Creación de un biobanco zoológico único con una tecnología de código de barras 2D para muestras

Steve Knight

Mediante tubos de muestras con códigos de barras 2D, software y escáneres de códigos de barras donados por Ziath, Ltd., la Sociedad Zoológica de Londres (ZSL) pretende crear un archivo de especímenes únicos recogidos en los últimos 40 años que estará a disposición de investigadores de todo el mundo.

En los archivos…

Actualmente existe una colección de frascos, cajas y recipientes de plástico antiguos y bastante descuidados oculta entre los archivos de la Sociedad Zoológica de Londres (ZSL). El contenido de esta colección es fascinante. Entre ellas se incluyen muestras donadas por fuentes muy diversas, como biopsias de tejidos de animales con enfermedades poco comunes, objetos incautados por el Servicio de Aduanas del Reino Unido o la Policía Metropolitana, que consideraron que se traficaba con ellos contraviniendo el acuerdo CITES (Convención sobre el Comercio Internacional de Especies Amenazadas de Fauna y Flora Silvestres), o simplemente especímenes que algún zoólogo jubilado pensó que valía la pena conservar. Muchas de las muestras almacenadas datan de hace 40 años o más.

El personal del Instituto de Zoología de la ZSL, consciente del valor que tiene esta colección tan impresionante para la investigación, ha admitido la necesidad de catalogar, procesar y almacenar la colección, que cada vez crece más, para preservar la integridad de las muestras y poner sus valiosos recursos a disposición de los investigadores. Sin embargo, la financiación de un biobanco de este tipo puede ser difícil de obtener. Por eso, se están desarrollando soluciones económicas y eficientes que permitan avanzar en el proceso.

Louise Gibson, responsable del biobanco de ZSL en el Instituto de Zoología y encargada de este proyecto, explicó: “Nuestro objetivo es cribar los especímenes almacenados, identificarlos correctamente, catalogarlos y poner las muestras biológicamente relevantes a disposición de los investigadores de otras instituciones académicas de todo el mundo, ya que estas muestras tienen un inmenso valor para los investigadores de enfermedades zoonóticas y quizás algún día resulten relevantes para la salud humana.” de muestras de Ziath y a su director General, Neil Benn, en particular, decidimos utilizar tubos de muestras con códigos de barras 2D que pueden almacenarse en las gradillas de la cámara de congelación. Además, utilizaremos el software Samples™ de Ziath para llevar un seguimiento de dónde se encuentran las muestras almacenadas de una manera más eficiente. Algunas de nuestras muestras tienen que estar congeladas, así que elegimos un sistema con el que estamos seguros de que las etiquetas de identificación del espécimen no se verán comprometidas. No podemos permitirnos correr el riesgo de tener que destruir muestras porque no se pueden leer las etiquetas.”

Teniendo esto en cuenta, es necesario hacer hincapié en la importancia de los biobancos veterinarios o zoológicos. A medida que los seres humanos siguen expandiéndose por zonas vírgenes de la Tierra, el proceso nos pone en contacto más estrecho con los animales salvajes. Las enfermedades pandémicas pueden surgir cuando personas y animales conviven en los mismos lugares físicos sin que se tomen las medidas necesarias para evitar la transferencia de vectores de enfermedades entre ambos. Por ejemplo, uno de los casos más recientes es el de la covid-19: se cree que este coronavirus procede de animales salvajes, y que los pangolines y los murciélagos frugívoros estuvieron implicados en su transmisión en los mercados de animales salvajes, donde se comercia con carne de animales salvajes y animales vivos. Por lo tanto, en este caso y en muchos más existe un alto riesgo de que la enfermedad se propague fácilmente si no se cumplen las normas sanitarias. Los vectores de enfermedades pueden transferirse fácilmente de una especie a otra y a los seres humanos. Actualmente no se espera que esta situación mejore en los próximos años con el aumento de la globalización y el cambio climático, por lo que el riesgo de propagación de enfermedades zoonóticas es muy real. Teniendo esto en mente, disponer de un biobanco de las principales especies salvajes de todo el planeta es, por tanto, un complemento muy útil para desarrollar estrategias y terapias que permitan hacer frente a cualquier pandemia futura.

Ziath suministra a ZSL tubos con códigos de barras 2D, así como el lector de códigos de un solo tubo, que se utilizará junto con el software Samples™ de Ziath. Esta tecnología permitirá al equipo recuperar rápida y fácilmente muestras de la colección cuando lo soliciten los investigadores.

Solución eficaz de gestión de muestras

Louise y su equipo de voluntarios eran conscientes de la necesidad de contar con un sólido sistema de gestión de muestras que garantizara el proceso. Además, necesitaban que el sistema fuera rentable y eficiente debido a la magnitud de las muestras de la colección.

Louise explica: “Necesitábamos un método sencillo y sólido para almacenar muestras críticas de ADN y tejidos de estos especímenes. El principal requisito era que las muestras fueran fáciles de almacenar y de encontrar y recuperar, y que el sistema tuviese una larga vida útil. Tras consultar a los especialistas en gestión

Los tubos de muestras con código de barras 2D de Ziath tienen el código de barras grabado con láser en la base de polipropileno de cada tubo. De este modo, se garantiza su seguridad y se evita el riesgo de que la etiqueta se desprenda o se caiga. Además, el grabado es resistente química y mecánicamente, lo que da tranquilidad a la hora de manipular y almacenar muestras. Esta información de identificación de la muestra puede registrarse en un sistema de gestión de muestras, y los datos del código de barras 2D pueden asignarse a las muestras. De esta forma, cuando se requiera una muestra específica, el sistema mostrará el código de barras exclusivo del tubo, el código de barras de la gradilla y la posición dentro de la gradilla, lo que permitirá encontrar las muestras necesarias con facilidad. Además, esto también elimina la necesidad de estar junto a un congelador y buscar entre cientos de tubos para encontrar el correcto.

