado un proceso eficiente de colaboración con otros laboratorios para ayudar a determinar estructuras de proteínas mediante la supervisión y la transferencia de protocolos de

Grupo de Investigación I Jefe de Grupo: María Macias I Estudiantes de Doctorado: Eric Aragón, Albert Escobedo, Nina Görner, Jordi Mas I Estudiante de Máster: Tiago López I Ayudante de Investigación: Pau Martín I Técnico de Laboratorio: Lidia Ruiz

obtención de proteínas puras. Memoria Anual IRB Barcelona 2009 25

Análisis de datos y modelaje de interacciones Las interacciones entre proteínas y otras moléculas se producen a una velocidad tan rápida y a una escala tan pequeña que hacen imposible que se puedan observar directamente. Para poder estudiar este tipo de conexiones es necesario recurrir a modelos teóricos que incorporen información de un gran número de fuentes y que se rijan por los principios básicos de la física y la química. El grupo de Modesto Orozco combina una variedad de métodos –desde el análisis automático de bases de datos biológicos hasta la adaptación de cálculos matemáticos de dinámica clásica y química cuántica- con la finalidad de desarrollar modelos de organismos vivos en el ordenador. El objetivo a largo plazo es conseguir conectar la escala más pequeña de la vida con el comportamiento de las células y con sistemas de mayor tamaño en los organismos.

Grupo de Investigación I Jefe de Grupo: Modesto Orozco I Investigadores Asociados: Agustí Emperador, Josep Lluís Gelpí, Manuel Rueda I Investigadores Postdoctorales: Neva Besker, Oliver Carrillo, Kathryn Collinet, Santiago Esteban, Athi Narayanan, Guillem Portella, Nadine Simone I Estudiantes de Doctorado: Annalisa Arcella, Özgen Deniz, Ignacio Faustino, Óscar Flores, Adam Hospital, Laura Orellana I Ayudantes de Investigación: Jose Alcántara, Carlos Fenollosa, Chiara Lara, Margarita Pedro

Las interacciones débiles, esenciales para la regulación Las células utilizan redes reguladoras para responder a su entorno. Las interacciones en estas redes, que son necesariamente débiles, experimentan cambios constantes. El laboratorio de Miquel Pons utiliza la RMN para analizar qué pasa cuando las proteínas interactúan entre sí o con moléculas pequeñas, como son los medicamentos. Un caso particularmente intrigante es el de las proteínas desordenadas que esconden su potencial de interacción en un caos estructural aparente. La complejidad de estas configuraciones se puede dirigir a través de la modelización estadística en RMN y otras técnicas experimentales. Pons y sus investigadores están desarrollando nuevas herramientas computacionales y de RMN con el objetivo de explorar el espacio químico en moléculas pequeñas que tengan la capacidad de reestructurar complejos de proteínas con finalidades terapéuticas prometedoras.

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Grupo de Investigación I Jefe de Grupo: Miquel Pons I Investigadores Asociados: Pau Bernadó, Jesús García I Investigadores Postdoctorales: Yolanda Pérez, Alejandra Sornosa I Estudiantes de Doctorado: Jascha Blobel, Giovanni Cincilla, Tiago Cordeiro, Carles Fernández, Arola Fortian, Oriol Marimon, Yandi Naranjo I Técnico de Laboratorio: Isabel Latorre I Estudiante Visitante: Lucas Gelain (Brasil)

Programa conjunto IRB Barcelona-BSC El programa de colaboración entre el IRB Barcelona y el Centro Nacional de Supercomputación (BSC) continuó centrando sus esfuerzos en el descubrimiento de nuevos avances en biología computacional. El programa, liderado por los investigadores Modesto Orozco (IRB Barcelona), Patrick Aloy (IRB Barcelona) y Víctor Guallar (BSC), permite a los científicos de las dos instituciones compartir recursos y servicios, así como trabajar conjuntamente para encontrar soluciones bioinformáticas orientadas a desarrollar nuevos proyectos en investigación computacional. Una de las iniciativas de esta colaboración conjunta es el Laboratorio Experimental de Bioinformática (EBL).

Integración experimental y computacional Los avances recientes en el campo de la genómica y las técnicas de alto rendimiento, que se han traducido en una explosión de datos biológicos, ofrecen una oportunidad única para hacer predicciones computacionales de las complejas redes biológicas en los organismos vivos. El EBL, dirigido por Montse Soler, centra su trabajo en integrar la información experimental de modelos in silico creados por biólogos computaciones del Programa de Biología Estructural y Computacional. Las áreas de estudio principales incluyen mapear las posiciones de los nucleosomas en el genoma para varios tipos de levadura, así como la investigación en líneas celulares de mamífero. El EBL también analiza el potencial regulador de las secuencias promotoras candidatas en el genoma humano y busca describir las vías patológicas, a nivel molecular, a partir de la combinación de la biología computacional y las técnicas de descubrimiento interactivas.

Grupo de Investigación I Directora del Laboratorio: Montse Soler I Manager del Laboratorio: Maica López I Investigadores Postdoctorales: Kathryn Collinet, Guillermo Suñé I Estudiantes de Doctorado: Rodrigo Arroyo, Clara Berenguer, Özgen Deniz I Ayudante de Investigación: Chiara Castellazi I Técnico de Laboratorio: Ricart Lluís I Estudiante Visitante: Elisa Duran (España)

Memoria Anual IRB Barcelona 2009 27

Programa de Medicina Molecular

as ciencias biomédicas se encuentran en el umbral de una nueva era en medicina que, en un futuro, debería conducir a la curación del cáncer, la diabetes, las enfermedades neurodegenerativas y una variedad de enfermedades que aún no se pueden combatir con las vacunas, los antibióticos o los fármacos existentes. Los científicos, sin embargo, tienen a su alcance un amplio abanico de herramientas para estudiar el origen de las enfermedades y disponen de nuevos métodos para intervenir en los procesos celulares. La meta para

las próximas décadas es aprender a utilizar estas herramientas, que ya han revolucionado el diagnóstico médico, para poder manipular directamente las moléculas responsables de las enfermedades. El objetivo del Programa de Medicina Molecular es ampliar el conocimiento en estas áreas y encontrar nuevas vías para transformar los nuevos descubrimientos en aplicaciones biomédicas. El programa cuenta con un amplio equipo de expertos en bioquímica, biología molecular y celular, señalización celular y regulación, genómica, genética e inmunología. Las actividades de investigación incluyen el estudio de las bases moleculares de la diabetes, la obesidad, la inflamación, el síndrome metabólico y enfermedades raras, así como la búsqueda de nuevos tratamientos para estas patologías. Los grupos dentro del Programa de Medicina Molecular también centran esfuerzos en las vías de señalización que controlan los procesos celulares, la biología de los macrófagos, los estudios genómicos de las enfermedades, las bases moleculares de las aminoacidurias hereditarias y las bases estructurales de la función transportadora de la membrana.

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Interpretación de señales El laboratorio de Carme Caelles estudia los principios que regulan la interacción entre las vías de señalización más importantes de la acción antiinflamatoria. El grupo estudia los mecanismos implicados en la vía antiinflamatoria de las moléculas, como por ejemplo los glucocorticoides, un tipo de ligando con propiedades antiinflamatorias. El punto de unión entre todas estas moléculas es su capacidad de bloquear la activación de las señales proinflamatorias, como es el caso de las vías de señalización de las proteínas quinasa activadas por estrés. Evitar la activación de este tipo de proteínas, por ejemplo, es clave no solamente para la acción antiinflamatoria de estas moléculas, sino también para otras acciones farmacológicas. Un segundo interés del grupo es el estudio de las proteínas de señalización de la familia NIMA, implicadas

Grupo de Investigación I Jefe de Grupo: Carme Caelles I Investigador Asociado: Joan Roig I Investigador Postdoctoral: Neus Teixidó I Estudiantes de Doctorado: Mª Teresa Bertran, Kader Cavusoglu, Rodrigo Gatica, Jordi Lanuza, Giuseppe Pulice, Laura Regué, Sara Sdelci I Técnico de Laboratorio: Cristina Vila

en la regulación del ciclo de división celular.

Inflamación y macrófagos El grupo de Antonio Celada estudia los macrófagos, un tipo de célula que tiene una función clave en los procesos inflamatorios. En una primera fase, los macrófagos eliminan los microorganismos que se encuentran en el foco inflamatorio y, en una segunda fase, ejercen una actividad antiinflamatoria y ayudan a reparar lesiones. Los macrófagos también desempeñan un papel clave en procesos inflamatorios crónicos, como en el caso de la artritis reumatoide, e inducen a la formación de vasos sanguíneos que promueven el crecimiento de células cancerígenas. Por ello es clave conocer el funcionamiento de estas células y saber potenciarlas cuando son beneficiosas o bloquearlas cuando son perjudiciales. Celada y su equipo de investigadores estudian la señalización que produce la activación de los macrófagos y cómo se regulan los genes que activan las distintas funciones de estas células. El objetivo es encontrar dianas terapéuticas para diseñar fármacos que alteren la actividad de los macrófagos.

Grupo de Investigación I Jefe de Grupo: Antonio Celada I Investigador Asociado: Jorge Lloberas I Investigadores Postdoctorales: Mónica Comalada, Francesc Miró, Luís Santamaría I Estudiantes de Doctorado: Erika Barboza, Selma Pereira, Neus Serrat, Lorena Valverde, Catrin Youssif I

Ayudantes de Investigación: Consol Farrera, Gemma López, Maria Sans I Estudiantes Visitantes: Marta Pedreño (España), Catalina Rincón (Méjico), Judith Rodríguez (España), Damià Romero (España)

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Ingeniería metabólica y terapia de la diabetes La glucosa se almacena en forma de glucógeno principalmente en el hígado y en los músculos. El proceso de síntesis y degradación del glucógeno se ve afectado en enfermedades como la diabetes mellitus y en otras patologías. El laboratorio de Joan J Guinovart estudia la regulación fisiológica del metabolismo del glucógeno y las implicaciones patológicas derivadas de su alteración. El grupo ha descubierto diferencias significativas entre el músculo y el hígado a la hora de procesar el glucógeno, un descubrimiento que puede ser relevante para explicar los defectos en la diabetes. El laboratorio también ha descubierto que las neuronas, a pesar de tener la capacidad de sintetizar glucógeno, lo mantienen bloqueado a través de tres mecanismos, uno de los cuales implica el complejo laforina-malina. Los conocimientos adquiridos contribuirán al desarrollo de estrategias para tratar patologías vinculadas a las alteraciones en el metabolismo del glucógeno como, por ejemplo, la diabetes mellitus, la enfermedad de Lafora y otros estados neurodegenerativos.

Grupo de Investigación I Jefe de Grupo: Joan J Guinovart I Investigadores Asociados: Joaquim Calbó, María del Mar García I Investigadores Postdoctorales: Adelaida Díaz, Jordi Duran, Carlos Rodríguez, Florencia Tevy, Delia Zafra I Estudiantes de Doctorado: Óscar Blanco, Mireia Díaz, Carles Martínez, Laura Nocito, Susana Ros, Isabel Sáez, Felipe Slebe, Jordi Vallès I Ayudante de Investigación: Anna Adrover I Técnicos de Laboratorio: Ester Guerra, Emma Veza I Asistente Administrativo: Carolina Sánchez I Investigador Visitante: Núria de la Iglesia (España) I Estudiantes Visitantes: Marta Moreno (España), Carlos Spichiger (Chile)

Suministro de aminoácidos en el cuerpo El cuerpo necesita un suministro constante de aminoácidos para hacer proteínas. Las células son capaces de producir muchos tipos de aminoácidos a partir de componentes sencillos, pero otros se tienen que extraer a partir de la comida. Para obtener estas moléculas hay que hacerlas pasar a través de la membrana de la célula. El laboratorio de Manuel Palacín estudia este sistema y por qué se vuelve defectuoso en un grupo de enfermedades llamadas aminoacidurias primarias hereditarias (PIA’s). En los últimos 15 años, el grupo ha identificado algunos miembros de una nueva familia de proteínas llamadas HAT’s, que son responsables del transporte de algunos aminoácidos y que sufren alteraciones durante las PIA’s. En la actualidad, los científicos están analizando el papel de las estructuras de HAT para entender cómo realizan las funciones transportadoras. 30 Memoria Anual IRB Barcelona 2009

Grupo de Investigación I Jefe de Grupo: Manuel Palacín I Investigador Asociado: José Luís Vázquez I Investigadores Postdoctorales: Chiara Bartoccioni, Susanna Bodoy, Joana Fort, Lukasz Kowalczyk, Mercè Ratera, Albert Rossell, Eva Valencia I Estudiantes de Doctorado: Meritxell Costa, Gonzalo Delgado, Arturo Rodríguez, Laura Rodríguez I Técnicos de Laboratorio: Susanna Bial, Vanesa Rodríguez, Jorge Seco I Manager de Proyectos: Olga Bausà I Estudiantes Visitantes: Meritxell Espinó (España), Arantzazu Zubeldia (España)

Resistencia a la insulina y nuevas estrategias para terapias contra la diabetes El estilo de vida cada vez más sedentario ha dado como resultado un aumento drástico de los casos de diabetes tipo 2 y otros problemas asociados como la obesidad, la hipertensión y otros síndromes que aumentan la morbilidad y la mortalidad en la población. La combinación de estos desórdenes y la resistencia a la insulina se denomina síndrome metabólico, una condición que afecta a un 40% de las personas de más de 60 años. Estudios recientes sugieren que algunos de estos problemas pueden tener su origen en mecanismos genéticos y celulares comunes. El laboratorio de Antonio Zorzano está tratando de identificar los genes responsables del desarrollo de la resistencia a la insulina asociada a la obesidad o a la diabetes tipo 2. El grupo se centra en genes relacionados con los procesos que se producen en unas estructuras celulares llamadas mitocondrias, en los mecanismos que controlan estos u otros genes y en la identificación de nuevas señales posiblemente implicadas. Otros obje-

Grupo de Investigación I Jefe de Grupo: Antonio Zorzano I Investigadores Postdoctorales: Mª Àngels Díaz, Saska Ivanova, Iliana López, Pablo Muñoz, Deborah Naon, Montserrat Romero, Jana Sánchez, Manuela Sánchez, David Sebastián, Eleonora Sorianello I Estudiantes de Doctorado: Víctor Francis, María Isabel Hernández, Caroline Mauvezin, Eduard Noguera, David Sala, Ana Sancho, Jessica Segalés, Sonia Veiga I Manager de Proyectos: Olga Bausà I Técnicos de Laboratorio: Ignacio Castrillón, Juan Carlos Monasterio I Estudiante Visitante: Guilherme Alves (Brasil)

tivos incluyen entender cómo se transporta la glucosa a las células e identificar nuevos compuestos que podrían ser efectivos para tratar el síndrome metabólico.

