IRB Barcelona Resumen Ejecutivo 2008 by IRB Barcelona

Resumen Ejecutivo 2008

IRB Barcelona Parque Científico de Barcelona Baldiri Reixac 10 08028 Barcelona España Tel: +34 93 402 0250 Fax: +34 93 403 7114 info@irbbarcelona.org www.irbbarcelona.org

Con la colaboración de

Instituto de Investigación Biomédica

Entidades fundadoras

Centres de recerca de Catalunya

Resumen CientĂfico Resumen Ejecutivo 2008 1

© Copyright 2009 Producción: Oficina de Comunicación y Relaciones Externas Instituto de Investigación Biomédica — IRB Barcelona Baldiri Reixac, 10 08028 Barcelona www.irbbarcelona.org Edición y maquetación: Anna Alsina

Créditos

Diseño: Nicola Graf Fotografía: Maj Britt Hansen, Raimon Solà, Oficina de Comunicación y Relaciones Externas Impresión: Puresa/La Trama Depósito legal: B-20008-2009

Este documento se ha impreso con papel ecológico procedente de plantaciones de gestión forestal sostenible.

Resumen Ejecutivo 2008

Índice

Prólogo................................................................

Resumen Científico Programa de Biología Celular y del Desarrollo..................

Programa de Biología Estructural y Computacional............

Programa de Medicina Molecular..................................

Programa de Química y Farmacología Molecular...............

Programa de Oncología.............................................

Plataformas Científicas.............................................

Datos IRB Barcelona Patronato.............................................................

Junta de Gobierno...................................................

Comité Científico Internacional...................................

Fuentes de Financiación............................................

Resumen de la Producción Científica.............................

Tesis Doctorales......................................................

Actividades de Transferencia de Tecnología.....................

Seminarios Barcelona BioMed......................................

Conferencias Barcelona BioMed...................................

Actividades de Divulgación.........................................

Organigrama..........................................................

Personal de Dirección y Administración..........................

Estadísticas de Recursos Humanos................................

Afiliaciones de los Investigadores.................................

Parque Científico de Barcelona...................................

4 Resumen Ejecutivo 2008 Índice

6 Resumen Ejecutivo 2008 Resumen CientĂfico

PRÓLOGO

IRB Barcelona: creciendo sobre una base sólida

a tercera edición de la memoria anual del IRB Barcelona se divide en tres volúmenes: la Memoria Científica, que ofrece un

resumen detallado de la investigación llevada a cabo durante el año por nuestros grupos de investigación y plataformas científicas, el Resumen Ejecutivo, que incluye datos generales y cifras del Instituto, e Historias de Ciencia del IRB Barcelona, en el que se destacan algunos de los proyectos de investigación del Instituto, prestando especial atención a las personas que se hallan detrás de la ciencia. El objetivo principal de estos volúmenes es ofrecer una visión detallada de las actividades llevadas a cabo en el Instituto durante el año 2008. Asimismo, esperamos que también sirvan de plataforma para que los lectores se adentren en la actividad de este nuevo centro único en el escenario de la investigación biomédica. La nueva fase de construcción y ampliación del Parque Científico de Barcelona (PCB), colindante a los laboratorios del IRB Barcelona, continúa avanzando según las previsiones. El PCB, donde se ubican actualmente los grupos científicos del Instituto, está en pleno proceso de expansión para aumentar su superficie de los 36.800 m2 hasta los 90.000 m2 en el año 2011. El agujero inmenso en el suelo, fruto de las obras de ampliación del PCB, ha sido cubierto para dar paso a la construcción de cimientos sólidos en los que se ubicarán nuevos laboratorios y servicios para la comunidad científica. El área se ha convertido en un testamento físico de la importante inversión económica hecha en infraestructuras de investigación en Barcelona, una realidad que está cambiando el paisaje de la ciudad y fomentando el potencial de la investigación biomédica en la región. Prólogo Resumen Ejecutivo 2008 7

El IRB Barcelona, a una escala similar, también avanza con rapidez al ritmo de su anfitrión. Tres años después de su fundación oficial en el 2005, los cimientos del Instituto se han establecido de forma sólida para abrir paso a la consolidación del IRB Barcelona como uno de los centros de investigación pioneros a nivel mundial. Durante el 2008, el Instituto lanzó iniciativas relevantes orientadas a cumplir con sus misiones, que incluyen promover la investigación multidisciplinaria de excelencia en el campo de la biología estructural, la química y la biología, con un énfasis especial en cáncer; impulsar las colaboraciones entre institutos de investigación locales, nacionales e internacionales y promover el potencial de Barcelona como un clúster biomédico; ofrecer un alto nivel de formación en el campo de las ciencias biomédicas a estudiantes y visitantes en todos los niveles de sus carreras científicas; promover la innovación y la transferencia de tecnología en el campo de la biomedicina y fomentar un diálogo abierto con el público mediante una serie de actividades educativas y de ciencia y sociedad.

Los cimientos del Instituto se han establecido de forma sólida para abrir paso a la consolidación del IRB Barcelona como uno de los centros de investigación pioneros a nivel mundial

Captación de talentos científicos El IRB Barcelona ha continuado invirtiendo esfuerzos durante el 2008 en la captación de algunas de las mentes científicas más brillantes del mundo. El científico Jens Lüders (Hannover, 1969), de la Universidad de Stanford (EEUU), se incorporó al IRB Barcelona en enero para dirigir un grupo de investigación dentro del Programa de Biología Celular y del Desarrollo. Su investigación se centra en revelar los mecanismos moleculares que se hallan detrás de la organización microtubular. El investigador Xavier Salvatella (Barcelona, 1972), anteriormente en la Universidad de Cambridge (Gran Bretaña), se incorporó al IRB Barcelona en julio del 2008 como investigador principal dentro del Programa de Química y Farmacología Molecular. Su grupo estudia la estructura y las dinámicas de las biomacromoléculas y su papel en el desarrollo de enfermedades. El Instituto también contrató al científico Travis Stracker (Ohio, 1974), anteriormente en el Memorial Sloan Kettering Cancer Center de Nueva York (EEUU), para liderar un grupo de investigación en el Programa de Oncología. El laboratorio, que iniciará sus actividades a comienzos del 2009, centrará esfuerzos en la inestabilidad genómica y el cáncer e investigará el papel que juega la respuesta al daño de ADN en la supresión de tumores.

8 Resumen Ejecutivo 2008 Prólogo

Resumen CientĂfico Resumen Ejecutivo 2008 9

Plataformas científicas al servicio de la ciencia Hace unos años, los laboratorios acostumbraban a centrar sus esfuerzos en un número limitado de genes y moléculas, a menudo en un único sistema modelo. En la actualidad, los proyectos relacionados con la medicina suelen englobar la monitorización del comportamiento de la totalidad del genoma, con estudios que pasan rápidamente del ordenador al tubo de ensayo, a organismos modelo y a tejidos humanos. Ningún laboratorio por sí solo puede llegar a dominar todas las técnicas necesarias para dilucidar estas cuestiones. Por este motivo, hemos puesto en marcha distintas unidades de servicios con el fin de poner al alcance de nuestros investigadores unas instalaciones y unos equipamientos de última generación. Al margen de las plataformas científicas ya existentes dedicadas a la genómica funcional, la espectrometría de masas, la expresión de proteínas y los ratones transgénicos, durante el año 2008 se creó la Unidad de Bioestadística y Bioinformática, dirigida por el científico David Rossell (Barcelona, 1977), del MD Anderson Cancer Center de Houston, Texas. También se puso en marcha la Plataforma Científica de Microscopía Digital Avanzada, gestionada conjuntamente con el PCB y dirigida por el científico Julien Colombelli (París, 1977), del European Molecular Biology Laboratory de Heidelberg, Alemania. Estas nuevas adiciones amplían el abanico consolidado de plataformas existentes gestionadas por el Parque Científico de Barcelona y los Servicios Científicos y Técnicos de la Universidad de Barcelona.

Los investigadores del IRB Barcelona han conseguido aumentar con éxito los recursos de investigación gracias a la obtención de ayudas competitivas y de fuentes de financiación privadas

Nuevos horizontes marcados por colaboraciones El IRB Barcelona es consciente de que ningún instituto por sí solo puede desvelar las complejidades moleculares de las ciencias de la vida. Para conseguir que la investigación se traduzca en beneficios para la salud humana es esencial adoptar un camino basado en el conocimiento y las habilidades de un amplio equipo multidisciplinario de expertos. Asimismo, para transformar el conocimiento en nuevas herramientas y terapias es fundamental que se establezcan nuevos vínculos con institutos de investigación, universidades, centros clínicos y el sector industrial. Con este objetivo, los científicos del IRB Barcelona establecieron en el 2008 numerosas colaboraciones científicas y entraron a formar parte de redes de investigación a nivel local, nacional e internacional. También continuó aumentando el número de alianzas estratégicas institucionales con otros centros.

10 Resumen Ejecutivo 2008 Prólogo

El programa conjunto con el Centro de Supercomputación de Barcelona (BSC), creado en el 2007, continuó fiel a sus objetivos con la creación del Laboratorio de Bioinformática Experimental (EBL), un grupo de investigación dirigido conjuntamente por investigadores principales del IRB Barcelona y del BSC. Por otro lado, varios grupos de investigación del IRB Barcelona y del Instituto de Investigaciones Biomédicas August Pi i Sunyer (IDIBAPS) empezaron a planificar reuniones periódicas conjuntas en el marco de creación del nuevo Instituto de Investigación Sanitaria Clínic-IDIBAPS. El objetivo de esta iniciativa es impulsar las colaboraciones entre científicos que trabajan en centros de investigación básica y clínica promoviendo así la investigación traslacional.

Atracción de recursos Aparte de la fuente de financiación principal que proviene de la Generalitat de Catalunya (a través del Departamento de Innovación, Universidades y Empresa y el Departamento de Salud), los investigadores del IRB Barcelona consiguieron incrementar con éxito los recursos de investigación gracias a la obtención de ayudas competitivas y de fuentes de financiación privadas. La Comisión Europea otorgó al IRB Barcelona en el 2008 la coordinación de dos proyectos pioneros en el ámbito de la salud dentro del 7o Programa Marco. El Instituto también fue seleccionado para participar como socio en cuatro proyectos de biomedicina financiados por la Comisión Europea. Asimismo, el investigador Eduard Batlle, del Programa de Oncología del IRB Barcelona, fue premiado en el 2008 con una ayuda del Consejo Europeo de Investigación (ERC) para liderar un estudio sobre la progresión del cáncer colorrectal. Los investigadores del IRB Barcelona también recibieron ayudas de entidades con fines filantrópicos destinadas a impulsar actividades de investigación. La Fundación Banco Bilbao Vizcaya Argentaria amplió y reforzó la colaboración existente con el IRB Barcelona con una aportación económica para financiar actividades de investigación en el Programa de Oncología y también como patrocinadora de las actividades Barcelona BioMed. La Fundación Marcelino Botín, por su parte, continuó respaldando a los grupos de investigación de los programas de Medicina Molecular y de Biología Estructural y Computacional. El IRB Barcelona también fue uno de los cuatro institutos de investigación españoles seleccionados por ‘La Caixa’ que recibieron una dotación económica destinada a incorporar a jóvenes talentos en el programa de doctorado. La iniciativa se puso en marcha en el 2008 con el lanzamiento de la primera convocatoria de becas. El Instituto también consolidó durante el año nuevas estructuras administrativas para dar apoyo adicional a los científicos en sus actividades de investigación. La creación de una oficina de proyectos en noviembre fue impulsada para dar apoyo técnico a los investigadores y guiarlos durante el proceso de solicitudes de financiación externa.

Prólogo Resumen Ejecutivo 2008 11

12 Resumen Ejecutivo 2008 Resumen CientĂfico

Un entorno para la innovación La mayoría de la investigación en el IRB Barcelona se centra sobre todo en incógnitas científicas básicas que han sido, durante décadas, una fuente muy importante de innovación y de nuevas tecnologías. La probabilidad de lograr nuevos avances científicos es mayor en un entorno que fomente la innovación y que facilite la transferencia de tecnología. Además del apoyo recibido por parte de la Fundación Bosch i Gimpera, el IRB Barcelona unió esfuerzos para crear su propia Oficina de Innovación y Proyectos Estratégicos, que entrará en funcionamiento a comienzos del 2009.

Formación de futuros líderes: El programa de doctorado del IRB Barcelona El nivel de investigación y el número de actividades en el IRB Barcelona constituyen un entorno único en el que estudiantes de todo el mundo pueden realizar trabajos de investigación para la obtención de sus doctorados. Los estudiantes, que se benefician de la tutela cercana de su mentor, tienen a su alcance un amplio abanico de actividades, servicios y redes científicas durante su estancia doctoral. El programa que ofrecemos, que en el 2008 se vio reforzado con el lanzamiento del Programa Internacional de Doctorado ‘La Caixa’/IRB Barcelona, va más allá del laboratorio: a los estudiantes de doctorado del IRB Barcelona se les brinda la oportunidad de conocer, a través de seminarios y conferencias, a investigadores de primera línea en sus respectivos campos. Las reuniones de carácter social, denominadas ‘cool-off sessions’ y que se celebran una vez al mes, también ofrecen a los estudiantes la oportunidad de relacionarse en un entorno más informal con el resto de doctorandos del Instituto. En el 2008, la comunidad estudiantil impulsó la creación de un Consejo para coordinar actividades organizadas por doctorandos que incluyen, entre otras, la celebración del primer simposio de doctorado del IRB Barcelona, previsto para noviembre del 2009.

El nivel de investigación y el número de actividades en el IRB Barcelona constituyen un entorno único en el que estudiantes de todo el mundo pueden realizar trabajos de investigación para la obtención de sus doctorados

Un programa para postdoctorados A pesar del número de programas de financiación e incentivos que hay en la actualidad al alcance tanto de los investigadores que se encuentran al inicio de sus carreras como de aquellos con más experiencia que ya han puesto en marcha sus propios laboratorios, la necesidad real de cubrir investigación mediante la contratación de postdoctorados a menudo no se tiene lo suficientemente en cuenta. Después de la consolidación de

Prólogo Resumen Ejecutivo 2008 13

nuestro programa de doctorado, que ha logrado resultados excelentes, nuestro objetivo ahora es basarnos en este ejemplo para impulsar la creación de estructuras y recursos para los investigadores que se hallan un paso más adelante de sus carreras científicas. El IRB Barcelona ofrece a los postdoctorados una atmósfera estimulante para llevar a cabo sus proyectos de investigación en laboratorios y plataformas científicas punteras. Los investigadores postdoctorados también tienen acceso, al igual que los estudiantes, a un amplio abanico de seminarios, conferencias, talleres, servicios y redes científicas. El objetivo del IRB Barcelona es ofrecer un entorno científico óptimo a los investigadores que se hallan en una fase clave de sus carreras, preparándolos así para recorrer el camino dirigido a encontrar cargos científicos independientes en laboratorios españoles, europeos y del resto del mundo. El IRB Barcelona lanzó en el 2008 una convocatoria interdisciplinaria con el objetivo de contratar a postdoctorados para trabajar en proyectos liderados por grupos de dos programas de investigación distintos. Las cuatro plazas se cubrieron con éxito; tres de los postdoctorados se incorporaron al Instituto ese mismo año y el cuarto se incorporará a comienzos del 2009. Como reconocimiento de las necesidades específicas de los postdoctorados en materia de formación y de apoyo en el desarrollo de sus carreras, el Instituto ha empezado a poner en marcha nuevas estructuras e iniciativas que van más allá del laboratorio.

