INSTITUTO DE INVESTIGACION EN HORTICULTURA Y SEMILLAS Presentación de la Unidad Mixta de Investigación El Instituto de investigación en Horticultura y Semillas (IRHS) agrupa los principales centros de investigación de vegetales en Angers bajo el auspicio de INRA, Agrocampus Ouest y de la Universidad de Angers. Con un presupuesto de unos 2,4 M€ y 230 miembros, su propósito es el de constituir y optimizar una estructura lider para la comprensión y explotación de los productos hortícolas y de las semillas basándose en una investigación fundamental y estratégica. Con este objetivo, el Instituto considera distintos enfoques integrados y coordina esfuerzos y conocimientos de genetistas, fitopatólogos, fisiólogos / eco-fisiólogos, bioquímos, modelizadores, estadísticos y bioinformáticos. Sus 3 divisiones contienen 13 equipos de investigación que trabajan en diferentes proyectos y comparten recursos científicos, tecnológicos y de gestión del personal. El Instituto participa en varios proyectos de investigación financiados por la Unión Europea, como TESTA (para la sanidad de la semillas), PONTE (para el control de las plagas), MIRRI (proyecto de infraestructura de investigación sobre los recursos microbiológicos), Fruit Breedomics (para el mejor rendimiento de frutas), Q Collect (Colecciones de referencia de plagas) y Emphasis (Gestión de plagas y de agentes patógenos emergentes). El IRHS es la mayor unidad de la SFR Quasav (Estructura Federativa de Investigación sobre la calidad y la sanidad de las plantas), que reúne todas las unidades de investigación y de experimentación de la región Pays de la Loire en el campo del vegetal. Desde su creación en 2012, el IRHS quiere convertirse en un centro de excelencia internacional en sus temas de investigación. Ha invertido mucho esfuerzo en el desarrollo de nuevas tecnologías y enfoques emergentes The Unit (como genómica, meta genómica, epigenética, bioinformática y fenotipicación alta velocidad) para alcanzar una biología predictiva y reforzar sus capacidades de innovación. El Instituto es una fuerza motriz para el clúster internacional VEGEPOLYS. Es también el elemento más importante del programa regional RFI Objectif Végétal - Investigación, Formación & Innovación en Pays de la Loire. El IRHS acoge dos becas ConnectTalent de la Región Pays de la Loire, otorgadas a Etienne Bucher (epigenética) en 2014, y a David Rousseau (fenotipicación alta velocidad) en 2016.
Formación El IRHS está muy implicado en la formación de los estudiantes: -
Universidad Bretagne Loire, un grupo de universidades e instituciones que reúnen los principales centros de formación superior y de investigación de las regiones Bretagne y Pays de la Loire Escuela de posgrado VENAM (Planta-Medio ambiente-Nutrición-Agroindustria, Mar). Título de Ingeniero (de Agrocampus Ouest, especialización en horticultura) Master Biología y tecnología del vegetal Licenciaturas profesionales (Biología analítica y experimental de los microorganismos, de las plantas y de los animales; Gestión de la sanidad de la plantas; Agricultura orgánica)
Temas de investigación Rosas y otras plantas ornamentales Arquitectura, floración y resistencia a las enfermedades http://www6.angers-nantes.inra.fr/irhs_eng/The-Research-Institute-onHorticulture-and-Seeds/Research-Divisions/Roses-and-Other-Ornamentals
Entender la floración, la arquitectura de las plantas y la resistencia a las enfermedades a través de - un enfoque multidisciplinario (biotecnologías, genética, eco-fisiología, fisiología molecular, modelización…) - un enfoque con múltiples escalas (desde la planta hasta el gen).
Investigar el impacto de las prácticas humanas y de la selección natural sobre la diversidad genética del género Rosa.
Colaboraciones locales con historiadores, economistas, matemáticos, colaboraciones nacionales e internacionales. Colaboración con el equipo “Morfología floral” (RDP, Lyon) y coordinación del consorcio internacional para la secuenciación del genoma de la rosa (compuesto de aproximadamente por 20 equipos y para el que ha recibido apoyo financiero del INRA y de la Región “Pays de la Loire”).
Calidad y Sanidad de las frutas y hortalizas Pomoideas, hortalizas apiacéas, y plagas y agentes patógenos asociados http://www6.angers-nantes.inra.fr/irhs_eng/The-Research-Institute-onHorticulture-and-Seeds/Research-Divisions/Fruits-and-Legumes
Identificar y entender el determinismo genético, molecular y ambiental de: - resistencia y defensa inducida - calidad nutricional y organoléptica.
