Thermo Nautilus LIMS for Biobanking

Thermo Scientific Nautilus LIMS 바이오뱅크 업무 및 생검표본 관리

최고 수준의 기능, 사용 편의성 및 융통성

최고 수준의 기능, 사용 편의성 및 융통성

생검표본은 미래의 의약품 및 치료 방법 개발에 필요한 새로운 연구개발 활동의 기반이 됩니다. 지난 10년 동안 연 구/분석용으로 생성된 시료의 수가 급증했으며, 이렇게 된 가장 큰 이유는 병진의학(translational medicine)과 역학 (epidemiology)에 대한 관심이 증가했기 때문입니다. 이로 인해 높은 처리량과 수용량을 갖춘 실험실에서 선별하는 시 료와 라이브러리에 대한 수요를 충족시키는 대규모 바이오뱅크와 바이오리포지토리가 발전하게 되었습니다. 이러한 발전과 함께 고품질 시료에 대한 필요성과 중요성이 커지고 있으며, 막대한 양의 시료 및 관련 데이터를 관리해야 하는 경우가 많은 연구자들 사이에서 시료를 정확하게 효율적으로 관리하는 방법이 최대 관심 사항이 되었습니다. 국가별, 지역별 및 질병별로 많은 시설이 만들어지고 있기 때문에 바이오뱅크와 바이오리포지토리의 수가 빠르게 증 가하고 있으며 그 규모도 커지고 있습니다. 이러한 바이오뱅크의 기능은 일차 약품 선별 용도의 동결 세포 부분표본 (aliquot) 보관에서부터 질병 연구를 위한 조직 검사, 환자 DNA 시료 채취, 분할 혈액 및 소변 시료의 복수 부분표본을 포 함하는 전체 모집단 연구에 이르기까지 매우 다양합니다.

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과제

바이오뱅크의 핵심 역할

바이오뱅크가 해결해야 하는 과제는 시료 자체에 만 국한되지 않고 엄청나게 방대한 영역으로 확대 됩니다. 이러한 시설에서는 환자의 인구통계학적 정보, 동의서, 연계 보관성(chain of custody) 등과 같은 시료와 관련된 정보도 관리해야 합니다. 연구 자의 복잡한 시료 관련 요구 사항을 충족하고, 환자 권리를 보호하고, 시료 무결성을 보장하려면 이러 한 모든 정보가 필요합니다. 물리적 시료의 관리를 간소화하기 위해 많은 바이오뱅크에서는 최신 장 비와 자동화 시스템을 이용하고 있습니다. 물론, 이 러한 장비와 시스템이 중요하지만 이를 통해서는 문제의 일부만 해결할 수 있을 뿐입니다. 연구자에 게 최고 수준의 서비스를 제공하려면 이러한 도구 를 바이오뱅크의 실험실 정보 관리 시스템(LIMS) 을 통해 제공되는 지식 및 데이터와 통합하고 활용 할 수 있어야 합니다.

UK Biobank와 같은 일부 시설은 처음부터 대규모 저장 용량과 빠른 검색 속도로 용이하게 확장할 수 있도록 준비되어 있지만 다른 시설들은 그때 그때 수집하여 극저온 냉동고에 보관한 시료를 수작업 으로 검색해야 합니다. 두 경우 중 어디에 속하더라 도 국가별, 지역별 및 질병별 바이오뱅크에서 점점 더 중요해지는 사항은 어떤 방법으로 시료 무결성, 추적 및 감사를 보장할 것인가 입니다. 이러한 시료와 관련된 통계 정보 및 분석 데이터를 추적하려면 직관적이고 능률적인 방식으로 검체 정보를 저장하고 제공할 수 있는 최신 기술을 갖춘 실험실이 필요합니다. 바이오뱅크가 빠른 발전을 이루려면 사용자에게 다음을 제공해야 합니다.

www “장비 통합 기능이 기본적으로 제공되는 Nautilus LIMS는 도입 초기부터 상당한 생산성 향상을 가져왔습니다. 기존 로보틱스 장비와 통합되었으므로 데이터 관리 프로세스가 상당히 향상되었습니다.”

— HUNT Research Centre and Biobank의 LIMS 관리자인 Thor Gunnar Steinsli

• 향상된 물류 및 운영 지원 • 관련 검체 정보에 대한 보다 종합적인 이해 • 빠르게 처리해야 하며 오류가 발생하기 쉬운 프 로세스를 자동화하는 도구 • 정보에 기반하여 보다 빠르게 의사 결정을 하기 위한 실시간 정보 Thermo Scientific 솔루션과 서비스는 이러한 요구 를 해결합니다. 생검표본 관리에는 복잡한 시료 추적 과정이

믿을 수 있는 Thermo Scientific Nautilus LIMS 생명 과학 연구 및 개발을 촉진하려면 정확하고 규 정을 준수하며 효율적인 생검표본 관리가 매우 중 요합니다. Thermo Scientific Nautilus LIMS는 신 약 개발과 임상 운영, 생명과학 연구 및 실험실, 연구 센터, 의료 기관 및 위탁 연구 기관의 고유한 검체 수 집, 추적 및 보관 문제를 해결하도록 특수하게 설계 되어 있습니다.

