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Del genoma al metagenoma Descifrar los códigos genéticos de las bacterias de nuestro organismo aportaría nuevas claves en el conocimiento de enfermedades como la obesidad Proyecto MetaHIT En Europa, se han implicado en este ambicioso proyecto, llamado MetaHIT, 11 grupos de investigación, entre los cuales el único representante de España es el grupo que dirige Francisco Guarner, del Valle de Hebrón. Su grupo, junto a UCB Pharma S.A., forma parte de esta investigación, que ha recibido 11,4 millones del séptimo Programa Marco de la Comisión Europea para investigar el microbioma humano. MetaHIT ha arrancado el pasado mes de abril y tiene una duración prevista de cuatro años. Los otros grupos europeos participantes son de Francia (que tiene dos), Dinamarca, Italia, Alemania, Holanda, Dinamarca, Reino Unido y Bélgica, a los que cabe sumar uno de China. Más adelante, es posible que se adhieran también otros grupos de Japón, Singapur, Canadá y Australia. En paralelo, además, se está desarrollando otro proyecto, en el que se enmarca MetaHIT, de mayor envergadura y liderado por un consorcio internacional. Es el denominado The International Human Microbiome Project, que constituye un esfuerzo coordinado entre la Dirección General de Investigación de la Comisión Europea, de Bruselas, y el National Institute of Health, dirigido desde Washington. Tanto en Europa como en EE.UU., el 90% del programa está financiado por organismos públicos, aunque también participan algunas industrias farmacéuticas y de la alimentación.
- Imagen: NIAID -
Los científicos creen posible descubrir algunos defectos en el microbioma asociados a la enfermedad inflamatoria intestinal
El objetivo de todos ellos es obtener un mapa completo del microbioma humano, para lo cual el proyecto MetaHIT analizará los genes del microflora intestinal; EE.UU., la flora de la cavidad bucal y vaginal; y otros países los microorganismos que se encuentran en la piel.
Una de las aspiraciones del proyecto MetaHIT es que sus hallazgos sean aplicables en dos áreas: la obesidad y la enfermedad inflamatoria intestinal (colitis ulcerosa o enfermedad de Crohn). Es posible que las personas obesas tengan cierta actividad enzimática propia de las bacterias que colonizan el organismo y, en el caso de la enfermedad inflamatoria intestinal, puede que se descubran algunos defectos en el microbioma asociados a esta patología y que no son transmisibles.
OBESIDAD Y ENFERMEDAD INFLAMATORIA INTESTINAL Para analizar las causas de la obesidad y la enfermedad inflamatoria intestinal, el proyecto MetaHIT tomará muestras de heces de 400 personas voluntarias, sanas -que servirán como controles de la enfermedad- y afectadas por la obesidad o la enfermedad inflamatoria intestinal. La intención es recabar datos para comparar sus microbiomas e intentar explicar, en parte, el origen de estas dos patologías y cómo reducir su riesgo de aparición. "Si observamos cambios en el microbioma que explican la enfermedad inflamatoria intestinal y el microbioma se puede mejorar, podríamos intervenir para resolver la enfermedad", comenta
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Guarner. Los participantes en el proyecto MetaHIT deberán obtener muestras de heces y congelarlas inmediatamente. Después, mediante un procedimiento de extracción, los investigadores tomarán de ellas sólo el ADN -donde están contenidos los códigos genéticos.
- Imagen: Mariana Ruiz Villarreal -
A continuación, con un procedimiento de amplificación universal, pero específico para bacterias, se obtendrán varias muestras que se secuenciarán en varios centros. Y ese ADN se reconocerá por un procedimiento de bioinformática que permitirá saber qué proteína secuencia cada gen y, al conocer las proteínas, saber cuáles de ellas son enzimas - productos con actividad biológica- y, por lo tanto, qué función tiene cada bacteria.
Con la secuenciación de las primeras muestras -de entre 10 y 20 personas- los científicos elaborarán unas plantillas de unos tres millones de genes que, posteriormente, servirán para analizar el resto de muestras de los voluntarios, para ver si están bien representadas. En caso de no ser así, las plantillas se enriquecerán con datos nuevos hasta obtener un mapa completo del microbioma de nuestra microflora intestinal. « Metagenoma y microbioma
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