Chromosome 1
Chromosome 2
1pter 36.3 36.2 36.1 35 34.3 34.2 34.1 33 32.3 32.2 32.1 31.3
LPU 020-A LPS 010-A
24 23 22
(1p36) PAX7
21
LPS 013-A
16
(1p32.3) CKS1B/CDKN2C(P18)
15
LPH 039-A
14 13
22.3 22.2
12 11.2 11.1 11.1
22.1
11.2 12
21 13.3
23.1 23.2 23.3 24 25.1 25.2 25.3
2pter
LPT 02PR/G-A
(2p24.3) N-MYC (2p23) ALK
LPS 019-A
(2p21) EML4 (2p11.2) IGK
(1p11.1-q11.1) 1/5/19a Satellite
LPE 005R/G-A
(1q12) 1 Classical Satellite
LPE 001R/G-A
(1q21) CKS1B/CDKN2C(P18)
LPT 03PR/G-A
16.1 15.3
24.3 24.2 24.1 23 22
15.2 15.1
LPS 020-A LPS 038-A / LPH 034-A
(2p11.1-q11.1) 2a Satellite
13 12
21.2 21.1 14.3 14.2 14.1
12 13.1 13.2 13.3
13
21.1 21.2
12 11.2
LPE 002R/G-A
11.1 11.1
11.2 12
21.3
(3p11.1-q11.1) 3a Satellite
22
LPE 003R/G-A
13.1 13.2
22
23 24.1 24.2 24.3
LPH 521-A LPU 009-A
(4p11.1-q11.1) 4a Satellite
11 11.1
LPE 004R/G-A
Chromosome 6
26.2 26.3 27
(4q21.3) AFF1
LPH 032-A LPH 507-A
(2q36) PAX3
28
LPS 012-A
29
23.1 23.2 23.3 31.1 31.2 31.3 32 33.1 33.2 33.3
32
34 35.1 35.2 35.3
33
LPS 029-A / LPH 035-A LPT 03QR/G-A
4qter
22.3 22.2 22.1 21.3
Chromosome 7
LPT 04QR/G-A
LPT 06PR/G-A
6pter
22 21 15.3 15.2
(6p21) CCND3 Plus
15.1
LPH 522-A
14
21.2
(5p11.1-q11.1) 1/5/19a Satellite
13
21.1
LPE 005R/G-A
12 11.2 11.1 11 12
12 11.2
Chromosome 8
11.21
LPE 006R/G-A
21.2 21.3
16.1 16.2 16.3
(5q32) PDGFRB (5q35) Cri-Du-Chat/SOTOS TLX3 5qter
LPH 024-A LPH 031-A
22.1 22.2 22.3 23.1 23.2 23.3 24 25.1 25.2 25.3 26 27
LPU 013-A LPH 050-A
(7p11.2) EGFR
LPS 003-A
22
(7q22) Del (7q)
31.1 31.2
(6q22.1) ROS1
LPS 022-A
(7q31.2) C-MET Del (7q)
31.3 32
(6q23.3) MYB
33 34 35
LPH 016-A
(7q34) TCRB
36
(6p27) MLLT4
LPH 510-A
6qter
7qter
LPT 06QR/G-A
21.3 21.2 21.1 12 11.2
11.1 11.1
11.21 11.22
LPE 007R/G-A
11.23 12 13 21.1
LPU 024-A LPU 011-A
22
21
(5q31.2) Del (5q)
LPU024-A
(7q11.23) Saethre-Chotzen/ Williams-Beuren Williams-Beuren
21.1
15
23.3 23.2 23.1
11.22
13 14
LPT 07PR/G-A
(7p21.1) Saethre-Chotzen/ Williams-Beuren
(7p11.1-q11.1) 7a Satellite
22 22
(6p11.1-q11.1) 6a Satellite
11.23
15
26
35
25 24 23
14
34
(3q27.3) BCL6 3qter
LPU 013-A
13.1 13.2 13.3
22
31.3
(5p15.2) Cri-Du-Chat/SOTOS
LPT 05PR/G-A
12
(4q12) FIP1L1/CHIC2/PDGFRA
21
24 25.1 25.2
LPH 036-A
11.2
25
31.1 31.2
26.1
31
14
13.3 13.2 13.1 12
28
(3q26.2) EVI1
15.1
23 24
23
25.3
5pter 15.3 15.2
