IRB Barcelona Resumen Ejecutivo 2007 by IRB Barcelona

Resumen Ejecutivo 2007

IRB Barcelona

Tel: +34 93 403 7111 Fax: +34 93 403 7114 info@irbbarcelona.org www.irbbarcelona.org

Entidades fundadoras

Con la colaboración de

Instituto de Investigación Biomédica

Parque Científico de Barcelona Baldiri Reixac 10 08028 Barcelona España

Centres de recerca de Catalunya

Créditos

Producción: Oficina de Comunicación y Relaciones Externas Instituto de Investigación Biomédica — IRB Barcelona Baldiri Reixac, 10 08028 Barcelona, España www.irbbarcelona.org Maquetación y Edición: Anna Alsina Diseño: Nicola Graf Fotografía: Maj Britt Hansen; Parque Científico de Barcelona; Raimon Solà (p. 33) Impresión: La Trama Depósito legal: B-29137-2008

Resumen Ejecutivo 2007

Índice Prólogo...............................................................

Resumen Científico Programa de Biología Celular y del Desarrollo..................

Programa de Biología Estructural y Computacional............

Programa de Medicina Molecular..................................

Programa de Química y Farmacología Molecular...............

Programa de Oncología.............................................

Plataformas Científicas.............................................

Datos IRB Barcelona

Patronato.............................................................

Junta de Gobierno...................................................

Comité Científico Internacional...................................

Fuentes de Financiación............................................

Resumen de la Producción Científica.............................

Tesis Doctorales......................................................

Actividades de Transferencia de Tecnología.....................

Barcelona BioMed Seminars........................................

Barcelona BioMed Conferences....................................

Actividades de Divulgación.........................................

Organigrama..........................................................

Personal de Dirección y Administración..........................

Estadísticas de Recursos Humanos................................

Afiliaciones de los Investigadores.................................

Parque Científico de Barcelona...................................

R es u me n Eje cu ti vo 2 0 0 7 Índice

R e s u m Exe cu tiu 2 0 0 7 Ă?ndice

Prólogo

El IRB Barcelona avanza en el escenario de la investigación biomédica

a segunda Memoria Anual del IRB Barcelona, un instituto joven y vibrante ubicado en la capital de Cataluña, se divide en tres apartados: la Memoria Científica, que ofrece un resumen detallado del trabajo realizado durante el año por nuestros grupos de investigación y plataformas tecnológicas, el Resumen Ejecutivo, en el que se incluyen datos generales y cifras del Instituto, e ‘Historias de Ciencia del IRB Barcelona’, en el que se destacan algunos de los proyectos de investigación llevados a cabo durante el pasado año, prestando especial atención a las personas que están detrás de la ciencia en el IRB Barcelona. El objetivo principal de estos volúmenes es reflejar las actividades que se han llevado a cabo en el Instituto durante el 2007. Esperamos que a medida que los lectores se adentren en el contenido de la memoria puedan llegar a conocer mejor este centro, nuevo y único, y su relevancia en el escenario de la investigación biomédica.

Preparando el escenario para una investigación de excelencia en una ciudad de excelencia El carácter de un instituto lo conforman distintos factores. El primero y más importante es su visión, las personalidades de sus científicos y la calidad de la investigación que lleva a cabo. También juegan un papel fundamental el entorno físico en el que se encuentra, las infraestructuras de investigación, y el clima científico y político que lo rodean. Con un largo reconocimiento como faro de las artes, de la arquitectura y de la música, Cataluña está realizando en la actualidad grandes inversiones destinadas a impulsar sus recursos científicos. Las personas que no hayan visitado Barcelona

Con un largo reconocimiento como faro de las artes, de la arquitectura y de la música, Cataluña está realizando en la actualidad grandes inversiones destinadas a impulsar sus recursos científicos

Pró lo go R es u m en Ej ec u t i v o 2 0 0 7

recientemente se quedarían asombradas al ver el nuevo perfil científico de la ciudad. El IRB Barcelona es un motor importante de este cambio, a medida que los gobiernos de Cataluña y de España, la ciudad de Barcelona, un sinfín de industrias y algunas personas clave están logrando transformar la región en un polo científico de reconocido prestigio en el ámbito internacional.

Tenemos una desafiante visión con una gran proyección de futuro: llevar a cabo trabajos de investigación en las ciencias moleculares de la vida que se traduzcan en beneficios para la salud de las personas. En la última década ha surgido una explosión de nuevos conceptos en biotecnología que ha tenido un gran impacto en la práctica de la medicina. El resultado ha sido la obtención de nuevas y potentes herramientas de diagnóstico y los primeros fármacos ‘diseñados racionalmente’. Estos cambios no son más que la punta del iceberg de lo que probablemente va a suceder en un futuro cercano. Para beneficiarnos de ello, será preciso adoptar nuevas y flexibles maneras de realizar investigación. La última gran revolución en medicina comenzó a finales del siglo XIX y continuó en el siglo siguiente con la identificación de los microbios que causan las enfermedades infecciosas, y con el desarrollo de vacunas, antibióticos y otro tipo de fármacos. Este conocimiento y los productos resultantes representaron un punto de inflexión en la sociedad, ya que permitieron aumentar la esperanza y la calidad de vida en los países desarrollados y, progresivamente, también en los países en vías de desarrollo.

Joan Massagué, Director Adjunto (izquierda) y Joan J Guinovart, Director, IRB Barcelona 8

Re esu s u m Exe cu tiu 2 0 0 7 Índice

En la actualidad, las principales causas de mortalidad en la mayor parte del mundo industrializado —enfermedades cardiovasculares, cáncer y enfermedades neurodegenerativas— provienen de una fuente diferente: de defectos en los genes humanos y complejos procesos biológicos. Para aprender a diagnosticar y tratar estos defectos, será necesario disponer de un nuevo tipo de medicina basada en un profundo conocimiento molecular de las células y de los organismos. Sin embargo, el conocimiento por sí mismo no es una cura; debe transformarse en nuevas herramientas y soluciones terapéuticas. Lograr esta transformación es un gran reto que un instituto como el IRB Barcelona no puede afrontar solo y, por ello, estamos estableciendo nuevos tipos de acuerdos con universidades, centros clínicos y con la industria. Esta visión de futuro se tiene que consolidar mediante la aplicación de un nuevo enfoque interdisciplinario. Hace años, los grupos científicos solían concentrar su trabajo en un número reducido de moléculas y procesos, habitualmente en un único organismo modelo. En la actualidad, pueden seguir un proceso que abarca la totalidad del genoma, con experimentos que van desde el ordenador hasta la probeta, y desde ratones hasta el tejido humano. Esto requiere disponer de una amplia gama de técnicas, cuyo dominio no puede lograr un solo grupo. La memoria, aparte de describir la investigación realizada en el Instituto, destaca también la creación de plataformas científicas de tecnología punta, así como otras áreas de actividad como son la formación y las actividades informativas dirigidas a la población y orientadas a respaldar la ciencia que desarrolla el IRB Barcelona. Un año de consolidación y crecimiento El IRB Barcelona, fundado oficialmente hace dos años, ha entrado por la puerta grande en el escenario científico, a escala local, nacional e internacional. Durante el transcurso de este último año, hemos reclutado a nuevos talentos científicos, y hemos establecido plataformas

Pró lo go R es u m en Ej ec u t i v o 2 0 0 7

El IRB Barcelona, fundado oficialmente hace dos años, ha entrado por la puerta grande en el escenario científico, a escala local, nacional e internacional

científicas e implementado procedimientos administrativos como red de apoyo a la labor de investigación que se realiza en el Instituto. Ha sido un año de consolidación y crecimiento que nos ha permitido avanzar en el objetivo de consolidar el IRB Barcelona como uno de los centros de investigación biomédica más destacados del mundo. Una buena medida de nuestro progreso científico es la lista de publicaciones cuya autoría pertenece a científicos del IRB Barcelona, incluidas en la Memoria Científica y resumidas en la página 42 de este volumen, todas ellas logradas en el breve periodo de tiempo que llevan trabajando en nuestra institución. Hemos conseguido, asimismo, reclutar a talentos científicos para que pusieran en marcha sus grupos de investigación en el IRB Barcelona. Jens Lüders (hasta ahora en la Universidad de Stanford) entró a formar parte del Programa de Biología Celular y del Desarrollo y centrará su labor de investigación en los mecanismos moleculares de organización microtubular. Xavier Salvatella (actualmente en la Universidad de Cambridge) entrará a formar parte del Programa de Química y Farmacología Molecular y centrará su labor de investigación en la estructura y dinámica de biomacromoléculas y la relación de estas con las enfermedades. Ambos investigadores tomarán posesión de sus cargos durante el 2008. El Instituto también contrató en el 2007 a especialistas para gestionar las plataformas científicas de Genómica Funcional (Herbert Auer, de la Universidad de Ohio), de Expresión de Proteínas (Nick Berrow, anteriormente en la Universidad de Oxford) y de Ratones Transgénicos. También se iniciaron las actividades de la plataforma científica de Espectrometría de Masas bajo la dirección de Marta Vilaseca (hasta ahora en la Universidad de Barcelona). En septiembre, el IRB Barcelona y el Centro de Supercomputación de Barcelona (BSC) firmaron un acuerdo para poner en marcha un programa de investigación conjunto formado por un grupo de investigadores del Departamento de Ciencias de la Vida en el BSC y del Programa de Biología

10 R e su me n Ej e cu ti vo 2 0 0 7 Pró lo go

Estructural y Computacional del IRB Barcelona. El objetivo principal del programa es fortalecer la investigación desarrollada en biología computacional y favorecer la colaboración entre ambas instituciones. A través de esta iniciativa, los investigadores del IRB Barcelona tienen a su disposición los potentes recursos computacionales del BSC, y los investigadores del BSC, por su parte, tienen acceso a los laboratorios del IRB Barcelona. En noviembre del 2007 se celebró la primera reunión del Comité Científico Internacional, integrado por 15 destacados investigadores internacionales en biomedicina. La tarea principal del Comité es orientar al IRB Barcelona en el diseño de la estrategia científica y las actividades de investigación. La valoración del Comité sobre los avances logrados en investigación fue muy positiva y aportó una visión más amplia que ayudará a definir el futuro del IRB Barcelona. Aparte de la fuente de financiación principal que proviene de la Generalitat de Catalunya (a través del Departamento de Innovación, Universidades y Empresa y el Departamento de Salud), los investigadores del IRB Barcelona han conseguido incrementar con éxito los recursos de investigación gracias a la obtención de ayudas competitivas y de fuentes de financiación privadas. Los recursos se han obtenido tanto individualmente como a través de programas especiales como el Consolider y el CIBER, de los ministerios de Educación y Ciencia, y de Sanidad y Consumo, respectivamente, así como a partir de programas de investigación financiados por la Unión Europea. En la página 45 de este Resumen Ejecutivo se presenta una síntesis de nuestra participación en redes de investigación y la lista de ayudas concedidas. En la Memoria Científica se facilita información detallada al pie del apartado correspondiente a cada grupo de investigación. Los investigadores del IRB Barcelona también recibieron, durante el 2007, ayudas de entidades con fines filantrópicos destinadas a impulsar actividades de investigación. La Fundación Banco Bilbao Vizcaya Argentaria amplió y reforzó la

Pró lo go R es u m en Ej ec u t i v o 2 0 0 7 1 1

colaboración existente con el IRB Barcelona con una aportación económica para financiar actividades de investigación del Programa de Oncología y también como patrocinadora de las actividades Barcelona BioMed. Por su parte, la Fundación Marcelino Botín continuó respaldando a dos grupos de investigación de los programas de Medicina Molecular y de Biología Estructural y Computacional. El IRB Barcelona también fue uno de los cuatro institutos de investigación biomédica españoles escogidos por ’la Caixa’ que recibieron una dotación económica destinada a incorporar a jóvenes talentos en el programa de doctorado. La iniciativa se pondrá en marcha a principios del 2008 con el lanzamiento de la primera convocatoria de becas. La investigación en el IRB Barcelona Nuestros grupos de investigación se organizan en cinco programas que se centran en un área específica de trabajo y que incluyen temas y proyectos que fomentan la interacción entre programas. El Programa de Biología Celular y del Desarrollo estudia cómo se utiliza la información del genoma para crear estructuras dentro de la célula, para guiar la formación y regeneración de tejidos y para crear un organismo completo. El programa utiliza métodos de alto rendimiento para observar, durante estos procesos, la actividad global de los genes y de las proteínas en organismos sanos y enfermos. El Programa de Biología Estructural y Computacional parte del nivel molecular e incluye estudios sobre el análisis estructural de moléculas simples y sus interacciones. Los métodos principales que se utilizan provienen de la física y de la ciencia computacional: rayos X, RMN, microscopía electrónica, biofísica de macromoléculas, biocomputación y modelización molecular. El Programa de Química y Farmacología Molecular se especializa en el diseño y síntesis de moléculas pequeñas y macromoléculas que se pueden utilizar para investigar proteínas y otras moléculas biológicas. El programa hace énfasis especial en la química combinatoria. Un área específica de atención es la producción de bibliotecas de sustancias y la optimización de procesos para producirlas. Una segunda área de

12 R e s u me n Eje cu tivo 2 0 0 7 Pró lo go

interés es conocer cómo los fármacos afectan a las moléculas y cómo pueden modificarse para controlar mejor sus efectos. El Programa de Medicina Molecular integra estudios sobre las bases moleculares de las enfermedades metabólicas y genéticas, busca dianas diagnósticas y terapéuticas y estudia el comportamiento global del genoma y del proteoma durante las enfermedades. El Programa de Oncología incluye distintos aspectos sobre el inicio y la progresión de los tumores, la relación entre células madre y cáncer, así como la identificación de los mecanismos celulares que provocan la extensión y metástasis de tumores concretos en otras partes del cuerpo. Plataformas científicas Hace unos años, los laboratorios acostumbraban a centrar sus esfuerzos en estudiar las funciones de un número limitado de genes o moléculas en un único sistema modelo. Hoy en día, los proyectos relacionados con la medicina suelen englobar la observación de todo el genoma, con estudios que pasan rápidamente del ordenador al tubo de ensayo, a organismos modelo y a tejidos humanos. Ningún laboratorio por sí solo puede dominar todas las técnicas necesarias para dilucidar estas cuestiones. Por este motivo, hemos puesto en marcha distintas unidades de servicios con el fin de poner a disposición de nuestros investigadores unas instalaciones y unos equipamientos de última generación. Estas nuevas adiciones amplían el gran número de plataformas existentes gestionadas

