PubMed: informação em ciências da saúde

PUBMED FONTE DE INFORMAÇÃO EM CIÊNCIAS DA SAÚDE

Bibliotecas da Universidade de Aveiro 2012

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PubMed 2

Sumário

! ! ! ! !

Sobre a PubMed Conteúdos Funcionalidades Pesquisa Espaço pessoal

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PubMed 3

Informação científica

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A publicação científica é a componente formal da comunicação científica e tem como função! documentar, disseminar e certificar os resultados da investigação científica.

Um dos meios tradicionais e ainda o mais usado e considerado para a publicação são os artigos em revistas científicas.

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O processo de peer review ou refereeing (revisão por pares)

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Processo utilizado na publicação de artigos em revistas e que consiste em submeter o trabalho científico à avaliação de um ou mais especialistas da área. Através deste processo é certificada a qualidade dos artigos publicados numa revista científica.

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PubMed 5

O processo de peer review ou refereeing (revisão por pares)

!

As práticas, os meios e mecanismos de publicação científica variam em função das diferentes áreas de conhecimento e práticas de investigação, variando assim, também, as plataformas e estratégias para pesquisa e descoberta de informação.

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Bases de dados de artigos científicos

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Reúnem num único ponto de acesso revistas científicas de diferentes editores e permitem a realização de pesquisas abrangentes.

São as ferramentas adequadas para a realização de uma revisão bibliográfica sobre um determinado assunto.

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Bases de dados de artigos científicos

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Podem ser multidisciplinares ou temáticas.

A PubMed é a base de dados temática internacional considerada essencial para a pesquisa de informação, nas áreas científicas das Ciências da Saúde e Biomedicina.

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Bases de dados de artigos científicos

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Outras bases de dados podem ser usadas para pesquisa de informação científica nas áreas científicas das Ciências da Saúde e Biomedicina. As bases de dados multidisciplinares, ou seja, que abrangem todas as áreas do conhecimento, que estão disponíveis para a comunidade académica são a SCOPUS, a Web of Science e a Academic Search Complete.

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Bases de dados de artigos científicos

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As bases de dados estão disponíveis no portal das bibliotecas da ua, na página Web “artigos”, com o endereço eletrónico http://www.ua.pt/sbidm/biblioteca/artigos

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Sobre a PubMed

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PubMed 11

Sobre

!โ ฏ

Endereรงo eletrรณnico da Pubmed? http://www.pubmed.org ou http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/

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Sobre

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Base de dados bibliográfica especializada em literatura biomédica;

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Criada em 1997, nos Estados Unidos, pela National Library of Medicine, com o objetivo de tornar os conteúdos da Medline pesquisáveis através da Internet;

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Sobre

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Áreas indexadas: medicina, enfermagem, medicina veterinária, medicina dentária, cuidados de saúde, ciências pré-clínicas;

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Pesquisa livre na Web - http://www.pubmed.org;

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Sobre

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As referências podem conter o acesso ao texto integral dos artigos, quer através da PubMed Central, quer do portal Web do editor;

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Possibilita o acesso ao texto integral dos artigos das revistas assinadas pela UA, consórcio b-on e acesso livre (Open Access);

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Sobre

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Indexa mais de 22 milhões de registos – artigos científicos e de revisão, conferências, livros eletrónicos, entre outros;

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Atualizada diariamente;

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Com artigos desde 1865 até ao presente;

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Sobre

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Os assuntos atribuidos aos artigos são controlados pelo Thesaurus MeSH;

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Com os conteúdos da Medline e OldMedline. A OldMedline contém artigos de revistas publicadas entre 1946 e 1965 de cerca de 80 países;

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Sobre

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Artigos out-of-scope "

Artigos selecionados pela National Library of Medicine (NML) que pertencem a revistas multidisciplinares (selectively indexed journal) que não são abrangidas pela Medline (ex. Science e Nature).

Estes artigos pertencem às áreas das ciências da vida e biomedicina, e são indexados na base de dados Medline. Na PubMed, um artigo out-of-scope tem na sua citação a tag [PubMed].