Barcelona BioMed La investigación actual se caracteriza por tener una vertiente plenamente internacional. Mantenernos bien informados de los acontecimientos mundiales en las ciencias biomédicas e impulsar colaboraciones con otras instituciones internacionales son dos elementos clave para conseguir nuestros objetivos. Uno de los mecanismos que hemos puesto en marcha son las ‘Barcelona BioMed’, una serie de actividades científicas de divulgación que consisten en seminarios, conferencias, talleres y fórums, todas ellas orientadas a proporcionar una plataforma de intercambio de opiniones sobre biomedicina. Los Seminarios Barcelona BioMed consisten en un ciclo de conferencias semanales a cargo de reconocidos científicos internacionales de distintas áreas de las ciencias biomédicas para presentar y poner en común los últimos resultados en sus campos de investigación. A través de estos seminarios, los investigadores del IRB Barcelona y la comunidad científica local tienen la oportunidad de intercambiar información sobre los últimos avances en las ciencias de la vida y de establecer un contacto directo con los ponentes. Durante el año 2008, el IRB Barcelona organizó más de un centenar de seminarios. Las Conferencias Barcelona BioMed se organizan en colaboración con la Fundación BBVA y tienen lugar en la sede del Institut d’Estudis Catalans, en el centro de Barcelona. Las conferencias constituyen una plataforma

14 Resumen Ejecutivo 2008 Prólogo

Resumen CientĂfico Resumen Ejecutivo 2008 15

creativa donde investigadores de primera línea se reunen para poner en común los últimos avances alcanzados en un amplio abanico de disciplinas. El enfoque singular de estas conferencias consiste en reunir a un grupo selecto de participantes con el fin de favorecer un entorno catalizador de ideas. Un total de veinte ponentes, elegidos entre los mejores investigadores del mundo en sus campos, se reúnen con un número reducido de participantes durante tres días de intenso debate sobre la situación actual y el futuro de sus disciplinas. Entre los temas que se trataron en las Conferencias Barcelona BioMed destacan ‘Targeting and Tinkering with Interaction Networks’ (abril), ‘Metastasis Genes and Functions’ (mayo) y ‘Morphogenesis and Cell Behaviour’ (octubre). Estamos convencidos de que los institutos que tengan a su alcance el potencial de cambiar a la sociedad deben debatir sus trabajos de investigación con el público general, ayudando así a la población a afrontar dichos cambios. Los Fórums Barcelona BioMed son una plataforma para fomentar el diálogo multidisciplinario en temas biomédicos con el objetivo final de acercar la ciencia a la sociedad. El Fórum de este año, titulado ‘From woman to woman: Practical advice on how to get and stay ahead in science’, se centró en los motivos que empujan a las mujeres a acabar renunciando, en un porcentaje muy superior al de los hombres, a sus carreras científicas durante los últimos años de su etapa académica. El Fórum ofreció soluciones prácticas orientadas a ayudar a las mujeres científicas a superar el desnivel de género para garantizar así la igualdad de oportunidades en sus carreras científicas. Los resultados del fórum se publicaron en una edición especial de la revista de la Sociedad Española de Bioquímica y Biología Molecular y en una publicación especial del IRB Barcelona titulada ‘Breaking the Glass Ceiling: Proposals to Adjust the Role of Women in Science’. Construyendo la comunidad IRB Barcelona El IRB Barcelona también dirigió esfuerzos durante el 2008 hacia la creación de oportunidades de intercambio a nivel científico y social. Entre las iniciativas destacan la revista ‘In Vivo’, la publicación semestral del IRB Barcelona, la puesta en marcha de recursos mediante la creación de la intranet del Instituto, así como un número de actividades sociales que incluyen las ‘cool-off sessions’, la creación de un club de fútbol y de un equipo de deportistas para competir en la Maratón de Barcelona, así como un número de encuentros sociales. El 2008 ha sido un año de consolidación y crecimiento en las distintas áreas de investigación del Instituto. A medida que el IRB Barcelona continúa creciendo, nuestros científicos y el personal de apoyo a la investigación seguirán uniendo esfuerzos para hacer frente a los retos científicos y organizativos, con el objetivo de garantizar un posicionamiento destacado en el escenario internacional de los centros de investigación biomédica. Joan J Guinovart Director 16 Resumen Ejecutivo 2008 Prólogo

Joan Massagué Director Adjunto

Resumen Científico • Programa de Biología Celular y del Desarrollo • Programa de Biología Estructural y Computacional • Programa de Medicina Molecular • Programa de Química y Farmacología Molecular • Programa de Oncología • Plataformas Científicas

Resumen Científico Resumen Ejecutivo 2008 17

Programa de Biología Celular y del Desarrollo

una escala que abarca desde el tamaño de una molécula individual hasta el cuerpo humano, la célula se sitúa aproximadamente en el medio, siendo el vínculo entre los dos niveles. Al transformar la información que contiene su genoma en proteínas y en otras moléculas, una célula sabe cuándo dividirse, qué forma adoptar y cómo debe comportarse para construir un organismo completo. Es posible comprender qué le ha pasado a un organismo sano o enfermo a partir de lo que ocurre en el interior de las células. El Programa de Biología Celular y del Desarrollo investiga la interrelación de estos niveles mediante un estudio más exhaustivo de la célula con el fin de averiguar cómo se forman las estructuras y su contribución en la construcción de un organismo. Hasta hace dos décadas, estas cuestiones se estudiaban en disciplinas muy distintas, si bien desde entonces se han ido acercando y han ido creciendo de manera conjunta. Los biólogos celulares están empezando a controlar los procesos que permiten a las células crear estructuras de mayor tamaño, a la vez que biólogos del desarrollo están centrando su interés en los mecanismos celulares que controlan el crecimiento de embriones. La unión de estas dos áreas requiere la implementación de abordajes experimentales multidisciplinarios que comprenden desde la biología molecular moderna, la genética clásica, la bioquímica y la microscopía avanzada hasta los más modernos métodos de tecnología punta de la genómica y la proteómica. Los grupos del programa exploran cuestiones como la forma en la que se produce la comunicación de señales, tanto dentro como entre las células, qué controla la migración celular, cómo se forman las fronteras entre tejidos durante el desarrollo y cómo se controla el crecimiento de tejidos. También son materia de estudio la organización microtubular, la división celular en el desarrollo y la enfermedad, la regulación epigenética y la función de la cromatina, y la manipulación de la traducción genética con fines terapéuticos. Los modelos utilizados por los distintos grupos de investigación del programa incluyen levadura, Drosophila, ranas, ratones y parásitos humanos.

18 Resumen Ejecutivo 2008 Resumen Científico

Dentro del núcleo: estructura y función de la cromatina Ninguna célula produce ARN ni proteínas de todos sus genes todo el tiempo. Esto se debe, en parte, a que el ADN en el núcleo está envuelto en proteínas y otras moléculas por una forma denominada cromatina. Estas moléculas desempeñan un papel importante porque ayudan a empacar una cantidad inmensa de ADN en el pequeño espacio del núcleo; otra función de estas moléculas es conseguir que los genes sean accesibles (o inaccesibles) a las estructuras funcionales que los transforman en otros tipos de moléculas. El laboratorio de Ferran Azorín estudia los procesos moleculares que estructuran la cromatina para poder controlar sus efectos biológicos. El tema principal en el que están trabajando es averiguar cómo se desactivan los bloques grandes de ADN y lo que hace la célula para mantener estos bloques desactivados. Algunas regiones del ADN están silenciadas de manera casi permanente; otras se activan o desactivan para lograr determinados efectos en el desarrollo. Azorín y su equipo están estudiando ambos tipos de regiones.

Señales que organizan las células en las estructuras del cuerpo Para crear un organismo complejo es preciso que las células se especialicen, cambiando la manera en la que se dividen, su forma y su conducta, tal y como hacen, por ejemplo, cuando migran. Estos cambios morfogenéticos están coordinados por indicadores del entorno como, por ejemplo, por moléculas secretadas por otras células. Estas indicaciones deben ser interpretadas correctamente dentro de la célula,

Resumen Científico Resumen Ejecutivo 2008 19

lo cual significa que la información debe pasar a lo largo de una vía de moléculas de señalización. Una misma señal puede tener distintos efectos en momentos y sitios distintos del cuerpo. Muchas de estas vías de comunicación celular, que se han conservado a lo largo de la evolución, han facilitado que los estudios con organismos modelo como la mosca de la fruta puedan revelar información sobre la evolución en los humanos y otros animales. El laboratorio de Jordi Casanova centra su investigación en este proceso utilizando como modelos el desarrollo de la tráquea y la vía de señalización celular del receptor de Torso en la mosca de la fruta.

Las bases de la división celular Las células nuevas del organismo provienen de células progenitoras que se ha dividido. La división celular requiere de una sincronización perfecta de múltiples eventos, y la manera en que ésta se produce depende del contexto: funciona de manera distinta en células embrionarias o en células madre que luego se especializan en células sanguíneas, en neuronas, o en cientos de otros tipos de células, o también dentro de un tumor de rápido crecimiento. El laboratorio de Cayetano González combina la genética, la biología molecular y la microscopía avanzada en vivo para estudiar la división celular. Los sistemas modelo que utilizan estos investigadores incluyen la Drosophila y células cultivadas de vertebrados. Entre los proyectos actualmente en curso se encuentra el estudio del huso mitótico (un conjunto de fibras que tiran de los cromosomas para dividirlos en dos grupos), el estudio de proteínas de reciente descubrimiento que conforman estructuras denominadas centrosomas y la modelización del cáncer en la mosca de la fruta.

El citoesqueleto microtubular: una cuestión de organización Los microtúbulos unen los husos que conducen a la segregación cromosómica durante las divisiones celulares meióticas con el objetivo de producir huevo y esperma, y proporcionar movimiento al esperma mediante el desarrollo de flagelo. Después de la fertilización, los microtúbulos son necesarios para promover la proliferación celular a partir de la formación del huso miótico, la segregación cromosómica y la división celular. Cuando las células se diferencian, los microtúbulos establecen polaridad celular, participan en la comunicación entre las células y también juegan un papel en la migración celular. Para llevar a cabo funciones tan variadas, los microtúbulos se organizan en redes complejas de diversos tamaños y formas. Una incorrecta organización microtubular ha sido relacionada con enfermedades como el cáncer y defectos del desarrollo. Con el objetivo de comprender cómo las células organizan sus redes microtubulares, el laboratorio de Jens Lüders estudia los mecanismos moleculares que determinan dónde y cuándo se forman los microtúbulos. El laboratorio, que utiliza el cultivo de tejidos celulares y el extracto de huevos de Xenopus laevis como sistemas modelos, centra su investigación en la identificación y caracterización de las vías microtubulares y en el papel de los centros organizadores microtubulares como, por ejemplo, el centrosoma.

Formación de extremidades: señales, compartimentos y límites En el embrión, estructuras complejas como las extremidades comienzan a desarrollarse como grupos de células que son idénticas al principio, pero que rápidamente se subdividen en territorios más pequeños llamados compartimentos. El laboratorio de Marco Milán está aprovechando los resultados derivados de casi un siglo de estudios de genética realizados en la mosca de la fruta con el fin de estudiar las señales que guían el desarrollo de las extremidades en la Drosophila. En trabajos anteriores de investigación se ha demostrado que los compartimentos se desarrollan gracias a mecanismos que evitan que distintos tipos de células se mezclen, lo cual conduce a la formación de subterritorios y límites compartimentales entre los tejidos. Las células que se encuentran en dicho límite físico secretan las moléculas señalizadoras como Wg/Wnt y Dpp/TGF‚ que guían el patrón y el crecimiento de toda la extremidad. Milán y su equipo están

20 Resumen Ejecutivo 2008 Resumen Científico

interesados en entender cómo estas moléculas controlan procesos tan complejos como la generación de extremidades adultas con un tamaño concreto, forma y patrón fijo y específico de especie.

Traducción genética y enfermedades Para sobrevivir, las células tienen que transformar la información que contienen en el genoma en ARN y, posteriormente, en proteínas. Este último paso, denominado traducción, requiere de un complejo entramado de otras moléculas que los científicos justo ahora empiezan a entender en mayor detalle. Muchas de las interacciones que se producen abarcan desde el proceso de fabricación de proteínas hasta otras vías reguladoras en las células. Los desequilibrios causados por alteraciones de estas interacciones se encuentran en el origen de varias enfermedades y son utilizados por patógenos humanos durante procesos infecciosos. El laboratorio de Lluís Ribas de Pouplana está estudiando estas redes de interacción en células humanas y en protozoos que infectan a los seres humanos. El grupo también estudia la evolución de la maquinaria de traducción genética, que se ha visto sometida a cambios significativos en la evolución de células eucarióticas como la levadura, las plantas y los animales. A través del estudio de las moléculas relacionadas con la traducción, Ribas y su grupo confían en obtener un mayor conocimiento sobre la evolución de estas células.

Construcción y reconstrucción del cerebro El desarrollo del cerebro incluye distintas etapas: la formación de las regiones, el desarrollo y especificación de distintos tipos de células nerviosas, el control de la migración celular, y la formación de redes de conexión para unir unas células con otras. Asimismo, tienen que responder adecuadamente a la estimulación para permitir la memoria y el aprendizaje. Para lograr estas fases, es necesario que las células activen genes específicos en el momento preciso, que interpreten correctamente las señales de las moléculas que se encuentran en la superficie de otras células (o que son secretadas por éstas) y que respondan de forma adecuada. El laboratorio de Eduardo Soriano centra parte de su investigación en identificar nuevos genes que contribuyen a que se produzcan estos procesos. El grupo también trabaja en el estudio de las diferencias entre las células cerebrales en las etapas embrionarias y durante los primeros años de vida —células que pueden desarrollarse y recuperarse— y las células cerebrales en adultos, que no pueden hacer ninguna de estas dos cosas. Un mayor conocimiento de los mecanismos que rigen el desarrollo temprano del cerebro podría ayudar a los científicos a diseñar nuevas terapias regenerativas orientadas a reparar lesiones cerebrales en adultos.

Resumen Científico Resumen Ejecutivo 2008 21

Programa de Biología Estructural y Computacional

a física y la vida tienen su punto de encuentro en las moléculas individuales, cuyo comportamiento viene dictado por la forma y las propiedades químicas de estas. El ADN, el ARN, las proteínas y otras moléculas interactúan entre sí y se transforman mediante un complejo ritual que da como resultado la creación de organismos vivientes. Para tener un entendimiento detallado de la vida es necesario dilucidar la relación entre el comportamiento de estos componentes y sus estructuras. Esta perspectiva es igualmente crucial para la investigación de enfermedades genéticas, causadas a menudo por pequeños cambios estructurales entre las moléculas. También es útil para mejorar los fármacos existentes y crear otros nuevos. Un fármaco consiste habitualmente en una pequeña molécula que funciona acoplándose a una proteína y alterando su comportamiento. Sin disponer de una imagen estructural de esta interacción es imposible determinar con exactitud cómo funcionan estas moléculas. El Programa de Biología Estructural y Computacional agrupa a un gran número de expertos que investigan estos aspectos de la vida. Los importantes avances en el campo de la cristalografía de rayos X y RMN logrados durante las últimas tres décadas, tecnologías accesibles a los investigadores del IRB Barcelona, han proporcionado imágenes estructurales muy precisas de muchas de las moléculas biológicas clave. Sin embargo, todavía quedan muchas por explorar y, hasta ahora, ha resultado muy difícil examinar el funcionamiento interno de las ‘máquinas moleculares’ formadas por un número elevado de moléculas. En muchos casos es posible obtener información estructural sobre nuevas proteínas y sus interacciones al comparar sus secuencias con las de otras moléculas conocidas. Para ello es necesario el uso de innovadoras herramientas computacionales, cuyo potencial ha crecido enormemente en los últimos años debido a la gran fuente de información que se ha generado con los proyectos de genómica.

22 Resumen Ejecutivo 2008 Resumen Científico

Diagramas del interior de las máquinas Los numerosos proyectos de secuenciación genómica han proporcionado una lista casi completa de las moléculas que puede producir un organismo. Las técnicas post-genómicas están revelando, de forma gradual, qué componentes se utilizan para construir determinadas máquinas en la célula. Sin embargo, todavía falta obtener una visión detallada de la unión de estos componentes. El grupo de Patrick Aloy está diseñando nuevos métodos bioinformáticos para combinar la información procedente de los genomas (secuencias proteicas) con la lista de componentes de las maquinarias (obtenidas a través de espectrometría de masas y otras técnicas) e información sobre las interacciones de superficies o componentes de moléculas (procedentes de estudios de rayos X y de RMN) con diagramas de la construcción detallados de los complejos. Esta información se puede utilizar para indicar los puntos débiles de un complejo, que podrían servir de dianas para experimentos o para el diseño de nuevos fármacos.