Nuestros grupos de investigación se organizan en cinco programas que se centran en un área específica de trabajo y que incluyen temas y proyectos que fomentan la interacción entre programas

por el Parque Científico de Barcelona y por los Servicios Científicos y Técnicos de la Universidad de Barcelona. Un entorno para la innovación La mayoría de la investigación que se lleva a cabo en el IRB Barcelona se centra, sobre todo, en cuestiones científicas básicas que han sido, durante décadas, una fuente muy importante de innovación y de nuevas tecnologías. La probabilidad de lograr nuevos avances científicos es mayor en un entorno que fomente la innovación y que facilite a nuestros investigadores la transferencia de tecnología. En

Pró lo go R es u m en Ej ec u t i v o 2 0 0 7 1 3

este sentido, el IRB Barcelona goza de una ubicación privilegiada en el Parque Científico de Barcelona y trabaja en estrecha colaboración con el Centro de Innovación de la Fundación Bosch i Gimpera y la Agencia de Valorización y Comercialización de los Resultados de la Investigación (AVCRI) de la Universidad de Barcelona. Formación de futuros líderes: el programa de doctorado del IRB Barcelona El nivel de investigación y el número de actividades y plataformas del IRB Barcelona constituyen un entorno único en el que estudiantes de todo el mundo pueden realizar trabajos de investigación para la obtención de sus doctorados. Los estudiantes, que se benefician de estar bajo la tutela cercana de su mentor, pueden acceder a un amplio abanico de actividades, servicios y redes científicas. El programa que ofrecemos va más allá del laboratorio: a los estudiantes de doctorado en el IRB Barcelona se les brinda la oportunidad de conocer a investigadores de primera línea en sus respectivos campos a través de seminarios, conferencias y otras actividades organizadas distintos días a la semana, con el fin de mantenerlos al día de los últimos avances en biomedicina. Las reuniones de carácter social, denominadas cool-off sessions y que se celebran una vez al mes, también ofrecen a los estudiantes la oportunidad de relacionarse en un entorno más informal con el resto de doctorandos del Instituto. Además de ser el escenario ideal para iniciar vínculos de amistad entre los estudiantes, estas reuniones informales también ayudan a fomentar un espíritu de colaboración desde el comienzo de sus carreras científicas. Este año, la comunidad estudiantil ha empezado a planificar la puesta en marcha de un Consejo Estudiantil con el objetivo de coordinar actividades, incluida la celebración de un simposio que organizarán los mismos estudiantes. Barcelona BioMed La investigación actual se caracteriza por tener una vertiente plenamente internacional. Mantenernos

14 R e s u me n Eje cu tivo 2 0 0 7 Pró lo go

bien informados de los acontecimientos mundiales en todas las ciencias biomédicas e impulsar colaboraciones con otras instituciones internacionales son dos elementos clave para conseguir nuestros objetivos. Uno de los mecanismos que hemos puesto en marcha son las ‘Barcelona BioMed’, una serie de actividades científicas de divulgación que consisten en seminarios, conferencias, talleres y foros, todos ellos orientados a proporcionar una plataforma de intercambio de opiniones sobre temas relacionados con la biomedicina. Los Barcelona BioMed Seminars consisten en un ciclo de conferencias semanales a cargo de reconocidos científicos internacionales de distintas áreas de las ciencias biomédicas para presentar y poner en común los últimos resultados en sus áreas de investigación. A través de estos seminarios, los investigadores del IRB Barcelona y la comunidad científica local tienen la oportunidad de intercambiar información sobre los últimos avances en las ciencias de la vida y de establecer un contacto directo con el ponente de cada seminario. Las Barcelona BioMed Conferences son un ciclo de conferencias que se organizan en colaboración con la Fundación BBVA y tienen lugar en la sede del Institut d'Estudis Catalans, en el centro de Barcelona. Las conferencias constituyen una plataforma creativa donde investigadores de primera línea se reúnen para poner en común los últimos avances en una gran variedad de disciplinas. El singular enfoque de estas reuniones consiste en reunir a un grupo selecto de participantes con el fin de favorecer un entorno catalizador de ideas. Un total de veinte ponentes, elegidos entre los mejores investigadores del mundo en sus campos, se reúnen con un número reducido de participantes durante tres días de intenso debate sobre la

Pró lo go R es u m en Ej ec u t i v o 2 0 0 7 1 5

situación actual y el futuro de sus disciplinas. Entre los temas que se trataron en las Barcelona BioMed Conferences en el 2007 destacan la Regulación de las Funciones de la Cromatina (Marzo), Inflamación y Enfermedades Crónicas (Junio) y Células Madre y Cáncer (Octubre).

Con 27 grupos de investigación independientes, un gran contingente de plataformas científicas y tecnológicas, y cerca de 400 miembros, el IRB Barcelona ha consagrado rápidamente su presencia en el escenario de los institutos de investigación biomédica

Estamos convencidos de que los institutos que tengan en sus manos el potencial de cambiar a la sociedad deben debatir sus trabajos de investigación con el público general, ayudando así a la población a afrontar dichos cambios. Por este motivo, en el 2007 lanzamos los Barcelona BioMed Forums, eventos abiertos al público general que tienen como objetivo mejorar el nivel de concienciación de la población y fomentar una mayor comprensión de los avances logrados en las ciencias biomédicas y su impacto en la sociedad. El primer Barcelona BioMed Forum, titulado ‘Ciencia, Economía y Sociedad: Invertir en la Investigación en Oncología’ se celebró en abril y reunió a representantes de las ciencias, la economía y la sociedad, para debatir las medidas y estrategias necesarias para limitar el impacto social y económico del cáncer. Con 27 grupos de investigación independientes, un gran contingente de plataformas científicas y tecnológicas, y cerca de 400 miembros, el IRB Barcelona ha consagrado rápidamente su presencia en el escenario de los institutos de investigación biomédica. El IRB Barcelona continúa en plena fase de crecimiento y, lo más importante, dispone de mucho potencial para materializarlo. Con este fin, este próximo año tenemos previsto intensificar nuestros esfuerzos en la captación de talentos científicos internacionales de primera línea para que dirijan nuevos grupos de investigación y plataformas científicas, acoger iniciativas de nuestra comunidad de doctorandos para fortalecer las actividades y las oportunidades de las que disponen los estudiantes, y ampliar nuestras actividades de divulgación con el objetivo de acercar a la población general la investigación biomédica que se lleva a cabo en el IRB Barcelona. Joan J Guinovart Director

16 R e su me n Ej e cu ti vo 2 0 0 7 Pró lo go

Joan Massagué Director Adjunto

Resumen Científico • Programa de Biología Celular y del Desarrollo • Programa de Biología Estructural y Computacional • Programa de Medicina Molecular • Programa de Química y Farmacología Molecular • Programa de Oncología • Plataformas Científicas

Programa de Biología Celular y del Desarrollo

n una escala que abarca desde el tamaño de una molécula individual hasta el cuerpo humano, la célula se sitúa aproximadamente en el medio, siendo el vínculo entre los dos niveles. Al transformar la información que contiene su genoma en proteínas y en otras moléculas, una célula sabe cuándo dividirse, qué forma adoptar y cómo debe comportarse para crear un organismo completo. Es posible entender qué le ha pasado a un organismo sano o enfermo a partir de lo que ocurre en el interior de las células. El Programa de Biología Celular y del Desarrollo investiga la interrelación de estos niveles mediante un estudio más exhaustivo de la célula con el fin de averiguar cómo se forman las estructuras y su contribución en la construcción de un organismo. Hasta hace dos décadas, estas cuestiones se estudiaban en disciplinas muy distintas, si bien desde entonces se han ido acercando y han ido creciendo de manera conjunta. Los biólogos celulares están empezando a controlar los procesos que permiten a las células crear estructuras de mayor tamaño, a la vez que biólogos del desarrollo están centrando su interés en los mecanismos celulares que controlan el crecimiento de embriones. La unión de estas dos áreas requiere la implementación de abordajes experimentales multidisciplinarios que comprenden desde la biología molecular moderna, la genética clásica, la bioquímica y la microscopía avanzada hasta los más modernos métodos de tecnología punta de la genómica y la proteómica. Los grupos de investigación exploran cuestiones como la forma en la que se produce la comunicación de señales, tanto dentro como entre las células, qué controla la migración celular, cómo se forman las fronteras entre tejidos durante el desarrollo y cómo se controla el crecimiento de tejidos. También son materia de estudio la organización microtubular, la división celular en el desarrollo y la enfermedad, la regulación epigenética y la función de la cromatina, y la manipulación de la traducción genética para fines terapéuticos. Los modelos utilizados por los distintos grupos de investigación del programa incluyen levadura, Drosophila, ranas, ratones y parásitos humanos.

18 R e s u me n Eje cu tivo 2 0 0 7 Re sume n Cient ífico

Dentro del núcleo: estructura y función de la cromatina Ninguna célula produce ARN ni proteínas de todos sus genes todo el tiempo. Esto se debe, en parte, a que el ADN en el núcleo está envuelto en proteínas y otras moléculas por una forma denominada cromatina. Estas moléculas desempeñan un papel importante porque ayudan a empacar una cantidad inmensa de ADN en el pequeño espacio del núcleo; otra función de estas moléculas es conseguir que los genes sean accesibles (o inaccesibles) a las estructuras funcionales que los transforman en otros tipos de moléculas. El laboratorio de Ferran Azorín estudia los procesos moleculares que estructuran la cromatina para poder controlar sus efectos biológicos. El tema principal en el que están trabajando es averiguar cómo se desactivan los bloques grandes de ADN y lo que hace la célula para mantener estos bloques desactivados. Algunas regiones del ADN están silenciadas de manera casi permanente; otras se activan o desactivan para lograr determinados efectos en el desarrollo. Azorín y su equipo están estudiando ambos tipos de regiones.

Señales que organizan las células en las estructuras del cuerpo Para crear un organismo complejo es preciso que las células se especialicen, cambiando la manera en la que se dividen, su forma y su conducta, tal y como hacen, por ejemplo, cuando migran. Estos cambios morfogenéticos están coordi-

nados por indicadores del entorno, como por ejemplo, las moléculas secretadas por otras células. Estas indicaciones deben interpretarse correctamente dentro de la célula, lo cual significa que la información debe pasar a lo largo de una vía de moléculas de señalización. Una misma señal puede tener distintos efectos en momentos y sitios distintos del cuerpo. Muchas de estas vías de comunicación celular, que se han conservado a lo largo de la evolución, han facilitado que los estudios con organismos modelo como la mosca de la fruta puedan revelar información sobre la evolución en los humanos y otros animales. El laboratorio de Jordi Casanova centra su investigación en este proceso utilizando como modelos el desarrollo de la tráquea y la vía de señalización celular del receptor de Torso en la mosca de la fruta.

Las bases de la división celular Las células nuevas del organismo provienen de células progenitoras que se han dividido. La división celular requiere una sincronización perfecta de múltiples eventos, y la manera en que esta se produce depende del contexto: funciona de manera distinta en células embrionarias o en células madre que luego se especializan en células sanguíneas, en neuronas, o en cientos de otros tipos de células, o también dentro de un tumor de rápido crecimiento. El laboratorio de Cayetano González combina la genética, la biología molecular y la microscopía avanzada en vivo para estudiar la división celular. Los

Resume n Cient ífico R es u m en Ej ec u t i v o 2 0 0 7 1 9

sistemas modelo que utilizan estos investigadores incluyen la Drosophila y células cultivadas de vertebrados. Entre los proyectos actualmente en curso se encuentra el estudio del huso mitótico (un conjunto de fibras que tiran de los cromosomas para dividirlos en dos grupos), el estudio de proteínas de reciente descubrimiento que conforman estructuras denominadas centrosomas y la modelización del cáncer en la mosca de la fruta.

Formación de extremidades: señales, compartimentos y límites En el embrión, estructuras complejas como las extremidades comienzan a desarrollarse como grupos de células que son idénticas al principio, pero que rápidamente se subdividen en territorios más pequeños llamados compartimentos. El laboratorio de Marco Milán está aprovechando los resultados derivados de casi un siglo de estudios de genética realizados en la mosca de la fruta con el fin de estudiar las señales que guían el desarrollo de las extremidades en la Drosophila. En anteriores trabajos de investigación se ha demostrado que los compartimentos se desarrollan gracias a mecanismos que evitan que distintos tipos de células se mezclen, lo cual conduce a la formación de subterritorios y límites compartimentales entre los tejidos. Las células que se encuentran en dicho límite físico secretan las moléculas señalizadoras como Wg/Wnt y Dpp/TGF‚ que guían el patrón y el crecimiento de toda la extremidad. Milán y su equipo están interesados en entender cómo estas moléculas controlan procesos tan complejos como la generación de extremidades adultas con un tamaño concreto, forma y patrón fijo y particular de especie.

Traducción genética y enfermedades Para sobrevivir, las células tienen que transformar la información que contienen en el

genoma en ARN y, posteriormente, en proteínas. Este último paso, denominado traducción, requiere de un complejo entramado de otras moléculas que los científicos justo ahora empiezan a entender con mayor detalle. Muchas de las interacciones que se producen abarcan desde el proceso de fabricación de proteínas hasta otras vías reguladoras en las células. Los desequilibrios causados por alteraciones de estas interacciones se encuentran en el origen de distintas enfermedades y son utilizados por patógenos humanos durante procesos infecciosos. El laboratorio de Lluís Ribas de Pouplana está estudiando estas redes de interacción en células humanas y en protozoos que infectan a los seres humanos. El grupo también estudia la evolución de la maquinaria de traducción genética, que se ha visto sometida a cambios significativos en la evolución de células eucarióticas como la levadura, las plantas, y los animales. A través del estudio de las moléculas relacionadas con la traducción, Ribas y su grupo confían en obtener un mayor conocimiento sobre la evolución de estas células.