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Programa de Química y Farmacología Molecular

a elaboración de nuevos fármacos implica diseñar nuevas moléculas o modificar las ya existentes para conseguir un efecto determinado en las células y en los organismos. En el pasado, la ciencia farmacéutica se basaba en pruebas de ensayo y error para identificar sustancias que ayudasen a tratar los síntomas de una enfermedad y, posteriormente, se utilizaba la química para extraerlas y perfeccionarlas. A menudo, estos procesos se realizaban sin tener conocimientos sobre el funcionamiento de estas sustancias. En la actualidad, los científicos han descubierto cómo actúan un gran número de fármacos. Habitualmente se unen a una proteína concreta o a un complejo molecular alterando su estructura física o sus componentes químicos, un cambio que afecta a la interacción posterior con otras moléculas. Para estudiar y manipular estas interacciones

se utiliza una gran variedad de técnicas, que también están dirigidas a encontrar ‘dianas’ –proteínas que desempeñan un papel clave en el desarrollo de las enfermedades- que al ser manipuladas pueden restablecer el funcionamiento correcto de la célula. El Programa de Química y Farmacología Molecular cuenta con amplios conocimientos y la experiencia necesaria para abordar este nuevo enfoque en el diseño de fármacos. El objetivo es identificar dianas, entender sus funciones y la naturaleza de las interacciones con otras moléculas, así como diseñar o modificar moléculas que puedan influir en su comportamiento. Los grupos del programa sintetizan una extensa variedad de compuestos bioactivos, con especial énfasis en los ácidos nucleicos, los péptidos, las proteínas, los peptidomiméticos y otros compuestos químicos. También utilizan métodos innovadores como la síntesis enantioselectiva, la síntesis de fase sólida de librerías de compuestos bioactivos y las reacciones multicomponente. El objetivo de los grupos es crear sustancias que sean útiles como medicamentos o como herramientas para investigar sistemas biológicos. La investigación se centra en estudiar la interacción entre las dianas y las sustancias candidatas a medicamento. Las técnicas utilizadas son, principalmente, la RMN, la computación y la espectrometría de masas.

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Descubrimiento de nuevos compuestos La investigación en el laboratorio de Fernando Albericio se basa en una potente plataforma química diseñada para dirigir proyectos de química medicinal, con un énfasis especial en cáncer. Los subproyectos metodológicos tienen como objetivo principal alimentar la plataforma química, dilucidar incógnitas científicas y solucionar los problemas que puedan surgir durante la investigación. Uno de los campos de investigación principales del grupo es la síntesis total de productos naturales de origen marino con nuevas estructuras y niveles importantes de bioactividad. Los compuestos con estructuras peptídicas o poliheterocíclicas y la combinación de sistemas peptídicos y heterocíclicos forman parte de los esfuerzos de investigación del grupo. Otro ámbito de estudio es la optimización de la bioactividad y las propiedades de los compuestos a partir de la preparación de librerías basadas en productos naturales.

Grupo de Investigación I Jefe de Grupo: Fernando Albericio I Investigadores Asociados: Mercedes Álvarez, Jan Spengler I Investigadores Postdoctorales: Silvia Cavalli, Judit Tulla I Estudiantes de Doctorado: Tommaso Cupido, Anna Iris Fernández-Llamazares, Peter Fransen, Yésica García, Xavier Just, Laia Miret, Marta Pelay, Elisabet Prats, Pau Ruiz, Lorena Simón, Ramon Subirós, Gemma Vilar, Rubí Zamudio I Ayudantes de Investigación: Gerardo Acosta, Miriam Gongora, Marta Paradís I Estudiantes/Investigadores Visitantes: Carolina Adura (Chile), Simón Guerrero (Chile), Fanny Guzman (Chile)

Fabricación de ADN y ARN artificiales El éxito en el desarrollo de la mayoría de los proyectos científicos depende de la habilidad de los investigadores para crear pequeñas moléculas artificiales de ADN y ARN. El grupo de Ramon Eritja sintetiza estas moléculas a partir de sus subunidades. La investigación del grupo engloba desde la preparación de moléculas complejas de ADN y ARN como fármacos potenciales hasta el uso de estructuras de ADN para construir circuitos a nanoescala. De entre los proyectos de investigación destaca el descubrimiento de bases no naturales para estabilizar estructuras poco comunes de ácidos nucleicos y que pueden ser de utilidad para diseñar fármacos. El laboratorio también centra esfuerzos en el diseño de nuevos derivados de ARN para controlar la expresión génica y en el uso de derivados de ácidos nucleicos en la organización de moléculas y materiales en superficies que pueden ser de interés para desarrollar nuevos mecanismos bioanalíticos.

Grupo de Investigación I Jefe de Grupo: Ramon Eritja I Investigadores Asociados: Anna Aviñó, Carme Fàbrega I Investigadores Postdoctorales: Alejandra Garibotti, Santiago Grijalvo, Sonia Pérez, Montserrat Terrazas I Estudiantes de Doctorado: Margarita Alvira, Rubén Ferreira, Brendan Manning, Sandra Ocampo I Estudiante de Máster: Maria Tintoré

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Diseño y obtención de fármacos El objetivo final del diseño ‘racional’ de fármacos es estudiar la superficie de las proteínas con el fin de diseñar un ligando selectivo muy eficiente que cambie el comportamiento de la proteína en la dirección deseada. El grupo de Ernest Giralt está trabajando para conseguirlo y comprender los principios que dictan cómo las moléculas se reconocen y se enlazan entre sí. El laboratorio centra parte de la investigación en aspectos de difícil resolución como, por ejemplo, hacer que las células acepten sustancias extrañas (medicamentos), encontrar vías para romper el conglomerado de proteínas que se forma en el Alzheimer y en otras enfermedades neurodegenerativas, y conseguir fármacos que puedan cruzar la barrera hematoencefálica. El grupo investiga cómo mejorar los métodos que han de permitir abordar todos los aspectos anteriores: la obtención de información estructural con RMN, cómo mejorar la síntesis de la fase sólida de péptidos y cómo perfeccionar los algoritmos computacionales para descubrir nuevos fármacos.

Grupo de Investigación I Jefe de Grupo: Ernest Giralt I Investigadores Asociados: Natàlia Carulla, Teresa Tarragó, Meritxell Teixidó I Investigadores Postdoctorales: Miguel Moreno, Laura Nevola, Óscar Peña, Soledad Royo I Estudiantes de Doctorado: Muriel Arimon, Xavier Arroyo, Andrey Dyachenko, Michael Goldflam, Anna Guimerais, Bernat Guixer, Nessim Kichik, Abraham López, Morteza Malakoutikhah, Irene Martin, Laura Mendieta, Roger Prades, Silvia Pujals, Rosa Pujol, Laia Sánchez, Bernat Serra I Asistente de Investigación: Esther Zurita I Estudiantes Visitantes: Vinicius Ilha (Brasil), Nathaly Segovia (España)

Desarrollo de métodos sintéticos para compuestos bioactivos El laboratorio de Antoni Riera está trabajando en la creación de nuevos métodos sintéticos necesarios en distintas etapas del desarrollo de fármacos. El grupo tiene un interés especial en la síntesis asimétrica, un enfoque clave porque los procesos estándar para sintetizas moléculas pequeñas producen enantiómeros (moléculas que tienen las mismas propiedades pero que son imágenes espejo unas de otras). Las moléculas biológicas pueden reaccionar de forma muy diferente a los dos tipos de enantiómeros y, por lo tanto, es crucial producir y purificar sólo la versión deseada. Los investigadores también centran esfuerzos en encontrar vías para producir más cantidad de compuestos con interés terapéutico y en crear bibliotecas químicas para hacer cribados biológicos. 34 Memoria Anual IRB Barcelona 2009

Grupo de Investigación I Jefe de Grupo: Antoni Riera I Investigador Asociado: Xavier Verdaguer I Investigador Postdoctoral: Catalina Ferrer I Estudiantes de Doctorado: Nuria Aiguabella, Edgar Cristóbal, Sean Doran, Yi Ning Ji, Thierry León, Pablo Martín, María Moreno, Marc Revés, Ana María Vázquez I Técnico de Laboratorio: Ferran Santacana I Investigador Visitante: Jean-Claude Kizirian (Francia)

En busca de nuevas moléculas bioactivas La preparación de nuevas entidades químicas es el primer paso, y tal vez el más importante, en el proceso de descubrimiento de fármacos. El laboratorio de Màrius Rubiralta trabaja en el desarrollo de tecnologías orientadas a obtener compuestos bioactivos en forma pura. El grupo desarrolla procedimientos sintéticos para conseguir nuevas moléculas polipeptídicas o compuestos heterocíclicos, un tipo de estructuras que se encuentran a menudo en fármacos. El laboratorio también centra parte de la investigación en la descripción de nuevas reacciones multicomponentes basadas en heterociclos, utilizando algunos de los constructos sintéticos como herramienta para separar los enantiómeros y otros productos de alto valor añadido mediante distintas tecnologías como, por ejemplo, la cromatografía. El grupo finalizó sus actividades en el IRB Barcelona en diciembre de 2009.

Grupo de Investigación I Jefe de Grupo: Màrius Rubiralta I Investigadores Asociados: Anna Diez, Rodolfo Lavilla, Cristina Minguillón I Investigadores Postdoctorales: Davide Bello, Rosario Ramon, Javier Ruiz I Estudiantes de Doctorado: Jordi Mas, Anna María Pérez, Sara Preciado, Nuria Rubio, Raquel Sancho, Esther Vicente I Asistente Administrativo: Montse Moreno

Estudio de proteínas con comportamientos inapropiados La investigación llevada a cabo en el laboratorio de Xavier Salvatella tiene como objetivo describir los movimientos de las proteínas y su papel en enfermedades como el Alzheimer, la amiloidosis sistémica y la encefalopatía espongiforme transmisible (enfermedad de Creutzfeldt-Jakob), en las que los agregados proteicos insolubles tienden a acumularse en el tejido de los pacientes. El laboratorio centra parte de su trabajo en la caracterización de las propiedades estructurales de determinadas proteínas desordenadas que están involucradas en estas enfermedades. El grupo también estudia las relaciones entre la estructura y la toxicidad en los agregados que estas proteínas forman en los tejidos de pacientes. Conseguir una descripción en resolución alta

Grupo de Investigación I Jefe de Grupo: Xavier Salvatella I Investigadores Postdoctorales: Santiago Esteban, Robert Fenwick, Maria Francesca Mossuto I Estudiante de Doctorado: Eva De Mol

de estos procesos, que conducen a la aparición de enfermedades, brinda oportunidades para desarrollar nuevos enfoques terapéuticos, unos de los objetivos del grupo. Memoria Anual IRB Barcelona 2009 35

Programa de Oncología

l cáncer se origina cuando fallan los procesos fundamentales que controlan la reproducción, la diferenciación y el comportamiento de las células. El Programa de Oncología tiene por objetivo mejorar el pronóstico, la prevención y el tratamiento del cáncer mediante el estudio de los principios básicos que rigen el desarrollo de la enfermedad. El programa centra la investigación en los diferentes aspectos de la aparición y la progresión de los tumores, con especial énfasis en los mecanismos responsables de la adquisición de malignidad, en la relación entre las

36 Memoria Anual IRB Barcelona 2009

células madre y el cáncer, y en la identificación de los factores que conducen a la metástasis en tejidos específicos. Los grupos de investigación del programa trabajan para crear vínculos estrechos con la parte clínica de la investigación en cáncer. Los acuerdos de colaboración establecidos con varias unidades de oncología y patología de hospitales del área metropolitana de Barcelona facilitan la traducción de la investigación básica en nuevas herramientas diagnósticas y terapéuticas de interés para el ámbito clínico.

Las etapas del cáncer colorrectal El cáncer colorrectal constituye una de las principales causas de muerte por cáncer en todo el mundo. Aunque la mayoría de los tumores colorrectales se inician como lesiones benignas, una pequeña proporción puede evolucionar hasta estadios más malignos si se acumulan mutaciones en genes promotores de cáncer o en genes que normalmente evitan el desarrollo de tumores. El último paso, el más letal en el progreso de la enfermedad, es la migración de células de cáncer colorrectal hacia otros órganos, principalmente el hígado, donde empiezan a desarrollar nuevos tumores. El laboratorio de Eduard Batlle estudia el inicio del cáncer colorrectal y su progresión, desde fases iniciales hasta la formación de tumores agresivos. Para sus estudios, el equipo desarrolla modelos celulares y animales que imitan la versión humana de esta enfermedad devastadora. El objetivo

Grupo de Investigación I Jefe de Grupo: Eduard Batlle I Investigador Asociado: Elena Sancho I Investigadores Postdoctorales: Alexandre Calon, Carme Cortina, Peter Jung, Anna Merlos, Annie Rodolosse, Guiomar Solanas I Estudiantes de Doctorado: Francisco Barriga, Elisa Espinet, Gavin Whissell I Ayudantes de Investigación: Sergio Palomo, Nerea Peiró I Técnicos de Laboratorio: Javier Hernando, Marta Sevillano

final es obtener información que permita diseñar nuevas herramientas diagnósticas y terapéuticas. El grupo de investigación de Elena Sancho se fusionó con el de Eduard Batlle en el año 2009.

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Laboratorio de Metástasis Tumoral (MetLab) Un complejo entramado de redes de señalización en el interior de las células controla su división, diferenciación, movimiento, organización y muerte. Las células cancerígenas desobedecen estas señales durante la progresión del tumor y la metástasis, que es la responsable del 90% de las muertes por cáncer. El interés principal del MetLab, dirigido por Roger Gomis, estriba en la identificación de grupos de genes y sus funciones, cuyo abuso por parte de las células tumorales los convierte en instrumentos para la metástasis. Recientemente se ha observado que algunos de los genes candidatos identificados por el laboratorio se encuentran afectados en muestras de pacientes. Mediante el conocimiento de la combinación de errores biológicos que facilitan la invasión de órganos vitales se podrá atacar eficazmente la enfermedad a través de la combinación de fármacos contra las posibles dianas terapéuticas.

