Naturaleza FĂsica y QuĂmica del Protoplasma
Naturaleza Física del Protoplasma Diferencias entre Soluciones Solución Verdadera
Solución Coloidal
Suspensión
<0.001 µm
0.001 – 0.1µm
> 0.1µm
Invisibles por medios ópticos
Visibles (microscopio)
Visibles
No se sedimentan
No se sedimentan
Se sedimentan
Partículas disueltas
Dispersas
Suspendidas
Soluto: sólido, líquido o gas
Fase dispersa: SLG
Soluto: sólido
Solvente: líquido (S. acuosa)
Fase dispersante: SLG
Solvente: líquido
fase dispersa
T°
T° fase dispersante
Gel
Sol
Difusión
Isotónica Hipertónica
Hipotónica
Osmosis
Isotónica
Naturaleza Química del Protoplasma Elementos biogénicos o Bioelementos Primarios C, H, O, N Carbono Hidrógeno95% Oxígeno
Nitrógeno
Secundarios
Oligoelementos
P, K, Ca, Mg, S, Cl, Na Fósforo Potasio Calcio 4.5% Magnesio Azufre Cloro Sodio
Cu, Mo, Fe, Mn, Zn Cobre Molibdeno Hierro Manganeso0.5% Zinc Fl, B, Al, Si, Co, V, Cr, Li, I
Enlaces covalentes
p+
e8p+ 8n±
La molécula de agua: H2O p+
H(+)
H(+) (-)O
e-
H(+)
(-)O
H(+)
Enlaces de Hidrógeno
4-10 Kcal/mol
H(+)
1 mol = 6,023 x 1023 (Número de Avogadro)
(-)O
H(+)
Diferencias entre compuestos orgánicos e inorgánicos Característica
Orgánicos
Inorgánicos
Número: >21’000.000
90%
10%
Estructura
Compleja, alto PM
Simple, bajo PM
Tipo de enlace
Covalente
Electrovalente
Electrólisis
No electrólitos
Electrólitos
Velocidad de reacciones
Lenta, entre moléculas
Rápida, entre iones
Puntos de licuefacción y ebullición
Bajos
Altos
Solubilidad
En solventes orgánicos
En agua
Inflamación
Inflamables
No inflamables
Carbohidratos MonosacĂĄridos Grupo AldehĂdo
Grupo Cetona
Ribosa
Ribulosa
Glucosa
Fructosa
aldopentosa
cetopentosa
aldohexosa
cetohexosa
5’ 4’
1’ 3’
2’
Anillo furanosa 6’ 5’
4’ 6’
3’
1’ 2’
5’ 4’
1’
3’
Anillo furanosa
2’
Anillo piranosa
Oligosacáridos Formación de un Disacárido de dos hexosas
Reacción de condensación
+ H2O O enlace glicosídico 1,4
Maltosa
Sucrosa
Lactosa
Polisacáridos Almidón Amilosa
Enlace glicosídico 1,4
n
Amilopectina Enlace glicosídico 1,4
n Enlace glicosídico 1,6
n
Zea mays
Solanum tuberosum
Musa paradisiaca
Celulosa
Quitina
n
Lípidos O
O
CH2OC R1
CH2OH HO C R1 O
CHOH
O CHOC R2
HO C R2 O
O
CH2OH HO C R3 Glicerol
CH2OC R3
Acidos Grasos
TRIGLICERIDO
Ceras Cera de Abejas
Acido palmítico
Triacontanol
+ 3H2O
Película superficial
agua
Fosfolípidos O
Micela simple
CH2OC R1 O CHOC R2
Extremo no polar (“colas hidrófobas”)
agua
O CH2OP OH
Extremo polar (“cabeza hidrófila”)
Micela doble
OH
agua
Esteroides
Terpenos
Feromonas
Radical
R H
Amina
H
N
C
O C Carboxilo OH
H
Los 20 AA´s de las Proteínas Nombre
Abreviatura
Observación
Estructura de Aminoácido
Proteínas
Alanina Arginina Asparagina Acido Aspártico Acido Glutámico Cisteina Fenilalanina Glutamina Glicina Histidina Isoleucina Leucina Lisina Metionina Prolina Serina Treonina Triptofano Tirosina Valina