Moléculas que se unen al ADN El grupo liderado por Miquel Coll utiliza distintas técnicas para estudiar el ADN cuando está unido a proteínas y a otras moléculas. Su método principal de estudio se basa en el uso de rayos X de alta intensidad que permite estudiar moléculas en forma cristalizada. Uno de los temas centrales de la investigación es determinar la forma mediante la cual las proteínas se unen al ADN para controlar la actividad de los genes, lo que constituye un paso clave en la mayoría de procesos biológicos. Otra área de interés es

Resumen Científico Resumen Ejecutivo 2008 23

el fenómeno denominado transferencia horizontal de genes, en el cual determinadas células transportan ADN a otras células. Este proceso requiere complejos mecanismos para transportar el ADN a través de las membranas. Otros temas de interés científico incluyen el estudio de estructuras únicas de ADN y de nuevos fármacos que puedan acoplarse al ADN en lugar de hacerlo a proteínas.

Estrés oxidativo: proteínas de membranas Las proteínas, que desempeñan un papel fundamental en la mayoría de los procesos biológicos, casi nunca actúan solas. Normalmente una molécula se une a docenas de proteínas, a los ARN, o a otras moléculas para realizar una función determinada. Observar de manera detallada las estructuras internas de las proteínas y, en algunos casos, descubrir dónde actúan dentro de la célula, no es una tarea fácil. Con el fin de responder a estas cuestiones, el laboratorio de Ignasi Fita combina la cristalografía de rayos X y la crio-microscopía electrónica para estudiar la biología estructural del peroxisoma, uno de los orgánulos eucarióticos más pequeños delimitados por una membrana. El grupo está particularmente interesado en los complejos que intervienen en la aparición de enfermedades y en las proteínas que se unen a la membrana del orgánulo. Los investigadores colaboran en el estudio de complejos de proteínas eucarióticas y de virus ligados a proteínas receptoras necesarias para entrar en la célula. El trabajo de investigación también se centra en el estudio de diferentes tipos de enzimas, en concreto, las asociadas al estrés oxidativo.

La RMN y la purificación de estructuras La resonancia magnética nuclear (RMN) es una técnica eficaz utilizada para determinar estructuras tridimensionales a partir de la aplicación de campos magnéticos intensos a disoluciones de proteínas. Mediante el uso de secuencias de pulsos, la técnica permite obtener señales que se correlacionan con las distancias entre átomos con el fin de obtener familias de estructuras representativas. El laboratorio de Maria Macias se ha especializado en la utilización de esta técnica para analizar las estructuras de las proteínas y sus mecanismos de plegamiento. Su grupo de investigación ha puesto en marcha un proceso eficaz de colaboración con otros laboratorios interesados en determinar estructuras de proteínas mediante la supervisión y la transferencia de protocolos de obtención de proteínas puras en escala de miligramos. El laboratorio también presta apoyo a las asignaciones de RMN que se llevan a cabo y las supervisa, y ofrece protocolos modificados para la determinación de estructuras en solución.

Análisis de datos y modelaje de interacciones Las interacciones entre proteínas y otras moléculas se producen con tanta rapidez y a una escala tan pequeña que no se pueden observar directamente. Para poder estudiarlas hay que recorrer a modelos que incorporen información de muchas fuentes. El grupo de Modesto Orozco combina distintos métodos —desde el análisis automático de bases de datos biológicas hasta la adaptación de cálculos matemáticos de dinámica clásica y química cuántica— para desarrollar dichos modelos en el ordenador. El objetivo a largo plazo es conectar la escala más pequeña de la vida con el comportamiento de las células y con sistemas de mayor tamaño en los organismos.

Las interacciones como modificadoras de estructuras La RMN es especialmente útil para observar cambios que se producen muy rápidamente cuando las proteínas interactúan entre ellas, o bien con pequeñas moléculas, como por ejemplo un fármaco. El laboratorio de Miquel Pons utiliza esta técnica para estudiar lo que sucede durante estas interacciones. Un caso particularmente intrigante es el de las proteínas desordenadas que ocultan su potencial de interacción en un caos estructural aparente. La complejidad de estas configuraciones puede abordarse mediante la modelización estadística en RMN y otras técnicas experimentales. En el desarrollo

24 Resumen Ejecutivo 2008 Resumen Científico

de medicamentos, la complejidad del mundo de las proteínas y sus interacciones se asimila en la gran variedad de estructuras químicas que constituyen el llamado espacio químico, de tamaño equiparable al número aproximado de estrellas que hay en el universo. Pons y su grupo están desarrollando nuevas herramientas computacionales y de RMN cuyo objetivo es explorar el espacio químico en las moléculas pequeñas que tengan la capacidad de reestructurar complejos de proteínas con fines terapéuticos prometedores.

Integración experimental y computacional Los avances recientes en el campo de la genómica y las técnicas de alto rendimiento, que han derivado en una explosión de datos biológicos, ofrecen una oportunidad única para hacer predicciones computacionales, con gran precisión, de las complejas redes biológicas en los organismos vivos. La puesta en marcha de métodos computacionales en investigación puede, no obstante, suscitar dudas sobre las capacidades predictivas de las simulaciones por ordenador. Por este motivo, la validación experimental ha pasado a ser un requisito en este tipo de investigación. El Laboratorio de Bioinformática Experimental (EBL) se creó en enero de 2008 como parte de un programa de colaboración entre el IRB Barcelona y el Centro de Supercomputación de Barcelona orientado a conseguir nuevos avances científicos en biología computacional. El EBL, dirigido por Montse Soler, centra su investigación en integrar la información experimental en modelos in silico creados por biólogos computacionales del Programa de Biología Estructural y Computacional. Las áreas de investigación principales incluyen el mapeo del genoma de las posiciones del nucleosoma por una variedad de tipos de levadura, y la búsqueda en líneas celulares de mamíferos para desvelar los factores que influyen en el posicionamiento en ciertas regiones del genoma como, por ejemplo, la metilación del ADN. El EBL también analiza el potencial regulador de las secuencias promotoras candidatas en el genoma humano y busca describir las vías patológicas a nivel molecular a partir de la combinación de la biología computacional y las técnicas de descubrimiento interactivas.

Resumen Científico Resumen Ejecutivo 2008 25

Programa de Medicina Molecular

as ciencias biomédicas se encuentran a las puertas de una nueva era en medicina que en un futuro nos conducirá a curar el cáncer, la diabetes, las enfermedades neurodegenerativas y un gran número de enfermedades que no se pueden combatir con vacunas u otros fármacos existentes. Los científicos, sin embargo, disponen de un arsenal de herramientas para estudiar el origen de las enfermedades y de nuevos métodos para intervenir en los procesos celulares. La meta para las próximas décadas es aprender a utilizar estas herramientas, que ya han revolucionado el diagnóstico médico, para poder manipular directamente las moléculas responsables de las enfermedades. El objetivo del Programa de Medicina Molecular es ampliar los conocimientos en estas áreas y encontrar nuevas vías para transformar los nuevos descubrimientos en aplicaciones biomédicas. El programa cuenta con un gran equipo de especialistas en bioquímica, biología celular y molecular, señalización y regulación celulares, genómica, genética e inmunología. La actividad que se desarrolla en el programa incluye el estudio de las bases moleculares de la diabetes, la obesidad, la inflamación, el síndrome metabólico y enfermedades raras, así como la investigación de nuevos tratamientos para estas patologías. Los grupos de investigación del Programa de Medicina Molecular también estudian las vías de señalización que controlan los procesos celulares, la biología de los macrófagos, los estudios genómicos de las enfermedades, las bases celulares de las aminoacidurias heredadas y las bases estructurales de la función transportadora de la membrana.

26 Resumen Ejecutivo 2008 Resumen Científico

Interpretar las señales El laboratorio de Carme Caelles estudia los principios que regulan la interacción entre las vías de señalización más importantes de la acción antiinflamatoria. Las señales proinflamatorias inician la respuesta inflamatoria a través de la activación de las proteínas denominadas JNK. En contraposición, moléculas con reconocida actividad antiinflamatoria como los glucocorticoides impiden la activación de JNK, siendo esta propiedad crucial en el mecanismo de acción farmacológica. Un segundo ámbito de interés del grupo es el estudio de las proteínas de señalización de la familia NIMA, implicadas en la regulación del ciclo de división celular.

Inflamación y macrófagos El grupo de Antonio Celada estudia los macrófagos, un tipo de célula cuya función es clave en los procesos inflamatorios. En una primera fase, los macrófagos eliminan los microorganismos (bacterias, parásitos, levaduras, etc.) que se encuentran en el foco inflamatorio y, en una segunda fase, ejercen una actividad antiinflamatoria y ayudan a reparar lesiones. Los macrófagos también desempeñan un papel clave en los procesos inflamatorios crónicos, como es el caso de la artritis reumatoide. Además, inducen la formación de vasos sanguíneos, favoreciendo el crecimiento de células cancerígenas. Por ello es muy importante conocer el funcionamiento de estas células y saber pontenciarlas cuando son beneficiosas o bloquearlas cuando son dañinas. Celada y su equipo de investigadores estudian la señalización inducida por las moléculas que producen la activación de los macrófagos y cómo se regulan los genes que activan las distintas funciones de estas células. El objetivo es encontrar dianas terapéuticas útiles para diseñar fármacos que alteren la actividad de estas células, ya sea para que se reproduzcan, se diferencien, se activen o se induzca su muerte y desaparición.

Resumen Científico Resumen Ejecutivo 2008 27

Ingeniería metabólica y terapia de la diabetes El exceso de glucosa se almacena en forma de glucógeno en el hígado y en los músculos, para volver a convertirse en glucosa en situaciones de alta demanda energética. Este proceso de síntesis y degradación del glucógeno está alterado en algunas patologías como la diabetes mellitus. La acumulación anormal de glucógeno en las neuronas también se ha detectado en otras patologías. El laboratorio de Joan J Guinovart trabaja para ampliar el conocimiento del metabolismo del glucógeno y aprender cuáles son los motivos por los que se altera en determinadas enfermedades. El grupo ha descubierto diferencias significativas entre el músculo y el hígado a la hora de procesar el glucógeno, un hallazgo que puede ser relevante para explicar los defectos observados en la diabetes. El laboratorio también ha descubierto que las neuronas, a pesar de tener la capacidad de sintetizar glucógeno, lo mantienen bloqueado a través de tres mecanismos, uno de los cuales implica al complejo laforina-malina. La desaparición de este último mecanismo está asociada con la degeneración neuronal observada en la devastadora enfermedad de Lafora. Los conocimientos adquiridos contribuirán al desarrollo de estrategias para el tratamiento de patologías vinculadas a las alteraciones en el metabolismo del glucógeno como, por ejemplo, la diabetes mellitus, la enfermedad de Lafora y otros estados neurodegenerativos. El laboratorio continúa trabajando en la identificación de compuestos antidiabéticos, entre los que destaca el wolframato sódico, un compuesto que ha demostrado tener propiedades antidiabéticas y antiobesidad. El compuesto ha superado las fases 1 y 2 de ensayos clínicos.

Suministro y resuministro de aminoácidos en el cuerpo El cuerpo necesita una aportación constante de aminoácidos para construir proteínas. Las células son capaces de producir muchos tipos de aminoácidos a partir de estructuras más simples; no obstante, otros aminoácidos deben obtenerse a través de la comida. La obtención de estas moléculas significa absorberlas hacia el interior de la célula a través de la membrana celular. El laboratorio de Manuel Palacín estudia este sistema y la razón por la que se vuelve defectuoso en una serie de enfermedades denominadas aminoacidurias primarias heredadas (PIA). En estas enfermedades, el riñón, el intestino y otros tejidos podrían dejar de absorber los aminoácidos. Cada sistema se responsabiliza de distintos tipos de aminoácidos; en algunos casos, todavía se desconocen los genes causantes de los defectos. Durante los últimos 15 años, el grupo de Palacín ha identificado varios miembros de una nueva familia de proteínas de membrana celular llamadas HATS que actúan de transportadoras de algunos aminoácidos y que padecen alteraciones durante las PIAs. En la actualidad, los científicos están analizando las estructuras de HAT para adquirir un mayor conocimiento sobre la forma en que estas llevan a cabo sus funciones transportadoras.

Resistencia a la insulina y nuevas estrategias para terapias contra la diabetes El estilo de vida cada vez más sedentario ha dado como resultado un aumento drástico de diabetes tipo 2 y de problemas asociados como la obesidad, la hipertensión y otras alteraciones que aumentan la morbilidad y la mortalidad en la población. A la combinación de estos desórdenes y a la resistencia a la insulina se le ha denominado síndrome metabólico, una condición que afecta a más del 40% de personas mayores de 60 años. Estudios recientes sugieren que algunos de estos problemas pueden tener su origen en mecanismos genéticos y celulares comunes. El laboratorio de Antonio Zorzano intenta identificar los genes responsables del desarrollo de la resistencia a la insulina asociada a la obesidad o a la diabetes tipo 2. Los investigadores se centran específicamente en genes relacionados con los procesos que tienen lugar en las estructuras celulares llamadas mitocondrias, en los procesos que controlan estos y otros genes, y en la identificación de nuevas señales posiblemente implicadas. Otros objetivos del grupo son entender cómo se transporta la glucosa a la célula y la identificación de nuevos compuestos que puedan ser efectivos en el tratamiento del síndrome metabólico.

28 Resumen Ejecutivo 2008 Resumen Científico

Programa de Química y Farmacología Molecular

a elaboración de nuevos fármacos implica diseñar nuevas moléculas o modificar moléculas ya existentes para lograr un efecto específico en las células y en los organismos. En el pasado, la ciencia farmacéutica se basaba en pruebas de ensayo y error para identificar sustancias que ayudasen a tratar los síntomas de una enfermedad y, posteriormente, mediante procesos químicos, aislarla y perfeccionarla. A menudo, estos procesos se realizaban con total desconocimiento de cómo funcionaban en realidad estas sustancias. Hoy en día, los científicos han descubierto cómo funcionan muchos fármacos. Habitualmente se enlazan a una proteína en particular o a un complejo molecular y modifican su estructura o química, afectando a la forma en la que estos fármacos interactúan con otras moléculas. Se utilizan un gran número de técnicas desarrolladas para estudiar y manipular dichas interacciones, así como para identificar nuevas dianas, es decir, nuevas proteínas que pueden desempeñar un papel clave en el desarrollo de una enfermedad, y cuya manipulación puede restablecer el funcionamiento correcto de la célula. El Programa de Química y Farmacología Molecular cuenta con amplios conocimientos técnicos y la experiencia necesaria para abordar este nuevo enfoque en el diseño de fármacos. El objetivo es identificar dianas, entender sus funciones y la naturaleza de sus interacciones con otras moléculas, así como construir o modificar las moléculas que pueden influir en este comportamiento. Los grupos del programa sintetizan una extensa variedad de compuestos bioactivos, con especial énfasis en los ácidos nucleicos, péptidos, proteínas, peptidomiméticos -moléculas que se parecen o imitan a los péptidos naturales- así como otros compuestos químicos. También utilizan métodos innovadores como la síntesis enantioselectiva, la síntesis de fase sólida de bibliotecas de compuestos bioactivos y las reacciones multicomponente. El objetivo de los grupos es crear sustancias que sean útiles como medicamentos o como herramientas para investigar sistemas biológicos. La investigación se centra en estudiar la interacción entre las sustancias candidatas a medicamento y las dianas escogidas. Las técnicas principales utilizadas son la RMN, los estudios computacionales y la espectrometría de masas.

Resumen Científico Resumen Ejecutivo 2008 29

Descubrir nuevos compuestos La investigación en el laboratorio de Fernando Albericio se basa en una potente plataforma química diseñada para llevar a cabo proyectos de química medicinal, con un énfasis especial en cáncer. Los subproyectos metodológicos tienen como objetivo principal alimentar la plataforma química, dilucidar incógnitas científicas y solucionar los problemas que puedan surgir durante la investigación. Los ecosistemas marinos han demostrado ser una fuente rica de biodiversidad biológica y química que, inevitablemente, terminará traduciéndose en el descubrimiento de nuevos fármacos candidatos potenciales. La última década ha sido testimonio del aumento dramático del número de compuestos preclínicos de vida marina en ensayos clínicos. La evolución de los productos marinos naturales en el descubrimiento de fármacos puede abrir puertas a la identificación de nuevos caminos prometedores. La llegada al mercado en los últimos meses de los tres primeros productos marinos pone de manifiesto la importancia del ecosistema marino como fuente de nuevos compuestos farmacéuticos. Uno de los campos de investigación principales del grupo es la síntesis total de productos naturales de origen marino con nuevas estructuras y niveles importantes de bioactividad. Los compuestos con estructuras peptídicas o poliheterocíclicas y la combinación de sistemas peptídicos y heterocíclicos son parte de los esfuerzos de investigación del grupo. Otro ámbito de estudio relevante es la optimización de la bioactividad y las propiedades de los compuestos a partir de la preparación de librerías basadas en pro-

30 Resumen Ejecutivo 2008 Resumen Científico

ductos naturales. La metodología del grupo está orientada a facilitar los proyectos de investigación biomédica y a encontrar respuestas a las incógnitas que surgen durante la investigación. El laboratorio también prevé desarrollar métodos para preparar esqueletos innovadores y construir bloques que, una vez decorados adecuadamente, serán de utilidad en proyectos de química medicinal. La puesta en marcha de estos objetivos sintéticos está orientada a la búsqueda de eficacia, economía atómica y diversidad estructural. En este sentido, las reacciones multicomponentes son la primera opción a explorar para conseguir estos objetivos. El grupo, que basa una parte considerable de sus programas de investigación en el uso de metodología en fase sólida, tiene previsto continuar haciendo investigación en el desarrollo de resinas, espaciadores, reactivos de acoplamiento y estrategias, que de cara a un futuro podrán aplicarse a la síntesis de fármacos candidatos.