(4p16.3) FGFR3 Plus Wolf-Hirschhorn
27
22
33
LPT 04PR/G-A
13.3
21
31
4pter
14 21.3
21.2 21.3
32.2 32.3
16.3 16.2
11 11
32.1
LPH 504-A
3pter
21.1
LPH 039-A
(1p23.3) PBX1
26 25
LPS 009-A
13 14.1 14.2 14.3
12
22
Chromosome 5
7pter 25.3 25.2 25.1
31.1
21
Chromosome 4
LPT 01PR/G-A
(1p36.3) 1p36 SRD (CHD5)
31.2
13.2 13.1 12 11 11
Chromosome 3
C C
21.2 21.3 22.1 22.2 22.3
LPH 025-A
LPT 08PR/G-A
(8p11.2) FGFR1
LPS 018-A
(8p11.1-q11.1) 8a Satellite
LPE 008R/G/B-A
(8q12) CHARGE
LPU 021-A
(8q21.3) AML1/ETO
LPH 026-A
(8q23.3) Langer-Giedion
LPU 022-A
(8q24.1) Langer-Giedion
LPU 022-A
23 24.1
LPS 004-A LPH 025-A
8pter
24.21 24.22 24.23 24.3
LPH 048-A LPT 07QR/G-A
(8q24.21) cMYC cMYC Plus IGH/MYC
LPS 027-A / LPH 010-A LPH 523-A LPS 035-A
8qter
LPT 08QR/G-A
LPT 05QR/G-A
34
32.1
35
32.2 32.3
36 37.1 37.2 37.3
41
42.1
2qter Non-polymorphic clone LPT 02QNPR/G-A 2qter
LPT 02QR/G-A
42.2 42.3 43 44
1qter
LPT 01QR/G-A
Chromosome 9 24 23 22 21 13
Chromosome 10 LPT 09PR/G-A
9pter
12
(9p21.3) P16 MLLT3
(9q12) 9 Classical Satellite
LPE 009R/G-A
(9q34) BCR/ABL BCR/ABL Plus
LPH 007-A LPH 038-A
(10p14) DiGeorge II
14
LPU 015-A
(10p11.1-q11.1) 10a Satellite
12 11.2
LPE 010R/G-A
12
21.2 21.3
13.1
22.1 22.2 22.3 23.1 23.2 23.3 24.1 24.2 24.3
13.2
25.1 25.2 25.3
13.3
(10q24.3) TLX1
LPH 049-A
26.2
LPT 09QR/G-A
11.2 11.11 11
26.1
9qter
13
21.1
33 34.1 34.2 34.3
15.5 15.4 15.3 15.2 15.1
11.2
11.2
21.2 21.3
32
12.3 12.2 12.1
11.1 11.1
21.1
31
LPT 10PR/G-A
13
LPS 036-A / LPH 009-A LPH 509-A
13
22.1 22.2 22.3
10pter
14
12 11 11
15
Chromosome 11
26.3
10qter
LPT 10QR/G-A
13.4 13.5 14.1 14.2 14.3 21 22.1 22.2 22.3 23.1 23.2 23.3 24.1 24.2 24.3 25
11pter (11p11.1-q11.1) 11a Satellite (11q13.3) CCND1 Breakapart IGH/CCND1 CCND1 Plus MYEOV Plus (11q22.3) ATM P53/ATM
Chromosome 18
17pter 13 12 11.2 11.1 11.1
11.2 12 21.1 21.2 21.3
22 23 24 25
LPT 17PR/G-A
(17p13.3) Smith-Magenis(RAI1)/ Miller-Dieker Smith-Magenis(FLII)/ Miller-Dieker (17p13) P53 P53/ATM
11.32 11.31
LPU 019-A
11.1 11.1
11.2
LPU 007-A
12.1 12.2 12.3
LPS 037-A / LPH 017-A LPH 052-A
21.2 21.3 22
(17p11.1-q11.1) 17a Satellite
23
LPU 019-A LPU 007-A
LPE 017R/G/B-A LPU 017-A
(17q12) HER2
LPS 001-A
(17q21.1-q21.2) FAST RARa PML/RARa RARa Proximal RARa Distal TOP2A
LPH 502-A LPH 023-A LPH 062-A LPH 063-A LPS 002-A
17qter