Grupo de Investigación I Director de Gestión del MetLab: Roger Gomis I Director Adjunto del IRB Barcelona: Joan Massagué I Investigador Asociado: Mónica Morales I Estudiantes de Doctorado: Anna Arnal, Milica Pavlovic, Maria Tarragona I Técnico de Laboratorio: Esther Fernández I Manager del Laboratorio: Marc Guiu I Investigadores Visitantes: Xabier Adrian García, Cristina Nadal (miembros del Instituto de Investigaciones Sanitarias IDIBAPS-Hospital Clínic/IRB Barcelona)

La respuesta al daño en el ADN, inestabilidad genómica y cáncer La integridad del genoma se ve amenazada por diversos tipos de daños en el ADN. El reconocimiento de las lesiones del ADN activa la respuesta celular al daño del ADN (DDR), una reacción que desencadena cascadas de transducción de señales que alteran el comportamiento de la célula y promueven la estabilidad genómica. La DDR no sólo evita que el daño del ADN perdure en las células hijas, sino que además desempeña un papel importante en la supresión de tumores. La investigación en el laboratorio de Travis Stracker se centra en el estudio de la DDR y su papel en el mantenimiento de la salud. La inestabilidad genómica y una DDR defectuosa pueden derivar en una mayor predisposición a diferentes tipos de cáncer y a otras enfermedades. El grupo está investigando las vías de señalización que controlan estas reacciones para comprender qué función desempeñan en la supresión de tumores y para identificar maneras de manipularlas con el objetivo de contribuir a nuevas aplicaciones clínicas. El grupo de investigación inició su actividad en el IRB Barcelona en mayo de 2009. 38 Memoria Anual IRB Barcelona 2009

Grupo de Investigación I Jefe de Grupo: Travis Stracker I Investigador Postdoctoral: Maria Ángeles Tapia I Estudiantes de Doctorado: Helena González, Katrin Rein, Irena Stevanovic I Ayudante de Investigación: Suvi Aivio

Plataformas Científicas

a investigación llevada a cabo en el IRB Barcelona cuenta con un amplio abanico de plataformas científicas que ofrecen a los investigadores soporte técnico, acceso a recursos biomédicos de última generación, así como instrumentación y servicios orientados a acelerar los resultados científicos. Las plataformas científicas del IRB Barcelona, equipadas con tecnologías de investigación punteras, ofrecen un amplio repertorio de servicios y técnicas en microscopía digital avanzada, bioestadística, bioinformática,

genómica funcional, espectrometría de masas, expresión de proteínas y modelos de enfermedad a partir de ratones. Los servicios ofrecidos a los investigadores del IRB Barcelona incluyen herramientas para analizar o alterar genes a nivel genómico, acceso a sistemas y técnicas de microscopía digital avanzada de última generación para asistir a los investigadores en el procesamiento y la interpretación de datos, técnicas de espectrometría para identificar un gran número de especies biológicas, herramientas computacionales para facilitar la interpretación de resultados experimentales, técnicas de expresión de proteínas de alto rendimiento para poder llevar a cabo un número elevado de variaciones experimentales en paralelo y la producción de ratones modificados genéticamente destinados a la investigación. La ubicación estratégica de las plataformas científicas dentro del Parque Científico de Barcelona garantiza las sinergias y la eficacia científica en los proyectos de investigación. Además de disponer de plataformas científicas propias, la investigación biomédica desarrollada en el IRB Barcelona también se beneficia de las plataformas y los servicios del Parque Científico de Barcelona, así como de los servicios técnicos de la Universidad de Barcelona.

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Más allá de los límites de la microscopía de luz convencional La Plataforma Científica de Microscopía Digital Avanzada (ADM) ofrece acceso a instrumentos de última generación que van desde la microscopía confocal espectral automática hasta técnicas emergentes para la manipulación celular y la visualización. La ADM pone al alcance de los investigadores un amplio abanico de técnicas necesarias para llevar a cabo todos los pasos de la visualización digital, incluyendo la preparación de muestras, la adquisición de imágenes, el análisis y la interpretación de resultados. La plataforma también dispone de sección óptica en fluorescencia con un sistema confocal espectral, disco giratorio y sistemas de microscopía multifotónica. Otras técnicas específicas que también se están desarrollando incluyen la TIRF, la nanocirugía láser, la microinyección y la microscopía de fluorescencia automática de campo amplio. La ADM también está invirtiendo esfuerzos en desarrollar nuevos instrumentos –como el FRAP de campo amplio combinado, la cirugía láser y la fotoactivación- en colaboración con investigadores del Instituto.

Grupo de Investigación I Jefe de la Unidad: Julien Colombelli I Técnicos de Investigación: Lídia Bardia, Anna Lladó

Transformar cifras en información En la actualidad, los investigadores tienen que hacer frente no sólo al reto de obtener información científica relevante, sino también a la capacidad de extraer la máxima información de valor posible. La estadística ofrece un marco científico riguroso para poner a prueba las hipótesis y para ampliar los conocimientos sobre los sistemas y procesos que generan los datos biomédicos. También sirve para guiar a los investigadores hacia la mejor manera de llevar a cabo sus experimentos para conseguir los objetivos fijados. La Unidad de Bioestadística y Bioinformática da soporte a los científicos en el diseño y el análisis de experimentos biomédicos a partir de herramientas informáticas pioneras y de metodología innovadora. La unidad ofrece a los investigadores una ventaja competitiva mediante el desarrollo de soluciones, que incluyen el desarrollo de nuevas metodologías y programas, orientadas a resolver problemas muy específicos y a acelerar la obtención de resultados. 40 Memoria Anual IRB Barcelona 2009

Grupo de Investigación I Jefe de la Unidad: David Rossell Técnico de Investigación: Evarist Planet

Estudiar el genoma en un único experimento Durante la última década, la biología molecular ha evolucionado del análisis individual de los genes hacia un enfoque más global, dirigiendo los estudios hacia las complejas redes reguladoras que abarcan desde docenas hasta centenares de interacciones entre genes. Para garantizar el éxito de la investigación en este campo, los investigadores necesitan un número creciente de herramientas que les permitan analizar o alterar genes en un ámbito genómico amplio. La Plataforma Científica de Genómica Funcional pone al alcance de la comunidad científica herramientas genómicas de última generación. Estos recursos se engloban en dos categorías: silenciamiento de la expresión génica con ARNsh’s y análisis de transcripción genómica, polimorfismos de ADN e inmunoprecipitación de la cromatina. La plataforma ofrece, en todos los métodos analíticos, un servicio completo que incluye desde la consulta inicial durante el diseño del proyecto hasta el control de calidad de los materiales, el procesamiento de muestras, el análisis inicial de datos, y la interpretación y validación de los resultados.

Grupo de Investigación I Jefe de la Unidad: Herbert Auer I Técnicos de Investigación Senior: Eva González, Silvia Rodríguez

Nuevos caminos en espectrometría de masas La espectrometría de masas, que se ha convertido en una de las herramientas más relevantes de las ciencias biomédicas, tiene un campo de aplicación muy amplio que cubre desde el análisis molecular hasta la caracterización de proteínas. Gracias a su versatilidad, la espectrometría de masas es una tecnología a la que cada vez recurren más científicos. La Plataforma Científica de Espectrometría de Masas ofrece herramientas de cromatografía y espectrometría modernas para identificar y caracterizar una amplia variedad de especies biológicas. La plataforma ha implementado el análisis de proteínas intactas para obtener una caracterización completa y está trabajando en el desarrollo de técnicas proteómicas para cuantificar proteínas y determinar modificaciones posttraduccionales. La plataforma utiliza el apareamiento iónico por MS para estudiar las estructuras macromoleculares y la conformación de proteínas, ácidos nucleicos y sus complejos.

Grupo de Investigación I Jefe en Funciones de la Unidad: Marta Vilaseca I Técnico de Investigación Senior: Claudio Diema I Técnico de Investigación: Nuria Omeñaca

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Ratones transgénicos como herramientas de investigación El ratón transgénico es uno de los modelos más potentes para estudiar enfermedades humanas. El objetivo de la Plataforma Científica de Ratones Transgénicos es poner al alcance de los investigadores esta tecnología, ya sea a través de la obtención de ratones pre-generados, de células madre embrionarias modificadas genéticamente, de vectores diana obtenidos de recursos públicos o de la generación de nuevos modelos transgénicos. La plataforma trabaja para ofrecer un servicio completo que incluya desde el desarrollo y la producción de ratones transgénicos hasta el diseño y construcción de vectores diana de genes y la producción de células madre embrionarias de ratones mediante la inyección de ADN purificado o de células embrionarias en embriones preimplantados. Un aspecto muy importante del trabajo llevado a cabo por la plataforma es la adaptación y la mejora de las tecnologías actuales para aumentar la eficiencia de la producción y ofrecer modelos más complejos.

Solución de los retos proteicos con alto rendimiento Tradicionalmente, los investigadores solían abordar los retos con proteínas a partir de procesos repetitivos de pruebas y rediseños que a menudo eran costosos y requerían mucho tiempo. La Plataforma Científica de Expresión de Proteínas pone al alcance de los investigadores servicios de alto rendimiento que permiten ejecutar en paralelo y de manera simultanea muchas variaciones de un experimento como, por ejemplo, truncamientos o mutaciones de proteínas. Esta capacidad de ejecución de un gran número de variaciones experimentales –generalmente hasta 96- tiene el potencial de reducir de forma significativa el tiempo que se necesita para solucionar problemas con proteínas, un hecho que contribuye a acelerar tanto los resultados experimentales como su publicación. Los métodos de alto rendimiento, aparte del ahorro de tiempo que suponen, también son rentables y pueden reducir de manera significativa el coste de los proyectos llevados a cabo en el laboratorio. 42 Memoria Anual IRB Barcelona 2009

Grupo de Investigación I Jefe de la Unidad: Nick Berrow I Técnico de Investigación Senior: Raquel García I Técnico de Laboratorio: Mª Carmen Romero

MetCentre: Un nuevo centro colaborativo de investigación

unque durante siglos la metástasis ha sido considerada un problema de gran magnitud, los avances que se han realizado en su determinación genética, los mecanismos moleculares y los tratamientos específicos han sido mínimos. Sin embargo, los avances conceptuales y tecnológicos que se han producido recientemente ofrecen una oportunidad sin precedentes para afrontar este problema. En un esfuerzo por desarrollar una nueva estrategia contra la metástasis, el IRB Barcelona creó oficialmente en julio del 2009 una nueva iniciativa que tiene como objetivo ser un vehículo para facilitar y canalizar los recursos y los esfuerzos en investigación sobre las causas, los mecanismos y los posibles tratamientos de la metástasis. El MetCentre reúne a grupos de investigación básica del IRB Barcelona y grupos de investigación clínica y traslacional de hospitales y plataformas tecnológicas de Barcelona para desarrollar investigación conjunta en el área de la metástasis. Los fondos de que disponen para investigación están destinados específicamente a la metástasis. Los objetivos del MetCentre son incorporar y desarrollar tecnología y protocolos multidisciplinarios para descubrir genes y funciones relevantes a nivel clínico para el cáncer y la metástasis, establecer un marco o referente adecuado para canalizar todos los esfuerzos relacionados con la metástasis desde una perspectiva transversal y traslacional, así como contribuir al descubrimiento de nuevos procedi-

mientos para la prevención, diagnóstico y tratamiento de la metástasis. La investigación se está centrando en el estudio del proceso de la metástasis tanto a nivel global como a través de sus componentes individuales: la angiogénesis del tumor, los progenitores procedentes de la médula, la movilidad y adhesión celulares, las interacciones con el microentorno del tumor y las células madre. La convergencia de disciplinas multidisciplinarias identificadas en cinco ramas de investigación del Instituto, Biología Celular y del Desarrollo, Biología Estructural y Computacional, Medicina Molecular, Oncología y Química y Farmacología Molecular, son un vivero adecuado para el lanzamiento de proyectos multidisciplinarios contra la metástasis.

(De izquierda a derecha) Joan J Guinovart, Director del IRB Barcelona, José Montilla, Presidente de la Generalitat de Catalunya, y Joan Massagué, Director Adjunto del IRB Barcelona, durante la presentación oficial del MetCentre en julio del 2009.

Memoria Anual IRB Barcelona 2009 43

Datos del IRB Barcelona Patronato Junta de Gobierno Comité Científico Internacional Fuentes de Financiación Resumen de la Producción Científica Formación Académica Actividades de Transferencia de Tecnología Seminarios Barcelona BioMed Actos Institucionales Actividades de Divulgación El IRB Barcelona en los Medios Organigrama del IRB Barcelona Personal de Dirección y Administración Estadísticas de Recursos Humanos Afiliaciones de los Investigadores Parque Científico de Barcelona Memoria Anual IRB Barcelona 2009 45

Patronato El Patronato del IRB Barcelona, el máximo órgano de gobierno del Instituto, es responsable de supervisar las actividades de investigación, aprobar los fondos operativos y velar por el cumplimiento de los objetivos anuales en investigación. El Patronato, integrado por 11 miembros, está presidido por el Consejero del Departamento de Innovación, Universidades y Empresa de la Generalitat de Catalunya.

Presidente

Miembros

Honorable Sr Josep Huguet Biosca

Joan Roca Acín

Consejero del Departamento de Innovación, Universidades y Empresa, Generalitat de Catalunya

Vicepresidente Primero Honorable Sra Marina Geli Fàbrega Consejera del Departamento de Salud, Generalitat de Catalunya

Vicepresidente Segundo Excelentísimo y Magnífico Dr Dídac Ramírez Sarrió Rector de la Universidad de Barcelona

Director General de Investigación, Departamento de Innovación, Universidades y Empresa, Generalitat de Catalunya

Ramon Moreno Amich Director General del Programa de Centros de Investigación (CERCA), Departamento de Innovación, Universidades y Empresa, Generalitat de Catalunya

Miquel Gómez Clarés Secretario de Estrategia y Coordinación, Departamento de Salud, Generalitat de Catalunya

Carles Miquel Collell Responsable del Programa de Investigación e Innovación en Ciencias de la Salud, Departamento de Salud, Generalitat de Catalunya (desde julio de 2009)

Marta Segura Bonet Secretario General, Departamento de Salud, Generalitat de Catalunya (hasta julio de 2009)

Maria Carme Verdaguer Directora del Centro de Innovación, Fundación ‘Bosch i Gimpera’

Jordi Alberch Vie Vicerector de Investigación, Universidad de Barcelona

Fernando Albericio Palomera Director General, Parque Científico de Barcelona

Roser Artal Rocafort Directora Gerente, Parque Científico de Barcelona

Junta de Gobierno Las responsabilidades principales de la Junta de Gobierno del IRB Barcelona son supervisar las acciones directivas del Instituto, velar por la ejecución y el progreso de las funciones delegadas por el Patronato y promocionar las actividades de investigación. La Junta está actualmente presidida por el Secretario de Estrategia y Coordinación del Departamento de Salud de la Generalitat de Catalunya.

Presidente

Otros Participantes

Miquel Gómez Clarés

Fernando Albericio Palomera

Secretario de Estrategia y Coordinación, Departamento de Salud, Generalitat de Catalunya

Miembros Joan Roca Acín

Director General, Parque Científico de Barcelona

Joan J Guinovart Cirera Director, IRB Barcelona

Margarida Corominas Bosch

Directora de Gestión, IRB Barcelona

Director General de Investigación, Departamento de Innovación, Universidades y Empresa, Generalitat de Catalunya (desde abril de 2009)

Ramon Moreno Amich

Director General de Investigación, Departamento de Innovación, Universidades y Empresa, Generalitat de Catalunya (hasta abril de 2009)

Jordi Alberch Vie

Vicerector de Investigación, Universidad de Barcelona

Memoria Anual IRB Barcelona 2009 47

Comité Científico Internacional El Comité Científico Internacional del IRB Barcelona es responsable de ofrecer asesoramiento estratégico y velar por la calidad científica de los trabajos llevados a cabo por los equipos de investigación del Instituto. El Comité está formado por un grupo de 15 destacados científicos en el campo de la biomedicina.