Construyendo y reconstruyendo el cerebro El desarrollo del cerebro incluye distintas etapas: la formación de las regiones, el desarrollo y especificación de distintos tipos de células nerviosas, el control de la migración celular, y la formación de redes de conexión para unir unas células con otras. Asimismo, tienen que responder adecuadamente a la estimulación para permitir la memoria y el aprendizaje. Para lograr estas fases, es necesario que las células activen genes específicos en el momento preciso, que interpreten correctamente las señales de las moléculas que se encuentran en la superficie de otras células (o que son secretadas por estas) y que respondan de forma adecuada. El laboratorio de Eduardo Soriano centra parte de su investigación en identificar nuevos genes que contribuyen a que se produzcan estos procesos. El grupo también está trabajando en el estudio de las diferencias entre las células cerebrales en las etapas embrionarias y durante los primeros años de vida —células que pueden desarrollarse y recuperarse— y las células cerebrales en adultos, que no pueden hacer ninguna de estas dos cosas. Un mayor conocimiento de los mecanismos que rigen el desarrollo temprano del cerebro podría ayudar a los científicos a diseñar nuevas terapias regenerativas orientadas a reparar lesiones cerebrales en adultos.

20 R e s u me n Eje cu tivo 2 0 0 7 Re sume n Cient ífico

Programa de Biología Estructural y Computacional

a física y la vida tienen su punto de encuentro en las moléculas individuales, cuyo comportamiento viene dictado por la forma y las propiedades químicas de estas. El ADN, el ARN, las proteínas y otras moléculas interactúan entre sí y se transforman mediante un complejo ritual que da como resultado la creación de organismos vivientes. Para tener un entendimiento detallado de la vida es necesario dilucidar la relación entre el comportamiento de estos componentes y sus estructuras. Esta perspectiva es igualmente crucial para la investigación de enfermedades genéticas, causadas a menudo por pequeños cambios estructurales en las moléculas. También es útil para mejorar los fármacos existentes y crear otros nuevos. Un fármaco consiste habitualmente en una pequeña molécula que funciona acoplándose a una proteína y alterando su comportamiento. Sin disponer de una imagen estructural de esta interacción, es imposible determinar con exactitud cómo funcionan estas moléculas.

El Programa de Biología Estructural y Computacional agrupa a un gran número de expertos que investigan estos aspectos de la vida. Los importantes avances en el campo de la cristalografía de rayos X y RMN logrados durante las últimas tres décadas, tecnologías accesibles a los investigadores del IRB Barcelona, han proporcionado imágenes estructurales muy precisas de muchas de las moléculas biológicas clave. Sin embargo, aún quedan muchas por explorar y, hasta ahora, ha resultado muy difícil examinar la estructura de las ‘maquinarias moleculares’ formadas por muchas moléculas. En muchos casos es posible obtener información estructural sobre nuevas proteínas y sus interacciones al comparar sus secuencias con las de otras moléculas conocidas. Esto requiere el uso de innovadoras herramientas computacionales, cuyo potencial ha crecido enormemente en los últimos años debido a la gran fuente de información que se ha generado con los proyectos de genómica.

Resume n Cient ífico R es u m en Ej ec u t i v o 2 0 0 7 2 1

Diagramas del interior de las máquinas Los numerosos proyectos de secuenciación genómica han proporcionado una lista casi completa de las moléculas que puede producir un organismo. Las técnicas postgenómicas están revelando, de manera gradual, qué componentes se utilizan para construir determinadas máquinas en la célula. Sin embargo, todavía falta obtener una visión detallada de la unión de estos componentes. El grupo de Patrick Aloy está diseñando nuevos métodos bioinformáticos para combinar la información procedente de los genomas (secuencias proteicas) con la lista de componentes de las maquinarias (obtenidas a través de espectrometría de masas y otras técnicas) e información sobre las interacciones de superficies o componentes de moléculas (procedentes de estudios de rayos X y de RMN) con diagramas de la construcción detallados de los complejos. Esta información se puede utilizar para indicar los puntos débiles de un complejo, que podrían servir de dianas para experimentos o para el diseño de nuevos fármacos.

Moléculas que se unen al ADN El grupo liderado por Miquel Coll utiliza distintas técnicas para estudiar el ADN cuando está unido a proteínas y a otras moléculas. Su método principal de estudio se basa en el uso de rayos X de alta

intensidad que permite estudiar moléculas en forma cristalizada. Uno de los temas centrales de la investigación es determinar la forma mediante la cual las proteínas se unen al ADN para controlar la actividad de los genes, lo que constituye un paso clave en la mayoría de procesos biológicos. Otra área de interés es el fenómeno denominado transferencia horizontal de genes, en el que determinadas células transportan ADN a otras células. Este proceso requiere complejos mecanismos para transportar el ADN a través de las membranas. Otros temas de interés científico incluyen el estudio de estructuras únicas de ADN y de nuevos fármacos que puedan acoplarse al ADN en lugar de acoplarse a proteínas.

Estrés oxidativo: proteínas de membranas Las proteínas, que desempeñan un papel fundamental en la mayoría de los procesos biológicos, casi nunca actúan solas. Normalmente una molécula se une a docenas de proteínas, a los ARN, o a otras moléculas para realizar una función determinada. Observar de manera detallada las estructuras internas de las proteínas y, en algunos casos, descubrir dónde actúan dentro de la célula, no es una tarea fácil. Con el fin de responder a estas cuestiones, el laboratorio de Ignasi Fita combina la cristalografía de rayos X y la crio-microscopía electróni-

22 R e s u me n Eje cu tivo 2 0 0 7 Re sume n Cient ífico

ca para estudiar la biología estructural del peroxisoma, uno de los orgánulos eucarióticos más pequeños delimitados por una membrana. El grupo está particularmente interesado en los complejos que intervienen en la aparición de enfermedades y en las proteínas que se unen a la membrana del orgánulo. Los investigadores colaboran en el estudio de complejos de proteínas eucarióticas y de virus ligados a proteínas receptoras necesarias para entrar en la célula. El trabajo de investigación también se centra en el estudio de diferentes tipos de enzimas, en concreto, las asociadas al estrés oxidativo.

La RMN y la determinación de estructuras La resonancia magnética nuclear (RMN) es una eficaz técnica utilizada para determinar estructuras tridimensionales a partir de la aplicación de campos magnéticos intensos a disoluciones de proteínas. Mediante el uso de secuencias de pulsos, la técnica permite obtener señales que se correlacionan con las distancias entre átomos con el fin de obtener familias de estructuras representativas. El laboratorio de Maria J Macias se ha especializado en la utilización de esta técnica para analizar las estructuras de las proteínas y sus mecanismos de plegamiento. Su grupo de investigación ha puesto en marcha un eficaz proceso de colaboración con otros laboratorios interesados en determinar estructuras de proteínas mediante la supervisión y transferencia de protocolos de obtención de proteínas puras en escala de miligramos. El laboratorio también presta apoyo a las asignaciones de RMN que se llevan a cabo y las supervisa, y ofrece protocolos modificados para la determinación de estructuras en solución.

Análisis de datos y modelado de interacciones Las interacciones entre proteínas y otras moléculas se producen con tanta rapidez y a una escala tan pequeña que no se pueden observar directamente. Para poder estudiarlas hay que recorrer a modelos que incorporen información de muchas fuentes. El grupo de Modesto Orozco está combinando distintos métodos —desde el análisis automático de bases de datos biológicas hasta la adaptación de cálculos matemáticos de dinámica clásica y química cuántica— para

desarrollar dichos modelos en el ordenador. El objetivo a largo plazo es conectar la escala más pequeña de la vida con el comportamiento de las células y con sistemas de mayor tamaño en los organismos.

De cómo las interacciones modifican las estructuras La RMN es especialmente útil para observar cambios que se producen muy rápidamente cuando las proteínas interactúan entre ellas, o bien con pequeñas moléculas, como por ejemplo un fármaco. El laboratorio de Miquel Pons está utilizando esta técnica para estudiar lo que sucede durante estas interacciones. Un caso particularmente intrigante es el de las proteínas desordenadas que ocultan su potencial de interacción en un caos estructural aparente. La complejidad de estas configuraciones puede abordarse mediante la modelización estadística en RMN y otras técnicas experimentales. En el desarrollo de medicamentos, la complejidad del mundo de las proteínas y sus interacciones se asimila en la gran variedad de estructuras químicas —conocidas como espacios químicos— que son equiparables al número aproximado de estrellas que hay en el universo. Pons y su grupo están desarrollando nuevas herramientas computacionales y de RMN cuyo objetivo es explorar el espacio químico en las moléculas pequeñas que tengan la capacidad de reestructurar complejos de proteínas con fines terapéuticos prometedores.

Resume n Cient ífico R es u m en Ej ec u t i v o 2 0 0 7 2 3

Programa de Medicina Molecular

as ciencias biomédicas se encuentran a las puertas de una nueva era en medicina que en un futuro nos conducirá a curar el cáncer, la diabetes, las enfermedades neurodegenerativas y un gran número de enfermedades que no se pueden combatir con vacunas u otros fármacos existentes. Los científicos, sin embargo, disponen de un arsenal de herramientas para estudiar el origen de las enfermedades y de nuevos métodos para intervenir en los procesos celulares. La meta para las próximas décadas es aprender a utilizar estas herramientas, que ya han revolucionado el diagnóstico médico, para poder manipular directamente las moléculas responsables de las enfermedades. El objetivo del Programa de Medicina Molecular es ampliar los conocimientos en estas áreas y encontrar nuevas vías para transformar los nuevos descubrimientos en aplicaciones biomédicas. El programa cuenta con un gran equipo de especialistas en bioquímica, biología celular y molecular, señalización y regulación celulares, genómica, genética e inmunología. La actividad que se desarrolla en el programa incluye el estudio de las bases moleculares de la diabetes, la obesidad, la inflamación, el síndrome metabólico y enfermedades raras, así como la investigación de nuevos tratamientos para estas patologías. Los grupos de investigación del Programa de Medicina Molecular también estudian las vías de señalización que controlan los procesos celulares, la biología de los macrófagos, los estudios genómicos de las enfermedades, las bases celulares de las aminoacidurias heredadas y las bases estructurales de la función transportadora de la membrana.

24 R e s u me n Eje cu tivo 2 0 0 7 Re sume n Cient ífico

Interpretar las señales El laboratorio de Carme Caelles estudia los principios que regulan la interacción entre las vías de señalización más importantes de la acción antiinflamatoria. Las señales pro-inflamatorias inician la respuesta inflamatoria a través de la activación de las proteínas denominadas JNK. En contraposición, moléculas con reconocida actividad antiinflamatoria como los glucocorticoides impiden la activación de JNK, siendo esta propiedad crucial en el mecanismo de acción farmacológica. Un segundo ámbito de interés del grupo es el estudio de las proteínas de señalización de la familia NIMA, implicadas en la regulación del ciclo de división celular.

Inflamación y macrófagos El grupo de Antonio Celada estudia los macrófagos, un tipo de célula cuya función es clave en los procesos inflamatorios. En una primera fase, los macrófagos eliminan los microorganismos (bacterias, parásitos, levaduras, etc.) que se encuentran en el foco inflamatorio y, en una segunda fase, ejercen una actividad antiinflamatoria y ayudan a reparar lesiones. Los macrófagos también desempeñan un papel clave en los procesos inflamatorios crónicos, como es el caso de la artritis reumatoide. Además, inducen la formación de vasos sanguíneos, favoreciendo el crecimiento de células cancerígenas. Por ello es muy importante

conocer el funcionamiento de estas células y saber potenciarlas cuando son beneficiosas o bloquearlas cuando son dañinas. Celada y su equipo de investigadores estudian la señalización inducida por las moléculas que producen la activación de los macrófagos y cómo se regulan los genes que activan las distintas funciones de estas células. El objetivo es encontrar dianas terapéuticas útiles para diseñar fármacos que alteren la actividad de estas células, ya sea para que se reproduzcan, se diferencien, se activen o se induzca su muerte y desaparición.

Ingeniería metabólica y terapia de la diabetes El exceso de glucosa se almacena en forma de glucógeno en el hígado y en los músculos, para volver a convertirse en glucosa en situaciones de alta demanda energética. Este proceso de síntesis y degradación del glucógeno está alterado en algunas patologías como la diabetes mellitus. La acumulación anormal de glucógeno en las neuronas también se ha detectado en otras patologías. El laboratorio de Joan J Guinovart trabaja para ampliar el conocimiento del metabolismo del glucógeno y aprender cuáles son los motivos por los que se altera en determinadas enfermedades. El grupo ha descubierto diferencias significativas en el procesamiento del glucógeno entre el músculo y el hígado a la hora de procesar el glucógeno, un hallazgo que puede ser relevante para ex-

Resume n Cient ífico R es u m en Ej ec u t i v o 2 0 0 7 2 5

davía se desconocen los genes causantes de los defectos. Durante los últimos 15 años, el grupo de Palacín ha identificado varios miembros de una nueva familia de proteínas de membrana celular llamadas HATS que actúan de transportadoras de algunos aminoácidos y que padecen alteraciones durante las aminoacidurias primaria heredadas. Actualmente, los científicos están analizando las estructuras de HAT para adquirir un mayor conocimiento en relación con la forma en que estas llevan a cabo sus funciones transportadoras.

plicar los defectos observados en la diabetes. El laboratorio también ha descubierto que las neuronas, a pesar de tener la capacidad de sintetizar glucógeno, lo mantienen bloqueado a través de tres mecanismos, uno de los cuales implica al complejo laforinamalina. La desaparición de este último mecanismo está asociada con la degeneración neuronal observada en la devastadora enfermedad de Lafora. El laboratorio, que continúa trabajando en la identificación de compuestos con propiedades antidiabéticas, ha demostrado que el wolframato sódico tiene propiedades antidiabéticas y antiobesidad. Dicho compuesto ha superado ya la primera fase de ensayos clínicos y actualmente se encuentra en la segunda fase.