13.2
LPE 018R/G-A LPS 014-A
13.1 12 11 11 12
13.1 13.2
(18q21.3) MALT1 Breakapart IGH/MALT1 BCL2 Breakapart IGH/BCL2 BCL2 Plus 18qter
LPT 18QR/G-A
13.4
11.1 11
12
LPS 030-A LPS 031-A LPH 519-A LPH 525-A LPH 011-A LPH 052-A
(12p11.1-q11.1) 12a Satellite
LPT 12PR/G-A 13 12 11.2
LPH 012-A LPE 012R/G/B-A
13.1 13.2 13.3 14 15 21.1 21.2 21.3
LPH 013-A LPH 506-A
22
(12q13.3) CHOP (12q15) MDM2
(11q24) FLI1/EWSR1
LPS 007-A
(19p13.3) E2A Breakapart E2A MLLT1 (19p11.1-q11.1) 1/5/19a Satellite
14.1 14.2 14.3 21.1 21.2 21.3
LPS 015-A
22 31
(13p11.1-q11.1) 13/21a Satellite (13q14.2) RB1 D13S319 Plus (13q14.3) 13q14.3 D13S25
LPE NOR-A LPE 013R/G-A
13 12 11.2 11.1 11.1
11.2 12
LPH 011-A LPH 068-A LPH 006-A LPH 043-A
13 21 22 23 24.1 24.2 24.3 31
LPS 016-A
32.1
32
23
32.2 33
24.31 24.32 24.33
34
32.3
13qter
LPT 13QR/G-A
12qter
LPT 12QR/G-A
Chromosome 15
Acro-P-Arm
LPE NOR-A
(14p11.1-q11.1) 14/22a Satellite (14q11.2) TCRAD (14q32.13) TCL1
(15p11.1-q11.1) 15a Satellite
11.1 11.1
LPE 014R/G-A
LPH 046-A
(14q32.3) IGH Breakapart IGH Proximal Plus IGH Distal Plus IGH Plus IGH/BCL2 IGH/CCND1 IGH/MYC IGH/MALT1
Acro-P-Arm
13 12 11.2
11.2 12 13 14
LPH 047-A
14qter
LPS 032-A LPH 515-A LPS 516-A LPH 517-A LPS 033-A LPS 031-A LPS 035-A LPS 034-A
(15q11.2) SNRPN UBE3A
15 21.1 21.2 21.3 22.1 22.2 22.3 23
(15q24.1) FAST PML PML/RARa
24 25
Chromosome 16 LPE NOR-A
13.3
16pter
LPT 16PR/G-A
13.2 13.1
LPE 015R/G-A
12 11.2
LPU 005-A LPU 006-A
11.1 11.1
11.2
LPU 023-A
(16p13.1) CBFb/MYH11
LPH 022-A
(16p11.1-q11.1) 16a Satellite
12.1 12.2 13
LPH 501-A LPH 023-A
(16p13.3) Rubinstein-Taybi
LPE 016R/G-A
21 22 23
(16q22) CBFb/MYH11
LPH 022-A
(16q23) MAF Plus
LPH 520-A
24 26.1 26.2 26.3
15qter
LPT 15QR/G-A
LPT 16QR/G-A
16qter
LPT 14QR/G-A
LPT 11QR/G-A
Chromosome 20 20pter
LPT 19PR/G-A 13 12
LPH 019-A LPH 503-A LPH 508-A LPE 005R/G-A LPT 19QR/G-A
(20p12) (JAG1)
Chromosome 21
11.1 11.1
11.2 12 13.1
13.3
(20p11.1-q11.1) 20a Satellite
LPU 012-A
13 12 11.2 11.1 11.1
11.2 21
LPE 020R/G-A
22.1 22.2
(20q12) MAFB Plus Del (20q) (20q13.12) Del (20q) (20q13.2) ZNF217
Chromosome 22
Chromosome X
Chromosome Y
LPT 20PR/G-A
11.2
13.2
19qter
11.1 11
12.1 12.2 12.3 13
Acro-P-Arm
Chromosome 14
24.2
13.3
LPS 017-A LPS 034-A LPS 028-A LPS 033-A LPH 518-A
11.2
20qter
(17q11.2) NF1
(17q22) HLF