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Sobre

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Pesquisa de ensaios clínicos (Clinical trials) "

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Estudos biomédicos e investigação relacionada com áreas da saúde, aplicados em seres humanos e que seguem protocolos pré-definidos;

Inclui citações in-process "

Artigos que ainda não foram indexados com os termos do thesaurus MeSH;

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Ferramentas da PubMed

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Ferramentas

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A PubMed oferece aos seus utilizadores um conjunto de ferramentas específicas. O acesso é feito a partir da página de entrada da base de dados, opção “PubMed Tools”.

http://www.pubmed.org

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Ferramentas

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Single Citation Matcher "

Permite localizar um artigo através de dados da referência bibliográfica. Usa-se quando se pretende um artigo em concreto, e não se tem muito informação.

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Ferramentas

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Batch Citation Matcher "

Pesquisa um grupo de artigos de uma só vez, através de várias referências bibliográficas já existentes. Esta ferramenta requer o conhecimento exato de vários elementos da citação - nome da revista, ano, volume, 1ª página do artigo, nome do autor, e a chave “VS”.

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PubMed 23

Ferramentas

!

Batch Citation Matcher "

A Query de pesquisa deve obedecer à estrura: journal_title|year|volume|first_page|author_name|your_key| Med J Aust|1970|2|787|Ananthakrishnan|VS Nome da revista

Ano

Vol.

1º pág. do artigo

Autor

Chave Your key

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Ferramentas

!

Batch Citation Matcher " 1.

2.

Como usar?

Preencher o campo “Email”; Preencher o campo “Citations Strings” Indian J Cancer|1978|15|55|Advani|VS Cancer|1980|45|2843|Advani|VS Indian Pediatr|1989|26|868|Ali|VS Med J Aust|1970|2|787|Ananthakrishnan|VS

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Ferramentas

!

Batch Citation Matcher " 3.

4.

Como usar?

Opção “search”; Condultar o email e retirar os PMIDs que se encontram no final dos elementos anteriormente enviados.

Indian J Cancer|1978|15|55|Advani|VS|374240 Cancer|1980|45|2843|Advani|VS|7379014 Indian Pediatr|1989|26|868|Ali|VS|2634004 Med J Aust|1970|2|787|Ananthakrishnan|VS|5487232 PMIDs

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Ferramentas

!

Batch Citation Matcher " 5.

Como usar?

Copiar os PMIDs para a caixa de pesquisa da PubMed e dar início à pesquisa: 374240, 7379014, 2634004, 5487232

6.

Consultar a lista das referências e os conteúdos a elas associados (abstract, texto integral, assuntos, etc.).

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Ferramentas

!

Batch Citation Matcher " 7.

8.

Como usar?

Uma das vantagens desta ferramenta, reside na localização dos artigos através de listas de referências bibliográficas já existentes, em forma XLS ou DOC. As queries de pesquisa devem obedecer à estrutura anteriormente apresentada; Mais informação sobre esta ferramenta: " "

Web http://med-lib-l.wikispaces.com/Batch+Citation+Matcher+instructions PDF http://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK3827/pdf/pubmedhelp.pdf

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Ferramentas

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Clinical Queries "

Ferramenta de pesquisa avançada e especializada da PubMed;

"

Desenvolvida principalmente para clínicos, disponibiliza investigação clínica baseada na evidência.

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Ferramentas

!

Clinical Queries "

A pesquisa "

Os resultados da pesquisa através desta ferramenta, estão limitados a áreas específicas de investigação clínica.

Para pesquisas mais abrangentes, deve usar o serviço de pesquisa da PubMed.

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Ferramentas

!

Clinical Queries "

A pesquisa "

Ao lançar o(s) termo(s) da pesquisa, os resultados são apresentados em três colunas, organizados por: "

"

"

Clinical Study Category (apresenta referências selecionadas sobre um determinado estudo clínico, categoria ou âmbito. Com possibilidade de refinamento de resultados); Systematic Reviews Referências de revisão sistemática de literatura, artigos de revisão de ensaios clínicos (clinical trials), conferências, linhas orientadoras (guidelines), etc.); Medical Genetics (referências que dizem respeito à Genética Médica).

