Composta por quatro unidades, sua reserva técnica conta com objetos e artefatos oriundos de pesquisas em antropologia, arqueologia e artes populares. Cada uma das unidades – Arqueologia, Etnologia, Cultura e Patrimônio e Documentação Textual, Sonora e Visual – funciona como um complemento das atividades de pesquisa e produção científica da Universidade Federal do Paraná.
O acervo é composto por peças coletadas em pesquisas, coleções doadas em comodato, além de peças adquiridas. Referência cultural importante do Estado, o MAE oferece amplo campo para estudo e pesquisa.