Nautilus LIMS™는 데이터 캡처와 사양 관리를 간 소화할 뿐만 아니라 연계 보관성 및 취급 보장 요구 사항을 해결합니다. 전혈, 조직, 세포 용해물, DNA, RNA, 단백질 등, 무엇을 보관하거나 추적하든지 Nautilus는 전체 조직 차원의 재고 관리를 지원합 니다. Nautilus의 웹 인터페이스는 보안이 유지되 는 환경에서 중앙 집중식 글로벌 액세스를 제공합 니다. 또한 Nautilus의 특허를 받은 기본 제공 그래 픽 워크플로 유틸리티 도구를 사용하여 조직에서 기능을 쉽게 확장하고 각 실험실의 고유한 요구 사 항에 맞게 솔루션을 조정할 수 있습니다.

필요합니다. Nautilus LIMS에서는 그래픽을 이용한 시각적 방법으로 시료를 보관한 냉동기 위치까지 추적할 수 있습니다.

복합 시료 관리 바이오뱅크 기반 연구에서는 처리하는 각 시료와 관련된 환자 정보를 사용할 수 있어야 연구자가 대 상 연구와 관련된 특정 질병 상태, 인종 및 연령 범위 를 검색할 수 있습니다. Nautilus LIMS는 환자 개인 정보 보호정책을 위반하지 않고 이러한 정보를 보 관하고 관리할 수 있는 구심점의 역할을 합니다. 또 한 바이오뱅크에서 주문 사양을 충족하는 시료를 사용할 수 있는지 여부를 쉽게 확인할 수 있도록 전 체 조직 차원의 재고 관리 기능을 지원합니다. 더욱이, Nautilus의 구성 가능한 실험실 워크플로 를 사용하면 개별 실험실에서 시료 및 상위/파생 관 계의 정의와 LIMS에서 각 물리적 항목 및 관련 정 보가 추적되는 범위를 조정할 수 있습니다. 여기에 는 필요에 따라 시료 위치, 양 추적, 관련 테스트, 환 자 정보 및 바이오뱅크 고객의 요구 사항을 검증하 고 입력하는 데 필요한 다른 모든 복합 정보가 포함 될 수 있습니다.

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“생명과학과 제약 분야에서 Thermo Fisher의 오랜 경험이 결합된 Nautilus LIMS의 유연성과 적응성, 그리고 안정성이 이 대규모 프로젝트의 데이터 관리를 위해 Nautilus LIMS를 선택하게 만들었습니다.”

— UK Biobank의 LIMS 관리자

연계 보관성 Nautilus의 계층 구조는 실험실에 필요한 연계 보 관성(chain-of-custody)도 간소화합니다. 실험실 에서 시료 또는 부분표본이 거친 경로에 관계 없이, Nautilus는 상세한 계층적 위치 관리, 부분표본/파생 및 합동 시료 추적, 문서화된 시료 소인을 사용하여 시료 기록을 보관하고 프로세스에 관여한 각 사용 자를 식별할 수 있습니다.

를 통해 시료의 검토, 승인, 수집, 농도 정규화, 테스트 및 납품을 수행할 수 있습니다. 이 프로세스는 매우 다양하고 복잡할 수 있지만 Nautilus 워크플로를 이 용하면 각 바이오뱅크에서 고객 요청을 쉽게 완료 할 수 있습니다. 예를 들어 바이오뱅크 기술자가 고 객이 요청한 것과 다른 시료(환자는 같지만 농도, 부 피 등이 다른 시료)를 보내도록 결정할 수 있습니다.

Nautilus의 직관적인 웹 인터페이스를 통해 조직 전 반의 시스템 뿐만 아니라 규제 기관과 연구실 같은 다른 시설의 시스템을 통합하고 상호 운용할 수 있 으며, 이를 통해 실험실 프로세스의 각 단계에 영향 을 주는 최신 데이터와 정보에 빠르게 액세스할 수 있습니다.

동의서 관리 연구자는 바이오뱅크에 보관된 시료를 요청할 수 있어야 합니다.

Nautilus LIMS 웹 인터페이스를 사용하면 연구자가 시료를 요청하고 진행 상황을 추적할 수 있습니다.