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PubMed 31

Ferramentas

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Topic-Specific Queries " "

Diretório com Queries específicas para clínicos e investigadores, áreas, interfaces, coleções de revistas; Após a seleção de uma destas Queries, as pesquisas na PubMed são feitas com esse filtro ativo. Para uma pesquisa geral na PubMed, deverá desativar o filtro/ Query selecionado(a) – opção “clear all”.

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Ferramentas

!

PubReader "

!

Formato acessível para leitura dos artigos científicos da PubMedCentral, através de dispositivos móveis.

PubMed Mobile "

Versão para dispositivos móveis.

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Ferramentas

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RSS Feeds "

Esta tecnologia permite saber se a base de dados tem novos artigos, ou outras publicações sobre o assunto pesquisado, sem ter que voltar a realizar novas pesquisas. A leitura do feed é possível através do browser da Internet ou de um agregador de feeds Google Reader. "

Na janela dos resultados da pesquisa, clicar no icon do RSS Feed e copiar o endereço do feed para o leitor.

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Pesquisar na PubMed http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/

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Antes de começar a pesquisar

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Desenvolver a estratégia de pesquisa 1.

Identificar os termos/conceitos de pesquisa. ! ! !

!

Os termos devem estar em língua inglesa; Verifique se estão escritos corretamente; Verifique se existem sinónimos ou palavras relacionadas com o termo a pesquisar; Verifique possíveis variantes linguísticas e siglas;

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Antes de começar a pesquisar

!

Desenvolver a estratégia de pesquisa 1.

Identificar os termos/conceitos de pesquisa. !

Usar vocabulário controlado sempre que possível "

!"#$%&'()*"+#",-)"'$."+/*0,*1#$+"+&/"+.2+-2)3"/+.2+ $//&,-"+#",-)"'$."/+4!"#$%#&%+5$)$+.2/#)262)+"+#",-27."+ .2+$)80"/+23+%$/2/+.2+.$."/9:+2/-2/+-2)3"/+5".23+/2)+ .2/*0,$."/+.2+#$%2;$'<"/+.2+$//&,-"+4!'()*+",-*#%.$/!9=+ -2)3"/+.2+-2/$&)"/+"&+.2/#)*-")2/>+

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Antes de começar a pesquisar

!

Desenvolver a estratégia de pesquisa 1.

Identificar os termos/conceitos de pesquisa. !

Compreender o vocabulário: o thesaurus MeSH® "

A PubMed usa vocabulário controlado para indexar os seus artigos, o que significa que existe um conjunto de termos específicos para descrever cada artigo. A utilização deste vocabulário controlado, vai fazer com que as pesquisas efetuadas tragam resultados mais assertivos. O Thesaurus MeSH® - Medical Subject Headings – é a ferramenta que impõe uniformidade e consistência à literatura indexada na PubMed.

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Antes de começar a pesquisar

!

Desenvolver a estratégia de pesquisa 1.

Identificar os termos/conceitos de pesquisa. !

Compreender o vocabulário: o thesaurus MeSH® " Os termos do MeSH® estão ordenados hierarquicamente e são atualizados anualmente. http://www.ncbi.nlm.nih.gov/mesh

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Antes de começar a pesquisar

!

Desenvolver a estratégia de pesquisa 2.

Refinar a pesquisa por: " " " " " " " "

Tipo de publicação; Espécie; Resumos ou texto integral dos artigos ; Língua da publicação; Sexo; Idade; Data; …

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Antes de começar a pesquisar

!

Desenvolver a estratégia de pesquisa 2.

Refinar a pesquisa por: Atenção: • • •

Uma vez aplicados limites a uma pesquisa, se não forem desativados, permanecem nas pesquisas seguintes; Só os limites por data ou língua é que não excluem os artigos in process; A aplicação de filtros dá origem a menos resultados.