Miembros Hans Clevers

The Netherlands Institute of Developmental Biology, Utrecht, Países Bajos

Michael Czech

Program in Molecular Medicine, University of Massachusetts Medical School, Worcester, EEUU

Christopher M Dobson

Department of Chemistry and Physics, Cambridge University, Cambridge, Reino Unido

Tim Hunt

Cancer Research UK, Londres, Reino Unido

Fotis C Kafatos

Imperial College London, Londres, Reino Unido

Bernd Meyer

Institute for Organic Chemistry, Hamburg University, Hamburgo, Alemania

Charles J Sherr

Department of Genetics and Tumor Cell Biology, St Jude Children’s Research Hospital, Memphis, EEUU

José Elguero

Bruce Spiegelman

Samuel H Gellman

Karen Vousden

Spanish National Research Council (CSIC), Madrid, España Faculty of Chemistry, University of Wisconsin, Madison, EEUU

David M Glover

Department of Genetics, Cambridge University, Cambridge, Reino Unido

Jan-Ake Gustafsson

Center for Biotechnology, Karolinska Institute, Estocolmo, Suecia

Andrew Hamilton

Department of Chemistry, Yale University, New Haven, EEUU

Robert Huber

Max Planck Institute of Biochemistry, Martinsried, Alemania

48 Memoria Anual IRB Barcelona 2009

Department of Cell Biology, Harvard Medical School, Boston, EEUU Beatson Institute for Cancer Research, Glasgow, Reino Unido

Fuentes de Financiación El IRB Barcelona recibió la mayoría de la financiación para actividades de investigación de la Generalitat de Catalunya, a través del Departamento de Innovación, Universidades y Empresa y del Departamento de Salud. El Instituto también recibió financiación adicional a partir de ayudas competitivas obtenidas, entre otros, del Ministerio español de Ciencia e Innovación y de la Comisión Europea, a través de los fondos FEDER y del 7º Programa Marco. Los investigadores del IRB Barcelona también recibieron apoyo financiero de la Universidad de Barcelona, la Institución Catalana de Investigación y Estudios Avanzados (ICREA), el Consejo Superior de Investigaciones Científicas (CSIC) y distintas redes CIBER.

Financiación Principal

Otras Fuentes de Financiación

Memoria Anual IRB Barcelona 2009 49

Resumen de la Producción Científica Publicaciones Científicas En el año 2009, los investigadores del IRB Barcelona contribuyeron al avance de la investigación biomédica con un total de 171 publicaciones científicas, 78 de las cuales fueron fruto de colaboraciones internacionales con investigadores del sector académico y de la industria. La lista que sigue es una selección de publicaciones representativas de la investigación llevada a cabo durante el 2009.

Aguado F, Díaz-Ruiz C, Parlato R, Martínez A, Carmona MA, Bleckmann S, Ureña JM, Burgaya F, del Río JA, Schütz G and Soriano E. The CREB/CREM transcription factors negatively regulate early synaptogenesis and spontaneous network activity. J Neurosci, 29(2), 328-33 (2009) Alarcón C, Zaromytidou AI, Xi Q, Gao S, Yu J, Fujisawa S, Barlas A, Miller AN, Manova-Todorova K, Macias MJ, Sapkota G, Pan D and Massagué J. Nuclear CDKs drive Smad transcriptional activation and turnover in BMP and TGF-beta pathways. Cell, 139(4), 757-69 (2009) Baños RC, Vivero A, Aznar S, García J, Pons M, Madrid C and Juárez A. Differential regulation of horizontally acquired and core genome genes by the bacterial modulator H-NS. PLoS Genet, 5(6), e1000513 (2009) Blobel J, Bernadó P, Svergun DI, Tauler R and Pons M. Low-resolution structures of transient protein-protein complexes using small-angle X-ray scattering. J Am Chem Soc, 131(12), 4378-86 (2009) Boer DR, Ruíz-Masó JA, López-Blanco JR, Blanco AG, Vives-Llàcer M, Chacón P, Usón I, Gomis-Rüth FX, Espinosa M, Llorca O, del Solar G and Coll M. Plasmid replication initiator RepB forms a hexamer reminiscent of ring helicases and has mobile nuclease domains. EMBO J, 28(11), 1666-78 (2009) Carulla N, Zhou M, Arimon M, Gairí M, Giralt E, Robinson CV and Dobson CM. Experimental characterization of disordered and ordered

50 Memoria Anual IRB Barcelona 2009

aggregates populated during the process of amyloid fibril formation. Proc Natl Acad Sci USA, 106(19), 7828-33 (2009) Casali A and Batlle E. Intestinal stem cells in mammals and Drosophila. Cell Stem Cell, 4(2), 124-27 (2009) Chavey C, Lazennec G, Lagarrigue S, Clapé C, Iankova I, Teyssier J, Annicotte JS, Schmidt J, Mataki C, Yamamoto H, Sanches R, Guma A, Stich V, Vitkova M, Jardin-Watelet B, Renard E, Strieter R, Tuthill A, Hotamisligil GS, Vidal-Puig A, Zorzano A, Langin D and Fajas L. CXC ligand 5 is an adipose-tissue derived factor that links obesity to insulin resistance. Cell Metab, 9(4), 339-49 (2009) Comellas G, Kaczmarska Z, Tarragó T, Teixidó M and Giralt E. Exploration of the one-bead one-compound methodology for the design of prolyl oligopeptidase substrates. PLoS One, 4(7), e6222 (2009) De Las Heras JM, Martinho RG, Lehmann R and Casanova J. A functional antagonism between the pgc germline repressor and torso in the development of somatic cells. EMBO Rep, 10(9), 1059-65 (2009) De Simone A, Richter B, Salvatella X and Vendruscolo M. Toward an accurate determination of free energy landscapes in solution states of proteins. J Am Chem Soc, 131(11), 3810-11 (2009) Español Y, Thut D, Schneider A and De Pouplana LR. A mechanism for functional segregation of mitochondrial and cytosolic genetic codes. Proc Natl Acad Sci USA, 106(46), 19420-25 (2009)

Faustino I, Aviño A, Marzoán I, Luque FJ, Eritja R and Orozco M. Unique tautomeric and recognition properties of thioketothymines? J Am Chem Soc, 131(35), 12845-53 (2009) Gao S, Alarcón C, Sapkota G, Rahman S, Chen PY, Goerner N, Macias MJ, Erdjument-Bromage H, Tempst P and Massagué J. Ubiquitin ligase Nedd4L targets activated Smad2/3 to limit TGF-beta signaling. Mol Cell, 36(3), 457-68 (2009) García-Fandiño R, Granja JR, D’Abramo M and Orozco M. Theoretical characterization of the dynamical behavior and transport properties of alpha,gamma-peptide nanotubes in solution. J Am Chem Soc, 131(43), 15678-86 (2009) González C. Below the convergence. Curr Biol, 19(8), R313-14 (2009) Guerrero-Valero M, Ferrer-Orta C, Querol-Audí J, Marin-Vicente C, Fita I, Gómez-Fernández JC, Verdaguer N and Corbalán-García S. Structural and mechanistic insights into the association of PKCalphaC2 domain to PtdIns(4,5)P2. Proc Natl Acad Sci USA, 106(16), 660307 (2009) Haren L, Stearns T and Lüders J. Plk1-dependent recruitment of gamma-tubulin complexes to mitotic centrosomes involves multiple PCM components. PLoS One, 4(6), e5976 (2009)

Reiriz C, Brea RJ, Arranz R, Carrascosa JL, Garibotti A, Manning B, Valpuesta JM, Eritja R, Castedo L and Granja JR. Alpha,gammapeptide nanotube templating of one-dimensional parallel fullerene arrangements. J Am Chem Soc, 131(32), 11335-37 (2009) Ruiz-Rodríguez J, Spengler J and Albericio F. Siamese depsipeptides: constrained bicyclic architectures. Angew Chem Int Ed Engl, 48(45), 8564-67 (2009) Sancho R and Minguillón C. The chromatographic separation of enantiomers through nanoscale design. Chem Soc Rev, 38(3), 797-05 (2009) Solon J, Kaya-Copur A, Colombelli J and Brunner D. Pulsed forces timed by a ratchet-like mechanism drive directed tissue movement during dorsal closure. Cell, 137(7), 1331-42 (2009) Tajbakhsh S and González C. Biased segregation of DNA and centrosomes: moving together or drifting apart? Nat Rev Mol Cell Biol, 10(11), 804-10 (2009) Torras-Llort M, Moreno-Moreno O and Azorín F. Focus on the centre: the role of chromatin on the regulation of centromere identity and function. EMBO J, 28(16), 2337-48 (2009)

Isidro-Llobet A, Alvarez M and Albericio F. Amino acid-protecting groups. Chem Rev, 109(6), 2455-04 (2009) Liesa M, Palacín M and Zorzano A. Mitochondrial dynamics in mammalian health and disease. Physiol Rev, 89(3), 799-45 (2009) Martínez AM, Schuettengruber B, Sakr S, Janic A, González C and Cavalli G. Polyhomeotic has a tumor suppressor activity mediated by repression of Notch signaling. Nat Genet, 41(10), 1076-82 (2009) Martínez MT, Tseng YC, Ormategui N, Loinaz I, Eritja R and Bokor J. Label-free DNA biosensors based on functionalized carbon nanotube field effect transistors. Nano Lett, 9(2), 530-36 (2009) Mauvezin C, Orpinell M, Francis VA, Mansilla F, Duran J, Ribas V, Palacín M, Boya P, Teleman AA and Zorzano A. The nuclear cofactor DOR regulates autophagy in mammalian and Drosophila cells. EMBO Rep, Epub Dec 4 (2009) Querol-Audí J, Casañas A, Usón I, Luque D, Castón JR, Fita I and Verdaguer N. The mechanism of vault opening from the high resolution structure of the N-terminal repeats of MVP. EMBO J, 28(21), 3450-57 (2009)

Memoria Anual IRB Barcelona 2009 51

Colaboraciones Científicas Los investigadores del IRB Barcelona participaron en un total de 189 colaboraciones externas con socios nacionales e internacionales del sector académico y de la industria. A la cifra se suman 43 colaboraciones internas adicionales, que se llevaron a cabo entre científicos del Instituto con la finalidad de reforzar los trabajos conjuntos entre los diferentes programas de investigación.

Tipos de Colaboraciones

35%

16%

49%

Colaboraciones Externas (Internacionales)

Colaboraciones Internas

Colaboraciones Externas (Nacionales)

Colaboraciones Externas por Sector

36% 47%

Universidades

52 Memoria Anual IRB Barcelona 2009

9% 8% Industria

Institutos/Centros de Investigación

Hospitales/Centros Médicos

Proyectos y Redes de Investigación Los grupos de investigación del IRB Barcelona participaron en un total de 182 proyectos y redes de investigación nacionales e internacionales durante el 2009.

Fuentes de Financiación

31% 2%

16%

51%

Fundaciones Privadas/Industria

Agencia de Gestión de Ayudas Universitarias y de Investigación (AGAUR)

Comisión Europea Gobierno Español

MICINN 41% ISCIII 9% MAEC/AECI 1%

Áreas de Investigación Biología Celular y del Desarrollo

26% 26% Biología Estructural y Computacional

19%

Oncología

Química y Farmacología Molecular

20% Medicina Molecular

Memoria Anual IRB Barcelona 2009 53

Proyectos de Investigación, Redes y Becas de Personal La financiación obtenida por los grupos de investigación a través de proyectos, redes y becas de personal ascendió en el año 2009 a 10.809.116€. La lista siguiente comprende las instituciones que contribuyeron a financiar el IRB Barcelona a partir de proyectos de investigación.

Entidades Financiadoras Entidades Públicas

European Science Foundation (ESF)

Ministerio de Ciencia e Innovación (MICINN)

‘Caixa Catalunya Obra Social’

Comisión Europea (EC)

Fundación FIPSE

Instituto de Salud Carlos III (ISCIII-MICINN)

Leukemia and Lymphoma Society

Agència de Gestió d’Ajuts Universitaris i de Recerca (AGAUR)

Industria

MAEC/AECI - Ministerio de Asuntos Exteriores y de Cooperación

Laboratorios Almirall

European Molecular Biology Organization (EMBO)

Enantia

Ministerio Ciencia Tecnologia e Ensino Superior (Portugal)

Ferrer Group International

Fundaciones

Noscira

Fundación ‘Banco Bilbao Vizcaya Argentaria’

GP Pharm

Fundación ‘Marcelino Botín’

Brainco Biopharma

Fundación ‘La Caixa’

Palau Pharma

Fundación ‘La Marató de TV3’

Ipsen Pharma

Asociación Española contra el Cáncer (AECC)

Hoffmann - La Roche

Fundación ‘Genoma España’

Genmedica Therapeutics

Los grupos de investigación del IRB Barcelona también recibieron soporte financiero de la Institución Catalana de Investigación y Estudios Avanzados (ICREA) y mediante la participación en distintas redes de investigación (CONSOLIDER, CIBERBBN, CIBERDEM, CIBERER, CIBERNED y RETIC). El IRB Barcelona agradece la contribución de los siguientes donantes privados: Julia García Gutiérrez, Marta Luz Adalid, PRONOR SL.

54 Memoria Anual IRB Barcelona 2009

Formación Académica El IRB Barcelona ofrece a los estudiantes de doctorado y a los investigadores postdoctorales de todo el mundo un entorno único, internacional y multidisciplinario donde poder realizar sus trabajos de investigación. En la actualidad, más de 150 estudiantes están realizando sus tesis doctorales en laboratorios del IRB Barcelona, de los cuales 37% son extranjeros y un 56% mujeres. Los estudiantes de doctorado pasan cuatro años en el Instituto llevando a cabo sus proyectos de investigación para obtener el título de doctorado de la universidad a la cual se han inscrito. El IRB Barcelona también cuenta con una comunidad postdoctoral de más de 90 investigadores, de los cuales un 45% son extranjeros. El Instituto ha impulsado una serie de actividades enfocadas a garantizar que estos científicos obtengan el máximo provecho de su estancia en el IRB Barcelona.

n paso importante para la comunidad de estudiantes de

coordinó un conjunto de actividades sociales y formativas des-

doctorado fue la consolidación en el año 2008 del Pro-

tinadas a ofrecer a los estudiantes formación de alto nivel y

grama Internacional de Doctorado “La Caixa”/IRB Barcelona,

orientación en sus carreras, así como a establecer colaboracio-

una iniciativa que representa una fuente de financiación im-

nes entre estudiantes y científicos procedentes de otros grupos

portante para contratar a estudiantes de doctorado de todo

o programas de investigación.

el mundo. Estas becas permiten seleccionar cada año a diez estudiantes con talento a partir de un gran número de soli-

•

Curso Introductorio para Estudiantes de Doctorado. El curso, impartido en septiembre, ofreció a los nuevos estudiantes una introducción a los programas de investigación y las plataformas científicas disponibles en el IRB Barcelona y en el Parque Científico de Barcelona, así como información útil sobre su estancia doctoral.

•

Rotaciones en los Laboratorios. Después de asistir al

citantes internacionales. Concretamente, en el año 2009, un total de 270 estudiantes solicitaron estas becas. En la primavera del 2009, el Instituto impulsó el Programa de Becas de Doctorado del IRB Barcelona, una nueva convocatoria predoctoral. El Instituto concedió un total de cinco becas, que se destinaron a cubrir el vacío financiero en el que a menudo se encuentran los estudiantes durante la transición entre la finalización de sus estudios y la concesión de becas externas. El IRB Barcelona continuó centrando esfuerzos durante el 2009 en la formación de estudiantes de doctorado. El Instituto

curso introductorio, los estudiantes participaron en una serie de rotaciones en los laboratorios del centro para conocer de primera mano las diferentes áreas de investigación y aproximaciones experimentales e interactuar con científicos de otros grupos con el objetivo de impulsar futuras colaboraciones en investigación.