요청 관리 연구자가 필요에 따라 바이오뱅크에서 검체를 검 색, 구성 및 요청하는 과정이 쉽지 않다면 바이오 뱅크가 제 역할을 못하고 있는 것입니다. Nautilus 의 고객 맞춤형 웹 액세스 기능을 사용하면 바이 오뱅크에서 이러한 과정을 쉽게 처리할 수 있습니 다. 웹 인터페이스를 사용하면 바이오뱅크 고객이 Nautilus 시스템에 직접 접속할 필요 없이 요청이 생 성되어 완수되는 과정을 추적할 수 있습니다. 고객 요청이 바이오뱅크에 도착하면 사용자가 Nautilus

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동의서에 따라 사용자에게 시료를 체크아웃할 수 있는 권한이 있는지 여부와 사용자가 시료로 할 수 있는 작업이 결정되기 때문에 바이오뱅크와 바이 오리포지토리에는 동의서 관리가 반드시 필요합 니다. 더욱이, 환자가 동의를 철회할 경우 시스템에 서 해당 환자에게서 수집한 시료, 즉 체크아웃된 시 료와 고객 시설에서 처리되고 있는 시료를 비롯한 모든 시료의 폐기를 시작할 수 있어야 합니다. 본사 는 이러한 요구 사항을 이해하고 있으며, 수동 프로 세스나 자동 프로세스를 통해 승인된 동의서를 기 반으로 폐기하거나 사용하지 않을 시료를 정확하 게 결정할 수 있도록 시료 추적 기능을 기본으로 제 공하고 있습니다. Nautilus에는 실제 동의서와 문 서화된 모든 제한 사항을 보관하고 볼 수 있는 기능 이 있습니다.

장비 통합 및 자동화

광범위한 플레이트 관리

오늘날 많은 바이오뱅크에서는 고수준의 자동화 를 사용하고 있으며 최신 기술의 장비를 이용하여 생검표본을 관리하고 있습니다. Nautilus는 장비 및 자동화 시스템 통합이 용이하도록 설계되어 있 습니다. 이제 이전의 분산된 시스템을 통합하여 시 스템 간에 데이터를 전자식으로 교환할 수 있으므 로 오류가 발생하기 쉬운 수동 프로세스를 제거하 고 생산성과 데이터 신뢰성을 높일 수 있습니다.

Nautilus를 사용하여 표준화한다는 것은, 짧은 시간

Nautilus는 플레이트 구성 및 채움 패턴 정의를 통 해 플레이트 추적을 간소화하므로, 사용자가 프로

에 적응 가능한 손쉬운 통합과 향상된 자동화를 통 해 투자 수익률(ROI)을 높이고 총소유비용을 절감 할 수 있다는 의미입니다. 단일 LIMS로 표준화한 실 험실에서는 IT 대 사용자 비율이 72% 증가하고 사 용자 효율성은 40% 증가했으며, 월별 작업 시료 수 는 50% 이상 증가했습니다.

젝트 요구 사항에 따라 작업 처리 및 의사 결정 트리 프로세스를 구축하고 형식을 지정할 수 있습니다.

Nautilus에 포함된 고급 플레이트 처리에는 그래픽 워크플로, 플레이트 편집기와 출력 및 자동화를 개 선할 수 있는 기본 제공 통합 기능이 포함됩니다. 사 용자는 그래픽 플레이트 편집기에서 끌어서 놓기 와 같은 기능을 사용하여 데이터 흐름을 자동화하 거나 수동으로 조정할 수 있습니다. 이제 이전의 분 산된 시스템을 통합하여 시스템 간에 데이터를 전 자식으로 교환할 수 있으므로 오류가 발생하기 쉬 운 수동 프로세스를 제거하고 생산성과 데이터 신 뢰성을 높일 수 있습니다. 또한, Nautilus에서는 1D 및 2D 바코드를 간편하게 인쇄하고 스캔할 수 있습 니다.

LIMS 및 분석 장비 데이터 통합

환자의 인구통계학적 정보와 연계 보관성 정보는 생검표본과 항상 연결되어 있어야 합니다. Nautilus의 뛰어난 플레이트 처리 기능은 사용자가 모든 부분표본과 관련 계층 정보를

지금까지 LIMS와 분석 시스템은 개별적이며 분산 되어 있었습니다. Nautilus의 Data Manager 솔루션 의 목표는 장비의 원시 데이터 저장 기능을 제공하 고 이 데이터를 플랫폼과 독립적인 형식으로 변환 하여 두 플랫폼을 완벽하게 통합하는 것입니다. 이 데이터를 LIMS 항목에 직접 연결하면 사용자가 단 일 인터페이스에서 모든 장비 데이터에 액세스할 수 있으므로 정보에 기반한 의사 결정이 가능하게 됩니다. 사용자는 이질적인 장비들의 서로 다른 분 석 방식을 비교하고 결과를 겹쳐 표시할 수 있습니 다. Data Manager는 장비 간의 차이를 극복하여 기 존 분석 장비의 가치를 극대화하고 장래의 투자를 보호합니다.