Fabricar ADN y ARN artificial El éxito en el desarrollo de la mayoría de proyectos científicos depende de la habilidad de los investigadores para crear pequeñas moléculas artificiales de ADN o ARN. El grupo de Ramon Eritja sintetiza estas moléculas a partir de sus subunidades, los nucleótidos. Los proyectos de investigación del grupo tratan desde la preparación de moléculas complejas de ADN y ARN como fármacos potenciales, hasta la utilización de estructuras de ADN para la fabricación de circuitos a nanoescala. Entre los proyectos de investigación del grupo destaca el descubrimiento de bases no naturales que estabilizan estructuras poco comunes de ácidos nucleicos y que pueden ser de utilidad en el diseño de un nuevo tipo de fármacos. El laboratorio también centra esfuerzos en el diseño de nuevos derivados de ARN para controlar la expresión génica a partir del mecanismo de interferencia de ARN. Asimismo, el grupo investiga el uso de los derivados de ácidos nucleicos en la organización de moléculas y materiales en superficies que pueden ser de interés para el desarrollo de nuevos mecanismos bioanalíticos.

Diseñar y obtener fármacos El objetivo final de un diseño ‘racional’ de fármacos radica en poder estudiar la superficie de cualquier parte de una proteína con el fin de diseñar un ligando selectivo muy eficiente que modifique el comportamiento de la proteína en la dirección deseada. Esto es todavía un sueño, aunque el grupo de Ernest Giralt está dedicando muchos esfuerzos para conseguirlo y para ampliar los conocimientos sobre los principios que regulan la manera en la que las moléculas se reconocen y se enlazan entre sí. El laboratorio centra parte de su investigación en distintos temas de difícil resolución, como conseguir que las células absorban sustancias foráneas (fármacos), encontrar formas de romper agregados de proteínas que se forman en la enfermedad de Alzheimer y en otras enfermedades neurodegenerativas, y lograr que los fármacos atraviesen la barrera hematoencefálica. El grupo investiga cómo mejorar los métodos necesarios que permitan abordar estas cuestiones: obtención de información estructural con RMN, mejora de la síntesis de fase sólida de péptidos (una manera de diseñar proteínas artificiales que no requieren células para producir moléculas) y perfeccionamiento de algoritmos computacionales que faciliten el descubrimiento de nuevos fármacos.

Desarrollar métodos sintéticos para compuestos bioactivos El laboratorio de Antoni Riera trabaja en el desarrollo de nuevos métodos sintéticos necesarios en distintas etapas del desarrollo de fármacos. El grupo tiene un interés especial en la síntesis asimétrica. Se trata de un punto clave, ya que muchos de los procesos estándar para sintetizar pequeñas moléculas generan enantiómeros (versiones ‘derecha e izquierda’, es decir, moléculas que tienen las mismas propiedades pero que son imágenes espejo unas de otras). Las moléculas biológicas pueden reaccionar de forma muy diferente a los dos tipos de enantiómeros, resultando así esencial producir y purificar solamente la versión deseada. El equipo también dedica sus esfuerzos a encontrar nuevas formas de crear mayores cantidades de compuestos que sean de interés terapéutico. Finalmente, el grupo está colaborando en la preparación de bibliotecas químicas que puedan utilizarse en el cribado biológico.

Resumen Científico Resumen Ejecutivo 2008 31

En busca de nuevas moléculas bioactivas La preparación de nuevas entidades químicas es el primer paso, y tal vez el más importante, en el proceso de descubrimiento de nuevos fármacos. La metodología para diseñar y preparar este tipo de compuestos, en cantidades y forma pura, es uno de los elementos clave de los proyectos biomédicos. El laboratorio de Màrius Rubiralta trabaja en el desarrollo de tecnologías orientadas a obtener compuestos bioactivos clave en forma pura. El grupo desarrolla procedimientos sintéticos para conseguir nuevas moléculas peptídicas o compuestos heterocíclicos -estructuras frecuentes en fármacos- y también estudia la separación de los enantiómeros de las moléculas obtenidas. Asimismo, el laboratorio centra parte de su investigación en la descripción de nuevas reacciones multicomponentes basadas en heterociclos, utilizando algunos de los constructos sintéticos como herramienta para separar los enantiómeros y otros productos de alto valor añadido mediante distintas tecnologías como, por ejemplo, la cromatografía. El grupo también investiga los procedimientos fundamentales y la investigación metodológica en este último campo.

Observar las proteínas con comportamientos inapropiados La investigación llevada a cabo en el laboratorio de Xavier Salvatella tiene como objetivo describir, de forma muy detallada, los movimientos de las proteínas y su papel en enfermedades como el Alzheimer, la amiloidosis sistémica y la encefalopatía espongiforme transmisible (enfermedad de Creutzfeldt-Jakob), en las que los agregados proteicos insolubles tienden a acumularse en el tejido de los pacientes. Entre las incógnitas específicas que el laboratorio busca desvelar se halla la caracterización de las propiedades estructurales, a partir de métodos de análisis innovadores y resultados experimentales, de determinadas proteínas desordenadas involucradas en estas enfermedades. El laboratorio también estudia las relaciones entre la estructura y la toxicidad en los agregados que estas proteínas forman en los tejidos de pacientes. Conseguir una descripción en resolución alta de estos procesos, que conducen a la aparición de enfermedades, brinda oportunidades para desarrollar nuevos enfoques terapéuticos, uno de los objetivos a largo plazo del grupo.

32 Resumen Ejecutivo 2008 Resumen Científico

Programa de Oncología

l cáncer se origina cuando fallan los procesos fundamentales que controlan la reproducción, la diferenciación y el comportamiento de las células. El Programa de Oncología tiene como objetivo mejorar el pronóstico, la prevención y el tratamiento del cáncer mediante el estudio de los principios básicos que rigen el desarrollo de dicha enfermedad. El programa centra su trabajo en los distintos aspectos de la aparición y el desarrollo de los tumores, con especial énfasis en los mecanismos responsables de la adquisición de la malignidad, en la relación existente entre las células madre y el cáncer, y en la identificación de los factores que conducen a la metástasis en tejidos específicos. Los grupos de investigación del programa trabajan en la formación de fuertes vínculos con la parte clínica de la investigación del cáncer. Los acuerdos de colaboración con distintas unidades de oncología y de patología de hospitales en el área metropolitana de Barcelona facilitan la traducción de la investigación básica de este programa en nuevas herramientas diagnósticas y terapéuticas de interés para el ámbito clínico.

Resumen Científico Resumen Ejecutivo 2008 33

Los estadios del cáncer colorrectal El cáncer colorrectal es una de las principales causas de muerte en todo el mundo. La mayoría de los tumores colorrectales se inician como lesiones benignas, si bien una pequeña proporción progresa hacia estadios malignos porque sus células han acumulado mutaciones en genes potenciadores del cáncer o en genes que normalmente suprimen el desarrollo de tumores. El paso final y el más letal en el progreso de la enfermedad es la migración de células de cáncer colorrectal hacia otros órganos, principalmente hacia el hígado, donde empiezan a desarrollar nuevos tumores. El laboratorio de Eduard Batlle se dedica a estudiar el inicio del cáncer colorrectal y su progresión desde los estadios tempranos hasta la formación de tumores agresivos. En sus estudios, el equipo desarrolla modelos celulares y animales que mimetizan la versión humana de esta devastadora enfermedad. El objetivo final es obtener información que permita diseñar nuevas herramientas diagnósticas y terapéuticas. El laboratorio de Elena Sancho centra su investigación en las vías de señalización celular en las distintas etapas del desarrollo del cáncer colorrectal. El desarrollo de un tumor maligno, que tiene lugar a lo largo de un periodo de varios años, parece seguir una serie de fases precisas: las mutaciones concretas en los genes relacionados con el cáncer se producen en un orden específico. El laboratorio tiene especial interés en estudiar los efectos de las mutaciones en las vías de señalización que afectan no sólo a las células cancerígenas sino también al microambiente del tumor. Una estrecha colaboración con investigadores clínicos ha permitido que el grupo tenga acceso a muestras

34 Resumen Ejecutivo 2008 Resumen Científico

de cáncer colorrectal en distintos estadios de malignidad, permitiendo así analizar las poblaciones de células que comprenden los tumores en cada una de las fases de la enfermedad. El objetivo final es obtener información que permita diseñar nuevas herramientas terapéuticas y diagnósticas.

Laboratorio de Metástasis Tumoral (MetLab) Un complejo entramado de redes de señalización en el interior de las células controla su división, diferenciación, movimiento, organización y muerte. Las células cancerígenas desobedecen estas señales durante la progresión del tumor y la metástasis, que es la responsable del 90% de las muertes por cáncer. El interés principal del MetLab, dirigido por Roger Gomis, estriba en la identificación de grupos de genes y sus funciones, cuyo abuso por parte de células tumorales los convierte en instrumentos para la metástasis. Estas funciones rigen las etapas fundamentales de la fuga de células del tumor primario al torrente sanguíneo, la invasión de tejidos distantes por parte de estas células en circulación y, en consecuencia, el establecimiento de colonias microscópicas en estos tejidos. Mediante la activación o la anulación de estos genes en células metastásicas se valida su función. Recientemente se ha observado que algunos de los genes candidatos identificados en el laboratorio se encuentran afectados en muestras de tumores de pacientes. Mediante el conocimiento de la combinación de errores biológicos que facilitan la invasión de órganos vitales por parte de células metastásicas, se podrá atacar eficazmente la enfermedad a través de la combinación de fármacos contra las posibles dianas terapéuticas.

Resumen Científico Resumen Ejecutivo 2008 35

Plataformas Científicas

a investigación llevada a cabo en el IRB Barcelona se beneficia de un amplio abanico de Plataformas Científicas que ofrecen a los investigadores asistencia técnica, acceso a recursos biomédicos de última generación, así como instrumentación y servicios orientados a acelerar los resultados científicos. Las Plataformas Científicas del IRB Barcelona, equipadas con tecnologías de investigación punteras, ofrecen un amplio repertorio de servicios y técnicas en microscopía digital avanzada, bioestadística, bioinformática, genómica funcional, espectrometría de masas, expresión de proteínas y modelos de enfermedad a partir de ratones transgénicos. Los servicios ofrecidos a los investigadores del IRB Barcelona incluyen herramientas de investigación para analizar o alterar genes a nivel genómico, acceso a instrumentos de microscopía digital avanzada de última generación, técnicas de espectrometría para identificar especies biológicas, herramientas computacionales para facilitar la interpretación de resultados experimentales, actividades de expresión de proteínas de alto rendimiento para llevar a cabo un número elevado de variaciones experimentales paralelamente y la producción de ratones modificados genéticamente destinados a la investigación. La ubicación estratégica de las Plataformas Científicas en el Parque Científico de Barcelona, cerca de los laboratorios del IRB Barcelona, garantiza las sinergias y la eficacia científica en los proyectos de investigación. Además de disponer de Plataformas Científicas propias, la investigación biomédica desarrollada en el IRB Barcelona también se beneficia de las plataformas y servicios del Parque Científico de Barcelona así como de los servicios técnicos de la Universidad de Barcelona.

36 Resumen Ejecutivo 2008 Resumen Científico

Más allá de los límites de la microscopía de luz convencional La llegada simultánea de las proteínas fluorescentes y los láseres ha revolucionado la microscopía de luz al permitir la localización específica de proteínas marcadas. Los rápidos avances en microscopía confocal han dado paso a instrumentos de tecnología punta que permiten la visualización en resolución alta de imágenes en 3D para su localización espacial, la resolución espectral mediante múltiples visualizaciones de fluoróforos, la adquisición automática precisa para garantizar una rápida visualización a tiempo real y la multiposición por cribajes. La microscopía de luz, además de mapear etiquetas multicolor en 3D, también se ha abierto camino en el campo de las dinámicas y las interacciones entre proteínas mediante técnicas directas de manipulación láser para medir parámetros biofísicos como la difusión, las uniones y las interacciones. Otras técnicas de fotomanipulación disponibles son la fotoactivación, que ofrece la posibilidad de cambiar fluoróforos según las preferencias de localización y temporales, y también la cirugía láser para la manipulación de órganos, células, o hasta orgánulos subcelulares. Las técnicas emergentes, que rompen con las limitaciones de difracción típicas de los microscopios ópticos, ofrecen la posibilidad de descifrar estructuras fluorescentes complejas mediante decenas de nanómetros. Por otro lado, la nueva generación emergente de microscopios basados en la iluminación lateral está sobrepasando los límites de la microscopía confocal tradicional gracias a su capacidad de poder llevar a cabo, con resolución alta y contraste, visualizaciones detalladas a tiempo real de un elevado número de especímenes de tamaños que llegan hasta varios milímetros. La Plataforma Científica de Microscopía Digital Avanzada (ADM), dirigida por Julien Colombelli, ofrece acceso a instrumentos de última generación que van desde la mi-

Resumen Científico Resumen Ejecutivo 2008 37

croscopía confocal espectral automática hasta técnicas emergentes para la manipulación celular y la visualización. La ADM inició sus actividades en el 2008 en un nuevo laboratorio que pone al alcance de los investigadores del IRB Barcelona un amplio abanico de plataformas necesarias para llevar a cabo todas las fases de la visualización digital, incluyendo la preparación de muestras, la adquisición de imágenes, su análisis e interpretación. La plataforma también dispone de sección óptica en fluorescencia con un sistema confocal espectral, disco giratorio y sistemas de microscopía multifotónica. Otras técnicas específicas, como la TIRF, la nanocirugía láser, la microinyección y la microscopía de fluorescencia automática de campo amplio, también se pondrán en marcha en breve. Para compensar el vacío entre los sistemas comerciales disponibles en la actualidad y el progreso en investigación puntera, la ADM también está invirtiendo esfuerzos en desarrollar nuevos instrumentos -como el FRAP de campo amplio combinado, la cirugía láser y la fotoactivación- en colaboración con investigadores del IRB Barcelona. La plataforma también ofrecerá en un futuro próximo actividades de formación en microscopía avanzada y técnicas de procesamiento de imágenes.

Convertir cifras en información Durante la última década se han generalizado un número de tecnologías que tienen la capacidad de generar grandes cantidades de información. Los experimentos genómicos y proteómicos de alto rendimiento, por ejemplo, generan datos que tienen como punto de partida desde números reducidos hasta centenares y millones de genes y proteínas. En la actualidad, los investigadores tienen que afrontar el reto de obtener información científica de calidad y tener la capacidad para extraer la máxima información de valor posible. La estadística, la ciencia que transforma datos en información, ofrece un marco científico riguroso para poner a prueba las hipótesis y para ampliar los conocimientos sobre los sistemas y procesos que generan los datos biomédicos. La teoría del diseño experimental también sirve para guiar a los investigadores hacia cuál es el mejor método para llevar a cabo sus experimentos y conseguir así los objetivos fijados. La Unidad de Bioestadística y Bioinformática, dirigida por David Rossell, se creó para dar apoyo a los científicos en el diseño y análisis de experimentos biomédicos mediante herramientas informáticas pioneras y metodología innovadora. La unidad ofrece a los grupos de investigación del IRB Barcelona una ventaja competitiva a través del desarrollo de soluciones hechas a medida para resolver problemas muy específicos. Estas soluciones, que incluyen el desarrollo de nuevas metodologías y programas, están orientadas a mejorar la calidad de la investigación y a acelerar la obtención de resultados.