Memoria Anual IRB Barcelona 2009 55

(De izquierda a derecha) Estudiantes de Doctorado del grupo liderado por Antoni Riera, el 1er Simposio de Estudiantes de Doctorado, y la Ministra Garmendia felicitando a Eva Novoa, estudiante de Doctorado, en julio de 2009 durante la ceremonia de entrega de certificados del Programa Internacional de Doctorado ”La Caixa”/IRB Barcelona del 2008-2009.

•

Comité Asesor de Tesis. Desde el inicio de su estancia

Los estudiantes de doctorado del IRB Barcelona, al margen

doctoral en el IRB Barcelona, los trabajos de investiga-

del trabajo de laboratorio, también tuvieron la oportunidad de

ción de los estudiantes son asesorados por un Comité

asistir a seminarios científicos, ‘journal clubs’, conferencias

Asesor de Tesis (TAC, siglas en inglés), un grupo forma-

internacionales, actividades educativas de divulgación, reunio-

do por investigadores internos y externos que se encar-

nes de grupo o de programa, y otras actividades de tipo social

ga de hacer el seguimiento de los progresos científicos

como las sesiones ‘cool off’, la liga de fútbol del IRB Barcelona

de los estudiantes a lo largo de su estancia en el Insti-

y grupos de atletismo y de senderismo. Las actividades desta-

tuto. La función del TAC, que se reúne una vez al año,

cadas durante el año 2009 incluyeron:

es guiar a los estudiantes en sus proyectos de investigación y en otros aspectos vinculados a su tesis doctoral. •

Seminarios de Estudiantes de Doctorado. El ciclo de seminarios, iniciado en septiembre del 2009, es

Programa ‘Footsteps’. El programa, iniciado en el año

una iniciativa de carácter mensual organizada por

2009, tiene como finalidad crear un vínculo de unión

estudiantes de doctorado. Los seminarios, que son

entre nuevos estudiantes y estudiantes de doctorado

impartidos por estudiantes, están dirigidos a toda la

que llevan más de un año trabajando en el IRB Barce-

comunidad de doctorandos del IRB Barcelona.

lona y que actúan como mentores de los nuevos estudiantes. •

•

Consejo de Estudiantes de Doctorado. En diciembre del 2009 se llevaron a cabo las elecciones para renovar a los miembros del Consejo de Estudiantes de Doctorado. Las principales tareas del consejo son la organización de actividades dirigidas a los estudiantes, así como gestionar la comunicación entre la comunidad de estudiantes y la dirección del Instituto.

56 Memoria Anual IRB Barcelona 2009

•

Primer Simposio de Estudiantes de Doctorado. El 1er Simposio de Estudiantes de Doctorado del IRB Barcelona, ‘La Arquitectura de la Vida’, se celebró los días 2 y 3 de noviembre del 2009 en Barcelona. El simposio reunió a más de 100 participantes y conferenciantes punteros de todo el mundo para debatir cuestiones relacionadas con la arquitectura de la vida, impulsar intercambios multidisciplinarios, adquirir nuevos cono-

cimientos y crear las bases para futuras colaboraciones. El acto, organizado en su totalidad por el Comité del Simposio de Estudiantes de Doctorado del Instituto, se celebró en el museo CosmoCaixa de Barcelona.

Tesis Doctorales Los estudiantes de doctorado defendieron en el año 2009 un total de 24 tesis, una vez finalizados sus proyectos de investigación en los laboratorios del IRB Barcelona.

Mercè Ratera, Universidad de Barcelona (2009) Director: Manuel Palacín

Identification and functional properties of mitofusin 2 splice variants Déborah P Naón, Universidad de Barcelona (2009) Director: Antonio Zorzano

Metabolic impact of liver glycogen synthase activation Susana Ros, Universidad de Barcelona (2009) Director: Joan J Guinovart

Nanotechnologies as drug delivery systems

Leticia Hosta, Universidad de Barcelona (2009) Director: Fernando Albericio

Amphipathic proline-rich cell-penetrating peptides: from development to cargo transport

N-Methyl phenylalanine-rich peptides as universal blood-brain barrier shuttles

Caracterització funcional d’HP1c, la isoforma eucromàtica de les proteïnes HP1 de Drosophila

NMR and SAXS studies of protein oligomerization. The effect of arginine and glutamic acid on proteins and their complexes

Characterization of the lysyl-tRNA synthetases from Trypanosoma brucei

Nuevas estrategias para el desarrollo de ligandos peptídicos para la purificación de proteínas por cromatografía de afinidad por medio de bibliotecas combinatorias

Silvia Pujals, Universidad de Barcelona (2009) Director: Ernest Giralt

Joan Font, Universidad de Barcelona (2009) Director: Ferran Azorín

Yaiza Español, Universidad de Barcelona (2009) Director: Lluís Ribas de Pouplana

Design and synthesis of peptides that neutralize bacterial endotoxins as therapeutic agents for the treatment of sepsis Carles Mas, Universidad de Barcelona (2009) Director: Fernando Albericio

El pèptid beta-amiloide (Ab) associat a la malaltia d’Alzheimer: I. Efecte d’inhibidors peptídics en la citotoxicitat d’Ab; II. Reciclatge molecular en fibra d’Ab Laia Sánchez, Universidad de Barcelona (2009) Directores: Ernest Giralt y Natàlia Carulla

Estudios de modelización molecular en solución Ignacio Soteras, Universidad de Barcelona (2009) Director: Modesto Orozco

Estudios estructurales de las relaxasas involucradas en el proceso de conjugación bacteriana Silvia Russi, Universidad Autónoma de Barcelona (2009) Director: Miquel Coll

Functional and structural characterization of the L-arginine/ Agmatine exchanger AdiC. A model for APC transporters

Morteza Malakoutikhah, Universidad de Barcelona (2009) Directores: Ernest Giralt y Meritxell Teixidó

Jascha Blobel, Universidad de Barcelona (2009) Directores: Miquel Pons y Pau Bernadó

Mariela M Marani, Universidad de Buenos Aires (2009) Directores: Fernando Albericio y Osvaldo Cascone

Nuevas estrategias para la síntesis de depsipéptidos Javier Ruiz, Universidad de Barcelona (2009) Directores: Fernando Albericio y Jan Spengler

Papel de alex3 durante el desarrollo de la corteza cerebral Guillermo López, Universidad de Barcelona (2009) Directores: Eduardo Soriano y Ferran Burgaya

Protein structure and dynamics studied by molecular dynamics simulations Tim Meyer, Universidad de Barcelona (2009) Director: Modesto Orozco

Regulación de las E3 ubiquitina ligasas Itch y WWP1 mediante sus dominios WW Begoña Morales, Universidad de Barcelona (2009) Directora: María J Macias

Resolució de l’estructura tridimensional de l’helicas hexamèrica DnaB

Memoria Anual IRB Barcelona 2009 57

Raquel Arribas, Universidad de Gerona (2009) Director: Miquel Coll

Role of EphB receptors in intestinal epithelial cell positioning and colorectal cancer progression Carme Cortina, Universidad Pompeu Fabra (2009) Director: Eduard Batlle

Síntesis de aminoácidos no naturales y aplicación a la síntesis de péptidos con interés farmacológico Rosario Ramón, Universidad de Barcelona (2009) Director: Antoni Riera

Síntesi total de Lamel·larina D i anàlegs de cadena oberta: Aplicacions d’alliberament cel·lular i d’inhibició de topoisomerases Daniel Pla, Universidad de Barcelona (2009) Directores: Fernando Albericio y Mercedes Álvarez

Structural studies on FF domains by NMR spectroscopy Román Bonet, Universidad Autónoma de Barcelona (2009) Directora: María J Macias

The role of TREX1 exonuclease processing of ssDNA and implications on macrophage activation Maria Serra, Universidad de Barcelona (2009) Directores: Antonio Celada y Jorge Lloberas

poración de investigadores postdoctorales internacionales de renombre. La convocatoria, que se abrirá próximamente, prevé incorporar a los primeros científicos en el 2011. Después del éxito alcanzado con el Programa de Doctorado, en el año 2009 también se impulsaron una variedad de iniciativas para contribuir a que la comunidad postdoctoral pueda aprovechar al máximo su estancia en el IRB Barcelona. De entre las actividades impulsadas destaca la creación del Consejo Postdoctoral, un órgano formado por dos miembros representativos de cada programa que tiene como objetivo actuar como punto de conexión con los miembros de la administración del Instituto con el objetivo de organizar actividades y establecer redes de interés para la comunidad postdoctoral. Una de las primeras actividades llevadas a cabo por el Consejo Postdoctoral fue la organización de actividades de formación destinadas a aumentar la interacción y la colaboración entre los miembros de la comunidad. Un ejemplo fue la primera edición de ‘Career Progression in Science’ en diciembre de 2009, una actividad organizada conjuntamente con el Parque

Formación Postdoctoral La formación postdoctoral recibió un nuevo impulso en el año 2009 gracias a la incorporación de cuatro nuevos investigadores postdoctorales, seleccionados a raíz de la convocatoria interdisciplinaria abierta en el año 2008. Se trata de un tipo de convocatoria destinada a promover las colaboraciones entre las distintas áreas de investigación y que requiere que los proyectos científicos de los candidatos se desarrollen haciendo investigación conjunta entre dos programas de investigación del Instituto. Las oportunidades que el IRB Barcelona ofrece a la comunidad postdoctoral aumentarán aún más en el futuro, gracias al Programa Marie Curie de la UE, que destinará durante los próximos cuatro años cerca de un millón de euros a la incor-

58 Memoria Anual IRB Barcelona 2009

Científico de Barcelona y orientada a ofrecer a los científicos más jóvenes nuevas opciones profesionales alternativas al trabajo de laboratorio.

Actividades de Transferencia de Tecnología El Departamento de Innovación y Proyectos Estratégicos se creó en marzo de 2009 para ofrecer asesoramiento a los investigadores y promover la transferencia de tecnología, uno de los objetivos estratégicos del IRB Barcelona. El departamento trabaja conjuntamente con los investigadores en la identificación, protección, desarrollo y comercialización de sus descubrimientos e invenciones para asegurar que la sociedad se pueda beneficiar de la investigación llevada a cabo en el Instituto. En el transcurso del 2009, los investigadores del IRB Barcelona participaron en un conjunto de actividades de investigación que resultaron en la solicitud de ocho patentes internacionales y la publicación de otras cinco (ver la lista adjunta de solicitudes publicadas en el 2009). El interés industrial de los descubrimientos fue fruto de las intensas colaboraciones entre los miembros del Instituto y los sectores biotecnológico y farmacéutico.

Process for the production of pramlintide

Brunner A, Werbitzky O, Varray S, Quattrini F, Hermann H, Strong A, Albericio F, Tulla-Puche J y Garcia Y Nº publicación/fecha: WO2009003666 (8/1/2009)

Salicylated conjugates useful for treating metabolic disorders

García-Vicente S, Marti L, Mayooux E, Mian A, Serrano M y Zorzano A Nº publicación/fecha: WO2009138437 (19/11/2009)

New polymers and their use as fluorescent labels

Aymami J, Albericio F, Avino AM, Farrera J, Royo M y Navarro I Nº publicación/fecha: WO2009007397 (15/1/2009)

Improved antitumoral treatments

Hosta L, Pla M, Cruz LJ, Kogan M y Albericio F Nº publicación/fecha: WO2009095480 (6/8/2009)

Coupling agents for the synthesis of polypeptides and polynucleotides Albericio F, El-Faham A, Luxembourg Y y Ewenson A Nº publicación/fecha: WO2009138985 (19/11/2009)

Seminarios Barcelona BioMed El ciclo de seminarios Barcelona BioMed reunió durante el año 2009 a 139 expertos internacionales en biomedicina para presentar los últimos resultados de sus trabajos de investigación a la comunidad científica local. Los seminarios, que tienen lugar varias veces por semana durante todo el año, sirvieron de plataforma para mantener a los investigadores del IRB Barcelona al día de los últimos avances científicos en biomedicina.

2009 14 de enero I Multifunctional RNA binding proteins: From splicing to miRNA processing and beyond. Sònia Guil, ICO-IDIBELL, Hospitalet de Llobregat, Barcelona, España

16 de enero I Organization of the mitochondrial electron transport

chain in dynamic superstructures. José Antonio Enríquez, Universidad de Zaragoza, Zaragoza, España

21 de enero I Genetic mechanisms that determine morphogenesis

of the vertebrate nervous system. Elisa Martí, Institut de Biologia Molecular de Barcelona, Barcelona, España

23 de enero I Integration of macrophage functions and immune ho-

meostasis by LXR nuclear receptors. Antonio Castrillo, Universidad de Las Palmas de Gran Canaria, Islas Canarias, España

28 de enero I Asymmetric segregation of age during cellular division in

budding yeast. Zhanna Shcheprova, IRB Barcelona, Barcelona, España

30 de enero I Snail controls bone length during fetal development and bone remodelling in the adult. Mª Ángela Nieto, Instituto de Neurociencias, Alicante, España

4 de febrero I High-throughput screening for Sonic Hedgehog pathway inhibitors separating the wheat from the chaff. Tommaso Cupido, IRB Barcelona, Barcelona, España

5 de febrero I Scaffolding proteins at cell junctions, the maguks,

as substrates for proteases during apoptosis. Sãska Ivanova, Jozef Stefan Institute, Ljubljana, Eslovenia

6 de febrero I Oxygen sensing in health and disease. Julián Aragonés,

Hospital La Princesa, Universidad Autónoma de Madrid, Madrid, España

60 Memoria Anual IRB Barcelona 2009

11 de febrero I Role of sub apical region proteins in tracheal deve-

lopment: Dissection of crumbs function. Annalisa Letizia, Institut de Biologia Molecular de Barcelona, Barcelona, España I Applications of dynamic nuclear polarisation for biomolecular NMR. Cristina Gabellieri, IRB Barcelona–UB, Barcelona, España

13 de febrero I The Dioxin Receptor AhR differentially modulates

cell migration in mesenchymal vs epithelial cells: Has AhR a role in the epithelial-to-mesenchymal transition? Pedro M Fernández, Universidad de Extremadura, Badajoz, España

16 de febrero I Role of the ubiquitin conjugation system in the

control of mitochondrial integrity. Mariusz Karbowski, University of Maryland, Biotechnology Institute, Maryland, EEUU I Elucidating signaling events through mass spectrometry-based proteomics. Judit Villén, Harvard Medical School, Boston, EEUU

18 de febrero I TGFbeta: From cytostasis to tumor progression and metastasis. Roger Gomis, IRB Barcelona, Barcelona, España

19 de febrero I A new pro-drug approach based in DPPIV/CD-26

enzyme. María José Camarasa, Instituto de Química Médica (CSIC), Madrid, España

20 de febrero I Glimpses of biomolecular structure and dynamics

through worldwide distributed computing: From protein folding to structure determination. Bojan Zagrovic, Mediterranean Institute for Life Sciences, Split, Croacia