Suministro y resuministro de aminoácidos en el cuerpo El cuerpo necesita una aportación constante de aminoácidos para construir proteínas. Las células son capaces de producir muchos tipos de aminoácidos a partir de estructuras más simples; no obstante, otros aminoácidos deben obtenerse a través de la comida. La obtención de estas moléculas significa absorberlas hacia el interior de la célula a través de la membrana celular. El laboratorio de Manuel Palacín está estudiando este sistema y la razón por la que se vuelve defectuoso en una serie de enfermedades denominadas aminoacidurias primarias heredadas (PIA). En estas enfermedades, el riñón, el intestino, y otros tejidos podrían dejar de absorber los aminoácidos. Distintos sistemas son responsables de diferentes tipos de aminoácidos; en algunos casos, to-

Resistencia a la insulina y nuevas estrategias para terapias contra la diabetes Nuestro estilo de vida cada vez más sedentario ha dado como resultado un aumento drástico de diabetes tipo 2 y de problemas asociados como la obesidad, la hipertensión, y otras alteraciones que aumentan la morbilidad y la mortalidad en la población. A la combinación de estos desórdenes y la resistencia a la insulina se le ha denominado síndrome metabólico, un síndrome que afecta a más del 40% de personas mayores de 60 años. Estudios recientes sugieren que algunos de estos problemas pueden tener su origen en mecanismos genéticos y celulares comunes. El laboratorio de Antonio Zorzano está intentando identificar los genes responsables del desarrollo de la resistencia a la insulina asociada a la obesidad o a la diabetes tipo 2. Estos investigadores están estudiando específicamente los genes relacionados con los procesos que tienen lugar en las estructuras celulares llamadas mitocondrias, en los procesos que controlan estos y otros genes, y en la identificación de nuevas señales posiblemente implicadas. Otros objetivos del grupo son entender cómo se transporta la glucosa a la célula y la identificación de nuevos compuestos que puedan ser efectivos en el tratamiento del síndrome metabólico.

26 R e s u me n Eje cu tivo 2 0 0 7 Re sume n Cient ífico

Programa de Química y Farmacología Molecular

a elaboración de nuevos fármacos implica diseñar nuevas moléculas o modificar moléculas ya existentes para lograr un efecto específico en las células y en los organismos. En el pasado, la ciencia farmacéutica se basaba en pruebas de ensayo y error para identificar sustancias que ayudasen a tratar los síntomas de una enfermedad y, posteriormente, mediante procesos químicos, aislarla y perfeccionarla. A menudo, estos procesos se realizaban con total desconocimiento de cómo funcionaban en realidad estas sustancias. Hoy en día, los científicos han descubierto cómo funcionan muchos fármacos. Habitualmente se enlazan a una proteína en particular o a un complejo molecular y modifican su estructura o química, afectando a la forma en la que estos fármacos interactúan con otras moléculas. Se utilizan un gran número de técnicas desarrolladas para estudiar y manipular dichas interacciones, así como para identificar nuevas dianas, es decir, nuevas proteínas que pueden desempeñar un papel clave en el desarrollo de una enfermedad, y cuya manipulación puede restablecer el funcionamiento correcto de la célula. El Programa de Química y Farmacología Molecular cuenta con amplios conocimientos técnicos y la experiencia necesaria para abordar este nuevo enfoque en el diseño de fármacos. El objetivo es identificar dianas, entender sus funciones y la naturaleza de sus interacciones con otras moléculas, así como construir o modificar las moléculas que pueden influir en este comportamiento. Los grupos del programa sintetizan una extensa variedad de compuestos bioactivos, con especial énfasis en los ácidos nucleicos, péptidos, proteínas, peptidomiméticos —moléculas que se parecen o imitan a los péptidos naturales— así como otros compuestos químicos. También utilizan métodos innovadores como la síntesis enantioselectiva, la síntesis de fase sólida de bibliotecas de compuestos bioactivos y las reacciones multicomponente. El objetivo es crear sustancias que sean útiles como medicamentos o como herramientas para investigar sistemas biológicos. La investigación se centra en estudiar la interacción entre las sustancias candidatas a medicamento y las dianas escogidas. Las principales técnicas utilizadas son la RMN, estudios computacionales y espectrometría de masas. Resume n Cient ífico R es u m en Ej ec u t i v o 2 0 0 7 2 7

Descubrir nuevos compuestos El laboratorio de Fernando Albericio centra su investigación en descubrir y sintetizar nuevos compuestos que puedan ser de utilidad como terapia contra desórdenes del sistema nervioso central y el cáncer. El equipo utiliza una aproximación integral tomando como base péptidos y pequeñas moléculas, que están siendo estudiados en colaboración con investigadores del ámbito industrial.

Fabricar ADN y ARN artificial El éxito en el desarrollo de la mayoría de proyectos científicos depende de la habilidad de los investigadores para crear pequeñas moléculas artificiales de ADN o ARN. El grupo de Ramón Eritja sintetiza estas moléculas a partir de sus subunidades, los nucleótidos. Los proyectos de investigación del grupo tratan desde la preparación de moléculas complejas de ADN y ARN, de posible uso terapéutico, hasta la utilización de estructuras de ADN para la fabricación de circuitos a nanoescala.

Diseñar y obtener fármacos El objetivo final de un diseño ‘racional’ de fármacos radica en poder estudiar la superficie de cualquier parte de una proteína con el fin de diseñar un ligando selectivo muy eficiente que modifique el comportamiento

de la proteína en la forma deseada. Esto es todavía algo intangible, aunque el grupo de Ernest Giralt está dedicando muchos esfuerzos para conseguirlo y para ampliar los conocimientos sobre los principios que regulan la manera en que las moléculas se reconocen y se enlazan entre sí. El laboratorio centra parte de su investigación en distintos temas de difícil resolución, como conseguir que las células absorban sustancias foráneas (fármacos), encontrar formas de romper agregados de proteínas que se forman en la enfermedad de Alzheimer y en otras enfermedades neurodegenerativas, y lograr que los fármacos atraviesen la barrera hematoencefálica. El grupo investiga cómo mejorar los métodos necesarios que permitan abordar estas cuestiones: obtención de información estructural con RMN, mejora de la síntesis de fase sólida de péptidos (una manera de diseñar proteínas artificiales que no requieren células para producir moléculas) y perfeccionamiento de algoritmos computacionales que faciliten el descubrimiento de nuevos fármacos.

Desarrollar métodos sintéticos para compuestos bioactivos El laboratorio de Antoni Riera está trabajando en el desarrollo de nuevos métodos sintéticos necesarios en distintas etapas del desarrollo de fármacos. El grupo se centra

28 R e s u me n Eje cu tivo 2 0 0 7 Re sume n Cient ífico

específicamente en la síntesis asimétrica. Este punto es de especial relevancia, ya que muchos de los procesos estándar para sintetizar pequeñas moléculas generan enantiómeros (versiones derecha o izquierda, es decir, moléculas que tienen las mismas propiedades pero que son imágenes espejo unas de otras). Las moléculas biológicas pueden reaccionar de forma muy diferente a los dos tipos de enantiómeros, resultando así esencial producir y purificar solamente la versión deseada. Asimismo, el equipo dedica sus esfuerzos a encontrar nuevas formas de crear mayores cantidades de compuestos que sean de interés terapéutico. Finalmente, el grupo está colaborando en la preparación de bibliotecas químicas que puedan utilizarse en el cribado biológico.

En busca de nuevas moléculas bioactivas El grupo de Màrius Rubiralta está trabajando en el desarrollo de tecnologías orientadas a la obtención de compuestos bioactivos clave en forma pura. Asimismo, el equipo está implementando procedimientos sintéticos conducentes a nuevos peptidomiméticos o a compuestos que contengan heterociclos, estructuras frecuentes en fármacos, y también a la separación de los enantiómeros de las moléculas obtenidas.

Resume n Cient ífico R es u m en Ej ec u t i v o 2 0 0 7 2 9

Programa de Oncología

l cáncer se origina cuando los procesos fundamentales que controlan la reproducción, la diferenciación y el comportamiento de las células comienzan a fallar. El Programa de Oncología tiene como objetivo mejorar el pronóstico, la prevención y el tratamiento del cáncer mediante el estudio de los principios básicos que rigen el desarrollo de dicha enfermedad.

El programa centra su trabajo en los distintos aspectos de la aparición y el desarrollo de los tumores, con especial énfasis en los mecanismos responsables de la adquisición de la malignidad, en la relación existente entre las células madres y el cáncer, y en la identificación de los factores que conducen a la metástasis en tejidos específicos. Los grupos de investigación del programa trabajan en la formación de fuertes vínculos con la parte clínica de la investigación del cáncer. Los acuerdos de colaboración con distintas unidades de oncología y de patología de hospitales en el área metropolitana de Barcelona facilitan la traducción de la investigación básica de este programa en nuevas herramientas diagnósticas y terapéuticas de interés para el ámbito clínico.

30 R e s u me n Eje cu tivo 2 0 0 7 Re sume n Cient ífico

Los estadios del cáncer colorrectal El cáncer colorrectal es una de las principales causas de muerte en todo el mundo. La mayoría de los tumores colorrectales se inician como lesiones benignas, si bien una pequeña proporción progresa hacia estadios malignos porque sus células han acumulado mutaciones en genes potenciadores del cáncer o en genes que normalmente suprimen el desarrollo de tumores. El paso final y el más letal en el progreso de la enfermedad es la migración de células de cáncer colorrectal hacia otros órganos, principalmente hacia el hígado, donde empiezan a desarrollar nuevos tumores. El laboratorio de Eduard Batlle se dedica a estudiar el inicio del cáncer colorrectal y su progresión desde los estadios tempranos hasta la formación de tumores agresivos. En sus estudios, el equipo desarrolla modelos celulares y animales que mimetizan la versión humana de esta devastadora enfermedad. El objetivo final es obtener información que permita diseñar nuevas herramientas diagnósticas y terapéuticas. El grupo de Elena Sancho centra su investigación en las vías de señalización celular en las distintas etapas del desarrollo del cáncer colorrectal. El desarrollo de un tumor maligno, que tiene lugar a lo largo de un periodo de varios años, parece seguir una serie de fases precisas: las mutaciones concretas en los genes relacionados con el cáncer se producen en un orden específico. El laboratorio tiene especial interés en estudiar los efectos de las mutaciones en las vías de señalización que afectan no sólo a las células cancerígenas sino también al microambiente del tumor. Una estrecha colaboración con investigadores clínicos ha per-

mitido que el grupo tenga acceso a muestras de cáncer colorrectal en distintos estadios de malignidad, permitiendo así analizar las poblaciones de células que comprenden los tumores en cada una de las fases de la enfermedad. El objetivo final es obtener información que permita diseñar nuevas herramientas terapéuticas y diagnósticas.

Laboratorio de Metástasis Tumoral (MetLab) Un complejo entramado de redes de señalización en el interior de las células controla su división, diferenciación, movimiento, organización y muerte. Las células cancerígenas desobedecen estas señales durante la progresión del tumor y la metástasis, que es la responsable del 90% de las muertes por cáncer. El interés principal del MetLab estriba en la identificación de grupos de genes y sus funciones, cuyo abuso por parte de células tumorales los convierte en instrumentos para la metástasis. Estas funciones rigen las etapas fundamentales de la fuga de células del tumor primario al torrente sanguíneo, la invasión de tejidos distantes por parte de estas células en circulación y, en consecuencia, el establecimiento de colonias microscópicas en estos tejidos. Mediante la activación o la anulación de estos genes en células metastásicas se valida su función. Recientemente se ha observado que algunos de los genes candidatos identificados en el laboratorio se encuentran afectados en muestras de tumores de pacientes. Mediante el conocimiento de la combinación de errores biológicos que facilitan la invasión de órganos vitales por parte de células metastásicas, se podrá atacar eficazmente la enfermedad mediante la combinación de fármacos contra las posibles dianas terapéuticas.

Resume n Cient ífico R es u m en Ej ec u t i v o 2 0 0 7 3 1

Plataformas Científicas

l IRB Barcelona dispone de un conjunto de Plataformas Científicas dedicadas a ayudar a los investigadores en su trabajo de investigación a través del apoyo técnico, acceso a tecnologías de última generación y servicios científicos. Se trata de unos recursos compartidos que tienen un papel clave en el impulso de la eficiencia investigadora y en la aceleración de los resultados experimentales.

Las Plataformas Científicas, equipadas con tecnologías punta y personal cualificado, ofrecen una amplia gama de servicios a los investigadores del IRB Barcelona, y permiten participan en proyectos de investigación y actividades llevadas a cabo por científicos del Instituto. Además de disponer de Plataformas Científicas propias, la investigación biomédica desarrollada en el IRB Barcelona también se beneficia de las plataformas y servicios del Parque Científico de Barcelona, así como de los servicios técnicos de la Universidad de Barcelona. Ubicadas en el Parque Científico de Barcelona, cerca de los laboratorios del IRB Barcelona, las Plataformas Científicas sirven de apoyo a la investigación biomédica a través de una amplia oferta de tecnologías y servicios en expresión de proteínas, espectrometría de masas de alta resolución, genómica funcional y modelos de enfermedad a partir de ratones. Los servicios ofrecidos a los investigadores del IRB Barcelona incluyen herramientas de investigación para analizar o alterar genes a escala genómica, actividades de expresión de proteínas de alto rendimiento para poder llevar a cabo en paralelo muchas variaciones de un experimento, producción de ratones modificados genéticamente destinados a la investigación, análisis de moléculas pequeñas y caracterización de proteínas. El número de Plataformas Científicas seguirá creciendo en el futuro con el fin de ampliar el abanico de servicios y ofrecer a la comunidad científica del IRB Barcelona una infraestructura sólida para la investigación.