관리하여 생검표본에서부터 개별 부분표본에 이르는 모든 단계에서 시료 정보를 사용할 수 있게 만듭니다.

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데이터 규정 준수 및 보안 Nautilus에는 구성 가능한 전자식 서명 템플릿과 21 CFR Part 11을 준수하는 감사 기능이 있으므로 사용자가 준수할 프로세스가 무엇인지 확실하게 알 수 있습니다. Nautilus의 데이터베이스는 Oracle RDBMS를 완벽하게 활용하여 데이터 보안, 감사 및 규정 준수를 시행하도록 설계되어 있습니다.

Nautilus가 비즈니스 규칙을 데이터베이스에 저장 하므로 Excel이나 기타 보고 패키지 등, 타사 응용 프 로그램이 데이터에 액세스할 경우를 비롯한 모든 경 우에 보안이 항상 활성화됩니다. 이 독창적인 아키텍 처를 통해 실험실 전반에서 데이터의 진본성, 무결성 및 추적 가능성을 보장하는 유연하고 안전한 방식으 로 통합을 수행할 수 있습니다. 또한, Nautilus는 조직 이 HIPAA 및 기타 개인정보보호 법률을 준수하면서 생검표본과 관련된 유전체 및 형질 데이터를 추적할 수 있게 해 주는 통합 솔루션의 일부입니다.

Thermo Fisher Scientific과의 파트너 관계 본사는 고객의 모든 바이오뱅크 요구 사항을 해결하 는 종합적인 솔루션을 제공합니다. Nautilus LIMS와 함께 사용할 수 있는 Thermo Scientific BioBank는 셀 기반 분석, 세균 클론, 단백질, DNA 및 RNA 라이브 러리 같은 광범위한 연구 응용 분야에서 -80°C로 생 물학적 시료를 안전하게 보관할 수 있도록 설계된 자 동화된 시료 관리 모듈입니다. BioBank에는 표준 및 딥 웰 마이크로티터 플레이트, 크리오관 등을 비롯한 광범위한 구성으로 수천 가지 시료를 보관할 수 있습 니다. BioBank에는 정전 시 최대 12시간 동안 시료를 보호하는 CO2 백업이라는 특수 기능이 있습니다.

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Thermo Scientific의 2D 바코드 인쇄 나사형 시험관 제 품군의 새 제품에는 500ul~12ml 체적의 ABgene®, Matrix® 및 NUNC® 관이 포함되며, 관 크기에 따라 24개, 48개 또는 96개 관의 마이크로플레이트 풋프린트 랙 으로 제공되는 이러한 제품은 자동화를 용이하게 해 줍니다. 민감한 특성을 가진 바이오뱅크 시료에는 안 전한 시료 추적과 연계 보관성을 보장하는 2D 바코드 가 영구적으로 부착되어 쉽게 떨어질 수 있는 기존 레 이블 방식보다 훨씬 우월합니다. 바이오뱅크와 바

이오리포지토리를 목표로 삼아 빠르게 성장하고 있 는 Thermo Scientific 도구와 기술 집합을 활용하는 조직은 향상된 시료 무결성, 추적 및 감사 기능을 통 해 경쟁력을 크게 향상시킬 수 있습니다.

Nautilus LIMS와 당사의 모든 정보관리 제품군에 대 해 자세히 알아보려면 웹 사이트 (www.thermoscientific.com/informatics)를 방 문하거나 전화(+1 215 964 6020)로 문의해 주십시 오. 본사의 Stem Cell Excellence 프로그램에 대해 알아보려면 www.stemcellexcellence.com을 방 문하십시오.

Cell Culture Excellence™ 세포 배양 실험실에 필수적인 제품 Thermo Scientific Cell Culture Excellence 프로그램은 세포 생물학자의 요구 사항을 충족하도록 설계된 고품질의 제품과 서비스를 제공합니다. 당사의 종합적인 포트폴리오에는 증식과 배양 및 실험에 이르는 세포 배양 프로세스의 모든 단계에서 특성화, 분석 및 저장을 통해 뛰어난 품질을 달성할 수 있도록 설계된 고급 도구가 포함되어 있습니다.

Thermo Scientific의 전체 세포 배양 제품 및 서비스에 대해 자세히 알아보려면 다음 웹 사이트를 방문하십시오.

www.thermoscientific.com/cellculture

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