Estudiar el genoma en un único experimento Durante la última década, la biología molecular ha evolucionado desde el análisis entre genes hasta un acercamiento más exhaustivo para estudiar las redes reguladoras, que engloban desde docenas hasta centenares de parejas que interactúan entre sí. A fin de garantizar el éxito de la investigación en este campo, los investigadores necesitan un número creciente de herramientas que les permitan analizar o alterar genes en un ámbito genómico amplio. La Plataforma Científica de Genómica Funcional, dirigida por Herbert Auer, pone al alcance de la comunidad científica del IRB Barcelona herramientas genómicas de última generación. Estos recursos se clasifican en dos categorías:

38 Resumen Ejecutivo 2008 Resumen Científico

•

Análisis de transcripción genómica, poliformismos de ADN e inmunoprecipitación de la cromatina (ChIP-chip). Estos tipos de análisis se desarrollan a partir de la tecnología de micromatrices, producida por Affymetrix. La plataforma ofrece, en todos los métodos analíticos, un servicio completo que incluye desde la consulta inicial durante el diseño del proyecto hasta el control de calidad de los materiales, el procesamiento de muestras, el análisis inicial de datos, así como la interpretación y la validación de resultados a partir de PCR a tiempo real.

•

Silenciamiento de la expresión génica con ARN. Para silenciar la expresión génica, la plataforma dispone de una biblioteca humana de ARN’s (Sigma) que cuenta con cerca de 75.000 clones que cubren la mayoría de transcripciones conocidas.

Nuevos caminos en espectrometría de masas La espectrometría de masas, que se ha convertido en una de las herramientas más importantes de las ciencias biomédicas, tiene un amplio campo de aplicación que cubre desde el análisis molecular hasta la caracterización de proteínas. Gracias a su versatilidad, la espectrometría de masas es una tecnología a la que cada vez recurren más científicos. Se trata de una herramienta que puede ofrecer una posición de ventaja para interrogar ensamblajes no-covalentes dinámicos que no se pueden analizar por otras vías y abrir así nuevos caminos en la topología de entidades de masa elevada que se ven complicadas por interacciones débiles o efímeras. La Plataforma Científica de Espectrometría de Masas, dirigida por Marta Vilaseca, ofrece a los investigadores del IRB Barcelona herramientas de cromatografía y espectrometría modernas para identificar y caracterizar una amplia variedad de especies biológicas. La plataforma trabaja en la implementación del análisis de proteínas intactas (top-down approach) con el fin de obtener caracterizaciones completas y en el desarrollo de técnicas proteómicas para cuantificar proteínas y determinar modificaciones post-traslacionales. La plataforma también utiliza el emparejamiento iónico por MS para estudiar las estructuras macromoleculares y la conformación de proteínas, ácidos nucleicos y sus complejos.

Ratones transgénicos como herramientas de investigación El ratón transgénico es uno de los modelos más interesantes de los que dispone la comunidad científica para la investigación de las enfermedades humanas. El objetivo de la Plataforma Científica de Ratones Transgénicos es poner esta tecnología al alcance de los investigadores del IRB Barcelona, ya sea a través de la obtención de ratones pregenerados, de células madre embrionarias modificadas genéticamente, de vectores diana obtenidos de recursos públicos o de la generación de nuevos modelos transgénicos. La plataforma trabaja para ofrecer un servicio completo que incluya desde el desarrollo y la producción de ratones transgénicos, hasta el diseño y la construcción de vectores diana de genes, así como la producción de células madre embrionarias de ratones mediante la inyección de ADN purificado o células embrionarias en embriones preimplantados. Un aspecto importante del trabajo realizado por esta plataforma es la adaptación y mejora de las tecnologías actuales al fin de aumentar la eficiencia de la producción y ofrecer modelos más complejos.

Solucionar los retos proteicos con el alto rendimiento Tradicionalmente, los investigadores solían abordar los problemas con proteínas a partir de procesos repetitivos de pruebas y rediseños que a menudo eran costosos y requerían mucho tiempo. La Plataforma Científica de Expresión de Proteínas pone al alcance de los investigadores servicios de alto rendimiento que permiten ejecutar simultáneamente y en paralelo un gran número de variaciones experimentales (por ejemplo, truncamientos o mutaciones de las proteínas). Esta capacidad de ejecución de un gran número de variaciones experimentales -generalmente hasta 96- tiene el potencial de reducir de manera significativa el tiempo que se necesita para solucionar problemas con proteínas, un hecho que contribuye a acelerar tanto los resultados experimentales

Resumen Científico Resumen Ejecutivo 2008 39

como su publicación. Los métodos de alto rendimiento, además del ahorro de tiempo que suponen, también son rentables y pueden reducir significativamente el coste de los proyectos llevados a cabo en el laboratorio. La plataforma, dirigida por Nick Berrow, ha lanzado recientemente una convocatoria para proyectos dirigida a investigadores del IRB Barcelona para utilizar la clonación HTP y, en un futuro próximo, también ofrecerá servicios de cribado de E. coli y en células mamíferas y de insectos o levadura, entre otros. La plataforma también prevé ofrecer un gran número de reactivos de calidad como, por ejemplo, alícuotas de bacteriófagos resistentes, clonación y expresión de E. coli, medios especializados de expresión y reactivos de clonación.

40 Resumen Ejecutivo 2008 Resumen Científico

Datos IRB Barcelona • Patronato • Junta de Gobierno • Comité Científico Internacional • Fuentes de Financiación • Resumen de la Producción Científica • Tesis Doctorales • Actividades de Transferencia de Tecnología • Seminarios Barcelona BioMed • Conferencias Barcelona BioMed • Actividades de Divulgación • Organigrama • Personal de Dirección y Administración • Estadísticas de Recursos Humanos • Afiliaciones de los Investigadores • Parque Científico de Barcelona

Resumen Científico Resumen Ejecutivo 2008 41

Patronato

l máximo órgano de gobierno del IRB Barcelona, el Patronato, está integrado por 11 miembros y presidido por el Consejero de Innovación, Universidades y Empresa de la Generalitat de Catalunya. El Patronato, que celebra reuniones con carácter bianual, es responsable de aprobar las actividades y la financiación del Instituto, así como de velar por el cumplimiento de los objetivos anuales de investigación.

Presidente Josep Huguet i Biosca Consejero del Departamento de Innovación, Universidades y Empresa, Generalitat de Catalunya

Vicepresidente Primero Marina Geli i Fàbrega Consejera del Departamento de Salud, Generalitat de Catalunya

Vicepresidentes Segundos Dídac Ramírez Sarrió Rector de la Universidad de Barcelona (noviembre de 2008–actualidad) Josep Samitier i Martí Rector en funciones de la Universidad de Barcelona (abril de 2008–noviembre de 2008) Màrius Rubiralta i Alcáñiz Rector de la Universidad de Barcelona (octubre de 2005–abril de 2008)

Miembros Ramon Moreno Amich Director General de Investigación del Departamento de Innovación, Universidades y Empresa, Generalitat de Catalunya Joan Roca Acín Director del Consejo Interdepartamental de Investigación e Innovación Tecnológica (CIRIT), Departamento de Innovación, Universidades y Empresa, Generalitat de Catalunya Marta Segura i Bonet Secretaria General del Departamento de Salud, Generalitat de Catalunya José Jerónimo Navas Director del Programa de Centros de Investigación, Departamento de Salud, Generalitat de Catalunya (octubre de 2005-septiembre de 2008)

42 Resumen Ejecutivo 2008 Patronato

Carme Verdaguer i Montanyà Directora General de la Fundación Bosch i Gimpera Josep Samitier Martí Vicerrector de Política Científica, Universidad de Barcelona (enero de 2007-abril de 2008) Fernando Albericio i Palomera Director General, Parque Científico de Barcelona Roser Artal Rocafort Directora Gerente, Parque Científico de Barcelona

Patronato Resumen Ejecutivo 2008 43

Junta de Gobierno Executive Board

a Junta de Gobierno del IRB Barcelona tiene como responsabilidades principales supervisar las tareas directivas del Instituto, promocionar las actividades de investigación y velar por la ejecución de las funciones delegadas por el Patronato. La Junta está presidida actualmente por el Director del Programa de Centros de Investigación del Departamento de Salud de la Generalitat de Catalunya y sus miembros son elegidos por un periodo de cuatro años.

Presidente José Jerónimo Navas Palacios Director del Programa de Centros de Investigación, Departamento de Salud, Generalitat de Catalunya (octubre de 2005-septiembre de 2008)

Miembros Ramon Moreno Amich Director General de Investigación del Departamento de Innovación, Universidades y Empresa, Generalitat de Catalunya Josep Samitier Martí Vicerrector de Innovación y Programas Internacionales de Investigación y Rector en funciones de la Universidad de Barcelona (enero de 2007-noviembre de 2008)

Otros Participantes Fernando Albericio Palomera Director General, Parque Científico de Barcelona Joan J Guinovart Cirera Director, IRB Barcelona Margarida Corominas Bosch Directora de Gestión, IRB Barcelona

44 Resumen Ejecutivo 2008 Junta de Gobierno

Comité Científico External AdvisoryInternacional Board

l Comité Científico Internacional del IRB Barcelona, formado por un grupo de 15 destacados científicos en el campo de la biomedicina, es responsable de ofrecer asesoramiento estratégico y de velar por la calidad científica de los trabajos llevados a cabo por los equipos de investigación del Instituto.

Miembros Hans Clevers The Netherlands Institute of Developmental Biology, Utrecht, Países Bajos Michael Czech Program in Molecular Medicine, University of Massachusetts Medical School, Worcester, EEUU Christopher M Dobson Department of Chemistry and Physics, Cambridge University, Cambridge, Reino Unido José Elguero Consejo Superior de Investigaciones Científicas (CSIC), Madrid, España Samuel H Gellman Faculty of Chemistry, University of Winsconsin, Madison, EEUU David M Glover Department of Genetics, Cambridge University, Cambridge, Reino Unido Jan-Åke Gustafsson Center for Biotechnology, Karolinska Institute, Estocolmo, Suecia Andrew Hamilton Department of Chemistry, Yale University, New Haven, EEUU Robert Huber Max Planck Institute of Biochemistry, Martinsried, Alemania Tim Hunt Cancer Research UK, Londres, Reino Unido Fotis C Kafatos Imperial College London, Londres, Reino Unido Bernd Meyer Institute for Organic Chemistry, Hamburg University, Hamburgo, Alemania

Comité Científico Internacional Resumen Ejecutivo 2008 45

Charles J Sherr Department of Genetics and Tumor Cell Biology, St Jude Children’s Research Hospital, Memphis, EEUU Bruce Spiegelman Department of Cell Biology, Harvard Medical School, Boston, EEUU Karen Vousden Beatson Institute, Glasgow, Reino Unido

46 Resumen Ejecutivo 2008 Comité Científico Internacional

Fuentes de Financiación

a mayoría de la financiación del IRB Barcelona para actividades de investigación en el 2008 provino de la Generalitat de Catalunya, a través del Departamento de Innovación, Universidades y Empresa y del Departamento de Salud. El Instituto también recibió financiación adicional a partir de ayudas competitivas obtenidas, entre otros, del Ministerio de Ciencia e Innovación y de la Comisión Europea, a través de los fondos FEDER y del 7o Programa Marco. La Universidad de Barcelona, la Institución Catalana de Investigación y Estudios Avanzados (ICREA), el Consejo Superior de Investigaciones Científicas (CSIC) y distintas redes CIBER también contribuyeron a la financiación a través de la incorporación al IRB Barcelona de investigadores contratados por estas instituciones.

Financiación Principal

Otras Fuentes de Financiación

Fuentes de Financiación Resumen Ejecutivo 2008 47

Resumen de la Producción Científica

Publicaciones Científicas Los investigadores del IRB Barcelona publicaron en el 2008 un total de 159 artículos científicos, 55 de los cuales fueron fruto de colaboraciones internacionales con investigadores del sector académico e industrial. La lista que sigue es una selección de publicaciones representativas de la investigación llevada a cabo en el IRB Barcelona durante el año 2008.

Aguilar-Arnal L, Marsellach FX and Azorín F. The fission yeast homologue of CENP-B, Abp1, regulates directionality of mating-type switching. EMBO J, 27(7), 1029-38 (2008) Bartoccioni P, Rius M, Zorzano A, Palacín M and Chillarón J. Distinct classes of trafficking rBAT mutants cause the type I cystinuria phenotype. Hum Mol Genet, 17(12), 1845-54 (2008) Casagrande F, Ratera M, Schenk AD, Chami M, Valencia E, Lopez JM, Torrents D, Engel A, Palacin M and Fotiadis D. Projection structure of a member of the amino acid/polyamine/organocation transporter superfamily. J Biol Chem, 283(48), 33240-48 (2008) Castellanos E, Dominguez P and González C. Centrosome dysfunction in Drosophila neural stem cells causes tumors that are not due to genome instability. Curr Biol, 18(16), 1209-14 (2008) Cifuentes D, Martínez-Pons C, GarcíaRocha M, Galina A, de Pouplana LR and Guinovart JJ. Hepatic glycogen synthesis in the absence of glucokinase: the case of embryonic liver. J Biol Chem, 283(9), 564249 (2008) Duarri A, Teijido O, López-Hernández T, Scheper GC, Barriere H, Boor I, Aguado F, Zorzano A, Palacín M, Martínez A, Lukacs GL, van der Knaap MS, Nunes V and Estévez R. Molecular pathogenesis of megalencephalic leukoencephalopathy with subcortical cysts: mutations in MLC1 cause folding defects. Hum Mol Genet, 17(23), 3728-39 (2008) Font-Burgada J, Rossell D, Auer H and Azorín F. Drosophila HP1c isoform interacts with the zinc-finger proteins WOC and Relative-of-WOC to regulate gene

expression. Gene Dev, 22(21), 3007-23 (2008) Garcia-Martin F, Cruz LJ, Rodriguez-Mias RA, Giralt E and Albericio FD. Design and synthesis of FAJANU: a de novo C(2) symmetric cyclopeptide family. J Med Chem, 51(11), 3194-02 (2008) Gordo S, Martos V, Santos E, Menéndez M, Bo C, Giralt E and de Mendoza J. Stability and structural recovery of the tetramerization domain of p53-R337H mutant induced by a designed templating ligand. Proc Natl Acad Sci EUA, 105(43), 16426-31 (2008) Herranz H, Pérez L, Martín FA and Milán M. A Wingless and Notch double-repression mechanism regulates G1-S transition in the Drosophila wing. EMBO J, 27(11), 1633-45 (2008) Jiménez JC, López-Macià A, Gracia C, Varón S, Carrascal M, Caba JM, Royo M, Francesch AM, Cuevas C, Giralt E and Albericio F. Structure-activity relationship of kahalalide F synthetic analogues. J Med Chem, 51(16), 4920-31 (2008) Jones TE, Brown CL, Geslain R, Alexander RW and Ribas de Pouplana L. An operational RNA code for faithful assignment of AUG triplets to methionine. Mol Cell, 29(3), 401-07 (2008) Kim C, Sano Y, Todorova K, Carlson BA, Arpa L, Celada A, Lawrence T, Otsu K, Brissette JL, Arthur JS and Park JM. The kinase p38 alpha serves cell type-specific inflammatory functions in skin injury and coordinates pro- and anti-inflammatory gene expression. Nat Immunol, 9(9), 101927 (2008) Klemsz MJ, McKercher SR, Celada A, Van