Ala Arg Asn Asp Glu Cis Fen Gln Gli His Ile Leu Lis Met Pro Ser Tre Trp Tir Val
Esencial
Contiene S Esencial
Esencial Esencial Esencial Esencial Esencial, contiene S
Esencial Esencial Esencial
R
R
O
H
O N
C
H
C
N
C
C OH
Enlace peptídico
H
H
H
Cálculo del número total de péptidos: X = YZ X = Nº total de péptidos Y = Nº de AA’s disponibles Z = Nº de AA’s en el péptido
Estructuras de las Proteínas Primaria Cuaternaria
Terciaria
Secundaria
Hélice-alfa
Lámina-beta
Acidos Nucleicos 5’
4’
1’ 3’
Desoxibosa
Ribosa
2’
OH Purina
Pirimidina
O
P OH O
Fosfato
Fosfato
Azúcar
Base nitrogenada + 2H2O
Nucleótido
5’
Cadenas “antiparalelas”
3’
“Pasamanos”
5’
3’ T
Desoxiribosa
A
Fosfato A
enlaces de H
“Peldaños” Pares de bases complementarias
= 2nm
T
C
G
A
T
1 giro completo = 10 pares de bases = 3.4 nm
G
5’ 3’
3’
C
5’
Diferencias entre ADN y ARN Característica
ADN
ARN
Nº de cadenas
Dos
Una
Tamaño
Mayor
Menor
Azúcar
Desoxiribosa
Ribosa
Bases Nitrogenadas
A, G, C, T
A, G, C, U
Duplicación
Autoduplicable
Se origina del ADN
Información genética
La contiene
La copia
Mutabilidad
Mutable
Copia la mutación
Estructura Celular
Célula Animal 7
8
6
17
6 4
9
10
1 3
1
2 16
2 9
4 3 16
12
15 18
11 12
14
15 13
14 1 = Citoplasma 2 = Membrana celular 3 = Núcleo 4 = RE rugoso 5 = RE liso 6 = Mitocondrias 7 = Microfilamentos
20
5
19 Célula Vegetal
5 8 = Lisosoma 9 = Peroxisoma 10 = Centríolos 11 = Microtúbulos 12 = Aparato de Golgi 13 = Cilios
14 = Ribosomas 15 = Cromatina 16 = Nucleolo 17 = Cloroplasto 18 = Pared celular 19 = Plasmodesmos 20 = Vacuola
Membrana Celular
Glucoproteína
Glucolípido
Fosfolípidos
Colesterol
Proteína periférica
Proteína integral
Difusión pasiva
Transporte pasivo
Difusión facilitada
Moléculas pequeñas
Transporte activo Grupo-translocación
Mecanismos de Transporte
Exocitosis
Moléculas grandes Endocitosis
Fagocitosis Pinocitosis
Transporte Pasivo Propiedad
Difusión Pasiva
Difusión facilitada
Transporte Activo
Grupo Translocación
En contra de la gradiente
No
No
Si
Si
Uso de permeasa
No
Si
Si
Si
Consumo de energía
No
No
Si
Si
Modificación química
No
No
No
Si
Bomba Sodio-Potasio Exterior
Citoplasma ATP Na+
AzĂşcar
Membrana celular
Permeasa
K+
Núcleo
Eucromatina Cromatina
Retículo endoplasmático
Heterocromatina Nucleolo
Filamentos intermedios
Lámina nuclear
Poro nuclear
Jugo nuclear (Nucleoplasma)
Membrana externa Envoltura nuclear Membrana interna
Retículo Endoplasmático Lúmen Núcleo Ribosomas
RE Rugoso RE Liso
Ribosomas
Subunidad pequeña ARNr + Proteínas
20 nm
Subunidad grande
Aparato de Golgi
Sacos aplanados De salida
Cisterna
LĂşmen
Cara cis
De entrada
VesĂcula de Golgi
Dictiosoma
Conjunto de cisternas
Lisosoma
Lisosomas
Digesti贸n de material ingerido por endocitosis
Fagocitosis
Exocitosis
Vacuola fagoc铆tica
Lisosoma primario
Lisosoma secundario
Vacuola digestiva
Cuerpo residual
Lisosomas Autofagia: destrucci贸n de estructuras inservibles
. ... . . .. .. . . .