25 de febrero I Ligand recognition of E3 ubiquitin ligases by means

of WW domain interactions. Begonya Morales, IRB Barcelona, Barcelona, España I New model organisms for functional developmen-

tal genetics. Michalis Averof, Institute of Molecular Biology and Biotechnology, Creta, Grecia

Ligand complexes. Celerino Abad Zapatero, University of Illinois, Chicago, EEUU

27 de febrero I Synthesis of natural pyranonaphthoquinones and

27 de marzo I The protein meta-structure: A novel concept for pro-

4 de marzo I Insights into the opening of the Vault complex from

1 de abril I Understanding human disease through protein interac-

related N-containing antibiotics. Norbert De Kimpe, Ghent University, Gante, Bélgica the high-resolution structure of the seven N-terminal domains of MVP. Arnau Casañas, Institut de Biologia Molecular de Barcelona, Barcelona, España I Evi/Wntless reveals betacatenin dependent and independent processes during planarian regeneration. Teresa Adell, Universidad de Barcelona, Barcelona, España

5 de marzo I Different combinatorial methods to obtain ceramide

and dihydroceramide analogues. Santiago Grijalvo, IRB Barcelona, Barcelona, España

6 de marzo I Molecular functions of A P-1 (Fos/Jun) in health and

disease. Erwin Wagner, Centro Nacional de Investigaciones Oncológicas, Madrid, España

11 de marzo I Wnt signalling in intestinal stem cells and colorectal cancer. Eduard Batlle, IRB Barcelona, Barcelona, España I When

DNA can’t find the way home: Crystal structure of MobMin complex with a 26-mer oligonucleotilde. Silvia Russi, IRB Barcelona–IBMBCSIC, Barcelona, España

13 de marzo I Protein complexes, cell organelle assembly and function in cell division pathways. Bodo Lange, Max-Planck Institute for Molecular Genetics, Berlín, Alemania

16 de marzo I Ligand independent traffic of Notch mediates a tu-

mour suppressor activity in Drosophila. Silvia Muñoz, University of Cambridge, Cambridge, Reino Unido

18 de marzo I The c-ABL/P73 signal transduction pathway in Alz-

heimer’s disease and Niemann Pick type C neurodegeneration. Alejandra Álvarez, Universidad Católica de Chile, Santiago, Chile I Functional analysis of domain shuffling in the human parasite Entamoeba histolytica. Manuel Castro de Moura, IRB Barcelona, Barcelona, España I DNA Conformation and biomolecular motors: New nanomedicine research targets. Sonia Trigueros, Oxford University, Oxford, Reino Unido

19 de marzo I Waveguide Interrogated Optical Sensor (WIOS) for

multianalyte screening of antibiotics in milk samples. Maria Pilar Marco, IQAC-CSIC, Barcelona, España

20 de marzo I How voltage controls in conductions in ion channels. Francisco Bezanilla, University of Chicago, Chicago, EEUU

25 de marzo I Exploring novel crystallization methods for target:

tein interaction interference as a new route to drug development. Robert Konrat, University of Vienna, Viena, Austria

tion networks. Andreas Zanzoni, IRB Barcelona, Barcelona, España

I The visualisation of morphogen gradient formation in the deve-

loping Zebrafish embryo. Steve Harvey, University of Cambridge, Cambridge, Reino Unido

3 de abril I Proteomic analysis in cerebrospinal fluid in search for diagnosis biomarkers in Amyotropic Lateral Sclerosis. Jacques Borg, IRB Barcelona, Barcelona, España

8 de abril I A program to determine DNA crystal packing interactions and its applications. Iñaki Martínez, Institut de Biologia Molecular de Barcelona, Barcelona, España

15 de abril I Metabolic remodelling of cancer cells: Structural and

functional characterization of mitochondria in lung cancer. Nadège Bellance, Universiré Victor Segalen, Burdeos, França I Directional migration of neural crest cells. Roberto Mayoor, University College London, Londres, Reino Unido

17 de abril I Discovery of small molecule ligands via virtual scree-

ning and NMR: Targeting human telomerase RNA. Thomas L James, University of California, San Francisco, EEUU

22 de abril I The megabladder mouse: A genetic model of congenital obstructive nephropathy and bladder smooth muscle development. Kirk M McHugh, Nationwide Children’s Hospital, Columbus, Ohio, EEUU

23 de abril I Effective GDNF brain delivery using microspheres. A promising strategy for Parkinson’s disease. María Blanco-Prieto, UnIversidad de Navarra, Pamplona, España

24 de abril I The interplay between TNF and glucocorticoid receptor determines lethal outcome in inflammatory shock models in mice. Claude Libert, Department of Molecular Biomedical Research, Ghent University, Gante, Bélgica

29 de abril I Genome-wide RNAi screen identifies multiple regulators of HIF in Drosophila. Andres Dekanty, IRB Barcelona, Barcelona, España I Novel applications for mass spectrometry. Marta Vilaseca, IRB Barcelona, Barcelona, España

6 de mayo I High-throughput screening for Sonic Hedgehog pathway inhibitors separating the wheat from the chaff. Tommaso Cupido, IRB Barcelona, Barcelona, España

7 de mayo I Development of a novel series of potent, selective and

orally bioavailable HDAC inhibitors with anti-tumor activity. Laura Llauger, IRBM-Merck, Pomezia, Italia

8 de mayo I Structural, biochemical, biological and technological

studies on the insect virus TrV. Diego MA Guerin, CSIC-UPV/EHU, Leioa, España

13 de mayo I Pushing structural details into the yeast interactome by high-throughput protein docking experiments. Roberto Mosca, IRB Barcelona, Barcelona, España I A developmentally regulated two-step process generates a non-centrosomal microtubule network in Drosophila trachea. Veronique Brodu, Institut Jacques Monod, CNRS, París, Francia

15 de mayo I Molecular puzzles: Learning about function and mechanism of enzymes from their structures. Alexander Wlodawer, National Cancer Institute-Frederick, Frederick, EEUU

20 de mayo I Cell competition, growth and size control in the Dro-

sophila wing imaginal disc. Salvador C Herrera, CSIC-UAM, Madrid, España

21 de mayo I Rational drug design for DNA repair mechanism as adjuvant in chemotherapy. Mª Carme Fàbrega, IRB Barcelona, Barcelona, España

22 de mayo I Of kinetochores and centrosomes: Mechanisms of

mitotic spindle assembly. Alexey Khodjakov, University College London, Londres, Reino Unido

26 de mayo I Functions of the proteasome: From protein degrada-

tion and immune surveillance to cancer therapy. Alfred Goldberg, Harvard Medical School, Boston, EEUU

27 de mayo I Zebrafish models for human disease: Skin and bones. Matthias Hammerschmidt, Cologne University, Colonia, Alemania

28 de mayo I Forces for cell sheet morphogenesis: Drosophila’s

dorsal closure as a model system. Dan Kiehart, Duke University, Durham, EEUU

29 de mayo I Microtubule kinetochore attachment and the regula-

tion of mitotic progression. Claudio Sunkel, Institute for Molecular and Cell Biology, Oporto, Portugal

62 Memoria Anual IRB Barcelona 2009

3 de junio I A role of receptor Notch in ligand cis-inhibition in Drosophila. Isabelle Becam, IRB Barcelona, Barcelona, España

4 de junio I Structural/function studies of α-synuclein and p75NTR. Marzoal Vilar, Centro Nacional de Investigaciones Oncológicas, Madrid, España

5 de junio I Coupling of transcription and mRNA processing, a brief summary. Carles Suñé, Instituto de Parasitología y Biomedicina ‘López Neira’, Granada, España

10 de junio I CD98hc: A dual function protein that mediates tumorigenesis? Chloé Feral, Université Nice Sophia Antipoli, Niza, Francia

I Essential roles for microRNAs in stem-cell maintenance in the

early mouse embryo. Tristan Rodríguez, Hammersmith Hospital, Londres, Reino Unido

11 de junio I Single amino acid substitution in Plasmodium yoelii

erythrocyte ligand determines its localization and controls parasite virulence. Osamu Kaneku, Institute of Tropical Medicine NEKKEN, Nagasaki, Japón

12 de junio I The dark side of tissue plasminogen activator: Role in

pancreatic cancer and Alzheimer’s disease. Pilar Navarro, Instituto de Investigación del Hospital del Mar (IMIM), Barcelona, España

17 de junio I Polycomb proteins in development and disease. Gia-

como Cavalli, Institut de Génétique Humaine, CNRS, Montpellier, Francia I Aptamer-facilitated biomarker discovery (AptaBiD) for cells. Sergey Krylov, York University & Centre for Research on Biomolecular Interactions, Toronto, Canadá

18 de junio I Cyclic peptides with inhibitory activity on integrin-

ligand binding. Soledad Royo, IRB Barcelona, Barcelona, España

1 de julio I MicroRNAs and growth control. Héctor Herranz, IRB Barcelona, Barcelona, España

3 de julio I Neurodegeneration and molecular therapy in Frie-

dreich’s ataxia. Javier Díaz-Nido, Departamento de Biología Molecular & Centro de Biología Molecular ‘Severo Ochoa’, Madrid, España

8 de julio I Crystal structure of a prokaryotic lipoxygenase: An

unpredicted domain and an unexpected substrate. Xavi Carpena, IRB Barcelona-IBMB-CSIC, Barcelona, España I Structural and functional studies of American conotoxins. Frank Mari, Florida Atlantic University, Florida, EEUU I A role for plant steroid hormones in stem cell and vascular patterning. Ana Caño, Institut de Recerca i Tecnologia Agroalimentàries-CSIC, Barcelona, España

9 de julio I Centriole biogenesis and evolution. Mónica Bettencourt, Instituto Gulbenkian de Ciência, Lisboa, Portugal I Development of

a fluorescent activity-based probe for profiling autotaxin in serum. Silvia Cavalli, IRB Barcelona, Barcelona, España

10 de julio I Structural biological inorganic chemistry reveals

mechanistic insights into the heme oxygenase catalysis. Masao Ikeda-Saito, Tohoku University, Sendai, Japón I Novel mechanistic and functional insights in the ubiquitin-like SUMO system. Stephan Muller, Max-Planck Institute of Biochemistry, Munich, Alemania

15 de julio I The oncogenic protein cortactin: A molecular switch

between cellular and bacterial motility. Narcisa Martínez, Universidad Complutense de Madrid, Madrid, España

16 de julio I Understanding amyloid beta-peptide aggregation.

Muriel Arimon, Institut de Bioenginyeria de Catalunya-IRB Barcelona, Barcelona, España I Signal integration by p38 MAPKs and CDKs. Angel R Nebreda, Centro Nacional de Investigaciones Oncológicas, Madrid, España

17 de julio I Converting pluripotent stem cells to blood -HOXB4 mediated stem cell tuning. Hannes Klump, University Hospital Essen, Essen, Alemania

22 de julio I Enjoying the sun: Mechanism of UV-damage detection

by the UVDDB complex. Nicolas Thoma, Friedrich Miescher Institute for Biomedical Research, Basilea, Suiza

17 de septiembre I Molecules in small spaces. Agustí Lledó, Skaggs Institute for Chemical Biology, La Jolla, EEUU

23 de septiembre I Searching Drosophila for new genes involved in wound healing. Antonio Jacinto, Universidade de Lisboa, Lisboa, Portugal

25 de septiembre I Fluorescence microscopy meets structural biology to study biomolecular complexes. Claus AM Siedel, HeinrichHeine-Univesität, Düsseldorf, Alemania

30 de septiembre I Bioinformatics analysis of imaginal discs regeneration. Enrique Blanco, Universidad de Barcelona, Barcelona, España

5 de octubre I Confident assignment of post-translational modifications using top-down mass spectrometry. Julian Whitelegge, The NPI-Semel Institute, UCLA, Los Angeles, EEUU

7 de octubre I Polarity orientation memory in neuroblasts. Jens Januschke, IRB Barcelona, Barcelona, España I Modeling oncogene dependence in 3D cell culture systems and mice. Martin Jechlinger, Memorial Sloan-Kettering Cancer Center, Nueva York, EEUU

8 de octubre I Protein dynamics from restrained ensemble molecu-

lar simulations. Robert Fenwick, IRB Barcelona, Barcelona, España

24 de julio I Novel antitumoral targets within the ERK pathway. Pie-

9 de octubre I Dispersing a crowd: Signaling mechanisms controlling

9 de septiembre I Patched degradation and its role in the interpre-

14 de octubre I Aldo-keto reductases of mice ande men: Towards

ro Crespo, Instituto de Biomedicina y Biotecnología de Cantabria, Santander, España tation of the Hedgehog morphogen gradient. Andreu Casali, IRB Barcelona, Barcelona, España

10 de septiembre I Synthetic alpha-helix peptidomimetics for the

inhibition of protein-protein interactions. Laura Nevola, IRB Barcelona, Barcelona, España

14 de septiembre I Design and chemical synthesis of antiviral peptides targeted to structural and/or functional domains: Assembly of Infectious Pancreatic Necrosis virus (IPNV) as a model system. Sergio H Marshall, Pontificia Universidad Católica de Valparaíso, Valparaíso, Chile

15 de septiembre I What is chloride doing to the neurotransmitter

transporters? Baruch Kanner, Hebrew University of Jerusalem, Jerusalén, Israel I The GAIT system: A gatekeeper of inflammatory gene expression. Paul Fox, Lerner Research Institute, Cleveland, EEUU

16 de septiembre I Metabolic consequences of lack of Caveolin-1 in mice. Manuel Fernández, Queensland University, Queensland, Australia

social behavior in bacteria. Holger Sondermann, Cornell University, Ithaca, EEUU

murine models for human cancers. Pedro Velica, University of Birmingham, Birmingham, Reino Unido I p63 Mediates cellular senescence in cancer and aging. Bill Keyes, Centro de Regulación Genómica, Barcelona, España I Functional characterization of VP3, the multitasking protein of Infectious Bursal Disease Virus. Idoia Busnadiego, CNB-CSIC, Madrid, España

16 de octubre I Balancing self-renewal and differentiation: Re-

gulation of symmetric and asymmetric division in the Drosophila nervous system. Andrea Brand, Cambridge University, Cambridge, Reino Unido

21 de octubre I Study of the serylation system in Drosophila melanogaster. Tanit Guitart, IRB Barcelona, Barcelona, España I Crystal

structures of avian reovirus and porcine adenovirus proteins. Pablo Guardado, Universidad de Santiago de Compostela, Santiago de Compostela, España

22 de octubre I Coupling mitotic checkpoint control to aneuploidy

and cancer. Rocío Sotillo, Memorial Sloan-Kettering Cancer Center, Nueva York, EEUU

Memoria Anual IRB Barcelona 2009 63

23 de octubre I Role of Parkin and Pink1 in mitochondrial quality

control. Richard J Youle, National Institute of Neurological Disorders and Stroke, Bethesda, EEUU I The multifaceted role of circulating endothelial cells and progenitors in cancer. Francesco Bertolini, Istituto Europeo di Oncologia, Milán, Italia

26 de octubre I Obesity-induced inflammation in T2D and CVD:

Pathogenic mediator and pharmacologic target. Steven E Shoelson, University of Harvard, Boston, EEUU