48 Resumen Ejecutivo 2008 Resumen de la Producción Científica

Beveren C and Maki RA. The macrophage and B cell-specific transcription factor PU.1 is related to the ets oncogene. J Immunol, 181(3), 1597-08 (2008) Liesa M, Borda-d’Agua B, Medina-Gómez G, Lelliott CJ, Paz JC, Rojo M, Palacín M, Vidal-Puig A and Zorzano A. Mitochondrial fusion is increased by the nuclear coactivator PGC-1beta. PLoS ONE, 3(10), e3613 (2008) Lloret-Llinares M, Carré C, Vaquero A, de Olano N and Azorín F. Characterization of Drosophila melanogaster JmjC+N histone demethylases. Nucleic Acids Res, 36(9), 2852-63 (2008) Malakoutikhah M, Teixidó M and Giralt E. Toward an optimal blood-brain barrier shuttle by synthesis and evaluation of peptide libraries. J Med Chem, 51(16), 4881-89 (2008) Marler KJ, Becker-Barroso E, Martínez A, Llovera M, Wentzel C, Poopalasundaram S, Hindges R, Soriano E, Comella J and Drescher U. A TrkB/EphrinA interaction controls retinal axon branching and synaptogenesis. J Neurosci, 28(48), 1270012 (2008) Noy A, Luque FJ and Orozco M. Theoretical analysis of antisense duplexes: determinants of the RNase H susceptibility. J Am Chem Soc, 130(11), 3486-96 (2008) Olivella S, Solé A, Lledó A, Ji Y, Verdaguer X, Suau R and Riera A. Theoretical and experimental studies on the mechanism of norbornadiene Pauson-Khand cycloadducts photorearrangement. Is there a pathway on the excited singlet potential energy surface? J Am Chem Soc, 130(50), 16898-07 (2008) Padua D, Zhang XH, Wang Q, Nadal C, Gerald WL, Gomis RR and Massagué J. TGFbeta primes breast tumors for lung metastasis seeding through angiopoietinlike 4. Cell, 133(1), 66-77 (2008) Pérez A, Lankas F, Luque FJ and Orozco M. Towards a molecular dynamics consensus view of B-DNA flexibility. Nucleic Acids Res, 36(7), 2379-94 (2008)

Quijano C, Tomancak P, Lopez-Marti J, Suyama M, Bork P, Milan M, Torrents D and Manzanares M. Selective maintenance of Drosophila tandemly arranged duplicated genes during evolution. Genome Biol, 9(12), R176 (2008) Rafel N and Milán M. Notch signalling coordinates tissue growth and wing fate specification in Drosophila. Development, 135(24), 3995-01 (2008) Sebastián C, Serra M, Yeramian A, Serrat N, Lloberas J and Celada A. Deacetylase activity is required for STAT5-dependent GM-CSF functional activity in macrophages and differentiation to dendritic cells. J Immunol, 180(9), 5898-06 (2008) Shaye DD, Casanova J and Llimargas M. Modulation of intracellular trafficking regulates cell intercalation in the Drosophila trachea. Nat Cell Biol, 10(8), 964-70 (2008) Stein A and Aloy P. Contextual specificity in peptide-mediated protein interactions. PLoS ONE, 3(7), e2524 (2008) Stein A, Panjkovich A and Aloy P . 3did update: domain-domain and peptidemediated interactions of known 3D structure. Nucleic Acids Res, 37, D300-04 (2008) The BioMoby Consortium, including Orozco M. Interoperability with Moby 1.0-it’s better than sharing your toothbrush! Brief Bioinform, 9(3), 220-31 (2008) Valledor AF, Arpa L, Sánchez-Tilló E, Comalada M, Casals C, Xaus J, Caelles C, Lloberas J and Celada A. IFN-{gamma}mediated inhibition of MAPK phosphatase expression results in prolonged MAPK activity in response to M-CSF and inhibition of proliferation. Blood, 112(8), 3274-82 (2008) Valledor AF, Sánchez-Tilló E, Arpa L, Park JM, Caelles C, Lloberas J and Celada A. Selective roles of MAPKs during the macrophage response to IFN-gamma. J Immunol, 180(7), 4523-29 (2008)

Pérez-Lluch S, Cuartero S, Azorín F and Espinàs ML. Characterization of new regulatory elements within the Drosophila bithorax complex. Nucleic Acids Res, 36(21), 6926-33 (2008)

Resumen de la Producción Científica Resumen Ejecutivo 2008 49

Colaboraciones Científicas Los investigadores del IRB Barcelona participaron en un total de 190 colaboraciones externas con socios nacionales e internacionales del sector académico e industrial. A la cifra se suman un total de 26 colaboraciones internas adicionales, que se llevaron a cabo entre investigadores del Instituto con el fin de reforzar los trabajos conjuntos entre los distintos programas de investigación. Tipos de Colaboraciones Colaboraciones Internas 11%

Colaboraciones Externas (Nacionales) 47%

Colaboraciones Externas (Internacionales) 42%

Colaboraciones Externas por Sector

Laboratorios 5% Hospitales 9% Universidades 39%

Compañías 11%

Parques Científicos & Centros de Investigación 16%

Instituciones de Investigación 20%

50 Resumen Ejecutivo 2008 Resumen de la Producción Científica

Proyectos y Redes de Investigación Durante el 2008, los investigadores del IRB Barcelona participaron en un total de 138 proyectos y redes de investigación nacionales e internacionales. El Instituto fue seleccionado por la Comisión Europea para coordinar dos proyectos de investigación en el ámbito de la salud dentro del 7o Programa Marco. El investigador Eduard Batlle también fue premiado en el 2008 con una ayuda del Consejo Europeo de Investigación (ERC) para liderar un estudio sobre la progresión del cáncer colorrectal.

Fuentes de Financiación Compañías 8% Fundaciones 20% Comisión Europea 10%

Generalitat de Catalunya 4%

Gobierno Español 58%

Áreas de Investigación

Oncología 7% Química y Farmacología Molecular 23%

Medicina Molecular 22%

Biología Celular y del Desarrollo 26%

Biología Estructural y Computacional 22%

Resumen de la Producción Científica Resumen Ejecutivo 2008 51

Proyectos de Investigación, Redes y Becas de Personal Las actividades de investigación del IRB Barcelona fueron financiadas a través de la Generalitat de Catalunya, el Ministerio de Ciencia e Innovación, la Comisión Europea, fundaciones públicas y privadas, instituciones y compañías. La financiación obtenida por investigadores del Instituto mediante proyectos de investigación, redes y becas de personal ascendió en el 2008 a 10.246.788€. La siguiente lista comprende las instituciones que contribuyeron a financiar los proyectos de investigación del IRB Barcelona.

Ministerio de Ciencia e Innovación Comisión Europea Fundación Marcelino Botin Fundación La Marató de TV3 Fundación “La Caixa” Agencia de Gestión de Ayudas Universitarias y de Investigación (AGAUR) Fundación Banco Bilbao Vizcaya Argentaria OncoStem Pharma Asociación Española contra el Cáncer (AECC) Laboratorios Almirall Grupo Ferrer Internacional European Science Foundation (ESF) Agencia Española de Cooperación Internacional (AECID) Sylentis Fundación para la Investigación y Prevención del SIDA en España (FIPSE) Fundación Genoma España Palau Pharma Era Biotech European Molecular Biology Organization (EMBO) Ipsen Pharma Affinity Petcare

La Institución Catalana de Investigación y Estudios Avanzados (ICREA) y distintas redes de investigación (CIBERDEM, CIBERER y CIBERNED) también contribuyeron a la financiación mediante contratos de investigación. El IRB Barcelona agradece las donaciones privadas a nivel individual de las siguientes personas: Dolors Barchino Ricarte, Montserrat Gallofré Bernat, Marta Luz Adalid, Francina Pons Pifarré, Josefina Porras González, Marta Prous (y familia) Vilaseca, Vallnord SA.

52 Resumen Ejecutivo 2008 Resumen de la Producción Científica

Tesis Doctorales

l IRB Barcelona impulsó, a lo largo del año, una serie de iniciativas orientadas a ofrecer formación y reforzar los vínculos entre los más de 150 estudiantes de doctorado que actualmente trabajan en laboratorios del Instituto. Las nuevas iniciativas incluyeron la creación de un Consejo de Estudiantes para representar a la comunidad, el lanzamiento de un nuevo sistema de rotaciones en los laboratorios para promover las interacciones multidisciplinarias entre estudiantes, la implantación de comités de asesoramiento de tesis, un curso introductorio para los nuevos estudiantes de doctorado y la creación de un grupo de trabajo liderado por estudiantes para organizar el primer simposio de estudiantes del Instituto, que se celebrará en noviembre del 2009 en Barcelona. Los estudiantes de doctorado defendieron en el 2008 un total de 27 tesis, una vez finalizados sus proyectos de investigación en laboratorios del IRB Barcelona. Activació gènica per la via de Torso i el seu antagonisme amb els mecanismes de repressió transcripcional de la línea germinal a Drosophila José Manuel de la Heras Chanes, Universidad de Barcelona (2008) Director: Jordi Casanova Caracterització de la proteïna tirosina quinasa citoplasmàtica Ack1 al sistema nerviós central Anna La Torre i Vila, Universidad de Barcelona (2008) Directores: Eduardo Soriano García y Jesús Ureña Caracterització de la proteïna dSAP18 a Drosophila melanogaster Elisabet Costa Cros, Universidad de Barcelona (2008) Directora: Maria Lluïsa Espinàs Characterisation of the methionyl-tRNA synthetase from mycoplasma penetrans Thomas Jones, Universidad de Barcelona (2008) Director: Lluís Ribas de Pouplana Diseño, síntesis y estructura de dominios helicoidales. Influencia de la introducción de aminoácidos D Carmen Giovana Granados, Universidad de Barcelona (2008) Director: Ernest Giralt

Tesis Doctorales Resumen Ejecutivo 2008 53

Estudio de métodos sintéticos para la preparación de productos naturales con azoles concatenados Delia Hernández-Romero, Universidad de Barcelona (2008) Directores: Fernando Albericio y Mercédez Álvarez Estudio de resinas para fase sólida y su aplicación a la síntesis de péptidos antitumorales Fayna García, Universidad de Barcelona (2008) Director: Fernando Albericio Estudio teórico de interacciones moleculares. Aplicaciones al diseño de fármacos Jordi Muñoz, Universidad de Barcelona (2008) Director: Modesto Orozco Estudio teórico del transporte de ligandos en proteínas y de la afinidad ligando receptor Axel Bidon-Chanal, Universidad de Barcelona (2008) Director: Modesto Orozco Estudios de mecanismos de interacción macromolecular Alberto Pérez, Universidad de Barcelona (2008) Director: Modesto Orozco Evolutionary algorithms and de novo peptide design Ignasi Belda, Universidad Politécnica de Cataluña (2008) Director: Ernest Giralt Genetic injury and macrophages. Implications in aging and inflammation Sebastián Muñoz, Universidad de Barcelona (2008) Directores: Antonio Celada y Jorge Lloberas Identificació de nous elements de la via de senyalització del receptor Torso de Drosophila melanogaster Gemma Ventura, Universidad de Barcelona (2008) Directores: Jordi Casanova y Marc Furriols Identificación y caracterización de un nuevo mecanismo regulador de la síntesis de glucógeno y su deficiencia en la enfermedad de Lafora David Vilchez, Universidad de Barcelona (2008) Director: Joan J Guinovart La flexibilidad en los ácidos nucleicos. Un estudio de dinámica molecular Agnes Noy, Universidad de Barcelona (2008) Director: Modesto Orozco Les propietats físiques de l’ADN en escala genòmica Josep Ramon Goñi, Universidad de Barcelona (2008) Director: Modesto Orozco Molecular mechanisms that regulate the classical and alternative activation of macrophages Luis Arpa, Universidad de Barcelona (2008) Directores: Antonio Celada y Annabel Fernández New protecting groups for the synthesis of complex peptides Albert Isidro, Universidad de Barcelona (2008) Directores: Fernando Albericio y Mercédez Álvarez

54 Resumen Ejecutivo 2008 Tesis Doctorales

Proteases identification with activity-based proteomics Eduard Sabidó, Universidad de Barcelona (2008) Directores: Ernest Giralt y Teresa Tarragó Role of the mitocondrial protein Mitofusin 2 on the hepatic metabolism José Carlos Paz, Universidad de Barcelona (2008) Director: Antonio Zorzano Role and regulation of mitocondrial dynamics in skeletal muscle Marc Liesa, Universidad de Barcelona (2008) Director: Antonio Zorzano Síntesi assimètrica de productes amb interès farmacològic a partir d’epoxialcohols insaturats Carlos Alegret, Universidad de Barcelona (2008) Director: Antoni Riera Síntesis de pseudopéptidos derivados de la miraziridina A Patricia López, Universidad de Barcelona (2008) Directora: Anna Diez Structural studies of proteins and protein complexes by mass spectrometry and force microscopy Stephanie Boussert, Universidad de Barcelona (2008) Director: Ernest Giralt Study of the aggregation process of amyloid proteins. Examination of aggregation inhibitors Dolors Grillo, Universidad de Barcelona (2008) Directores: Ernest Giralt y Francesc Rabanal The transport of arginine in macrophages and Th1/Th2 susceptibility Maria Gloria Sans, Universidad de Barcelona (2008) Directores: Antonio Celada y Jorge Lloberas Use of calix[4]arenes to recover the self-assembly ability of mutated p53 tetramerization domains Susana Gordo, Universidad de Barcelona (2008) Director: Ernest Giralt

Tesis Doctorales Resumen Ejecutivo 2008 55

Actividades de Transferencia de Tecnología

os investigadores del IRB Barcelona participaron en el 2008 en una serie de invenciones que resultaron en la publicación de solicitudes de patentes. El trabajo científico fue fruto de intensas colaboraciones entre los miembros del Instituto y los sectores biotecnológico y farmacéutico, así como del interés industrial de los descubrimientos.

A screening method for identifying new aminoacyl-tRNA synthetase inhibitors Ribas de Pouplana L, Bori Sanz T, Castro de Moura M y Geslain R No publicación/fecha: WO2008028862 (13/3/2008) A screening method for identifying new drugs Ribas de Pouplana L y Bori Sanz T No publicación/fecha: WO2008000785 (03/01/2008) Compounds for the treatment of diseases related to insulin resistance Gumà A, Cantó C y Zorzano A No publicación/fecha: WO2008006922 (17/1/2008) Compounds that act as a vehicle for delivery through the blood-brain barrier and charge delivery vehicle constructions Giralt E y Teixidó M No publicación/fecha: WO2008025867 (06/03/2008) Inhibition of alpha-synuclein aggregation Zurdo J, Fowler S, Stallwood Y, Giralt E, Teixidó M y Carulla N No publicación/fecha: WO2008003943 (01/10/2008) Inhibition of beta-amyloid aggregation Zurdo J, Fowler S, Carulla N, Giralt E y Teixidó M No publicación/fecha: WO2008050133 (02/05/2008) Method and device for the control and analysis of nerve cell growth Loza P, Amat I, Vathalloor M, Cormack G, Torner Ll, Artigas D, Andres MR y Soriano E No publicación/fecha: WO2008043808 (17/04/2008) Method for obtaining bicyclic peptides Tulla J, Bayo N y Albericio F No publicación/fecha: WO2008040833 (04/10/2008)

56 Resumen Ejecutivo 2008 Actividades de Transferencia de Tecnología

Method for peptide synthesis Giraud M, Albericio F, Quattrini F, Werbitzky O, Senn K y Williner M No publicación/fecha: WO2008040536 (04/10/2008) Polypeptides with the capacity to entrap drugs and release them in a controlled way Giralt E, Poyatos P, Gulin O y Anglada F No publicación/fecha: WO2008071594 (19/06/2008) Proton acceptor imunium/carbocation-type coupling agents Albericio F, El-Faham A, Luxembourg Y y Ewenson A No publicación/fecha: WO2008139481 (20/11/2008) P,S-type bidentate chiral ligands and use thereof in the Pauson-Khand reaction Sola J, Verdaguer X y Riera A No publicación/fecha: WO2008046950 (24/4/2008) Therapeutic agent for treatment of bipolar affective disorder in mammals Giralt E y Tarragó ME No publicación/fecha: WO2008077978 (03/07/2008)

Actividades de Transferencia de Tecnología Resumen Ejecutivo 2008 57

Seminarios Barcelona BioMed

l ciclo de seminarios Barcelona BioMed, organizado por investigadores principales del IRB Barcelona, reunió durante el 2008 a más de 100 expertos internacionales en biomedicina para presentar los últimos resultados de sus trabajos de investigación a la comunidad científica local. Los seminarios sirvieron de plataforma para mantener a los investigadores del IRB Barcelona al día de los últimos avances científicos.