Neil Benn explica: “A muchos lectores disponibles les resulta difícil leer tubos cubiertos de hielo. Las bajas temperaturas pueden hacer que la ventana del lector se empañe con una capa de condensación en el interior, difícil de eliminar y prevenir. El lector de un solo tubo de Ziath incluye un revestimiento crioprotector especial que evita eficazmente la formación de esta condensación.”

Las muestras se catalogarán con el programa informático Samples™ de Ziath. Muchas de las muestras del Instituto de Zoología no han sido catalogadas, por lo que el equipo se enfrenta a la ingente tarea de procesar los miles de especímenes que alberga.

“Tenemos la suerte de haber podido reunir un equipo de voluntarios que están dispuestos a ayudar a ZSL y al Museo de Historia Natural con sus biobancos”, añade Louise. Los voluntarios están evaluando los miles de especímenes recogidos y realizando una clasificación básica de las muestras. Una de las primeras cribas es dividir las especies en función de si aparecen en el anexo A de la CITES o no. El Anexo A contiene las especies más amenazadas, donde la tala ilegal, la caza furtiva y el tráfico suponen el mayor riesgo para su supervivencia. A continuación, en una clasificación posterior se analizará si se ha conservado un animal entero o solo una parte de él.

La importancia de los biobancos veterinarios o zoológicos

Para la mayoría de las aplicaciones modernas de biobancos, solo es necesario almacenar una muestra de tejido o una pequeña parte del animal. El acceso al ADN es la clave de la mayor parte de la investigación moderna y en ello se centran la mayoría de los biobancos. En el Instituto de Zoología se tomarán muestras de ADN o de tejidos enteros de los especímenes que se hayan conservado y que estén correctamente identificados. La nueva muestra se alojará en un tubo con código de barras 2D y los detalles del espécimen se introducirán en el sistema de gestión de muestras de Ziath para mantener el inventario. Cuando sea necesario, el lector de un solo tubo de Ziath permitirá recuperar la información del código de barras 2D con precisión.

Louise Gibson comentó: “Será mucho trabajo, ya que es un proceso lento y laborioso centrado principalmente en reconocer y catalogar los muchos miles de especímenes que la ZSL ha acumulado a lo largo de los años. Sin embargo, la transferencia de las muestras a tubos con código de barras 2D, que han sido organizados e identificados en gradillas con códigos de barras 1D y que pueden almacenarse fácilmente en cámaras de congelación, así como consultarse rápidamente para estudios posteriores, permitirá abrir por primera vez este fascinante archivo de especímenes zoológicos a investigadores de todo el mundo.”

Louise y su equipo ya han iniciado el proceso y esperan crear un biobanco zoológico al que puedan acceder otras instituciones académicas y que sea de utilidad para futuros estudios epidemiológicos.

¿Necesita más información?

Puede comunicarse con Steve Knight, director Comercial de Ziath, Ltd., enviando un correo electrónico a steve.knight@ziath. com, y con Louise Gibson, responsable del biobanco de ZSL en el Instituto de Zoología, escribiendo a Louise.Gibson@ioz.ac.uk www.ziath.com

Métodos de referencia ISO: ¿qué hay de nuevo?*

David Tomás Fornés (davidtomasfornes@gmail.com)

Introducción

En España los métodos de referencia para el análisis microbiológico de alimentos se encuentran completamente armonizados con los métodos internacionales desarrollados por ISO, así como con los métodos europeos adoptados por CEN. Esta normalización nos permite asegurar que los métodos incorporados son aceptables a escala nacional e internacional sin requerir cambios o adaptaciones adicionales. Asimismo, el empleo de métodos normalizados permite el cumplimiento de la legislación en vigor en lo relacionado con los criterios microbiológicos aplicados a alimentos (Reglamento 2073/2005 y sus modificaciones).

Las normas publicadas cubren un amplio abanico de microorganismos, tanto patógenos como indicadores de higiene y calidad. También se encuentran incluidas normas para el análisis de parásitos en alimentos, así como de las toxinas producidas por bacterias (enterotoxina estafilocócica y cereulida). De modo adicional, existen normas que incluyen requisitos generales o guías para la ejecución de los análisis, control de medios de cultivo, validación, incertidumbre, técnicas de PCR, etc. Es por tanto clave para las industrias alimentarias y los laboratorios de control garantizar la correcta aplicabilidad de los métodos de referencia o en su caso, de los métodos alternativos equivalentes, así como conocer cuáles son las versiones en vigor, sus modificaciones y correcciones, así como las nuevas publicaciones de normas a incorporar en caso necesario.

Desarrollo y revisión de métodos normalizados

Como se ha indicado, todas las normas microbiológicas publicadas en España a través de UNE están alineadas con las normas ISO y CEN.

Todas las normas de referencia son desarrolladas y revisadas por comités ISO/TC34/SC9 y CEN/TC463. En particular el comité ISO gestiona un total de 90 normas publicadas en vigor y 25 normas en revisión o desarrollo. En este comité participan en total 40 países.

El proceso de desarrollo y revisión de una norma incluye diferentes etapas:

Los plazos de desarrollo o revisión de la norma, desde su aprobación formal hasta su publicación pueden ser de entre 18 y 36 meses. La fase en la que se encuentra una determinada norma puede consultarse en la página web de ISO (www.iso.com).