- Para eliminar os limites - Change ou Remove.

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Pesquisa

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Pesquisa simples "

Pode simplesmento digitar um termo na caixa de pesquisa, e automaticamente é apresentada uma lista com termos que podem ser selecionados. Para desativar esta funcionalidade, basca clicar em “Turn off”, no final da lista de termos propostos.

"

A PubMed apresenta muitos termos. Para pesquisas mais eficientes, seja o mais específico(a) possível.

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Pesquisa

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Pesquisa avançada - Search Builder " " "

Ferramenta de pesquisa avançada da base de dados.

Permite pesquisar por campos específicos (autor, assunto, título de revista, afiliação, etc.).

Com registo do histórico de pesquisas durante 8 horas.

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Pesquisa

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Por assunto "

Ao inserir o assunto a pesquisar, a base assume o operador boleano AND e vai buscar automáticamente os termos controlados do MeSH para esse assunto – automatic term mapping. Os termos são pesquisados no título e resumo (abstract) dos artigos. "

Ex: Ao escrever heart attack a base vai pesquisar os artigos que têm no título e no resumo heart attack e, também, os artigos com o assunto controlado do MeSH myocardial infarction.

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Pesquisa

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Por autor "

Usar primeiro o último nome do autor e só depois as iniciais, sem pontuação entre eles.

Quando se pesquisa apenas pelo último nome, sem iniciais, deve-se colocar à frente do nome [au].

"

Ex: Kosbland ME Ex: Kosbland [au]

"

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Pesquisa

!

Por título de revista " "

Usar o título completo da revista ou a breviatura qualificada com [ta] Ex. Current Biology [ta] "

Caso não saiba o título completo da revista, pesquise no “Journals in NCBI Databases” – menu “More resources” > literature”.

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Pesquisa

!

Operadores boleanos "

Os operadores boleanos AND, OR, NOT existem para combinar termos. A última operação deve ser colocada entre (). "

"

Ex. Common cold AND (vitamin C OR zinc)

AND – usado para recuperar um conjunto de referências que contenham todos os termos de pesquisa "

EX. salmonella AND hamburger

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Pesquisa

!

Operadores boleanos "

OR – usado para recuperar um conjunto de referências que contenham pelo menos um dos termos de pesquisa. Use este operador para agrupar artigos com temáticas similares "

EX. football OR hockey OR soccer

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Pesquisa

!

Operadores boleanos "

NOT – usado para recuperar um conjunto de referências que contenham o primeiro termo de pesquisa. O termo seguido do operador é automaticamente excluido dos resultado. "

EX. arthritis NOT letter

Atenção: Os aporadores boleanos devem estar em letra maiúscula.

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Pesquisa

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Truncatura "

Usar o * para substituir vários caratéres no final da palavra. "

Ex. Bacter* recupera bacteria, bacterium, bacteriophase.

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Pesquisa

Artigos relacionados (related citations) – Ao entrar no registo de um artigo, estão disponíveis outros artigos que citam as mesmas bibliográficas “Related citations in PubMed”; ! Artigos de revisão – Um artigo de revisão (review article) é uma publicação que descreve, analisa e discute conhecimentos científicos ou tecnológicos já publicados. " Nos resultados de uma pesquisa são, também, apresentados os artigos de revisão. !

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Ferramentas de apoio

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PubMed 52

My NCBI

!

Área pessoal onde podem ser personalizados serviços na PubMed e outras bases de dados da NCBI. "

Após a criação de uma conta pessoal, é possível: " " " "

Salvar pesquisas, coleções de referências e bibliografias por autor; Partilhar coleções bibliográficas com outros utilizadores; Enviar por e-mail atualizações de pesquisas; Selecionar e criar filtros para as pesquisas.

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My NCBI

!

Salvar pesquisas – Opção “Save search” disponível na janela de resultados após a pesquisa. "

Esta pesquisa pode ser parametrizada segundo a atualização de novos resultados, formato dos artigos, número de items.