11 enero 2008

8 febrero 2008

Marine sponges as a model system of cellular recognition. Future perspectives in biomedical research Xavier Fernández, Institut de Bioenginyeria de Catalunya (IBEC), Barcelona, España

Cell proliferation and cell competition: what fruit flies can reveal about growth control Nicholas Baker, Albert Einstein College of Medicine, Nueva York, EEUU

23 enero 2008 How telomeres suppress DNA damage signalling at chromosome ends Eros Lazzerini Denchi, Lange Laboratory, The Rockefeller University, Nueva York, EEUU

25 enero 2008 Nanoscale molecular interactions, dynamics and functional relevance of endothelial adhesive platforms in primary living cells Francisco Sánchez-Madrid, Hospital de la Princesa, Universidad Autónoma de Madrid, Madrid, España

29 enero 2008 The IRB Barcelona has a new Biostatistics and Bioinformatics core facility! David Rossell, Biostatistics Unit, IRB Barcelona, Barcelona, España

30 enero 2008

15 febrero 2008 Epidermal stem cells in skin homeostasis and cancer Salvador Aznar-Benitah, Centro de Regulación Genómica (CRG), Barcelona, España

22 febrero 2008 Metabolic circularity as a guiding vision for systems biology: ‘Moonlighting’ proteins, a necessity of life? María Luz Cárdenas, Centre National de la Recherche Scientifique, Marseille, Francia

29 febrero 2008 Unraveling the host-pathogen interactions in Streptococcus pneumoniae by X-ray crystallography Juan Hermoso, GCMBE, Instituto QuímicaFísica Rocasolano, Madrid, España

7 marzo 2008

Cancer biomarkers and new cancer antigens for vaccine therapy Robert Rees, Nottingham Trent University, Nottingham, Reino Unido

Neurogenic niche in the carotid body and its applicability in cell therapy for Parkinson’s disease José López-Barneo, Hospital Universitario Virgen del Rocío, Sevilla, España

1 febrero 2008

14 marzo 2008

Control of neuronal cell generation and survival by cannabinoids Manuel Guzmán, Universidad Complutense, Madrid, España

Structured-based drug design: applications and future perspectives Celerino Abad-Zapatero, University of Illinois at Chicago, Chicago, EEUU

7 febrero 2008

26 marzo 2008

Analysing stem cells within intact tissue using Drosophila Allan Spradling, Carnegie Institution, Washington, EEUU

Azaheterocyclic analogues of natural products as lead towards biological activity Christian Stevens, Ghent University, Ghent, Bélgica

58 Resumen Ejecutivo 2008 Seminarios Barcelona BioMed

28 marzo 2008

23 abril 2008

Membrane biology in the genomics era Stephen Baldwin, Leeds University, Leeds, Reino Unido

Spatio-temporal evolution of endocytic subcomplexes during membrane budding: insights from quantitative inmunoelectron microscopy Fátima Idrissi, Institut de Biologia Molecular de Barcelona (IBMB-CSIC), Barcelona, España

2 abril 2008 Epithelial proliferation and axis specification in Drosophila Isabel Palacios, Cambridge University, Cambridge, Reino Unido

4 abril 2008 Complement genes and predisposition to disease. The dark side of innate immunity Santiago Rodríguez de Córdoba, Centro de Investigaciones Biológicas (CSIC), Madrid, España

9 abril 2008 Integrating Wnt and Shh signalling during spinal cord morphogenesis Roberto Álvarez, Institut de Biologia Molecular de Barcelona (IBMB-CSIC), Barcelona, España

10 abril 2008 RNAi therapeutics: Can it move from the bench to the bedside or is it just a flash in the pan? Sukhendu Dev, IRB Barcelona, Barcelona, España

11 abril 2008 Interaction of mycobacteria with macrophages: New role of NF−kB in the innate immune response Maximiliano G Gutiérrez, European Molecular Biology Laboratory (EMBL), Heidelberg, Alemania

16 abril 2008 Identifying the histone trimethylation role in an in vivo model of neural stem cell maintenance and differentiation Naiara Aquizu, Institut de Biologia Molecular de Barcelona, Barcelona, España

18 abril 2008 Multifunctional pharmaceutical nanocarriers for therapy and diagnostics Vladimir Torchilin, Northeastern University, Boston, EEUU

21 abril 2008 The endocytic control of cell-cell signalling and tumor suppression Thomas Vaccari, University of California, Berkeley, EEUU

25 abril 2008 Molecular mechanisms of amyotrophic lateral sclerosis (ALS): from in vitro models to cerebrospinal fluid biomarkers Jacques Borg, Neurochemistry Laboratory, Saint Etienne, Francia

28 abril 2008 Flybase Workshop Peter McQuilton, Flybase, Cambridge, Reino Unido

30 abril 2008 Factors that regulate target-cell specific innervations Sara Rubio, IRB Barcelona, Barcelona, España

7 mayo 2008 Scarface, a novel secreted serine proteaselike molecule is a target of JNK signalling required for embryonic dorsal closure in Drosophila Georgina Sorrosal, IRB Barcelona, Barcelona, España

9 mayo 2008 New approaches towards understanding the cellular basis of embryonic development in the mouse Miguel Torres, Centro Nacional de Investigaciones Cardiovasculares (CNIC), Madrid, España

14 mayo 2008 Minisymposium: Cell biology meets morphogenesis Antonio García-Bellido, Centro de Biología Molecular ‘Severo Ochoa’, Madrid, España; Franck Pichaud, University College London, Londres, Reino Unido; Markus Affolter, Basel University, Basel, Suiza

16 mayo 2008 3D structure and function of macromolecular multi-protein complexes involved in DNA repair using electron microscopy Óscar Llorca, Centro de Investigaciones Biológicas, Madrid, España

Seminarios Barcelona BioMed Resumen Ejecutivo 2008 59

Mechanical constraints pattern cellular behaviour during dorsal closure in Drosophila Nicole Gorfinkiel, Cambridge University, Cambridge, Reino Unido

18 junio 2008

19 mayo 2008

20 junio 2008

Myosin II and the morphogenesis of the imaginal discs Luis Escudero, MRC Laboratory of Molecular Biology, Cambridge, Reino Unido

21 mayo 2008 Chemotaxis in Drosophila: Making sense of graded olfactory stimuli Matthieu Louis, Centro de Regulación Genómica (CRG), Barcelona, España

23 mayo 2008 Is the DNA damage response (DDR) a bona fide tumour suppressor barrier? Óscar Fernández, Centro Nacional de Investigaciones Oncológicas, Madrid, España

26 mayo 2008 Differential regulation of sister chromatid cohesion in female Drosophila germ line stem cells Rui Martinho, Instituto Gulbenkian de Ciencia, Oeiras, Portugal

28 mayo 2008 DNA structure and genomics Juan Subirana, Universidad Politécnica de Cataluña (UPC), Barcelona, España

Role of the Wnt pathway during planarians regeneration Teresa Adell, Universidad de Barcelona, Barcelona, España

TRAIL, apoptosis and autophagy in normal and transformed cells Abelardo López Rivas, Centro Andaluz de Biología Molecular y Medicina Regenerativa, Sevilla, España

25 junio 2008 A permissive role of Notch in maintaining the DV affinity boundary of the Drosophila wing Isabelle Becam, IRB Barcelona, Barcelona, España

27 junio 2008 Identification and characterisation of Lynch syndrome: contributions of the EPICOLON project Antoni Castells, Hospital Clínic, Barcelona, España

2 julio 2008 The necrotic serpin, a protease inhibitor which controls the innate immune response in Drosophila David Gubb, CIC bioGUNE, Derio, España

3 julio 2008

The role of the histone variant macroH2A during cell fate decisions Marcus Buschbeck, Centro de Regulación Genómica (CRG), Barcelona, España

Regulation of self-renewal, proliferation and differentiation in a stem cell lineage Minx Fuller, Stanford University School of Medicine, Stanford, EEUU

30 mayo 2008

4 julio 2008

The oncogenic role of TGF-beta in glioma Joan Seoane, Institut de Recerca Hospital Universitari Vall d’Hebron, Barcelona, España

Translation in time and space: Sequential waves of polyadenylation and deadenylation define a translation circuit that drives meiotic progression Raúl Méndez, Centro de Regulación Genómica (CRG), Barcelona, España

4 junio 2008 Preferential incorporation of adult generated neurons into spatial memory networks Catia Teixeira, IRB Barcelona, Barcelona, España

6 junio 2008 Novel strategies to resolve inflammation Adriano Rossi, University of Edinburgh Medical School, Edinburgh, Escocia, Reino Unido

11 junio 2008 Graded sonic hedgehog signalling and the control of neural cell fate James Briscoe, National Institute for Medical Research (NIMR), Londres, Reino Unido

13 junio 2008 Neuron-glia metabolic coupling and plasticity Pierre Magistretti, Ecole Polytechnique Fédérale de Lausanne (EPFL), Lausanne, Suiza

17 junio 2008 Unveiling novel regulators of senescence using genetic screenings Jesús Gil, Imperial College Faculty of Medicine, Londres, Reino Unido

9 julio 2008 Intra-cytoplasmic lumen formation during terminal branches elongation of the Drosophila tracheal system Louis Gervais, IRB Barcelona, Barcelona, España

11 julio 2008 Synthetic peptides for specific DNA recognition José Luis Mascareñas, Universidad de Santiago, Santiago de Compostela, España

14 julio 2008 miRNA in stem cells Hannele Ruohola Baker, Washington University, Washington, EEUU

15 julio 2008 Generation of patient-specific iPS cells Ángel Raya, Centre de Medicina Regenerativa de Barcelona (CMRB), Barcelona, España

16 julio 2008 Thermostabilisation and structure

60 Resumen Ejecutivo 2008 Seminarios Barcelona BioMed

determination of a b1 adregenic receptor María Serrano Vega, MRC Laboratory of Molecular Biology, Cambridge, Reino Unido

25 julio 2008 Mitochondrial dysfunction increases oxidative stress and decreases chronological life span in fission yeast Elena Hidalgo, Universidad Pompeu Fabra, Barcelona, España

28 julio 2008 Toward carbohydrate-based drug discovery Shin-Ichiro Nishimura, National Institute of Advanced Industrial Science and Technology, Sapporo, Japón

3 septiembre 2008

Chile, Santiago, Chile Quantitative proteomics of the intraerythrocytic life stages of the malaria parasite Plasmodium falciparum Bernardo Foth, School of Biological Sciences, Nanyang Technological University, Singapur Host cell invasion by hemorrhagic arenaviruses Stefan Kunz, Centre Hospitalier Universitaire Vaudois, Lausanne, Suiza

8 octubre 2008 Polyploidy In colon carcinoma cells is modulated by mithramycin Sk Marc Bataller, Institut de Biologia Molecular de Barcelona (IBMB-CSIC), Barcelona, España

The unicell-to-multicell transition: A functional and comparative genomics approach Iñaki Ruiz, Universidad de Barcelona, Barcelona, España

9 octubre 2008

8 septiembre 2008

Towards rational intervention in Parkinson’s disease: structural studies of intrinsically disordered α-synuclein and associated protein complexes Carlos Bertoncini, Cambridge University, Reino Unido

Molecular imaging of angiogenesis: Peptides, proteins and nanoparticles Weibo Cai, University of Wisconsin, Madison, EEUU

10 septiembre 2008 Bioinformatics characterisation of protein variability Xavier de la Cruz, IRB Barcelona, Barcelona, España

17 septiembre 2008 Cell polarity and tissue morphogenesis in Drosophila Kyra Campbell, Cambridge University, Cambridge, Reino Unido

19 septiembre 2008 The mammalian ‘hipo’ pathway: signal trasduction through the Rassf1/Nore1Mst1/2 tumor suppressor complexes Joseph Avruch, Harvard Medical School, Harvard University, Boston, Massachusetts, EEUU

22 septiembre 2008 Targeted genome editing in mammalian cells using engineered zinc finger nucleases Phil Simmons, Sigma Aldrich, St. Louis, EEUU

25 septiembre 2008 Discovery of novel potent, selective and orally efficacious A2B adenosine receptor antagonists Bernat Vidal, Almirall Laboratories, Barcelona, España

Brain tumor supressors and neural stem cell self-renewal in Drosophila Hongyan Wang, Duke-NUS Graduate Medical School, Singapur

10 octubre 2008 Regulation of pre-mRNA splicing in budding yeast Josep Vilardell, Centro de Regulación Genómica (CRG), Barcelona, España

15 octubre 2008 The cytosolic kinase Ack1 in the developing nervous system Anna La Torre, Universidad de Barcelona/IRB Barcelona, Barcelona, España

17 octubre 2008 Looking for the Kepler’s laws of drug discovery Celerino Abad-Zapatero, University of Illinois at Chicago (UIC), Chicago, EEUU

22 octubre 2008 Regulatory particle of the proteasome: a nanoprocessor controlling cellular pathways Bernat Crosas, Institut de Biologia Molecular de Barcelona (IBMB-CSIC), Barcelona, España Spatio-temporal evolution of endocytic subcomplexes during membrane budding: insights from quantitative immunoelectron microscopy Fátima Idrissi, Institut de Biologia Molecular de Barcelona (IBMB-CSIC), Barcelona, España

24 octubre 2008

26 septiembre 2008 Structural characterisation of MuB helical filaments by electron microscopy Santiago Ramón-Maiques, Instituto de Biomedicina de Valencia (IBV-CSIC), Valencia, España

1 octubre 2008 Skeletal muscular formation and fibrosis; new insights about the role of TGB-beta and CTGF Enrique Brandan, Universidad Católica de

Biogenesis of a transport carrier during protein secretion Vivek Malhotra, Centro de Regulación Genómica (CRG), Barcelona, España

27 octubre 2008 Mysteries in growth control and the hippo pathway Georg Halder, University of Texas, MD Anderson Cancer Centre, Houston, EEUU

Seminarios Barcelona BioMed Resumen Ejecutivo 2008 61

Oscarella lobularis, an emerging sponge model in comparative developmental biology Eve Gazave, Centre d’Océanologie de Marseille, Marsella, Francia

28 octubre 2008 A role for the p53 tumor suppressor protein in metabolism Karim Bensaad, Cancer Research UK, Beatson Laboratories, Glasgow, Reino Unido A role of Stardust in morphogenesis and function of the Drosophila eye Natalia Bulgakova, Max Planck Institute of Molecular Cell Biology and Genetics, Dresden, Alemania

29 octubre 2008 Towards a theory of biological networks Natasa Przulj, University of California, Irvine, EEUU Mechanisms of dendrite differentiation and remodeling Gaia Tavosanis, Max Planck Institute of Neurobiology, Martinsried, Alemania

31 octubre 2008 Understanding and manipulating proteinprotein interactions in G protein signalling: one step beyond GPCRs Alan Smrcka, University of Rochester Medical Centre, Rochester, EEUU

3 noviembre 2008 Lipochaperones: lipids as molecular chaperones and topological determinants Mikhail Bogdanov, University of Texas, Houston, EEUU

5 noviembre 2008 JmjC+N histone demethylases in Drosophila melanogaster Marta Lloret, Institut de Biologia Molecular de Barcelona/IRB Barcelona, Barcelona, España

24 noviembre 2008 ER to nucleus communication relies on HAC1 mRNA targeting Tomás Aragón, University of California, San Francisco (UCSF), San Francisco, EUA

28 noviembre 2008 Alteration of mitochondrial form and function in metabolic diseases and cancer Rossignol Rodrigue, Université Victor Segalen, Bordeaux, Francia

3 diciembre 2008 Drosophila as a model to identify new human genes Álvaro Tavares, Instituto Gulbenkian de Ciéncia, Oeiras, Portugal Identification of proteins that interact with cyclophilin A, cyclophilin B and FKBP12 and their implications in CsA Guillermo Suñé, Institut de Recerca Vall d’Hebron, Barcelona, España

5 diciembre 2008 The function of the intermediate compartment in pre-Golgi trafficking involves its stable connection with the centrosome Jaakko Saraste, Bergen University, Bergen, Noruega

10 diciembre 2008 Investigating the molecular mechanisms of Myo5p recruitment to endocytic sites in Saccharomyces Cerevisiae Jonathan Giblin, Institut de Biologia Molecular de Barcelona (IBMB-CSIC), Barcelona, España

12 diciembre 2008 Transcription factors Foxc2 and Prox1 in lymphatic vascular development and cancer Tanya Petrova, CePO, CHUV & University of Lausanne, Epalinges, Suiza

7 noviembre 2008

15 diciembre 2008

Mechanisms of structural plasticity at the vertebrate neuromuscular junction Rüdiger Rudolf, Karlsruhe Institute of Technology, Karlsruhe, Alemania

A blow of fresh air: An unexpected role of NF-kB and JNK pathways in the response to hypoxia Jordi Rius, University of California, San Diego, EEUU

12 noviembre 2008 Force sensing in actin bundles: a model system to seek mechanosensors involved in cell adhesion and contractility Julien Colombelli, IRB Barcelona, Barcelona, España

14 noviembre 2008 Protein misfolding and disease: mapping the triggering event Mikael Akke, Lund University, Lund, Suecia

19 noviembre 2008 Dissecting Reelin functions in the adult brain by conditional transgene expression Lluís Pujadas Puigdomènech, IRB Barcelona, Barcelona, España

16 diciembre 2008 Tumor microenvironment: Effect on tumor metastasis and cancer stem cell maintenance Xiao-Fan Wang, Duke University Medical Centre, Durham, EEUU

18 diciembre 2008 The two-component system DesK/DesR: A general mechanism of signal transduction? Pedro Alzari, Institut Pasteur, París, Francia

19 diciembre 2008 Genomics of complex diseases Jesús Sainz, Instituto de Biomedicina y Biotecnología de Cantabria (IBBTEC), Cantabria, España

62 Resumen Ejecutivo 2008 Seminarios Barcelona BioMed

Conferencias Barcelona BioMed

l ciclo de conferencias Barcelona BioMed reunió a expertos destacados de todo el mundo para presentar y debatir las últimas novedades científicas en diversos campos de las ciencias biomédicas. Organizadas por el IRB Barcelona, gracias al apoyo de la Fundación BBVA, la selección del 2008 contó con ponentes internacionales líderes en biología celular y del desarrollo, oncología, y biología estructural y computacional. Las conferencias, celebradas en el Institut d’Estudis Catalans en el centro de la ciudad, fueron un éxito y reunieron a centenares de participantes de todo el mundo del sector académico e industrial.