28 de octubre I The physical forces behind collective cell migrati-

on: Where is the leader? Xavier Trepat, Institut de Bioenginyeria de Catalunya, Barcelona, España I Expression and purification trials of a membrane protease. Núria Cerdà, Institut de Biologia Molecular de Barcelona, Barcelona, España I Structural, mechanistic and functional analysis of c-Abl/Bcr-Abl and its tyrosine kinase inhibitors. Oliver Hantschel, Research Center for Molecular Medicine, Viena, Austria

30 de octubre I Crystal structure of a 1 MDa protein complex essential for microtubule growth. Guillermo Montoya, Centro Nacional de Investigaciones Oncológicas, Madrid, España I Genetic code reprogramming for the ribosomal expression of natural productlike non-standard peptides. Hiroaki Suga, University of Tokyo, Tokio, Japón

4 de noviembre I Effects of HDACIs in proliferation and apoptosis

of human leukaemia cell lines: Role of Annexin A1 and its membrane localization. Walter d’Acunto, Università degli Studi di Salerno, Salerno, Italia I Planarian stem cells: A proteomic screening for novel neoblast genes. Gustavo Rodríguez, Universidad de Barcelona, Barcelona, España I Role of High Mobility Group (HMG), chromosomal proteins in cancer. MR Rajeswari, All India Institute of Medical Sciences, Nueva Delhi, Índia

5 de noviembre I A CPEB-mediated translational control circuit

regulates meiosis, mitosis and tumour development. Raúl Méndez, Centro de Regulación Genómica, Barcelona, España I Towards a universal BBB-shuttle: Evaluation of a first library of potential peptidic BBB-shuttles using different in vitro tools. Roger Prades, IRB Barcelona, Barcelona, España

6 de noviembre I Molecular regulation of glucose uptake and storage in muscle. Kei Sakamoto, University of Dundee, Dundee, Reino Unido

11 de noviembre I Electrophoresis NMR—a tool for the determina-

tion of the charge of molecules. Ulrich Scheler, Leibniz Institute for Polymer Research, Dresden, Alemania I SOCS36E specifically interferes with Sevenless RTK during Drosophila eye development. Isabel Almudí, Universidad de Barcelona, Barcelona, España

13 de noviembre I Monolithic polymers: Present state-of-the-art

and future trends. Frantisek Svec, EO Lawrence Berkeley National

64 Memoria Anual IRB Barcelona 2009

Laboratory, Berkeley, EEUU

16 de noviembre I A new approach to induce tissue specific loss-offunction in Drosophila melanogaster. Nirmal Lorensuhewa, Australian National University, Canberra, Australia

18 de noviembre I Protein folding mechanisms reloaded. Athi Narayan, IRB Barcelona, Barcelona, España I Epigenetics speaks up for silent DNA. Miguel Peinado, Institut de Medicina Predictiva i Personalitzada del Càncer (IMPPC), Barcelona, España

20 de noviembre I Aicardi-Goutières syndrome and related phenotypes: Linking nucleic acid metabolism with autoimmunity. Yanick Crow, St Mary’s Hospital, Manchester, Reino Unido

25 de noviembre I Cell-ECM interactions mediated by integrins

regulate the proliferation-to-differentiation switch. Mª Dolores Martín-Bermudo, Universidad Pablo de Olavide, Sevilla, España I AFM studies on the mechanical resistance of proteins: effects of small ligand binding. Albert Escobedo, IRB Barcelona, Barcelona, España

26 de noviembre I NMR in drug discovery: Finding new prolyl oli-

gopeptidase inhibitors. Teresa Tarragó, IRB Barcelona, Barcelona, España

27 de noviembre I Dynamic polymers for targeted RNA and DNA

cancer therapy. Ernst Wagner, University Munich, Munich, Alemania

2 de diciembre I Smad-dependent and independent signalling in

osteoblast biology. Francesc Ventura, Universidad de Barcelona, Barcelona, España I Structural approaches to a system of mitochondrial proteins. Maria Solà, Institut de Biologia Molecular de Barcelona (IBMB-CSIC), Barcelona, España

3 de diciembre I Probing protein folding on the ribosome using NMR

spectroscopy. Shang-Te Danny Hsu, Cambridge University, Cambridge, Reino Unido

4 de diciembre I Natural selection in the XXI century and the emergence of evolutionary systems biology. Jaume Betranpetit, Institut de Biologia Evolutiva (UPF-CSIC), Barcelona, España

16 de diciembre I Physiological implications of the loss of TIF1a

in nuclear receptor signalling control. Johan Tisserand, Institut de Génétique et de Biologie Moléculaire et Cellulaire, Illkirch, França I Novel peptide-mediated interactions derived from highresolution 3-dimensional structures. Amelie Stein, IRB Barcelona, Barcelona, España

18 de diciembre I Molecular and functional characterization of

carnitine acyltransferases and its role against insulin resistance. Fausto Hegardt, Universidad de Barcelona, Barcelona, España

Actos Institucionales Conferencias Barcelona Biomed Más de 450 científicos de todo el mundo viajaron a Barcelona en el 2009 para participar en los actos organizados dentro del ciclo de Conferencias Barcelona Biomed. En su cuarto año, la serie ha seguido ganando prestigio internacional gracias a la capacidad de reunir a científicos de experiencia mundial para debatir las últimas novedades científicas en distintas áreas de la biomedicina. Organizadas por el IRB Barcelona con el apoyo de la Fundación BBVA, las conferencias del 2009 contaron con la participación de ponentes internacionales en química, biología celular y del desarrollo, oncología, genética y proteómica. Las conferencias se celebran en el corazón de la ciudad de Barcelona, en la sede del Institut d’Estudis Catalans.

20-22 de abril de 2009 I The DNA-Proteome: Recent Advances Towards Establishing the Protein-DNA Interaction Space Organizadores: Herbert Auer (IRB Barcelona) y Erich Grotewold (Ohio State University, Estados Unidos)

14-16 de septiembre de 2009 I Modelling Cancer in Drosophila

26-28 de octubre de 2009 I Peptide Engineering: Therapeutic Peptides Fifth Peptide Engineering Meeting (PEM5) Organizadores: Ernest Giralt (IRB Barcelona) y Claudio Toniolo (University of Padua, Italia)

Organizadores: Cayetano González (IRB Barcelona) y Helena Richardson (Peter Mac Research, Melbourne, Australia)

Memoria Anual IRB Barcelona 2009 65

Talleres Científicos Barcelona BioMed Estas actividades son un importante mecanismo de formación para los científicos que se encuentran en distintas etapas y categorías profesionales, ya que sirven para mantenerlos al día de las últimas tecnologías y técnicas disponibles en las distintas áreas de especialización. Los profesores y coordinadores de los talleres, profesionales que provienen de la investigación básica y de la industria, ofrecieron tanto conocimientos teóricos como sesiones prácticas para grupos reducidos de participantes. Los temas cubrieron un amplio abanico de materias en investigación básica y aplicada. Los Talleres Científicos Barcelona BioMed del 2009 consistieron en: 19-20 de noviembre de 2009 I Spine 2-Complexes Teach SG

workshop: Advanced Strategies for the Expression of Proteins and Protein Complexes in Yeast Organizadores: Miquel Coll (IRB Barcelona y IBMB-CSIC), Maria Armenia Carrondo (ITQB, Oeiras, Portugal), Ma Cristina Vega (CIBCSIC, Madrid), Albert Canals (IRB Barcelona y IBMB-CSIC)

14 de diciembre de 2009 I Media Training for Sci-

entists Presentado per Claire Ainsworth y Clare Wilson (SciConnect, Reino Unido)

Fórum Barcelona BioMed 11 de noviembre de 2009 I Barcelona BioMed Forum on ‘Creativity,

Science and Art’

El Fórum Barcelona BioMed en ‘Creatividad, Ciencia y Arte’, celebrado el 11 de noviembre de 2009, reunió a un selecto grupo internacional de científicos, artistas y teóricos para hablar de la simbiosis entre arte y ciencia. ¿Qué es ciencia y qué es arte? ¿Cómo se aproximan a la naturaleza? ¿Qué tienen en común y en qué difieren? ¿Qué papel reservan a la creatividad y a la intuición sus protagonistas? Conocimiento, belleza y enigma son conceptos asociados a ambas actividades pero, ¿en qué proporción? El fórum fue diseñado para conjugar información, entretenimiento y participación, con la combinación de conferencias y debates, exposiciones y sesiones creativas. También se pudo ver una muestra de 15 dibujos e imágenes de la muestra ‘Paisajes Neuronales’, cedida por el museo CosmoCaixa, que incluía composiciones realizadas por el neurocientífico Ramón y Cajal. Acompañando las 15 reproducciones, los miembros de la comunidad científica del IRB Barcelona expusieron sus propias obras, así como trabajos de artistas locales. El fórum estuvo precedido por una ‘Residencia de Artistas’. Tres artistas seleccionados trabajaron un día entero en los laboratorios del IRB Barcelona para conocer de cerca algunas de las técnicas utilizadas en la investigación biomédica actual. El objetivo final era proveerlos de las herramientas de la ciencia para inspirar proyectos futuros.

66 Memoria Anual IRB Barcelona 2009

1er Simposio de Estudiantes de Doctorado del IRB Barcelona 2-3 de noviembre de 2009 I 1er Simposio de Estudiantes de Doctorado del IRB Barcelona: ‘La Arquitectura de la Vida’

Organizadores: Comité del Simposio de Estudiantes de Doctorado del IRB Barcelona El Simposio de Estudiantes de Doctorado del IRB Barcelona es una iniciativa que reúne a estudiantes de doctorado e investigadores punteros de todo el mundo para presentar y debatir cuestiones de actualidad en el ámbito de las ciencias biomédicas. El primer acto de este ciclo, ‘La Arquitectura de la Vida’, exploró tópicos actuales de la investigación, con temas que incluyeron desde la exploración del ADN, el ARN y las proteínas, hasta los tejidos y los organismos, tanto en estados de salud óptimos como en procesos de enfermedad. El acto contó con ocho ponentes de renombre procedentes de distintos campos biomédicos y con más de 100 participantes, algunos de los cuales también tuvieron la oportunidad de presentar su investigación a través de ponencias y pósters. La conferencia se celebró en el museo CosmoCaixa de Barcelona.

Actividades del MetCentre El MetCentre, una nueva plataforma multidisciplinaria para la investigación en metástasis creada por el IRB Barcelona en julio de 2009, celebró durante el año las siguientes reuniones de colaboración: 27 de octubre de 2009 I Deconstructing Metastasis

Ponente: Joan Massagué, Memorial Sloan-Kettering Cancer Center (Nueva York, EEUU)

23 de diciembre de 2009 I Intestinal Stem Cell Genes in Colorectal Cancer Progression and Relapse Ponente: Eduard Batlle, IRB Barcelona

Actos de colaboración El IRB Barcelona organizó durante el 2009, en colaboración con otras instituciones, los siguientes actos:

22 de enero de 2009 I Cancer Research Meeting

Organizadores: Instituto de Investigaciones Sanitarias Clínic-IDIBAPS y IRB Barcelona

26 de marzo de 2009 I Neuroscience Research Meeting

Organizadores: Instituto de Investigaciones Sanitarias Clínic-IDIBAPS y IRB Barcelona

6 de abril de 2009 I Towards Gender Balance

Organizadores: IRB Barcelona y SET-Routes University Ambassador Programme (EMBL, EMBO, CERN)

18-19 de junio de 2009 I Research on Metabolic, Hepatic and

Digestive Diseases Meeting Organizadores: Instituto de Investigaciones Sanitarias Clínic-IDIBAPS y IRB Barcelona

23-25 de noviembre de 2009 I Expanding the Frontiers of Molecu-

lar Dynamics Simulations in Biology Organizadores: IRB Barcelona y Centro Nacional de Supercomputación

3 de diciembre de 2009 I Career Progression in Science - Options Beyond the Bench Organizadores: IRB Barcelona y Parque Científico de Barcelona

9 de diciembre de 2009 I Research on Infectious, Immunological

Diseases and International Health Meeting Organizadores: Instituto de Investigaciones Sanitarias Clínic-IDIBAPS y IRB Barcelona

9-11 de diciembre de 2009 I Critical Assessment of PRedirect

Interaction (CAPRI) 4th Evaluation Meeting Organizadores: IRB Barcelona y Centro Nacional de Supercomputación

Memoria Anual IRB Barcelona 2009 67

Actividades de Divulgación Los investigadores del IRB Barcelona participaron durante el 2009 en distintas actividades de divulgación organizadas por el Parque Científico de Barcelona. Las jornadas tuvieron como objetivo acercar la ciencia a los estudiantes para motivarlos a emprender carreras científicas.

Fes Recerca! Un ciclo de talleres destinados a estudiantes y al público general

13 de enero-14 de mayo I 3 de noviembre-17 de diciembre de 2009

Participantes: Muriel Arimó, Elisabeth Castellanos, Consol Farrera, Anna Guimerals, Ana Janic, Leire Mendizábal, Irene Martín, Miguel Moreno, Mónica Pascual, Maria Serra, Lorena Valverde y Esther Zurita Tópicos: Analiza ADN y descubre al autor de un crimen; moscas con cáncer

Recerca a Primària Una actividad de investigación bimensual para acercar la ciencia a alumnos de primaria mediante experimentos científicos

Enero-diciembre de 2009

Marta Llimargas, Laura Mendieta, Nuria Molist, Sara Preciado, Sonia Saborit, Manuela Sánchez, Sarah Sherwood, Eleonore Sorianello, Mónica Torras, Emma Veza, Esther Vicente y Marta Vilaseca

Passa l’Estiu al Parc! Un programa dirigido a estudiantes en los últimos años de carrera centrado en la participación activa en proyectos del PCB

1 de julio-31 de septiembre de 2009 Participantes (tutores): Patrick Aloy, Antonio Celada, Albert Canals, Miquel Coll, Alfred Cortés, Ernest Giralt, Cristina Minguillón, Modesto Orozco, Miquel Pons, Lluis Ribas de Pouplana, Antoni Riera y Xavier Salvatella

Participantes: Carme Cortina y Elisa Espinet

Recerca a Secundària

Tópicos: Introducción al método científico, extracción de ADN, células madre y análisis al microscopio

Una actividad académica orientada a dar soporte científico a los alumnos de secundaria en sus trabajos de investigación

Julio de 2009-marzo de 2010

Fira Recerca en Directe Una feria parar presentar los últimos avances científicos en Barcelona

15-16 de abril de 2009 Participantes: Noelia Camacho, Manuel Castro, Carme Cortina y Sergio Palomo Tópicos: Cáncer de colon. ¿Qué es y qué podemos hacer? Cómo encontrar nuevos medicamentos para combatir los parásitos

‘Kids Day’ en el IRB Barcelona Una actividad organizada por el IRB Barcelona para acercar la ciencia a los más pequeños

29 de junio de 2009

Voluntarios: Anna Adrover, Anna Arnal, Lydie Babin, Elisenda Buti, Jorge Domínguez, Meritxell Gavaldà, Anna Guimerais, Xavier Just,

68 Memoria Anual IRB Barcelona 2009

Participantes: Ana Janic, Thierry Leon, Irene Martín, Carles Martínez, Maria Moreno, Laura Nocito, Neus Rafel, Lídia Ruíz, Isabel Sáez, Pablo Sirkin, Jordi Vallès y Delia Zafra

Jornadas de Puertas Abiertas: ¿Qué es el Parque Científico de Barcelona? ¿Qué es hacer Investigación? Una experiencia para acercar la ciencia a los alumnos de secundaria

17, 19 y 24 de noviembre de 2009

Participantes: Carme Cortina y Elisa Espinet Tópicos: Extracción de ARN, visualización de células, cultivo celular in vitro, análisis del ARN extraído de células tumorales, separación de las células tumorales benignas de las malignas

El IRB Barcelona en los medios El IRB Barcelona aparece regularmente en los medios de comunicación catalanes, españoles e internacionales. Durante el 2009, las actividades y los resultados de investigación del Instituto fueron publicados alrededor de 500 veces en los medios en forma de noticias, entrevistas y reportajes en profundidad. Los investigadores del IRB Barcelona también contribuyeron directamente a la difusión de la ciencia en los medios con artículos de divulgación para el público general y a través de entrevistas en la radio y la televisión.