32 R e s u me n Eje cu tivo 2 0 0 7 Re sume n Cient ífico

Estudiar el genoma en un único experimento Durante la última década, la biología molecular ha evolucionado desde el análisis entre genes hasta un acercamiento más exhaustivo para estudiar las redes reguladoras, que engloban desde docenas hasta centenares de parejas que interactúan entre sí. A fin de garantizar el éxito de la investigación en este campo, los investigadores necesitan un número creciente de herramientas que les permitan analizar o alterar genes en un ámbito genómico amplio. La Plataforma Científica de Genómica Funcional pone al alcance de la comunidad científica del IRB Barcelona herramientas genómicas de última generación. Estos recursos se clasifican en dos categorías: • Análisis de transcripción genómica, poliformismos de ADN e immunoprecipitación de la cromatina (chIP-chip). Estos tipos de análisis se desarrollan a partir de la tecnología de micromatrices, producida por Affymetrix. La plataforma ofrece, en todos los métodos analíticos, un servicio completo que incluye desde la consulta inicial durante el diseño del proyecto hasta el control de calidad de los materiales, el procesamiento de muestras, el análisis inicial durante el diseño del proyecto hasta el control de calidad de los materiales, el procesamiento de muestras, el análisis inicial de datos así como la interpretación y la validación de resultados a partir de PCR a tiempo real.

• Silenciamiento de la expresión génica con ARN. Para silenciar la expresión génica, la plataforma dispone de una biblioteca humana de ARN (Sigma) que cuenta con cerca de 75.000 clones que cubren la mayoría de transcripciones conocidas.

Nuevas dimensiones en espectrometría de masas La espectrometría de masas, que se ha convertido en una de las herramientas más importantes de las ciencias bioquímicas, tiene un amplio campo de aplicación que cubre desde el análisis molecular hasta la caracterización de proteínas. Gracias a su versatilidad, la espectrometría de masas es una tecnología a la que cada vez recurren más científicos. Se trata de una herramienta que puede ofrecer una posición de ventaja para interrogar ensamblajes no-covalentes dinámicos que no se pueden analizar por otras vías y abrir así nuevos caminos en la topología de entidades de masa elevada que se ven complicadas por interacciones débiles o efímeras. La Plataforma Científica de Espectrometría de Masas ofrece apoyo científico y técnico a los investigadores del IRB Barcelona para identificar y caracterizar una amplia variedad de especies biológicas que comprenden desde moléculas pequeñas a moléculas grandes, como, por ejemplo, las proteínas intactas. La plataforma también contribuye al estudio de la conformación, la biología estructural y las interacciones no-covalentes de estas biomoléculas y complejos.

Resume n Cient ífico R es u m en Ej ec u t i v o 2 0 0 7 3 3

Solucionar problemas con un alto rendimiento

Ratones modificados genéticamente como herramientas de investigación El ratón transgénico es uno de los modelos más interesantes de los que dispone la comunidad científica para la investigación de las enfermedades humanas. El objetivo de la Plataforma Científica de Ratones Transgénicos es poner esta tecnología al alcance de los investigadores del IRB Barcelona, ya sea a través de la obtención de ratones pregenerados, de células madre embrionarias modificadas genéticamente, de vectores diana obtenidos de recursos públicos o de la generación de nuevos modelos transgénicos. La plataforma se esfuerza en ofrecer un servicio completo que incluya desde el desarrollo y la producción de ratones modificados genéticamente hasta el diseño y la construcción de vectores diana de genes, así como la producción de células madre embrionarias de ratones mediante la inyección de ADN purificado o células embrionarias en embriones preimplantados. Un aspecto importante del trabajo realizado por esta plataforma es la adaptación y mejora de las tecnologías actuales al fin de aumentar la eficiencia de la producción y ofrecer modelos más complejos.

Tradicionalmente, los investigadores solían abordar los problemas con proteínas a partir de procesos repetitivos de pruebas y rediseños que a menudo eran costosos y requerían mucho tiempo. La Plataforma Científica de Expresión de Proteínas pone al alcance de los investigadores servicios de alto rendimiento que permiten ejecutar en paralelo y de manera simultánea muchas variaciones de un experimento (por ejemplo, truncamientos o mutaciones de las proteínas). Esta capacidad de ejecución de un gran número de variaciones experimentales —generalmente hasta 96— tiene el potencial de reducir de manera significativa el tiempo que se necesita para solucionar problemas con proteínas, un hecho que contribuye a acelerar tanto los resultados experimentales como su publicación. Los métodos de alto rendimiento, además del ahorro de tiempo que suponen, también son asequibles y pueden reducir significativamente el coste de los proyectos llevados a cabo en el laboratorio. La plataforma ha lanzado recientemente una convocatoria para proyectos dirigida a investigadores del IRB Barcelona para utilizar la clonación HTP y, en un futuro próximo, también ofrecerá servicios de cribado en células mamíferas y células de insectos o levadura, entre otros. La plataforma también prevé ofrecer un gran número de reactivos de calidad, como por ejemplo alícuotas de bacteriófagos resistentes, clonación y expresión de E. coli, medios especializados de expresión y reactivos de clonación.

34 R e s u me n Eje cu tivo 2 0 0 7 Re sume n Cient ífico

Datos IRB Barcelona • Patronato • Junta de Gobierno • Comité Científico Internacional • Fuentes de Financiación • Resumen de la Producción Científica • Tesis Doctorales • Actividades de Transferencia de Tecnología • Barcelona BioMed Seminars • Barcelona BioMed Conferences • Actividades de Divulgación • Organigrama • Personal de Dirección y Administración • Estadísticas de Recursos Humanos • Afiliaciones de los Investigadores • Parque Científico de Barcelona

Patronato El Patronato del IRB Barcelona, el máximo órgano de gobierno del Instituto, está formado por 11 miembros y esta presidido por el consejero de Innovación, Universidades y Empresa de la Generalitat de Catalunya. El Patronato es responsable de aprobar el presupuesto anual del Instituto y de supervisar el plan estratégico.

Presidente Josep Huguet Biosca Consejero del Departamento de Innovación, Universidades y Empresa, Generalitat de Catalunya

Vicepresidente primero Marina Geli Fàbrega Consejera del Departamento de Salud, Generalitat de Catalunya

Vicepresidente segundo Màrius Rubiralta Alcáñiz Rector de la Universidad de Barcelona

Miembros Ramon Moreno Amich Director general de Investigación del Departamento de Innovación, Universidades y Empresa, Generalitat de Catalunya (abril de 2007—actualidad) Francesc Xavier Hernández Cardona Director general de Investigación del Departamento de Innovación, Universidades y Empresa, Generalitat de Catalunya (octubre de 2005—julio de 2006; diciembre de 2006—abril de 2007) Joan Roca Acín Director del Consell Interdepartamental de Recerca i Innovació Tecnològica (CIRIT), Departamento de Innovación, Universidades y Empresa, Generalitat de Catalunya Marta Segura Bonet Secretaria general del Departamento de Salud, Generalitat de Catalunya José Jerónimo Navas Palacios Director del Programa de Centros de Investigación, Departamento de Salud, Generalitat de Catalunya Carme Verdaguer Montanyà Directora general de la Fundació Bosch i Gimpera, Universidad de Barcelona

36 R e s u me n Eje cu tivo 2 0 0 7 Pat ro nat o

Josep Samitier Martí Vicerrector de Innovación y Programas Internacionales de Investigación, Universidad de Barcelona (enero de 2007—actualidad) Isidre Ferrer Abidanza Vicerrector de Política Científica, Universidad de Barcelona (octubre de 2005—enero de 2007) Fernando Albericio Palomera Director general, Parque Científico de Barcelona Roser Artal Rocafort Directora gerente, Parque Científico de Barcelona (junio de 2007—actualidad) Maria Montserrat Vendrell Rius Subdirectora, Parque Científico de Barcelona (octubre de 2005—marzo de 2007)

Miembros del Patronato durante la última reunión bianual celebrada en el IRB Barcelona

Pat ro nat o R es u m en Ej ec u t i v o 2 0 0 7 3 7

Junta de Gobierno La Junta de Gobierno del IRB Barcelona es el órgano responsable de ejecutar e implementar las funciones delegadas por el Patronato. La Junta también realiza el seguimiento periódico de las actividades administrativas y directivas del Instituto.

Presidente José Jerónimo Navas Palacios Director del Programa de Centros de Investigación, Departamento de Salud, Generalitat de Catalunya

Miembros Ramon Moreno Amich Director General de Investigación del Departamento de Innovación, Universidades y Empresa, Generalitat de Catalunya Josep Samitier Martí Vicerrector de Innovación y Programas Internacionales de Investigación, Universidad de Barcelona Isidre Ferrer Abidanza Vicerrector de Política Científica, Universidad de Barcelona (octubre de 2005—enero de 2007)

Otros participantes Fernando Albericio Palomera Director general, Parque Científico de Barcelona Joan J Guinovart Cirera Director, IRB Barcelona Margarida Corominas Bosch Directora de Gestión, IRB Barcelona

38 R e s u me n Eje cu tivo 2 0 0 7 Junt a de Go bierno

Comité Científico Internacional El Comité Científico Internacional del IRB Barcelona está formado por un grupo de 15 destacados científicos internacionales en el campo de la biomedicina. El Comité, que ofrece asesoramiento y orientación en los programas de investigación y actividades del Instituto, juega un papel clave en el diseño de la estrategia científica.

Miembros Hans Clevers The Netherlands Institute of Developmental Biology, Países Bajos Michael Czech Program in Molecular Medicine, University of Massachusetts Medical School, EEUU Christopher M Dobson Department of Chemistry and Physics, University of Cambridge, Reino Unido José Elguero Consejo Superior de Investigaciones Científicas (CSIC), España Samuel H Gellman Faculty of Chemistry, University of Wisconsin, EEUU David M Glover Department of Genetics, University of Cambridge, Reino Unido Jan-Ake Gustafsson Center for Biotechnology, Karolinska Institute, Suecia Andrew Hamilton Department of Chemistry, Yale University, EEUU Robert Huber Max Planck Institute of Biochemistry, Alemania Tim Hunt Cancer Research UK, Reino Unido Fotis Kafatos Imperial College London, Reino Unido Bernd Meyer Institute for Organic Chemistry, University of Hamburg, Alemania Charles J Sherr Department of Genetics and Tumour Cell Biology, St Jude Children’s Research Hospital, EEUU

Co mit é Cient ífico Int ernacio nal R es u m en Ej ec u t i v o 2 0 0 7 3 9

Bruce Spiegelman Department of Cell Biology, Harvard Medical School, EEUU Karen Vousden Beatson Institute for Cancer Research, Reino Unido

40 R e s u me n Eje cu tivo 2 0 0 7 Co mit ĂŠ Cient Ăfico Int ernac ional

Fuentes de Financiación Durante el 2007, el IRB Barcelona recibió la mayoría de su financiación para actividades de investigación de la Generalitat de Catalunya, a través del Departamento de Innovación, Universidades y Empresa y del Departamento de Salud. El Instituto recibió financiación adicional del Ministerio de Educación y Ciencia (a través del programa Ayudas a Parques Científicos y Tecnológicos), del Ministerio de Sanidad y Consumo (para prestar apoyo al MetLab y al Programa de Oncología) y de la Unión Europea, a través de los fondos FEDER. Los investigadores del IRB Barcelona también recibieron financiación procedente de proyectos competitivos otorgados por agencias públicas y privadas. La Universidad de Barcelona, la Institució Catalana de Recerca i Estudis Avançats (ICREA), el Consejo Superior de Investigaciones Científicas (CSIC) y distintas redes CIBER (CIBERDEM, CIBERNED, CIBERER y CIBERBBN) también contribuyeron a la financiación a través de la incorporación al IRB Barcelona de investigadores contratados por estas instituciones.

Financiación Principal

Otras Fuentes de Financiación

Fuent e s de Financiació n R es u m en Ej ec u t i v o 2 0 0 7

Resumen de la Producción Científica Publicaciones Científicas Los investigadores del IRB Barcelona publicaron en el 2007 un total de 177 artículos científicos en publicaciones especializadas en biomedicina, 70 de los cuales fueron fruto de colaboraciones internacionales con investigadores académicos y de la industria. La lista que sigue es una selección de publicaciones aparecidas en revistas con un factor de impacto superior a 7 (ISI 2006).