6-8 de octubre de 2008 MORPHOGENESIS AND CELL BEHAVIOUR Organizadores: Jordi Casanova (IRB Barcelona/IBMB-CSIC) y Marco Milán (IRB Barcelona) 19-21 de mayo de 2008 METASTASIS GENES AND FUNCTIONS Organizadores: Tyler Jacks, Massachusetts Institute of Technology (Cambridge, EEUU) y Joan Massagué, Memorial Sloan-Kettering Cancer Center (Nueva York, EEUU) 14-16 de abril de 2008 TARGETING AND TINKERING WITH INTERACTION NETWORKS Organizadores: Patrick Aloy (IRB Barcelona) y Rob Russell, European Molecular Biology Laboratory (Heidelberg, Alemania)

El ciclo Barcelona BioMed del 2008 también reunió a investigadoras destacadas durante el Fórum Barcelona BioMed, un acto de carácter concienciador dirigido a ofrecer consejos para superar el desnivel actual de género en las carreras científicas.

21 de julio de 2008 Barcelona BioMed Forum FROM WOMAN TO WOMAN: PRACTICAL ADVICE ON HOW TO GET AND STAY AHEAD IN SCIENCE Organizador: IRB Barcelona

Conferencias Barcelona BioMed Resumen Ejecutivo 2008 63

Actividades de Divulgación

urante el 2008, los investigadores del IRB Barcelona participaron activamente en un número de actividades organizadas por el Parque Científico de Barcelona. La participación de investigadores del IRB Barcelona en las jornadas, abiertas al público general y orientadas a estudiantes de primaria y de secundaria, tuvo como objetivos acercar la ciencia llevada a cabo en el Instituto a una audiencia más amplia y motivar a los estudiantes a emprender carreras científicas.

10 de enero-24 de abril

25 de octubre-29 de noviembre de 2008

FES RECERCA! Un ciclo de talleres prácticos dirigidos a estudiantes de secundaria y al público general Participantes: Elisabeth Castellanos1, Consol Farrera2, Ana Janic1, Leire Mendizábal1 y Maria Serra2 Grupos de investigación en 1división celular y 2biología de macrófagos Tópicos: Analiza ADN e investiga el autor de un crimen; moscas con cáncer Enero-diciembre 2008

RECERCA A PRIMÀRIA Una actividad bimensual para acercar la ciencia a alumnos de primaria mediante la participación activa en experimentos de investigación Participantes: Carme Cortina y Elisa Espinet Laboratorios de cáncer colorrectal I y II Tópicos: Introducción al método científico, extracción de ADN, células madre y análisis en el microscopio 10-11 de abril de 2008

FIRA RECERCA EN DIRECTE Una feria científica para presentar los últimos avances en investigación en Barcelona Participantes: Carme Cortina y Sergio Palomo Laboratorios de cáncer colorrectal I y II Tópico: Cáncer de colon. ¿Qué es y qué podemos hacer? 7-8 de junio de 2008

FESTA DE LA CIÈNCIA 2008 Una fiesta científica con experimentos reales y demostraciones en el Parque de la Ciutadella Participantes: Elisabeth Castellanos y Ana Janic Grupo de investigación en división celular Tópico: Extracción de ADN de la saliva

64 Resumen Ejecutivo 2008 Actividades de Divulgación

1 de julio-30 de septiembre de 2008

PASSA L’ESTIU AL PARC! Un programa dirigido a estudiantes en sus últimos años de carrera para familiarizarse con el mundo de la investigación mediante la participación activa en proyectos de grupos del PCB Participantes (tutores): Fernando Albericio1, Carme Caelles2, Albert Canals3, Antonio Celada4, Ernest Giralt5, Joan Guinovart6, Jens Lüders7, Marco Milán8, Cristina Minguillón9, Lluís Ribas de Pouplana10 y Antoni Riera11 Grupos de investigación en 1química combinatoria para el descubrimiento de nuevos compuestos, 2 señalización celular, 3biología estructural de proteínas, ácidos nucleicos y sus complejos, 4biología de macrófagos, 5diseño, síntesis y estructura de péptidos y proteínas, 6ingeniería metabólica y terapia de la diabetes, 7organización microtubular, 8desarrollo y control del crecimiento, 9 peptidomiméticos y heterociclos bioactivos (Biosyner), 10traducción genética, 11síntesis asimétrica Julio de 2008-marzo de 2009

RECERCA A SECUNDÀRIA Una actividad académica para ayudar a alumnos de secundaria en sus trabajos de investigación a través de un programa de tutorías Participantes (tutores): Maria Isabel Arévalo1, Elisabeth Casstellanos2, Ana Janic2, Irene Martín3, Carles Martínez4, Laura Nocito4, Neus Rafel5, Lidia Ruiz6, Isabel Saez4, Pablo Sirkin7, Jordi Vallès4 y Dèlia Zafra4 Grupos de investigación en 1señalización celular, 2división celular, 3diseño, síntesis y estructura de péptidos y proteínas, 4ingeniería metabólica y terapia de la diabetes, 5desarrollo y control del crecimiento, 6espectroscopia de RMN de biomoléculas, 7estructura y función de la cromatina 18-20 de noviembre de 2008

JORNADA DE PUERTAS ABIERTAS: ¿QUÉ ES EL PARQUE CIENTÍFICO DE BARCELONA? ¿QUÉ ES HACER INVESTIGACIÓN? Una experiencia práctica para acercar la ciencia a los alumnos de secundaria Participantes: Carme Cortina y Elisa Espinet Laboratorios de cáncer colorrectal I y II Tópicos: extracción de ARN, visualización de células, cultivo celular in vitro, análisis del ARN extraído de células tumorales y separación de las células tumorales benignas de las malignas

Actividades de Divulgación Resumen Ejecutivo 2008 65

Organigrama Comité Científico Internacional

Patronato Junta de Gobierno

Director

Director Adjunto

Joan J Guinovart

Joan Massagué

Comité Científico Interno Marco Milán Miquel Coll Antonio Zorzano Ernest Giralt Eduard Batlle

Directora de Gestión Margarida Corominas

Programas de investigación

Plataformas Científicas

Administración

Biología Celular y del Desarrollo

Microscopía Digital Avanzada

Gestión Científica y Académica

Ferran Azorín Jordi Casanova Cayetano González Jens Lüders Marco Milán Lluís Ribas de Pouplana Eduardo Soriano

Bioinformática/Bioestadística

Recursos Humanos

David Rossell

Sylvia Martínez

Biología Estructural y Computacional Patrick Aloy Miquel Coll Ignasi Fita Maria Macías Modesto Orozco Miquel Pons

Julien Colombelli

Genómica Funcional

Finanzas

Herbert Auer

Alex Puerto

Espectrometría de Masas

Compras

Marta Vilaseca

Yolanda Olmos

Ratones Transgénicos

Comunicación y Relaciones Externas

Medicina Molecular Carme Caelles Antonio Celada Joan J Guinovart Manuel Palacín Antonio Zorzano

Química y Farmacología Molecular Fernando Albericio Ramon Eritja Ernest Giralt Antoni Riera Màrius Rubiralta Xavier Salvatella

Margarita Navia

Sarah Sherwood

Expresión de Proteínas Nick Berrow

Servicios de Tecnología de la Información Francisco Lozano

Estructura científica Estructura administrativa de apoyo a las actividades científicas Estructura asesora

Oncología Eduard Batlle Elena Sancho MetLab

66 Resumen Ejecutivo 2008 Organigrama

Personal de Dirección y Administración

Dirección

Director

Director Adjunto

Joan J Guinovart

Joan Massagué

Directora de Gestión

Secretaria de Dirección

Margarida Corominas

Maria Estévez

Programas de Investigación Coordinador, Biología Celular y del Desarrollo

Secretaria de Programa Martha Brigg

Marco Milán

Coordinador, Biología Estructural y Computacional Miquel Coll

Coordinador, Medicina Molecular

Secretaria de Programa Vanessa Llobet

Secretaria de Programa Natàlia Molner

Antonio Zorzano

Coordinador, Química y Farmacología Molecular

Secretaria de Programa Eva Poca

Ernest Giralt

Coordinador, Oncología Eduard Batlle

Secretaria de Programa Sara Martorell

Personal de Dirección y Administración Resumen Ejecutivo 2008 67

Administración

Gestión Científica y Académica Margarita Navia (Jefa), Clara Caminal (Coordinadora Académica), Sònia Saborit (Coordinadora de Proyectos), Adriana Grosu (Técnica en Gestión de Proyectos Europeos)

Recursos Humanos Sylvia Martínez (Jefa), Sílvia Aguadé (Técnica de Administración de Personal), Maria Rovira (Técnica de Recursos Humanos) Finanzas Alex Puerto (Jefe), Elisava de la Hoz (Técnica Contable), Stel·la Serra (Técnica de Proyectos), Dan Maldonado (Técnico Contable), Silvia Ramírez (Técnica Contable, hasta septiembre de 2008), Cristina Coletas (Asistente de Finanzas) Compras Yolanda Olmos (Jefa), Xavier López (Técnico de Compras), Sara López (Administrativa de Compras), Eric González (Asistente Administrativo de Compras), Mª Jesús López (Asistente Administrativa de Compras, hasta octubre de 2008), Carles Coarassa (Jefe del anterior Departamento de Finanzas y Compras, hasta mayo de 2008) Comunicación y Relaciones Externas Sarah Sherwood (Jefa), Sònia Armengou (Responsable de Prensa y Relaciones con los Medios), Anna Alsina (Responsable de Información y Publicaciones), Meritxell Gavaldà (Coordinadora de Conferencias y Actos), Tanya Yates (Servicio Editorial)

Servicios de Tecnología de la Información

Francisco Lozano (Jefe),

Roberto Bartolomé (Arquitecto de Sistemas), David Villanueva (Administrador de Sistemas), Jesús Sánchez (Administrador de Sistemas)

68 Resumen Ejecutivo 2008 Personal de Dirección y Administración

Estadísticas de Recursos Humanos MIEMBROS IRB BARCELONA Laboratorios

362

Plataformas Científicas

Administración

Total

407

Personal científico por programa de investigación Plataformas Científicas 5% Oncologia 6%

Química y Farmacología Molecular 20%

Medicina Molecular 22%

Biología Celular y del Desarrollo 27% Biología Estructural y Computacional 20%

Personal científico por categorías profesionales Jefes de Grupo 8% Técnicos 15% Investigadores Asociados 10%

Estudiantes de Doctorado 45% Investigadores Postdoctorales 22%

Estadísticas de Recursos Humanos Resumen Ejecutivo 2008 69

Afiliaciones de los Investigadores Universidad de Barcelona (UB) Investigadores Principales

Otros Investigadores

Fernando Albericio Carme Caelles Antonio Celada Ernest Giralt Joan J Guinovart Modesto Orozco Manuel Palacín Miquel Pons Antoni Riera Màrius Rubiralta Eduardo Soriano

Mercedes Álvarez Ferran Burgaya José Antonio del Río (fins diciembre 2008) Anna Diez Annabel Fernández Josep Lluís Gelpí Rodolfo Lavilla Jorge Lloberas Albert Martínez Cristina Minguillón Jesús Ureña

Antonio Zorzano

Xavier Verdaguer

Institución Catalana de Investigación y Estudios Avanzados (ICREA) Investigadores Principales

Otros Investigadores

Patrick Aloy Eduard Batlle Roger Gomis Cayetano González Maria Macías Marco Milán Lluís Ribas de Pouplana Xavier Salvatella

Natàlia Carulla Elena Casacuberta (fins julio 2008) Alfred Cortés Xavier de la Cruz (fins septiembre 2008) José Luís Vázquez Ibar

Consejo Superior de Investigaciones Científicas (CSIC) Investigadores Principales

Otros Investigadores

Ferran Azorín Jordi Casanova Miquel Coll Ramón Eritja Ignasi Fita

Maria Lluïsa Espinàs Rosa Pérez Luque Maria Solà Cristina Vega

70 Resumen Ejecutivo 2008 Afiliaciones de los Investigadores

Un proyecto en expansión

l Parque Científico de Barcelona (PCB) impulsó sus objetivos durante el 2008 a través de diversas actividades en el ámbito de la investigación, la innovación y la difusión de la ciencia. El Parque experimentó un crecimiento importante, tanto a nivel de superficie e infraestructuras como en el número de profesionales, empresas y entidades que acoge. A finales de diciembre, el PCB contaba con 2.200 profesionales, cerca de 50 empresas, 25 unidades científicotecnológicas y más de 70 grupos de investigación. En el marco de las obras de construcción de la segunda fase destacó la inauguración del edificio Hélix, que amplió la superficie del Parque en más de 6.500 m2; la finalización de los trabajos de reforma del edificio de Administración, donde se instalaron las direcciones y administraciones de los principales institutos de investigación que acoge el PCB; y el traslado de la entrada principal del Parque a la calle Baldiri Reixac, que permitió unificar los servicios de recepción y de seguridad de los edificios Modular y de Administración. También finalizaron las obras de remodelación de las Torres Investigación e Innovación, que aportarán alrededor de 10.000 m2 y se inaugurarán en el 2009. En el ámbito de la investigación, destacó la creación de la Plataforma de ‘Drug Discovery’ (PDD), que ofrece servicios de asesoría en el proceso de descubrimiento de fármacos a entidades públicas y privadas, tanto internas como externas al PCB. Otros aspectos de interés incluyeron la ampliación de los espacios de los Servicios Científicos Comunes de la

Universidad de Barcelona dedicados a Drosophila, la finalización de las obras de reforma del Servicio de Experimentación Animal (SEA-PCB), que aumentó su capacidad inicial de 15.000 animales hasta los 35.000, así como el establecimiento de una nueva zona dedicada a especies acuáticas. En materia de innovación destacó la inauguración de la Bioincubadora PCBSantander, un proyecto que tiene como objetivo facilitar la creación y el crecimiento de nuevas empresas de base tecnológica. La Bioincubadora, impulsada conjuntamente por el PCB y la Fundación Bosch i Gimpera, con el apoyo del Banco Santander, contaba a finales de diciembre de 2008 con un total de 13 empresas en las que trabajaban más de 80 personas. Se trata de la segunda generación de empresas que participan en esta iniciativa. La segunda fase del proyecto de expansión del PCB, actualmente en curso, finalizará en el año 2011 y permitirá al Parque cuadruplicar su superficie inicial.

Researcher Resumen Científico AffiliationsResumen 2008 Executive Ejecutivo Summary 2008 7171

Resumen Ejecutivo 2008

IRB Barcelona Parque Científico de Barcelona Baldiri Reixac 10 08028 Barcelona España Tel: +34 93 402 0250 Fax: +34 93 403 7114 info@irbbarcelona.org www.irbbarcelona.org

Con la colaboración de

Instituto de Investigación Biomédica

Entidades fundadoras

Centres de recerca de Catalunya