23 de enero de 2009 I Avui

27 de marzo de 2009 I El Mundo

El diario AVUI dedicaba una doble página a los proyectos europeos en malaria y diabetes concedidos al IRB Barcelona, dentro de la segunda convocatoria del 7º Programa Marco de la Comisión Europea.

En una entrevista a doble página en el suplemento El Cultural, el científico del IRB Barcelona, Antonio Zorzano, explicaba los objetivos del proyecto europeo Mitin en diabetes, del cual es coordinador.

28 de enero de 2009 I Expansión

21 de abril de 2009 I Diario Médico

Expansión publicó una entrevista con el director adjunto del IRB Barcelona, Joan Massagué, después de haber sido galardonado con el Premio Fundación BBVA Fronteras del Conocimiento.

Diario Médico entrevistó a Travis Stracker, que se incorporó al IRB Barcelona procedente del Memorial Sloan Kettering Cancer Center, para establecer el Laboratorio de Inestabilidad Genética y Cáncer.

23 de marzo de 2009 I TV3

7 de mayo de 2009 I Público

Entrevista a Joan J Guinovart, director del IRB Barcelona, sobre cómo Barcelona está luchando para conseguir un puesto en la primera división internacional en investigación biomédica.

Público fue uno de los muchos medios que se hicieron eco de los resultados en metástasis del cáncer de mama al cerebro, publicados en Nature por el director adjunto del IRB Barcelona, Joan Massagué.

Memoria Anual IRB Barcelona 2009 69

9 de mayo de 2009 I El País

26 de julio de 2009 I La Vanguardia

Herbert Auer, director de la Plataforma de Genómica Funcional del IRB Barcelona, publicó un artículo de divulgación de dos páginas en El País sobre la conferencia Barcelona BioMed ‘The DNA Proteome’.

El director del IRB Barcelona, Joan J Guinovart, defendía en el artículo ‘Conocimiento para el crecimiento’ la necesidad de seguir apostando por la investigación en tiempos de crisis para fortalecer las economías catalana y española.

1 de junio de 2009 I Correo Farmacéutico

2 de octubre de 2009 I El Mundo

Correo Farmacéutico destacó el proyecto europeo Diomed en diabetes dirigido por Antonio Zorzano, coordinador del programa de Medicina Molecular del IRB Barcelona.

Amplia entrevista al jefe de grupo del IRB Barcelona, Cayetano González. El investigador explica los beneficios de estudiar la mosca Drosophila melanogaster para la biomedicina.

12 de julio de 2009 I La Vanguardia

30 de octubre de 2009 I La Gaceta

El IRB Barcelona fue destacado como uno de los centros de investigación pioneros en un artículo sobre los esfuerzos inversores en Cataluña para convertirse en un referente mundial en biomedicina.

El jefe de grupo y de programa del IRB Barcelona, Ernest Giralt, fue el protagonista de una noticia en La Gaceta por el trabajo desarrollado con péptidos y su potencial para la biomedicina.

18 de julio de 2009 I La Vanguardia

3 de noviembre de 2009 I El Periódico El primer simposio de estudiantes de doctorado del IRB Barcelona fue uno de los destacados del día en la sección de ciencia. El simposio se celebró en noviembre y contó con la Nobel de Química, Ada Yonath.

Amplio reportaje en La Vanguardia sobre la visita del Presidente José Montilla al IRB Barcelona y la puesta en marcha del MetCentre en el Instituto, una noticia que recogieron varios medios de comunicación.

20 de julio de 2009 I El País

21 de diciembre de 2009 I Diario Médico

Omnia Molecular, la spin off creada por el investigador del IRB Barcelona, Lluís Ribas de Pouplana, mereció un retrato en El País como ejemplo de empresa biotecnológica que ha sorteado los efectos de la crisis económica.

Diario Médico recogió la investigación desarrollada por el investigador del IRB Barcelona, Lluís Ribas de Pouplana, en el laboratorio de Traducción Genética. Los detalles sobre la nueva herramienta se publicaron en la revista Nucleic Acids Research.

70 Memoria Anual IRB Barcelona 2009

Organigrama del IRB Barcelona Patronato

Comité Científico Internacional

Junta de Gobierno Director Joan J Guinovart

Director Adjunto Joan Massagué

Directora de Gestión Margarida Corominas

Comité Científico Interno Marco Milán, Miquel Coll, Antonio Zorzano, Ernest Giralt, Eduard Batlle

Administración

Programas de Investigación

Plataformas Científicas

Biología Celular y del Desarrollo

Microscopía Digital Avanzada Julien Colombelli

Gestión Científica y Académica Margarita Navia

Bioestadística/Bioinformática David Rossell

Recursos Humanos Sylvia Martínez

Patrick Aloy, Miquel Coll, Ignasi Fita, María Macias, Modesto Orozco, Miquel Pons

Genómica Funcional Herbert Auer

Finanzas Alexandre Puerto

Medicina Molecular

Espectrometría de Masas Marta Vilaseca

Compras Yolanda Olmos

Ratones Transgénicos

Comunicación y Relaciones Externas Sarah Sherwood

Expresión de Proteínas Nick Berrow

Servicios de Tecnología de la Información Francisco Lozano

Ferran Azorín, Jordi Casanova, Cayetano González, Jens Lüders, Marco Milán, Lluís Ribas de Pouplana, Eduardo Soriano

Biología Estructural y Computacional

Carme Caelles, Antonio Celada, Joan J Guinovart, Manuel Palacín, Antonio Zorzano

Química y Farmacología Molecular

Fernando Albericio, Ramon Eritja, Ernest Giralt, Antoni Riera, Màrius Rubiralta (hasta dic. de 2009), Xavier Salvatella

Oncología Eduard Batlle, MetLab, Elena Sancho (hasta oct. de 2009), Travis Stracker

Estructura científica Estructura administrativa de apoyo a las actividades científicas

Innovación y Proyectos Estratégicos Jorge Domínguez

Memoria Anual IRB Barcelona 2009 71

Personal de Dirección y Administración Dirección IRB Barcelona Joan J Guinovart Director

Joan Massagué

Margarida Corominas

Antonio Zorzano

Eduard Batlle

Director Adjunto

Directora de Gestión

Programas de Investigación Marco Milán

Coordinador, Biología Celular y del Desarollo

Miquel Coll

Coordinador, Biología Estructural y Computacional

Coordinador, Medicina Molecular

Coordinador, Oncología

Ernest Giralt

Coordinador, Química y Farmacología Molecular

Administración Gestión Científica y Académica: Margarita Navia (Jefe), Clara Caminal (Coordinadora Académica), Sònia Saborit (Coordinadora de Proyectos), Adriana Grosu (Técnico en Gestión de Proyectos Europeos), Esther Cid (Asistente de Gestión Científica y Académica) I Recursos Humanos: Sylvia Martínez (Jefe), Silvia Aguadé (Técnico de Administración de Personal), Maria Rovira (Técnico de Recursos Humanos), Cristina Méndez (Asistente de Recursos Humanos, desde julio de 2009), Alba Cima (Asistente de Recursos Humanos, hasta julio de 2009)

I Finanzas: Alex Puerto (Jefe), Thais Raventós (Controller de Finanzas, desde septiembre de 2009), José Luís Fernández (Controller de Finanzas, hasta septiembre de 2009), Elisava de la Hoz (Técnico Contable), Dan Maldonado (Técnico Contable), Stel·la Serra (Técnico de Proyectos), Cristina Coletas (Asistente de Finanzas) I Compras: Yolanda Olmos (Jefe), Xavier López (Técnico de Compras), Sara López (Administrativa de Compras), Eric González (Administrativo de Compras) I Comunicación y Relaciones Externas: Sarah Sherwood (Jefe), Sònia Armengou (Responsable de Prensa y Relaciones con Medios), Anna Alsina (Responsable de Información y Publicaciones), Meritxell Gavaldà (Coordinadora de Conferencias y Actos), Tanya Yates (Soporte Editorial) I Servicios de Tecnología de la Información: Francisco Lozano (Jefe), Roberto Bartolomé (Arquitecto de Sistemas), David Villanueva (Administrador de Sistemas), Jesús Sánchez (Administrador de Sistemas), Rodolfo Scorians (Técnico de Service Desk) I Innovación y Proyectos Estratégicos: Jorge Domínguez (Jefe), Cristina Horcajada (Gestora de Transferencia de Tecnología) I Secretarias de Programa: Martha Brigg (Biología Celular y del Desarrollo), Vanessa Llobet (Biología Estructural y Computacional), Natàlia Molner (Medicina Molecular), Eva Poca (Química y Farmacología Molecular), Sara Martorell (Oncología)

Estadísticas de Recursos Humanos Miembros IRB Barcelona Laboratorios

387

Plataformas Científicas

Administración

Total

439

Personal Científico por Programas de Investigación

22%

20%

20% 26%

Biología Estructural y Computacional

7% 5%

Química y Farmacología Molecular

Oncología Plataformas Científicas

Medicina Molecular

Biología Celular y del Desarrollo

Memoria Anual IRB Barcelona 2009 73

Personal Científico por Categorías Profesionales

7% Investigadores Postdoctorales

Jefes de Grupo

25%

10%

17%

41%

Estudiantes de Doctorado Técnicos

74 Memoria Anual IRB Barcelona 2009

Investigadores Asociados

Afiliaciones de los Investigadores La comunidad del IRB Barcelona incluye investigadores contratados exclusivamente por el Instituto, así como científicos afiliados a otras instituciones, como la Universidad de Barcelona (UB), la Institución Catalana de Investigación y Estudios Avanzados (ICREA) y el Consejo Superior de Investigaciones Científicas (CSIC). La lista adjunta detalla los investigadores del IRB Barcelona con doble afiliación.

Universidad de Barcelona (UB) Jefes de Grupo

Fernando Albericio Carme Caelles Antonio Celada Ernest Giralt Joan J Guinovart Modesto Orozco Manuel Palacín Miquel Pons Antoni Riera Màrius Rubiralta (hasta diciembre de 2009) Eduardo Soriano Antonio Zorzano

Otros Investigadores

Mercédez Álvarez Ferran Burgaya Anna Diez (hasta diciembre de 2009) Annabel Fernández (hasta marzo de 2009) Josep Gelpí Rodolfo Lavilla (hasta diciembre de 2009) Jorge Lloberas Albert Martínez Cristina Minguillón (hasta diciembre de 2009) Jesús Ureña Xavier Verdaguer

Institución Catalana de Investigación y Estudios Avanzados (ICREA) Jefes de Grupo

Patrick Aloy Eduard Batlle Roger Gomis (Director de Gestión del MetLab) Cayetano González María Macias Marco Milán Lluís Ribas de Pouplana Xavier Salvatella

Otros Investigadores

Natàlia Carulla Alfred Cortés José Luís Vázquez-Ibar

Memoria Anual IRB Barcelona 2009 75

Consejo Superior de Investigaciones Científicas (CSIC) Jefes de Grupo

Ferran Azorín Jordi Casanova Miquel Coll Ramon Eritja Ignasi Fita

76 Memoria Anual IRB Barcelona 2009

Otros Investigadores Anna Maria Avinyó Jordi Bernués Maria Lluïsa Espinàs Xavier Franch Marc Furriols Maria Solà Cristina Vega

Parque Científico de Barcelona

lo largo de 2009, el Parque Científico de Barcelona (PCB) cumplió sus objetivos con el lanzamiento de distintas actividades en el campo de la investigación, la innovación y la difusión de la ciencia. El PCB experimentó un crecimiento considerable en cuanto a su superficie, infraestructuras, número de trabajadores, empresas y organizaciones ubicadas en el parque. Siguiendo el calendario previsto dentro del plan de ampliación, que tiene previsto finalizar en el año 2011, el PCB concluyó las obras de remodelación de las Torres R+D+I, permitiendo así poner en funcionamiento 10.000m2 adicionales. Durante el primer semestre de 2009 se fueron ocupando los nuevos espacios del complejo de Torres R+D+I hasta llegar a un nivel de ocupación a finales de año del 97%. Asimismo, continuaron las obras de construcción de la segunda fase de los edificios Clúster, Energías y Servicios, que está previsto que finalicen el año que viene. Aparte de este crecimiento, uno de los hechos más destacados fue la decisión de instalar en el PCB el Centro Nacional de Análisis Genómica (CNAG). El gobierno español aseguró en el año 2009 la creación de un centro científicotecnológico para la secuenciación de genomas a gran escala. Con este objetivo, la Administración General del Estado, la Generalitat de Catalunya y la Fundación Parque Científico de Barcelona firmaron un convenio de colaboración para la puesta en marcha de un Centro de Secuenciación en Barcelona.

Con este proyecto se quiere cubrir la creciente demanda de secuenciación masiva en proyectos de investigación genómica de gran envergadura, garantizar la participación de España en el Consorcio Internacional para la Investigación del Genoma del Cáncer (ICGC) y asegurar la competitividad en el ámbito estratégico de la genómica, así como en otros sectores de gran relevancia económica como, por ejemplo, la biomedicina, la agricultura, la biotecnología de alimentos, las energías renovables y la bioingeniería del medio ambiente. La primera fase del proyecto consiste en la puesta en marcha del centro e incluye la creación de infraestructuras y la dotación de equipamientos y recursos humanos. También incluye la realización de un proyecto piloto vinculado a la secuenciación de muestras tumorales, en el marco de la participación de España en la ICGC. Una vez concluya la primera fase, el Centro de Secuenciación se consolidará como infraestructura científicotecnológica mediante la captación de fondos competitivos y fuentes de financiación públicas y privadas que le permitirán extender sus actividades a un amplio abanico de proyectos estratégicos de I+D+I. En el ámbito de la innovación destacó el crecimiento de la Bioincubadora PCBSantander, que ascendió de 10 empresas incubadas a inicios del proyecto en 2007 a 16 empresas a finales del 2009.

Memoria Anual IRB Barcelona 2009 77

IRB Barcelona Parque Cient铆fico de Barcelona Baldiri Reixac 10 08028 Barcelona Tel: +34 93 402 0250 Fax: +34 93 403 7114 info@irbbarcelona.org www.irbbarcelona.org Entidades fundadoras

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