Aloy P. Shaping the future of interactome networks. Genome Biol, 8(10), 316 (2007) Astigarraga S, Grossman R, Díaz-Delfín J, Caelles C, Paroush Z and Jiménez G. A MAPK docking site is critical for downregulation of Capicua by Torso and EGFR RTK signalling. EMBO J, 26(3), 668-77 (2007) Blobel J, Schmidl S, Vidal D, Nisius L, Bernadó P, Millet O, Brunner E and Pons M. Protein tyrosine phosphatase oligomerization studied by a combination of 15N NMR relaxation and 129Xe NMR. Effect of buffer containing arginine and glutamic acid. J Am Chem Soc, 129(18), 5946-53 (2007) Cantó C, Pich S, Paz JC, Sanches R, Martínez V, Orpinell M, Palacín M, Zorzano A and Gumà A. Neuregulins increase mitochondrial oxidative capacity and insulin sensitivity in skeletal muscle cells. Diabetes, 56(9), 2185-93 (2007) Casacuberta E, Azorín F and Pardue ML. Intracellular targeting of telomeric retrotransposon Gag proteins of distantly related Drosophila species. Proc Natl Acad Sci USA, 104(20), 8391-96 (2007) Cortina C, Palomo-Ponce S, Iglesias M, Fernández-Masip JL, Vivancos A, Whissell G, Humà M, Peiró N, Gallego L, Jonkheer S, Davy A, Lloreta J, Sancho E and Batlle E. EphB-ephrin-B interactions suppress colorectal cancer progression by compartmentalizing tumour cells. Nat Genet, 39(11), 1376-83 (2007) Furriols M, Ventura G and Casanova J. Two distinct but convergent groups of cells trigger Torso receptor tyrosine kinase activation by independently expressing torso-like. Proc Natl Acad Sci USA, 104(28), 11660-65 (2007) Gallego O, Ruiz FX, Ardèvol A, Domínguez M, Alvarez R, de Lera AR, Rovira C, Farrés J, Fita I and Parés X. Structural basis for the high all-trans-retinaldehyde reductase activity of the tumour marker AKR1B10. Proc Natl Acad Sci USA, 104(52), 20764-69 (2007) García-Vicente S, Yraola F, Marti L, González-Muñoz E, García-Barrado MJ, Cantó C, Abella A, Bour S, Artuch R, Sierra C, Brandi N, Carpéné C, Moratinos J, Camps M, Palacín M, Testar X, Gumà A, Albericio F, Royo M, Mian A and Zorzano A. Oral insulin-mimetic compounds that act independently of insulin. Diabetes, 56(2), 486-93 (2007) González C. Spindle orientation, asymmetric division and tumour suppression in Drosophila stem cells. Nat Rev Genet, 8(6), 462-72 (2007) Llácer JL, Contreras A, Forchhammer K, Marco-Marín C, Gil-Ortiz F, Maldonado R, Fita I and Rubio V. The crystal structure of the complex of PII and acetylglutamate kinase reveals how PII controls the storage of nitrogen as arginine. Proc Natl Acad Sci USA, 104(45), 1764449 (2007)

42 R e s u me n Eje cu tivo 2 0 0 7 Re sume n de la Pro ducción C ientíf ic a

Lledó A, Benet-Buchholz J, Solé A, Olivella S, Verdaguer X and Riera A A. Photochemical rearrangements of norbornadiene Pauson-Khand cycloadducts. Angew Chem Int Ed Engl, 46(31), 5943-46 (2007) Masdeu C, Gómez E, Williams NA and Lavilla R. Double insertion of isocyanides into dihydropyridines: direct access to substituted benzimidazolium salts. Angew Chem Int Ed Engl, 46(17), 3043-46 (2007) Milán M. Sculpting a fly leg: BMP boundaries and cell death. Nat Cell Biol, 9(1), 17-8 (2007) Pascual M, Abasolo I, Mingorance-Le Meur A, Martínez A, Del Rio JA, Wright CV, Real FX and Soriano E. Cerebellar GABAergic progenitors adopt an external granule cell-like phenotype in the absence of Ptf1a transcription factor expression. Proc Natl Acad Sci USA, 104(12), 5193-98 (2007) Pastor JJ, Granados G, Carulla N, Rabanal F and Giralt E. Redesign of protein domains using one-bead-one-compound combinatorial chemistry. J Am Chem Soc, 129(48), 14922-32 (2007) Perdiguero E, Ruiz-Bonilla V, Gresh L, Hui L, Ballestar E, Sousa-Victor P, Baeza-Raja B, Jardí M, Bosch-Comas A, Esteller M, Caelles C, Serrano AL, Wagner EF and Muñoz-Cánoves P. Genetic analysis of p38 MAP kinases in myogenesis: fundamental role of p38alpha in abrogating myoblast proliferation. EMBO J, 26(5), 1245-56 (2007) Pérez A, Luque FJ and Orozco M. Dynamics of B-DNA on the microsecond time scale. J Am Chem Soc, 129(47), 14739-45 (2007) Rebollo E, Sampaio P, Januschke J, Llamazares S, Varmark H and González C. Functionally unequal centrosomes drive spindle orientation in asymmetrically dividing Drosophila neural stem cells. Dev Cell, 12(3), 467-74 (2007) Rueda M, Ferrer-Costa C, Meyer T, Pérez A, Camps J, Hospital A, Gelpí JL and Orozco M. A consensus view of protein dynamics. Proc Natl Acad Sci USA, 104(3), 796-801 (2007) Scheike JA, Baldauf C, Spengler J, Albericio F, Pisabarro MT and Koksch B. Amide-to-ester substitution in coiled coils: the effect of removing hydrogen bonds on protein structure. Angew Chem Int Ed Engl, 46(41), 7766-69 (2007) Solà J, Revés M, Riera A and Verdaguer X. N-phosphino sulfinamide ligands: an efficient manner to combine sulfur chirality and phosphorus coordination behavior. Angew Chem Int Ed Engl, 46(26), 5020-23 (2007) Teixidó M, Zurita E, Malakoutikhah M, Tarragó T and Giralt E. Diketopiperazines as a tool for the study of transport across the blood-brain barrier (BBB) and their potential use as BBB-shuttles. J Am Chem Soc, 129(38), 11802-13 (2007) Tulla-Puche J, Bayó-Puxan N, Moreno JA, Francesch AM, Cuevas C, Alvarez M and Albericio F. Solid-phase synthesis of oxathiocoraline by a key intermolecular disulfide dimer. J Am Chem Soc, 129(17), 5322-23 (2007) Varmark H, Llamazares S, Rebollo E, Lange B, Reina J, Schwarz H and González C. Asterless is a centriolar protein required for centrosome function and embryo development in Drosophila. Curr Biol, 17(20), 1735-45 (2007) Vilchez D, Ros S, Cifuentes D, Pujadas L, Vallès J, García-Fojeda B, Criado-García O, Fernández-Sánchez E, Medraño-Fernández I, Domínguez J, García-Rocha M, Soriano E, Rodríguez de Córdoba S and Guinovart JJ. Mechanism suppressing glycogen synthesis in neurons and its demise in progressive myoclonus epilepsy. Nat Neurosci, 10(11), 1407-13 (2007)

Re s u men de la Pro ducció n Cient ífica R es u m en Ej ec u t i v o 2 0 0 7 4 3

Colaboraciones Científicas Los investigadores del IRB Barcelona participaron durante el 2007 en un total de 128 colaboraciones nacionales e internacionales con centros de investigación, instituciones, universidades, laboratorios, hospitales y compañías del sector biomédico. A la cifra se suman 19 colaboraciones internas adicionales, que se llevaron a cabo entre investigadores de dos o más grupos del IRB Barcelona.

Tipos de Colaboraciones

Colaboraciones Externas (Nacionales) 53%

Colaboraciones Internas 13%

Colaboraciones Externas (Internacionales) 34%

Colaboraciones Externas por Sector Parques Científicos, Centros de Investigación e Instituciones 16%

Laboratorios 5%

Hospitales 8% Universidades 37%

Compañías 16%

Institutos de Investigación 18%

44 R e s u me n Eje cu tivo 2 0 0 7 Re sume n de la Pro ducción C ientíf ic a

Proyectos y Redes de Investigación Durante el 2007, los investigadores del IRB Barcelona participaron en un total de 137 proyectos y redes de investigación con socios nacionales e internacionales. Las actividades se financiaron a través de la Generalitat de Catalunya, el Ministerio de Educación y Ciencia, el Ministerio de Sanidad y Consumo, la Comisión Europea, así como fundaciones, instituciones y compañías.

Fuentes de Financiación Generalitat de Catalunya 12% Fundaciones, Instituciones y Compañías 20% Comisión Europea 12%

Gobierno Español 56%

Áreas de Investigación Biología Celular y del Desarrollo 29%

Biología Estructural y Computacional 21%

Oncología 5%

Medicina Molecular 22%

Química y Farmacología Molecular 23%

Re s u men de la Pro ducció n Cient ífica R es u m en Ej ec u t i v o 2 0 0 7 4 5

La siguiente lista detalla el origen de la financiación obtenida por los investigadores del IRB Barcelona a través de proyectos de investigación durante el 2007.

Proyectos de Investigación 2007

Cantidad otorgada (euros)

Ministerio de Educación y Ciencia

4.364.439

Comisión Europea

1.087.378

Instituto de Salud Carlos III

436.195

Fundación Banco Bilbao Vizcaya Argentaria

300.000

Fundació La Marató de TV3

295.623

Fundación Marcelino Botín

275.000

Agència de Gestió d'Ajuts Universitaris i de Recerca

192.391

Fundació ”la Caixa”

187.959

Fundación Caja Navarra

111.678

European Science Foundation

47.914

Esteve

35.838

Agencia Española de Cooperación Internacional

35.500

Oncostem Pharma

31.866

Novo Nordisk Pharma

27.600

Fundación para la Investigación y la Prevención del Sida en España

23.453

Mutua Madrileña

20.500

Almirall

19.262

Ferrer

19.262

European Molecular Biology Organization

18.750

Sylentis, Pharmamar

Total

9.430

7.540.038

Asimismo, el IRB Barcelona también recibió financiación a través de becas de personal concedidas a estudiantes (con Agaur, MEC e ISCIII) y a investigadores postdoctorales y asociados (con programas como Juan de la Cierva, Ramón y Cajal, I3 y Beatriu de Pinós).

46 R e s u me n Eje cu tivo 2 0 0 7 Re sume n de la Pro ducción C ientíf ic a

Tesis Doctorales El IRB Barcelona acoge a una comunidad estudiantil integrada por más de 150 estudiantes de doctorado de todo el mundo que actualmente trabajan en proyectos de investigación en laboratorios del Instituto. Durante su estancia doctoral, los estudiantes reciben orientación y asesoramiento científico y tienen acceso a una amplia oferta de actividades de investigación y servicios orientados a asegurar el éxito en su futuro profesional. En el transcurso del 2007, los estudiantes de doctorado defendieron un total de 21 tesis, una vez finalizado el proyecto de investigación en uno de los grupos del IRB Barcelona.

Anàlisi del complex bitòrax de Drosophila melanogaster i contribució de les proteïnes dSAP18 i GAGA a la seva regulació Silvia Pérez Lluch Universidad de Barcelona (2007) Directora: Lluïsa Espinas Aplicación de poliaminoácidos en la administración de péptidos y proteínas de interés terapéutico Oscar Peña Universidad de Barcelona (2007) Director: Ernest Giralt Caracterización del transportador SteT: primer modelo procariota de la familia LAT César del Rio Merino Universidad de Barcelona (2007) Director: Manuel Palacín Cid, la variant centromèrica de la histona H3 de Drosophila: mecanismes de deposició i anàlisis funcional Olga Moreno Moreno Universidad Autónoma de Barcelona (2007) Director: Ferran Azorín Disseny, síntesi i avaluació d’inhibidors de dimerització de la proteasa del VIH-1 Eulàlia Pinyol i Ollé Universidad de Barcelona (2007) Directora: Anna Diez DNA-gyrase A model peptides as potential probes to evaluate the antibacterial activity of quinolones: design, synthesis and interaction studies Mireia G Piqueras Universidad de Barcelona (2007) Director: Ernest Giralt Estudio de dos vías de modulación del receptor TRPV1 implicadas en dolor inflamatorio Martina Quintanar Universidad de Barcelona (2007) Directores: Fernando Albericio, Antonio Ferrer Montiel

Tesis D o ct o rales R es u m en Ej ec u t i v o 2 0 0 7 4 7

Funcionalització de N- i O-heterocicles. Interacció d’isonitrils amb azines, sals d’azines, dihidroazines i èters d’enol cíclics Carme Masdeu Universidad de Barcelona (2007) Director: Rodolfo Lavilla Functional study of the DOR gene Jordi Duran i Castells Universidad de Barcelona (2007) Director: Antonio Zorzano Implicación de JNK en el mecanismo de acción antidiabética de las TZDs/PPARα Julieta Díaz Delfín Universidad de Barcelona (2007) Directora: Carme Caelles Ligandos duales, una nueva estrategia para el desarrollo de agentes terapéuticos que interaccionen con GPCRs Marc Vendrell Universidad de Barcelona (2007) Director: Fernando Albericio; codirectora: Miriam Royo NMR as a tool to elucidate the rules that govern WW domain binding specificity and stability Ximena Ramirez-Espain Universidad Autónoma de Madrid (2007) Directora: Maria Macias Noves aproximacions sintètiques per a la química paral.lelitzable Aina Colombo Universidad de Barcelona (2007) Directores: Fernando Albericio, Pilar Forns Papel de la antiadhesina renal podocalixina en el desarrollo del sistema nervioso Nathalia Vitureira Serpa Universidad de Barcelona (2007) Director: Eduardo Soriano Papel de la MKP-1/Dusp-1 en la acción antiinflamatoria de los glucocorticoides en ratón Salvador Ferré Benedicto Universidad de Barcelona (2007) Directora: Carme Caelles Physiology and pharmacology of the soluble form and the membrane of the SSAO/VAP-1 membrane Silvia García Vicente Universidad de Barcelona (2007) Director: Antonio Zorzano Preparació de derivats de polisacàrids i la seva aplicabilitat com a selectors quirals en la separació d’enantiòmers per cromatografia de repartiment centrífug (CPC) Eva Pérez Palomar Universidad de Barcelona (2007) Directora: Cristina Minguillón Regulación de la proliferación de los progenitores neurales en el telencéfalo adulto: efecto de las aferencias neuronales sobre la proliferación en el hipocampo y funciones de la proteína priónica celular Xavier Fontana García Universidad de Barcelona (2007) Director: José A del Río

48 R e s u me n Eje cu tivo 2 0 0 7 Tesis D o ct o rales

Regulation of the IA-β and MKP-1genes by the AP1 complex Cristina Casals Casas Universidad de Barcelona (2007) Director: Antonio Celada Síntesi de nous catalitzadors per a reaccions d’organocatàlisi Noemí García-Delgado Universidad de Barcelona (2007) Director: Xavier Verdaguer Síntesi de substrats i inhibidors de la SSAO/VAP-1 Francesc Yraola Universidad de Barcelona (2007) Director: Fernando Albericio; codirectora: Miriam Royo

Tesis D o ct o rales R es u m en Ej ec u t i v o 2 0 0 7 4 9

Actividades de Transferencia de Tecnología Los investigadores del IRB Barcelona participaron en el 2007 en una serie de actividades de transferencia de tecnología con socios de la industria. A continuación se detallan los trabajos científicos que resultaron en patentes otorgadas y solicitudes de patentes para garantizar los derechos exclusivos de descubrimientos e invenciones. Por otra parte, la empresa Omnia Molecular, fundada en el año 2005 por el investigador del IRB Barcelona Lluís Ribas de Pouplana, obtuvo dos patentes y concluyó la primera ronda de inversión con la incorporación de la entidad de capital riesgo Caixa Capital Risc.