Estructura inservible
Cuerpo residual
RE liso Lisosoma primario
Vacuola autof谩gica Lisosoma secundario
Exocitosis
Lisosomas Autolisis: autodestrucci贸n de la c茅lula
Lisosomas
oxidasa 1 RH2 + O2 R + H2O2 Catalasa R’H2 + H2O2 R’ + 2H2O Catalasa 2H2O2 O2 + 2H2O
Mitocondrias
Membrana interna
Matriz
Membrana externa
Cresta mitocondrial
Citoesqueleto
MicrotĂşbulos
Filamentos de actina (= Microfilamentos)
Filamentos intermedios
Pared celular
Lamela Pared primaria
Pared secundaria
Cloroplasto Lamela intergranal
Grana
Tilacoide
Membrana interna Membrana externa
Estroma
Contactos celulares
Plasmodesmos
Desmosoma
Canal hidr贸filo
Uni贸n estrecha
Uni贸n de hendidura
Funciones Celulares
Ejemplos de Cambio Estándar de Energía Libre Reacción
ΔG°’ (cal)
Fosfoenolpiruvato Piruvato + Pi
- 14.800
3-Fosfoglicerato + Pi 1,3-Difosfoglicerato
+ 11.800
ATP ADP + Pi
- 7.300
AMP + 2Pi ATP
+ 7.700
Glucosa-6-fosfato Glucosa + Pi
- 3.300
Glicerol + Pi Glicerol-3-fosfato
+ 2200
Sistemas de oxidación/reducción de la Cadena Respiratoria Eh (voltios)
O/R NAD+/NADH
+
H+
- 0.32
Transportan e- en H NAD+: dinucleótido de nicotinamida y adenina
FAD: dinucleótido de flavina y adenina
FAD/FADH2
- 0.03
CoQ/CoQH2
+ 0.05
cit b.Fe+++/cit b.Fe++
+ 0.08
cit c1.Fe+++/cit c1.Fe++
+ 0.22
cit c.Fe+++/cit c.Fe++
+ 0.25
Citocromos: Fe es cofactor
cit a.Fe+++/cit a.Fe++
+ 0.29
Complejo X: cit b + cit c1
cit a3.Fe+++/cit a3.Fe++
+ 0.39
Complejo Y: Cit a + cit a3 (citocromo oxidasa)
Oxígeno/Agua
+ 0.82
4.52 Kcal/0.1 V de diferencia en los Eh
CoQ: coenzima Q, o ubiquinona
Transportan sólo e-
Cadena Respiratoria NAD+ NAD+ + 2H+ + 2e- NADH + H+
Sustrato reducido (Ej. C6H12O6)
NADH + H+
ATP
ATP
CoQ
2citX.Fe++
2citc.Fe+++
2citY.Fe++
½ O2
CoQH2
2citX.Fe+++
2citc.Fe++
2citY.Fe+++
H2O
2H = 2H+ + 2e-
Sustrato oxidado (Ej. CO2)
FADH2
2H+ 2H+ + 2e- + O ?
FAD
Alimentos
Primera: Digestión
Proteínas
Polisacáridos
Aminoácidos
Azúcares simples (ej. Glucosa)
Lípidos (Triglicéridos)
Macromoléculas a moléculas simples
Glucólisis
Citoplasma y Mitocondrias
Fuera de la célula
Etapas del Catabolismo
Segunda: M. simples → Acetil CoA Escaso ATP y NADH
Acidos grasos y Glicerol
ATP
Acido pirúvico
Tercera:
Ciclo de Krebs
Acetil CoA → H2O y CO2 Abundante NADH → ATP (CR)
NADH Cadena Respiratoria
Mitocondrias
Acetil CoA
NH3
H2O
ATP
CO2
Glucosa ATP Hexoquinasa ADP
Glucólisis
Glucosa-6-fosfato Glucosa-fosfato isomerasa
Fructosa-6-fosfato
2 Acido pirúvico
ATP Fosfofructoquinasa ADP
2ADP
Fructosa-1,6-difosfato
Piruvato quinasa
2ATP
2 Acido fosfoenolpirúvico
Aldolasa
Dihidroxiacetona fosfato
2 Gliceraldehído-3-fosfato 2NAD+ 2(2H) 2(NADH + H+)
Enolasa
Triosa-fosfato isomerasa
2 Acido-2-fosfoglicérico
2Pi Glicerldehído-3-fosfato deshidrogenasa Fosfoglicerato quinasa
2 Acido-1,3-difosfoglicérico
2ADP
2ATP
Fosfoglicerato mutasa
2 Acido-3-fosfoglicérico
Acido Pirúvico NAD+ 2H
Pirúvico deshidrogenasa
NADH + H+
El Ciclo de Krebs
CO2
Acetil CoA H2O Citrato sintetasa
Acido Oxaloacético
Acido Cítrico
NAD+
Aconitasa
Málico 2H + deshidrogenasa NADH + H