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My NCBI

!

Criar filtros – Criar e aplicar filtros nas pesquisas, por áreas de interesse (15 no máximo) "

!

Manage Filters – Aplicar filtros pré-definidos ou personalizados.

Atividade recente – Grava o percurso feito pelo utilizador nas bases de dados da NCBI, durante 6 meses.

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My NCBI

!

Personalizar o My NCBI – Na opção “Customize homepage” e “NCBI Site Preferences”, o utilizador pode personalizar o espaço pessoal " " "

Alterar password’s e e-mail’s; Partilhar pastas; Criar as janelas dos filtros, pesquisas, coleções, bibliografias, etc.

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EndNote

!

A PubMed permite a exportação de referências bibliográficas para o EndNote 1.

2.

3.

4.

Após a pesquisa, na janela de resultados, selecionar as referências a exportar; Na opção “send to:”, localizada no topo dos resultados, selecionar a opção “File” > “Medline” > “Recently Added” > “Create File”; Guardar o ficheiro localmente; Abri-lo com o EndNote e selecionar a opção de filtro “PubMed (NLM).

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1

A MEDLINE With Full Text http://search.epnet.com/ (EBSCO)

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MEDLINE With Full Text 2

Sobre

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! !

Base de dados bibliográfica especializada em informação médica; Acesso limitado ao domínio ua.pt; Acesso exclusivo ao texto integral de 1470 revistas

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MEDLINE With Full Text 3

Conteúdos ! Áreas indexadas: medicina, enfermagem, !

!

medicina veterinária, medicina dentária, cuidados de saúde, ciências pré-clínicas.

Acesso a mais de 1450 revistas em texto integral; Recupera informação a partir de 1949. Texto integral só a partir de 1965;

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MEDLINE With Full Text 4

Conteúdos

!

!

!

Todos os artigos incluidos estão indexados com os termos controlados do MeSH; Não faz ligação ao texto integral de revistas do consórcio b-on ou subscritas individualmente pela UA; Interface de pesquisa em várias línguas.

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MEDLINE With Full Text 5

Serviços

!

Assente na plataforma de pesquisa EBSCO; ! !

! ! !

Pesquisa simples e avançada; Possibilidade de pesquisa integrada com outras bases de dados subscritas pela UA, disponíveis na mesma plataforma; Ligação com o catálogo A to Z das bibliotecas da UA; Possibilidade de pesquisa dentro de uma revista específica; Espaço pessoal;

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MEDLINE With Full Text 6

Serviços

!

Assente na plataforma de pesquisa EBSCO; ! ! ! ! ! !

Possibilidade de adição de notas aos registos (com espaço pessoal); Link permanente dos registos; Filtros (texto integral, tipologia, data, etc.); Exportação de referências para o EndNote; Subscrição de RSS Feeds; Uso dos operadores boleanos na pesquisa – and, or, not, “ “;

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57

Mais informação…

PubMed 58

Tutoriais

http://www.nlm.nih.gov/bsd/disted/ pubmedtutorial/ ! http://www.nlm.nih.gov/bsd/disted/ pubmed.html !

PubMed 59

Glossรกrio

!โ ฏ

http://www.nlm.nih.gov/bsd/disted/ pubmedtutorial/glossary.html

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Outras fontes 60

!

Artigos científicos, papers de conferências, teses e relatórios, também podem ser pesquisados em: " " " "

!

Repositórios de documentos digitais – RIA, RCAAP, DRIVER Sistemas agregadores – b-on, Sciverse Hub Bases de dados de artigos científicos – SCOPUS (indexa na totalidade as referências da Medline) Motores de pesquisa Web – Google Scholar

Mais informação na página Web:+ <?5@AABBB>&$>5-A/%*.3A%*%'*"-2#$A$)80"/++

BIBLIOTECAS DA UNIVERSIDADE DE AVEIRO 2012 HTTP://WWW.UA.PT/SBIDM/BIBLIOTECA sbidm-biblioteca@ua.pt

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