Anti tumoural compounds Tulla-Puche J, Marcucci E, Bayó-Puxan N and Albericio F Solicitud de patente provisional de PharmaMar identificada como ‘Attorney Docket No. 07380361’ Arylalkylamine vanadium (v) salts for the treatment and/or prevention of diabetes mellitus Royo Exposito M, Marti Clauzel L, Abella Martin A, Garcia Vicente S, Testar Yinbert X, Zorzano Olarte A, Palacin Prieto M, Albericio Palomera F, Yraola Font F and Mian A Info publicación: US 2007066682 A1 20070322 CAN 146:309354 AN 2007:333004 Compounds that act as a vehicle for delivery through the blood-brain barrier and charge delivery vehicle constructions Giralt E and Teixidó M Info publicación: PCT/ES2007/0401, WO2008025867 Indole derivatives as antitumoural compounds Reyes Benitez JF, Francesch Solloso A, Cuevas Marchante C, Altuna Urquijo M, Pla Queral D, Alvarez Domingo M and Albericio Palomera F Info publicación: WO2007054748 A120070518 CAN146:528181 AN2007:538679 Inhibition of alpha-synuclein aggregation Zurdo J, Fowler S, Stallwood Y, Giralt E, Teixidó M and Carulla N Info publicación: PCT/GB2007/002469, WO2008003943 Método de identificación de compuestos para terapia de enfermedades relacionadas con la acumulación de glucógeno y uso de compuestos para preparar medicamentos contra dichas enfermedades Rodriguez de Cordoba S and Guinovart J (solicitada) New polymers and their use as fluorescent labels Aymamí J, Albericio F, Aviñó A, Farrera J, Royo M, Navarro I and Eritja R Info publicación: 07112386.3-2101 Pharmaceutical compositions comprising a tungsten salt (VI) for the treatment of neurodeeneroative disorders, particularly Alzheimer's disease and schizophrenia Gomez A, Corominola H, Zafra D, Gomis de Barbara R, Avila de Grado J, Dominguez J and Guinovart J Info publicación: WO2007014970, CA2616960 Proton acceptor immonium-type coupling reagents Albericio F, El-Faham A, Luxembourg Y and Ewenson A Solicitud de patente provisional en EEUU, identificada como ‘Attorney Docket No. 39712’

50 R e s u me n Eje cu tivo 2 0 0 7 Actividades de Transferencia de Tecnología

Barcelona BioMed Seminars El IRB Barcelona organizó durante el 2007 un ciclo de seminarios semanales con el fin de mantener a los investigadores al día sobre los últimos avances científicos en el campo de la biomedicina. Los Barcelona BioMed Seminars reunieron a docenas de expertos internacionales líderes en distintas áreas para presentar su investigación y los últimos resultados a la comunidad científica del IRB Barcelona. Organizados por investigadores del Instituto, los seminarios también estaban dirigidos a la comunidad científica local.

17 de enero de 2007 Transcription regulation: from parts list to genomic network Nicholas Luscombe, European Bioinformatics Institute, Wellcome Trust Genome Campus, Cambridge, Reino Unido 26 de enero de 2007 Development of new adenovirus vectors with specific tropism for the intestinal epithelium Miguel Chillón, Gene Therapy Laboratory, Centre de Biotecnologia Animal i Teràpia Genètica, Universidad Autónoma de Barcelona, Barcelona, España 2 de febrero de 2007 Mitochondrial membrane dynamics in human cells: actors, mechanisms and (dys)functions Manuel Rojo, Inserm, Institut de Myologie, París, Francia 6 de febrero de 2007 Transcriptional mechanisms underlying mammalian differential gene expression Bart Deplancke, University of Massachussets Medical School, Massachussets, EEUU 9 de febrero de 2007 Nuclear PTEN: a tale of many tails Rafael Pulido, Centro de Investigación Príncipe Felipe, Valencia, España 16 de febrero de 2007 Sharp boundaries of Dpp signalling trigger local cell death required for Drosophila leg morphogenesis Magali Suzanne, Centre de Biochimie, Université Nice Sophia Antipolis, Niza, Francia 19 de febrero de 2007 Phenotypic driven mammalian functional genomics: Applications to cancer and stem cell biology Frank Buchholz, Max Planck Institute for Molecular Cell Biology and Genetics, Munic, Alemania 20 de febrero de 2007 The ubiquitin-proteasome system: novel levels of regulation and biomedical applications Bernat Crosas, Institut de Biologia Molecular de Barcelona, CSIC, Barcelona, España 21 de febrero de 2007 Regulation of Rho signalling in tumour cell movement Emmanuel Vial, Institute of Signalling Developmental Biology and Cancer, Niza, Francia

B arcelo na B io M ed S e minars R es u m en Ej ec u t i v o 2 0 0 7 5 1

23 de febrero de 2007 Regulatory networks determining T cell versus macrophage/dendritic cell commitment Thomas Graf, Centro de Regulación Genómica, Barcelona, España 02 de marzo de 2007 Xenopus oocytes, MAP kinases and cancer Angel Nebreda, Centro Nacional de Investigaciones Oncológicas, Madrid, España 09 de marzo de 2007 A supramolecular approach to the molecular recognition of protein surfaces Javier de Mendoza, Institut Català d'Investigació Química, Tarragona, España 16 de marzo de 2007 Hedgehog-Gli signalling in stem cells, cancer and cancer stem cells Ariel Ruiz Altaba, University of Geneva Medical School, Ginebra, Suiza 23 de marzo de 2007 Finding new roles for p38MAPKs Ana Cuenda, Centro Nacional de Biotecnología, Madrid, España 30 de marzo de 2007 Glyoxylyl peptide chemistry and novel methods for the preparation of peptide microarrays Oleg Melnyk, Institut de Biologie de Lille, Lilla, Francia 13 de abril de 2007 Genetic analysis of cell cycle kinases using mouse models Marcos Malumbres, Centro Nacional de Investigaciones Oncológicas, Madrid, España 04 de mayo de 2007 Effects of hyperglycemia on gene expression in human muscle and adipose tissue: potential implications in glucose toxicity Hubert Vidal, Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (Inserm), Lion, Francia 18 de mayo de 2007 Insulin signalling in Drosophila melanogaster Aurelio Teleman, European Molecular Biology Laboratory, Heidelberg, Alemania 24 de mayo de 2007 Functional genomics in biomedical research Herbert Auer, IRB Barcelona, Barcelona, España 25 de mayo de 2007 Anopheles and plasmodium: immunogenomics of vector/pathogen interactions Fotis Kafatos, Imperial College London, Londres, Reino Unido 29 de mayo de 2007 Cyclic cystine knot motif as a basis for design of stable molecular scaffolds Masa Cemazar, Institute for Molecular Biosciences, University of Queensland, Brisbane, Australia 30 de mayo de 2007 Cryo-EM studies on the regulation of ribosomal translocation Sean Connel, Institut für Medizinische Physik und Biophysik, Berlín, Alemania

52 R e s u me n Eje cu tivo 2 0 0 7 B arcelo na B io M ed S e minars

31 de mayo de 2007 A quest for the physico-chemical principles that govern protein folding, misfolding and aggregation Xavier Salvatella, University of Cambridge, Cambridge, Reino Unido 1 de junio de 2007 Molecular control of cell polarity and assymetric cell division in Drosophila Andreas Wodarz, University of Göttingen, Göttingen, Alemania 8 de junio de 2007 Winners and losers during growth of the Drosophila wing Laura A Johnston, College of Physicians and Surgeons, Columbia University, Nueva York, EEUU 15 de junio de 2007 Genomics and systems biology approaches to the study of virulence in human malaria Hernando del Portillo, Centre de Recerca en Salut Internacional de Barcelona, Barcelona, España 22 de junio de 2007 Keeping mitochondria and endoplasmic reticulum together: can mitofusin-2 be helpful? Luca Scorrano, Venetian Institute of Molecular Medicine, Pádova, Italia 29 de junio de 2007 Functional genetic approaches identify cancerous miRNAs Reuven Agami, The Netherlands Cancer Institute, Amsterdam, Países Bajos 6 de julio de 2007 Identification of novel Hypoxia Inducible Factor (HIF)-target genes Luis del Peso, Instituto de Investigaciones Biomédicas, Madrid, España 13 de julio de 2007 Silencing of the genome through histone demethylation Ramin Shiekhatar, Centro de Regulación Genómica, Barcelona, España 27 de julio de 2007 Regulation of Groucho-dependent repression by RTK signalling Ze’ev Paroush, The Hebrew University, Jerusalén, Israel 14 de septiembre de 2007 The ENCODE Project: Uncovering the transcriptional complexity of the human genome Roderic Guigó, Centro de Regulación Genómica, Barcelona, España 21 de septiembre de 2007 Non-transcriptional control of DNA replication by c-Myc David Domínguez, Institute for Cancer Genetics, Columbia University Medical Center, Nueva York, EEUU 26 de septiembre de 2007 p38a, master regulator of myoblast proliferation and differentiation Eusebio Perdiguero, Centro de Regulación Genómica, Barcelona, España 28 de septiembre de 2007 Towards structure-based protein functional annotation and rational engineering Mayte Pisabarro, Biotechnologisches Zentrum, Dresden, Alemania

B arcelo na B io M ed S e minars R es u m en Ej ec u t i v o 2 0 0 7 5 3

28 de septiembre de 2007 Enhanced mucosal IgA response and solid protection against viral challenge induced by a novel dendrimeric peptide David Andreu, Proteomics & Protein Chemistry, DCEXS-UPF-PRBB, Barcelona, España 5 de octubre de 2007 The Protein Expression Core Facility: Implementing high through-put cloning and expression technologies at IRB Barcelona Nick Berrow, Plataforma Científica de Expresión de Proteínas, IRB Barcelona, España 19 de octubre de 2007 Targeting ubiquitin signalling networks Ivan Dikic, Johann Wolfgang Goethe University, Institute of Biochemistry, Frankfurt, Alemania 26 de octubre de 2007 Decoding the Notch signal: transcriptional events elicited by Notch signalling Sarah Bray, Cambridge University, Cambridge, Reino Unido 2 de noviembre de 2007 Genetic analysis of chromosome break metabolism in eukaryotic cells John Petrini, Memorial Sloan-Kettering Cancer Center, Nueva York, EEUU 9 de noviembre de 2007 Molecular chaperones and the dynamic remodelling of nuclear receptor action Andrew Cato, Institute of Toxicology and Genetics, Karlsruhe, Alemania 16 de noviembre de 2007 Choline binding repeats as recognition elements in pneumococcal choline-binding proteins (CBPs) Margarita Menéndez, Instituto de Química-Física Rocasolano (CSIC), Madrid, España 23 de noviembre de 2007 Studying structure and function of protein complexes by solid-state NMR spectroscopy Marc Baldus, Max Planck Institute for Biophysical Chemistry, Göttingen, Alemania 14 de diciembre de 2007 Molecular regulation of epithelial polarity and morphogenesis Fernando Martín-Belmonte, Centro de Biología Molecular Severo Ochoa, Madrid, España 19 de diciembre de 2007 The role of the Mre11 complex in apoptosis and tumour suppression Travis Stracker, Memorial Sloan-Kettering Cancer Center, Nueva York, EEUU 21 de diciembre de 2007 Multifaceted roles of p38α signalling in inflammation and gene regulation Jin Mo Park, Massachussets General Hospital, Massachussets, EEUU

54 R e s u me n Eje cu tivo 2 0 0 7 B arcelo na B io M ed S e minars

Barcelona BioMed Conferences Los investigadores del IRB Barcelona organizaron durante el 2007 el ciclo Barcelona BioMed Conferences, con la colaboración de institutos de prestigio de todo el mundo. Veinte ponentes, elegidos de entre los investigadores internacionales líderes en su campo, se reunieron con un número reducido de participantes para mantener durante tres días debates intensivos sobre las últimas novedades y el futuro de sus áreas de investigación. El ciclo de conferencias fue posible en parte gracias al compromiso de la Fundación BBVA para la promoción de la investigación básica y aplicada. Los eventos se celebraron en el Institut d'Estudis Catalans, en el centro de Barcelona.

26—28 de marzo de 2007 Barcelona BioMed Conference THE REGULATION OF CHROMATIN FUNCTIONS Organizadores: Ferran Azorín (IRB Barcelona/CSIC) y Tony Kouzarides (Wellcome Trust/Cancer Center, Gurdon Institute, Londres, Reino Unido) 25—27 de junio de 2007 Barcelona BioMed Conference INFLAMMATION AND CHRONIC DISEASE Organizadores: Carme Caelles (IRB Barcelona) y Michael Karin (University of California at San Diego, La Jolla, EEUU) 1—3 de octubre de 2007 Barcelona BioMed Conference STEM CELLS AND CANCER Organizadores: Eduard Batlle (IRB Barcelona) y Hans Clevers (Hubrecht Laboratory, Utrecht, Países Bajos)

Otras Conferencias 26 y 27 de abril de 2007 Fundación Ramón Areces/IRB Barcelona Joint Conference MOLECULAR MECHANISMS OF MACROPHAGE ACTIVATION: CLASSICAL AND ALTERNATIVE Organizadores: Antonio Celada (IRB Barcelona) y Francisco Lozano (Universidad de Barcelona, España) 24 y 25 de mayo de 2007 BSC-IRB Barcelona Conference on Computational Biology BIOMOLECULAR SIMULATIONS, BIOINFORMATICS AND SUPERCOMPUTING Organizador: Modesto Orozco (IRB Barcelona, Barcelona Supercomputing Center)

B arcelo na B io M ed Co nfe rence s R es u m en Ej ec u t i v o 2 0 0 7 5 5

Actividades de Divulgación Investigadores principales, científicos asociados, postdoctorados y estudiantes de doctorado del IRB Barcelona participaron activamente en el 2007 en un número de actividades de divulgación organizadas por el Parque Científico de Barcelona y abiertas al público general. El objetivo era acercar la ciencia a una audiencia más amplia y divulgar el conocimiento de la investigación llevada a cabo en el IRB Barcelona.