Acido Isocítrico Acido Málico Isocitrato deshidrogenasa H2O
Fumarasa
Acido α-Cetoglutárico
Acido fumárico FAD 2H
α-Cetoglutarato deshidrogenasa
Succinato deshidrogenasa
FADH2
Acido Succínico
CO2 NAD+ 2H NADH + H+
CO2 NAD+ 2H NADH + H+
Succinil CoA Succinil tioquinasa ATP
ADP+Pi
β-Oxidación Acil CoA sintetasa Activación: A.Graso + CoA + ATP
A.Graso-CoA + ADP
A.Graso-CoA + CoA → Acetil CoA + (NADH + H+) + FADH2 A.Graso-CoA (2C’s menos) + CoA → → → hasta que A.Graso-CoA tiene 4C’s A.Graso-CoA (4C’s) + CoA → 2Acetil CoA + (NADH + H+) + FADH2
Acetil CoA → Ciclo de Krebs
(NADH + H+) o FADH2 → CR
Ejemplo: Supongamos un ácido graso de 10C’s A.Graso (10C’s) + CoA + ATP → A.Graso-CoA (10C’s) + ADP
1ra etapa: A.Graso-CoA (10C’s) + CoA → Acetil CoA + (NADH + H+) + FADH2 2da etapa: A.Graso-CoA (8C’s) + CoA → Acetil CoA + (NADH + H+) + FADH2 3ra etapa: A.Graso-CoA (6C’s) + CoA → Acetil CoA + (NADH + H+) + FADH2 4ta etapa: A.Graso-CoA (4C’s) + CoA → 2Acetil CoA + (NADH + H+) + FADH2 Totales: 5Acetil CoA, 4(NADH + H+), 4FADH2
1 g lípido = 9000 cal; 1g glucógeno o proteína = 4.000 cal; 1 g glucosa = 3800 cal
AMB = litros de O2 x 1.25 g/litro x 3.800 cal/g Reservas de un hombre normal de 70 Kg de peso Compuesto
Grasa Proteína Glucógeno Glucosa
Masa (Kg)
Energía (cal)
135’000.000 24’000.000 900.000 76.000 Total: 159’976.000
15 6 0.225 0.020
Fermentaci贸n
Otro compuesto
Fermentación Láctica: Streptococcus lactis, células musculares Lactato deshidrogenasa
2CH3COCOOH + 2(NADH + H+) 2CH3CHOHCOOH + 2NAD+ Acido Pirúvico Acido Láctico
Fermentación Alcohólica: Saccharomyces cerevisiae Piruvato descarboxilasa
2CH3COCOOH 2CH3CHO + 2CO2 Acido Pirúvico Acetaldehído Alcohol deshidrogenasa
2CH3CHO + 2(NADH + H+) 2CH3CH2OH + 2NAD+ Etanol
Fotosíntesis
Luz
6CO2 + 12H2O C6H12O6 + 6O2 + 6H2O
Clorofila
ΔG°’ = 684 Kcal
Características de la Fotosíntesis En Bacterias Sitio:
En Plantas y Algas Cloroplastos:
- Fotofosforilación
Membrana celular
Tilacoides
- Fijación del CO2
Citoplasma
Estroma
Cíclica
Acíclica
H2S, H2, etc.
H2O
Producción de NADPH
Reacción paralela
Fotofosforilación
Generación de oxígeno
Anoxigénica
Oxigénica
Tipo de fotofosforilación Agente reductor
Luz
Fotofosforilaci贸n C铆clica
1 quantum de luz es absorbido
Sistema I (P700)
2eFerredoxina
Ubiquinona
Citocromo b ADP + Pi ATP
Citocromo f
Luz
Luz
1 quantum de luz es absorbido
1 quantum de luz es absorbido
Sistema I
Sistema II
(P700)
(P680)
ADP + Pi
2e-
H2O 2H+ + 2e- + ½ O2 Fotolísis del agua
2e-
ATP
Ferredoxina
Ubiquinona
2eFlavoproteína
Citocromo b ADP + Pi
ATP
NADP+
Citocromo f
NADPH + H+
Fotofosforilación Acíclica
Ciclo de Calvin 3Anhídrido carbónico (3 x 1C = 3C’s)
6Acido-3-fosfoglicérico (6 x 3C = 18C’s)
Ribulosa difosfato carboxilasa
6ATP
3Ribulosa-1,5-difosfato (3 x 5C = 15C’s) 6ADP + 6Pi 3ADP + 3Pi 6Acido-1,3-difosfoglicérico (6 x 3C = 18C’s)
3ATP 5Gliceraldehído-3-fosfato (5 x 3C = 15C’s)
6NADPH + 6H+
6Gliceraldehído-3-fosfato (6 x 3C = 18C’s)
1Gliceraldehído-3-fosfato (1 x 3C = 3C’s)
6NADP+
Azúcares, AA’s, A.Grasos, etc.