(18q11.2) SYT
LPE 011R/G-A
(12p13.2) TEL/AML1
Chromosome 13
24.1
19pter
LPT 18PR/G-A 13.3
(18p11.1-q11.1) 18a Satellite
13.3 13.2 13.1 12.3 12.2 12.1
Chromosome 19
11.2
21.1
(17p11.2) Smith-Magenis(RAI1)/ Miller-Dieker Smith-Magenis(FLII)/ Miller-Dieker
18pter
12pter
LPT 11PR/G-A
(11q23.3) MLL Breakapart MLL
11qter
Chromosome 17
Chromosome 12
22.3
LPH 524-A LPH 020-A LPH 020-A LPS 005-A LPT 20QR/G-A
Acro-P-Arm (21p11.1-q11.1) 13/21a Satellite (21q22.1) AML1 AML1/ETO TEL/AML1 (21q22.2) EWSR1/ERG TMPRSS2 ERG 21qter
LPE NOR-A
13 12 11.2 11.1 11.1
LPE 013R/G-A LPH 027-A LPH 026-A LPH 012-A LPS 008-A LPS 098-A LPS 099-A LPT 21QR/G-A
11.2 12.1 12.2 12.3 13.1 13.2 13.3
Acro-P-Arm
LPE NOR-A
(22p11.1-q11.1) 14/22a Satellite
LPE 014R/G-A
(22q11.21) DiGeorge TBX1/22q13.3 LPU 014-A DiGeorge TUPLE1/22q13.3 LPU 004-A DiGeorge N25/22q13.3 LPU 010-A (22q11.2) IGL
22.33 22.32 22.31 22.2 22.1 21.3 21.2 21.1 11.4 11.3 11.23 11.22 11.21 11.1 11.1
11.2 12
LPS 039-A / LPH 033-A
13
21.1 21.2
(22q11) BCR/ABL BCR/ABL Plus
LPH 007-A LPH 038-A
(22q12.2) EWSR1 EWSR1/ERG FLI1/EWSR1
LPS 006-A LPS 008-A LPS 007-A
21.3
XYpter
LPT XYPR/G-A
(Xp22.33) CRLF2 Distal CRLF2 Proximal P2RY8 Distal P2RY8 Proximal
LPH 511-A LPH 512-A LPH 513-A LPH 514-A
(Xp22.31) Kallmann/STS
LPU 016-A
11.32 11.31 11.2 11.1 11.1
11.21 11.221 11.222 11.223 11.23 12
(Xp11.1-q11.1) Xa Satellite LPE 0XR/G-A Xa & Ya Satellite LPE 0XYc-A Xa & Y Classical Satellite LPE 0XYq-A
22.1 22.2 22.3 23 24 25
(Xq13.2) XIST
22qter
LPT XYPR/G-A
(Yp11.32) CRLF2 Distal CRLF2 Proximal P2RY8 Distal P2RY8 Proximal SHOX
LPH 511-A LPH 512-A LPH 513-A LPH 514-A LPU 025-A
(Yp11.31) SRY
LPU 026-A
(Yp11.1-q11.1) Ya Satellite Xa & Ya Satellite
LPE 0YcR/G-A LPE 0XYc-A
(Yq12) Y Classical Satellite LPE 0YqR/G-A Xa & Y Classical Satellite LPE 0XYq-A LPU 018-A
26
(22q13.3) DiGeorge TBX1/22q13.3 LPU 014-A DiGeorge TUPLE1/22q13.3 LPU 004-A DiGeorge N25/22q13.3 LPU 010-A
XYpter
XYqter
LPT XYQR/G-A
27 28
XYqter
LPT XYQR/G-A
LPT 22QR/G-A
LPH 505-A LPT 17QR/G-A
Oxford Gene Technology Inc. 520 White Plains Road, Suite 500, Tarrytown, NY 10591, USA T: 860.298.8382 F: 860.298.8586 E: probes@rainbowscientific.com
Oncology and Constitutional FISH probes
www.ogt.com
E: probes@cytocell.com
W: www.cytocell.com US-PCHROM-V001/2014_07