Explicar el dinamismo adaptativo y la evolución de agentes patógenos considerando sus huéspedes y sus ambientes.
Desarrollar estrategias innovadoras para - el control de agentes patógenos, - la gestión de recursos genéticos, - la selección de variedades con buenas calidades organolépticas y nutricionales y de producción duradera.
Métodos y herramientas: Caracterización bioquímica y molecular - Ecofisiología – Modelización matemática – Genómica funcional usando la tecnología de “post-transcriptional gene silencing” – Genética de poblaciones – Genética – Epigenética.
Semillas, Estreses y Agentes patógenos Predecir mejor la sanidad y la calidad fisiológica de las semillas http://www6.angers-nantes.inra.fr/irhs_eng/The-Research-Institute-onHorticulture-and-Seeds/Research-Divisions/Seeds-Stress-and-Pathogens
Entender las adaptaciones de las semillas para hacer frente a los estreses abióticos. Especial interés acapara el estrés hídrico durante la maduración, la germinación y el establecimiento de las plántulas. El IRHS está reconocido al nivel internacional por sus investigaciones sobre los mecanismos moleculares y celulares implicados en la tolerancia a la desecación, al frio y a la hipoxia.
Entender los mecanismos de transmisión de patógenos a través de las semillas y como estos son capaces de sobrevivir en estos órganos y en la planta huésped. Mejorar los conocimientos sobre la filogenia y la evolución de las bacterias asociadas a las plantas.
Entender la estructura, la dinámica y la evolución de las comunidades bacterianas asociadas a semillas (tanto patógenas como nopatógenas) para mejorar las estrategias de control de enfermedades.
Instalaciones experimentales y colecciones biológicas Instalaciones experimentales 3600m2 túneles, 5700m2 invernaderos entre los cuales 360m2 son cámaras de cultivo dedicadas a plantas, organismos de cuarentena, cultivos y microorganismos modificados genéticamente. Contacto: remi.gardet@agrocampus-ouest.fr
3 plataformas IBiSA (Infraestructuras para la Sanidad biológica y la agronomía) Sus misiones son las de preservar, caracterizar y valorizar las colecciones (guardando en sus bases de datos diferentes datos fenotípicos y genotípicos). CIRM – Colección Francesa de Bacterias asociadas a las Plantas (CFPB), es una referencia internacional para los recursos genéticos de bacterias fitopatógenas. Colección de 7000 cepas, recursos estratégicos para la protección de las plantas http://www6.inra.fr/cirm_eng/CFBP-Plant-Associated-Bacteria Contacto: cfbp@angers.inra.fr
Centro de recursos biológicos de frutas de pepita y rosas Conservación a largo plazo de al menos 15 000 accesiones Conservación de ADN y de plantas en el campo Contactos: alix.pernet@angers.inra.fr, arnaud.guyader@angers.inra.fr
Centro de Recursos biológicos de hortalizas Apiaceae Colecciones de 3131 accesiones de zanahorias (Daucus carota L.) y 706 accesiones de perifollo (Chaerophyllum bulbosum L.) Contacto: emmanuel.geoffriau@agrocampus-ouest.fr
Plataformas técnicas comunes de la SFR Quasav
Análisis de ADN/ARN
Herramientas de alta tecnología para realizar genotipificaciones, secuenciaciones y análisis transcripcionales (Illumina Miseq y microarray Scanner…) Contacto: laurence.hibrand-saint-oyant@angers.inra.fr
Microscopia celular Análisis histológicos y citológicos. Experiencia y asistencia para la preparación de muestras, la observación y la interpretación de las imágenes (confocal, MEB…) Contacto: mayeul.milien@univ-angers.fr
Colecciones de Microorganismos
COMIC está dedicado a la preservación de los recursos microbianos (bacterias y hongos) de los laboratorios de la SFR Quasav Contacto: perrine.portier@angers.inra.fr
Contact: mayeul.milien@univ-angers.fr Nuevas herramientas y métodos de imagin para la Fenotipificación de caracterización en alta velocidad de: semillas y plantas - la calidad de semillas y plántulas - las interacciones plantas-patógenos - la arquitectura de las plantas ornamentales Contacto: phenotic@listes.univ.fr
Extracción, separación, purificación e identificación estructural de metabolitos secundarios de las plantas Contacto: david.guilet@univ-angers.fr
Análisis sensoriales Herramientas y métodos para análisis sensoriales sobre plantas : alimentos y plantas ornamentales Contacto: c.brasse@groupe-esa.com
Impression Service Reprographie Université d’Angers
Análisis Fotoquímicos