Anhídrido carbónico (1C) Fosfoenolpìruvato carboxilasa
Acido oxaloacético (4C’s) NADPH + H+
Acido fosfoenolpirúvico (3C’s)
NADP+
(33)
Acido málico ( 4C’s)
ADP + Pi NADP+
ATP
NADPH + H+
Acido pirúvico (3C’s) CO2
Ciclo de Hatch-Slack
Ciclo de Calvin
De mantenimiento
Biosíntesis De producción
-
Productos permanecen en la célula Contribuyen a su supervivencia Sustancias que no ingresan en alimentos Polisacáridos, lípidos, proteínas, ácidos nucleicos
- Productos abandonan la célula - Pueden servir para supervivencia de otras células Excreción: Desechos metabólicos Secreción: Productos cumplen una función: - Digestión: enzimas digestivas - Regulación: hormonas - Sostén: huesos, conchas - Reproducción: sustancias atrayentes - Protección: sustancias venenosas o irritantes
Replicación Transcripción
Traducción
ADN ARN(r,m,t) Proteínas
Replicación
Replicaci贸n
Replicaci贸n
Hijas
Progenitora
Transcripci贸n
Quinasa Mg++
Transcripci贸n
Traducción Primera Posición
Segunda Posición
Tercera Posición
U
C
A
G
Fen Fen Leu Leu
Ser Ser Ser Ser
Tir Tir
Cis Cis
Terminación Terminación
Terminación
Trp
U C A G
C
Leu Leu Leu Leu
Pro Pro Pro Pro
His His Gln Gln
Arg Arg Arg Arg
U C A G
A
Ile Ile Ile Met
Tre Tre Tre Tre
Asn Asn Lis Lis
Ser Ser Arg Arg
U C A G
G
Val Val Val Val
Ala Ala Ala Ala
Asp Asp Glu Glu
Gli Gli Gli Gli
U C A G
U
Traducci贸n
ARN de transferencia
Traducci贸n
Iniciaci贸n
Alargamiento
Traducci贸n Terminaci贸n
Anemia falciforme
Reproducci贸n celular N煤mero diploide
? Homo sapiens: 2n = 46
Drosophila melanogaster : 2n = 8
Zea mays: 2n = 20
Pan troglodytes: 2n = 48
Pisum sativum: 2n = 14
Rattus norvegicus: 2n = 42
Canis familiaris: 2n = 78
M
G2
Ciclo Celular Interfase = G1 + S + G2 (90% del ciclo)
S
G1
Reproducci贸n celular Mitosis
Interfase
Profasec
2n = 4
Metafase
Anafase
Reproducci贸n celular Mitosis
Telofase
2n = 4
Reproducci贸n celular Mitosis
Reproducci贸n celular Meiosis
Profase I
Meiosis I Meiosis
Leptoteno Zigoteno Paquiteno Interfase I precede a Meiosis I Diploteno Diacinesis
Metafase I Anafase I Telofase I Profase II Metafase II Meiosis II Anafase II Telofase II
Interfase II precede a Meiosis II
Reproducci贸n celular Meiosis Profase I
quiasma
Leptoteno
Zigoteno
Diploteno
Paquiteno
Diacinecis
Reproducci贸n celular Meiosis
Metafase I
Anafase I Cromosomas numerados por tama帽o, excepto X e Y
PROBABILIDAD DE TENER UN HIJO CON TRISOMÍA 21 (St Bartholomews Hospital, London)
Edad
1 niño en:
Edad
1 niño en:
Edad
1 niño en:
15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25
1578 1572 1565 1556 1544 1528 1507 1481 1447 1404 1351
26 27 28 29 30 31 32 33 34 35 36
1286 1208 1119 1018 909 796 685 574 474 384 307
37 38 39 40 41 42 43 44 45 46 47
242 189 146 112 85 65 49 37 28 21 15
Reproducci贸n celular Meiosis Telofase I
Profase II
Metafase II
Anafase II
Telofase II