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LE CADRE D' É VALUATION TRANSPARENT (TAF)
from Rapport Annuel du CIEM 2022
by ICES
Il faut garantir la transparence et la reproductibilité des principaux résultats scientifiques des groupes d’experts du CIEM. À cet effet, le cadre d’évaluation transparent (TAF) offre une ressource en ligne pour les bilans annuels des stocks de poissons et des pêcheries mixtes, ainsi que pour d’autres types d’évaluations issus des avis du CIEM sur des sujets tels que les contaminants, les indicateurs benthiques, les impacts de la pêche, les relevés statistiques, les estimations de captures, les synthèses des écosystèmes et des pêcheries. Le cadre permet à quiconque de trouver, référencer, télécharger et exécuter facilement une analyse à n’importe quel stade du processus menant à la publication de l’avis du CIEM.
À cet égard, l’utilisation d’outils permettant la reproductibilité de la recherche est une étape essentielle. La recherche reproductible adhère aux principes FAIR (« trouvable, accessible, interopérable et réutilisable »), où le principe de transparence permet à d’autres de parvenir au même résultat en utilisant les mêmes données et les mêmes méthodes. En 2022, les experts de la communauté du CIEM ont appris à bien se servir des outils qui permettent de reproduire la recherche, notamment comment générer des documents R Markdown pour documenter les analyses, des dossiers git pour les flux de code, et le TAF pour encapsuler la collecte, le traitement et la documentation des données sur une seule et même plateforme. Il s’agit de la formation « Reproducible science, best practices, and ICES Transparent Assessment Framework. »
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Trois workshops très populaires dédiés au TAF ont été organisés pour les experts travaillant sur l’évaluation des stocks, avec des introductions, des démonstrations et des exercices sur la production de bilans du CIEM et sur le travail dans un système GitHub.
Au centre de ces ateliers, en accès libre, on trouve le guide du TAF, ainsi que des exemples et des templates hébergés sur GitHub pour aider les utilisateurs à démarrer. D’autres modules d’apprentissage TAF sont disponibles sur le site web du CIEM.
Le système régional de base de données et d’estimation (RDBES) est une plateforme de base de données coordonnée au niveau régional pour les évaluations des pêcheries. La plateforme stocke des données détaillées d’échantillonnage des pêches commerciales et des données agrégées sur l’effort et les débarquements. Le TAF est un élément essentiel du RDBES : en soutien à ce processus, un workshop sur la collecte de données à l’aide du RDBES en utilisant le TAF a été organisé en 2022.
"Après une première courbe d'apprentissage, les experts qui utilisent le TAF indiquent que les analyses futures sont faciles à mettre à jour, à modifier et à ré-exécuter, tandis que les nouveaux utilisateurs ont pu réutiliser le code écrit par des utilisateurs plus expérimentés. Dans l'ensemble, les utilisateurs comprennent que le TAF est essentiel pour la transparence des avis et la provenance des données sous-jacentes. Dans le courant de l'année, une base de données de résultats TAF (principalement des évaluations de stocks) sera publiée. Cela devrait faciliter l'alimentation d'autres bases de données du CIEM avec recommandations (par exemple, les graphiques d'évaluation des stocks, la base de données 'avis et scénarios'). À terme, l’idée est de réduire la charge de travail des experts en matière d'évaluation des stocks".
Colin Millar
Chargé des données et de l'évaluation
Colin Millar Data and Assessment Professional Officer
Cecilia Kvaavik Advice Data Officer
Luca Lamoni Advice and Data Analyst