3 y 10 de marzo de 2007 | 3, 10, 16, 17 y 31 de mayo de 2007 | 17 de noviembre de 2007 | 1 de diciembre de 2007 RESEARCH! Un ciclo de talleres prácticos dirigidos a estudiantes de secundaria y al público general Participantes: Elisabeth Castellanos1, Consol Farrera2, Ana Janic1, Leire Mendizabal1 y Maria Serra2 Grupos de investigación del IRB Barcelona en división celular1 y biología de macrófagos2 Temas: Analiza ADN e investiga el autor de un crimen; moscas con cáncer 24 y 25 de marzo de 2007 FIESTA DE LA CIENCIA 2007 Una fiesta científica en el Parque de la Ciutadella con experimentos reales y demostraciones Participantes: Elisabeth Aguilar y Ana Janic Laboratorio de división celular del IRB Barcelona Tema: Extracción de ADN de células de la saliva Marzo a diciembre de 2007 RECERCA A PRIMÀRIA Una actividad bimensual para acercar la ciencia a alumnos de primaria a través de la participación activa en experimentos de investigación Participantes: Carme Cortina y Elisa Espinet Laboratorios de cáncer colorrectal I y II del IRB Barcelona Actividades: Taller de investigación para estudiantes de primaria y visita guiada del Parque Científico de Barcelona Temas: Introducción al método científico, células madre, preparación y observación de células en el microscopio y extracción de ADN 12 y 13 de abril de 2007 FIRA RECERCA EN DIRECTE Una feria científica para presentar los últimos avances conseguidos en instituciones científicas de Barcelona Participantes: Paola Bartoccioni, Hans Burghardt, Carles Cantó y Meritxell Orpinell Grupos de investigación del IRB Barcelona en patología y terapia moleculares en enfermedades heterogénicas y poligénicas Tema: Más allá de nuestros genes. ¿Por qué nos ponemos enfermos?

Estudiantes de primaria visitan la sala de moscas del IRB Barcelona durante una de las visitas guiadas al Parque Cientíﬁco de Barcelona

Re su me n Ej e cuti vo 2 0 0 7 A ct ividades de D ivulgac ión

1 de julio al 30 de septiembre de 2007 PASSA L'ESTIU AL PARC! Un programa dirigido a estudiantes universitarios en sus últimos años de carrera que quieran familiarizarse con el mundo de la investigación Participantes: Patrick Aloy1, Carme Caelles2, Antonio Celada3, Anna Diez4, Ernest Giralt5, Joan Guinovart6, Maria Macias7, Miquel Pons8, Antoni Riera9, Neus Serrat3, Teresa Tarragó5, Meritxell Teixidó5, Anabel F Valledor3 y Xavier Verdaguer9 Grupos de investigación del IRB Barcelona en biología estructural y computacional1; señalización celular2; biología de macrófagos3, peptidomiméticos y heterociclos bioactivos4; diseño, síntesis y estructura de péptidos y proteínas5; ingeniería metabólica y terapia de la diabetis6; espectroscopia de RMN de biomoléculas7, RMN molecular: estructura y dinámica de las proteínas y complejos de proteínas8; y unidad de investigación en síntesis asimétrica9 Actividades: Participación en proyectos realizados en grupos de investigación, centros de investigación y empresas ubicadas en el Parque Científico de Barcelona Julio de 2007 a marzo de 2008 RECERCA A SECUNDÀRIA Una actividad académica para ayudar a alumnos de secundaria en sus trabajos de investigación a través de un programa de tutorías Participantes: Elisabeth Aguilar1, Carlos Alegret2, Roman Bonet3, Daniel Cifuentes4, Carme Cortina5, Ana Janic1, Marc Liesa6, Carles Martínez4, Laura Nocito4, Neus Rafel7, Lidia Ruiz3 y Dèlia Zafra4 Grupos de investigación del IRB Barcelona en división celular1; síntesis asimétrica2; espectroscopia de RMN de biomoléculas3; ingeniería metabólica y terapia de la diabetis4; cáncer colorrectal5; patología y terapia moleculares en enfermedades heterogénicas y poligénicas6; y laboratorio de desarrollo y control del crecimiento7 Actividades: Tutoría y apoyo académico a estudiantes de 16 años en sus trabajos de investigación y sesiones prácticas en los laboratorios del Parque Científico de Barcelona 13—15 de noviembre de 2007 JORNADA DE PUERTAS ABIERTAS: VINE A FER UN DOCTORAL EXPRESS! Una experiencia práctica en laboratorios dirigida a alumnos de secundaria Participantes: Carme Cortina y Elisa Espinet Laboratorios de cáncer colorrectal I y II del IRB Barcelona Actividades: Experimentos prácticos en los laboratorios de cáncer colorrectal, con el apoyo y tutela de los investigadores Temas: Visualización de células, extracción de ARN de las células, análisis del ARN extraído de células tumorales, separación de las células tumorales benignas de las malignas y cultivo celular in vitro

A ct ividades de D ivulgació n R es u m en Ej ec u t i v o 2 0 0 7 5 7

Organigrama Comité Científico Internacional

Patronato Junta de Gobierno Director

Director Adjunto

Joan J Guinovart

Joan Massagué

Comité Científico Interno Marco Milán (desde diciembre 2007)

Cayetano González

Directora de Gestión

(hasta diciembre 2007)

Miquel Coll Antonio Zorzano Ernest Giralt Eduard Batlle

Programas de Investigación Biología Celular y del Desarrollo Ferran Azorín Jordi Casanova Cayetano González Marco Milán Lluís Ribas Eduardo Soriano

Biología Estructural y Computacional Patrick Aloy Miquel Coll Ignasi Fita Maria Macias Modesto Orozco Miquel Pons

Medicina Molecular Carme Caelles Antonio Celada Joan J Guinovart Manuel Palacín Antonio Zorzano

Margarida Corominas

Plataformas Científicas y Servicios

Administración Finanzas y Compras

Microscopía Avanzada Bioinformática/ Bioestadística Genómica Funcional

Carles Coarasa

Recursos Humanos Sylvia Martínez

Comunicación y Relaciones Externas

Herbert Auer

Sarah Sherwood

Espectrometría de Masas

Servicios de Tecnología de la Información

Marta Vilaseca

Francisco Lozano

Ratones Transgénicos

Gestión Científica y Académica

Expresión de Proteínas

Margarita Navia

Nick Berrow

Estructura científica Estructura administrativa de apoyo a las actividades científicas

Química y Farmacología Molecular Fernando Albericio Ramón Eritja Ernest Giralt Antoni Riera Màrius Rubiralta

Oncología Eduard Batlle Elena Sancho MetLab

58 R e s u me n Eje cu tivo 2 0 0 7 O rganigrama

Personal de Dirección y Administración Dirección Director

Directora de Gestión

Joan Guinovart

Margarida Corominas

Director Adjunto

Secretaria de Dirección

Joan Massagué

Maria Estévez

Programas de Investigación Programa de Biología Celular y del Desarrollo

Coordinador de Programa Marco Milán (desde diciembre de 2007)

Secretaria de Programa Isabel Santori

Coordinador de Programa Cayetano González (hasta diciembre de 2007)

Programa de Biología Estructural y Computacional

Coordinador de Programa

Secretaria de Programa

Miquel Coll

Vanessa Llobet

Programa de Medicina Molecular

Coordinador de Programa Antonio Zorzano

Secretaria de Programa Dulce Tienda (hasta diciembre de 2007)

Secretaria de Programa Natàlia Molner (desde octubre de 2007)

Programa de Química y Farmacología Molecular

Coordinador de Programa

Secretaria de Programa

Ernest Giralt

Eva Poca

Programa de Oncología

Coordinador de Programa

Secretaria de Programa

Eduard Batlle

Sara Martorell

Pe r s o nal de D irecció n y A dminist ració n R es u m en Ej ec u t i v o 2 0 0 7 5 9

Gestión Científica y Académica Jefa de Gestión Científica y Académica Margarita Navia

Coordinadora Académica Clara Caminal

Comunicación y Relaciones Externas Jefa de Comunicación y Relaciones Externas Sarah Sherwood

Secretaria de Conferencias Meritxell Gavaldà

Gabinete de Prensa

Servicio Editorial

Sònia Armengou

Tanya Yates

Información y Publicaciones Anna Alsina

Recursos Humanos Jefa de Recursos Humanos

Técnica de Recursos Humanos

Sylvia Martínez

Silvia Aguadé

Servicios de Tecnología de la Información Jefe de Servicios de Tecnología de la Información Francisco Lozano

Administrador de Sistemas David Villanueva

Arquitecto de Sistemas

Administrador de Sistemas

Roberto Bartolomé

Jesús Sánchez

Finanzas y Compras Jefe de Finanzas y Compras

Compras

Carles Coarasa

Anna Oñatevia (hasta noviembre de 2007)

Contabilidad

Compras

Silvia Ramírez

Sara López

Proyectos e Inventario

Compras

Stel·la Serra

Mª Jesús López

60 R e s u me n Eje cu tivo 2 0 0 7 Perso nal de D irecció n y Adminis trac ión

Estadísticas de Recursos Humanos Total de miembros del IRB Barcelona Administración

Investigadores

354

Total

382

Empleados del IRB Barcelona vs al total de miembros Empleados del IRB Barcelona

114

Otros

268

Total

382

Personal científico por programa de investigación Química y Farmacología Molecular 30%

Oncología 5% Medicina Molecular 21%

Plataformas Científicas 3%

Biología Celular y del Desarrollo 22% Biología Estructural y Computacional 19%

Personal científico por categorías profesionales Jefes de Grupo 7% Investigadores Postdoctorales 19% Investigadores Asociados 10%

Técnicos 18%

Estudiantes de doctorado 46%

Est adíst icas de Recurso s Humano s R es u m en Ej ec u t i v o 2 0 0 7 6 1

Afiliaciones de los Investigadores Universidad de Barcelona (UB) Investigadores Principales Fernando Albericio Carme Caelles Antonio Celada Ernest Giralt Joan J Guinovart Modesto Orozco Manuel Palacín Miquel Pons Antoni Riera Màrius Rubiralta Eduardo Soriano Antonio Zorzano

Otros Investigadores Mercedez Álvarez Ferran Burgaya José Antonio del Río Fernández Anna Díez Annabel Fernández Valledor Josep Lluís Gelpí Rodolfo Lavilla Jorge Lloberas Sergio Madurga Albert Martínez Garcia Cristina Minguillón Jesús Ureña Xavier Verdaguer

Consejo Superior de Investigaciones Científicas (CSIC) Investigadores Principales Ferran Azorín Jordi Casanova Miquel Coll Ramón Eritja Ignasi Fita

Otros Investigadores Maria Lluïsa Espinàs Dori Huertas Rosa Pérez Luque Maria Solà Cristina Vega

Institució Catalana de Recerca i Estudis Avançats (ICREA) Investigadores Principales Patrick Aloy Eduard Batlle Roger Gomis Cayetano González Maria Macias Marco Milán Lluís Ribas de Pouplana

Otros Investigadores Natalia Carulla Elena Casacuberta Alfred Cortes Xavier de la Cruz Alejandro Vaquero José Luis Vázquez Ibar

62 Resumen Ejecutivo 2007 Afiliaciones de los Investigadores

Parque Científico de Barcelona El PCB aumentará su superficie de 32.000 m2 a 90.000 m2 en el año 2011

El Parque Científico de Barcelona (PCB) es un espacio donde confluyen institutos de investigación, plataformas tecnológicas y empresas con la finalidad de promover la innovación en las ciencias de la vida. Establecido por la Universidad de Barcelona en 1997, fue el primer parque científico del Estado y un referente internacional en el fomento de la relación universidad-empresa. Sus objetivos son potenciar la investigación de excelencia con el apoyo de una amplia oferta tecnológica, dinamizar la relación entre la universidad y la empresa, impulsar la creación de nuevas empresas e institutos y promover la difusión de la ciencia y la cultura científica de la sociedad. Actualmente, el Parque Científico de Barcelona acoge a más de 2.200 profesionales, cuatro institutos de investigación, más de 45 empresas, una incubadora de empresas biotecnológicas, más de 70 grupos de investigación y una amplia oferta tecnológica de apoyo a la investigación. El Parque Científico de Barcelona aumentará su superficie de 32.000 m2 a 90.000 m2 en la segunda fase de construcción del proyecto, que finalizará en el año 2011. La ampliación, que ya estaba prevista en el proyecto inicial

de creación del PCB, supondrá también un incremento de las empresas biotecnológicas y farmacéuticas, centros e institutos de investigación, plataformas tecnológicas y servicios científicos y de apoyo a la innovación que actualmente acoge, así como un importante aumento del número de profesionales que trabajan en I+D+i, que, según las previsiones, llegará a los 4.000 en el 2011. Este crecimiento implica la creación y adecuación de nuevos espacios, así como la reestructuración de los actuales. El edificio Modular, donde hasta ahora se han ubicado la mayoría de los laboratorios de investigación y la oferta tecnológica del PCB, se ampliará, y las torres existentes en el cruce entre las calles Josep Samitier, Baldiri Reixac y la avenida del Dr Marañón se reestructurarán. En este contexto, el Parque construyó durante el 2007 un nuevo edificio de laboratorios denominado Hèlix. Este nuevo edificio ofrece más de 6.500 m2 de espacio destinado a laboratorios y acoge a más de 30 grupos y centros de investigación públicos y privados (IRB Barcelona, IBMB-CSIC, IBEC, Oryzon genomics, Ordesa, Combino Pharm, etc). Este nuevo espacio también alberga la Bioincubadora PCB-Santander, creada por 14 spin-offs de base tecnológica.

Parque Cient ífico de B arce lo na R es u m en Ej ec u t i v o 2 0 0 7 6 3

Resumen Ejecutivo 2007

IRB Barcelona

Tel: +34 93 403 7111 Fax: +34 93 403 7114 info@irbbarcelona.org www.irbbarcelona.org

Entidades fundadoras

Con la colaboración de

Instituto de Investigación Biomédica

Parque Científico de Barcelona Baldiri Reixac 10 08028 Barcelona España

Centres de recerca de Catalunya