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BRCA 1/2 TEST Test predittivo per il tumore al seno DESIGNING THE FUTURE OF GENOMICS
AMBITO DI APPLICAZIONE Il presente test è in grado di evidenziare una predisposizione genetica allo sviluppo di carcinomi alla mammella ed alle ovaie. Questi carcinomi possono essere di tipo sporadico o familiare. La maggioranza è di tipo sporadico e si sviluppa nella popolazione generale in assenza di familiarità, il loro sviluppo è correlato soprattutto a fattori ambientali. La restante parte è invece di tipo familiare o ereditario: in questo caso il rischio di sviluppare tumori è
più elevato se membri della stessa famiglia si sono ammalati di queste neoplasie in precedenza. I tumori ereditari alla mammella ed all’ovaio sono causati da mutazioni ricorrenti a livello della linea germinale che possono essere trasmessi da entrambi i genitori, sia ai figli maschi che femmine, in maniera autosomica dominante, ne risulta che i figli hanno il 50% di probabilità di ereditare la suscettibilità genetica allo sviluppo di tali tumori.
COMPONENTE GENETICA Sono stati scoperti due geni responsabili di circa il 50% delle forme ereditarie di tumori della mammella e/o dell’ovaio: Gene BRCA1 e Gene BRCA2 I geni BRCA1 e BRCA2 sono collocati rispettivamente sul cromosoma 17 (17q21) e sul cromosoma 13 (13q12.3). Entrambi i geni occupano una regione molto ampia del genoma umano che comprende circa 70kb.
BRCA1 è composto da 22 esoni e BRCA2 è composto da 27 esoni ed entrambi codificano per proteine multi dominio. Essi sono classificati come soppressori tumorali e fanno parte dei pathway cellulari coinvolti nella riparazione dei danni al DNA. Una perdita di funzione di uno di questi geni risulta in conseguenze fisiologiche simili ovvero aumenta il rischio di sviluppare cancro, principalmente al seno ed alle ovaie.
TEST GENETICO È un test di screening per individuare la presenza di mutazioni nei geni BRCA1 e BRCA2. Il test genetico, eseguito nei laboratori di Personal Genomics, prevede l’analisi dell’intera regione codificante di BRCA1 e BRCA2. Il DNA viene estratto dal campione biologico e i geni BRCA1 e BRCA2 vengono arricchiti e sequenziati tramite tecnologie di sequenziamento di nuova generazione mediante piattaforma Illumina. Le varianti risultanti dall’analisi bioinformatica delle sequenze prodotte vengono annotate tramite il software QIAGEN Clinical Insight (QCI TM) per identificare le varianti clinicamente significative. QCI TM un software che viene utilizzato da Personal Genomics per l’interpretazione delle varianti e che permette di identificare accuratamente le varianti patogeniche. QCI permette di ottenere: • Classificazioni computazionali che sono basate sulle line guida dell’American College of Medical Genetics (ACMG) per l’interpretazione delle varianti.
• Casi clinici curati manualmente con hyperlink cliccabili che indirizzano alle fonti di materiale scientifico. • Riferimenti bibliografici. QIAGEN Clinical Insight (QCI TM) include I seguenti database e strumenti di analisi: QIAGEN Clinical Insight-Interpret (5.1.20171220), Ingenuity Knowledge Base (Oz 180217.000), CADD (v1.3), CentoMD (-), EVS (ESP6500SI-V2), Allele Frequency Community (201710-02), JASPAR (2013-11), Vista Enhancer hg18 (2012-07), Vista Enhancer hg19 (2012-07), OMIM (May 26, 2017), gnomAD (2.0.1), Clinical Trials (Oz 180217.000), BSIFT (201602-23), TCGA (2013-09-05), PolyPhen-2 (v2.2.2), 1000 Genome Frequency (phase3v5b), Clinvar (2017-09-07), DGV (2016-05-15), COSMIC (v82), ExAC (0.3.1), HGMD (2017.3), PhyloP hg18 (2009-11), PhyloP hg19 (2009-11), DbSNP (150(2017-07-10)), TargetScan (6.2), SIFT4G (2016-02-23)
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BRCA 1/2 TEST Test predittivo per il tumore al seno
RISULTATI DEL TEST Il test genetico determina se un individuo presenta o meno delle mutazioni a livello dei geni BRCA1 o BRCA2. l’identificazione di una o più specifiche mutazioni permette di stimare il rischio di sviluppare il tumore associato a quel tipo di mutazione. Non tutte le donne con mutazioni a livello di BRCA1 o BRCA2 sviluppano la patologia neoplastica, ma il rischio è abbastanza alto. Sebbene la malattia sia rara per il sesso maschile, un uomo che presenta mutazioni di BRCA1 o BRCA2 possiede un rischio maggiore di sviluppare un tumore alla mammella.
Un risultato negativo significa che non è stata riscontrata alcuna mutazione. Tuttavia è importante sottolineare che un risultato negativo non significa un rischio zero di sviluppare un tumore al seno o all’ovaio; questi soggetti possiedono lo stesso rischio di tumore riportato per la popolazione generale, ciò perché la maggior parte di questo genere di tumori è di tipo sporadico, ed ha cause ancora non ben conosciute. Personal Genomics offre come risultato del test di screening un report interpretato con le mutazioni conclamate maligne o a significato patogenetico incerto/ignoto.
PROCEDURA Modalità di richiesta Il test deve essere richiesto da un medico. Verranno inviati il modulo di richiesta, il consenso informato e l’anamnesi che devono essere firmati congiuntamente dal medico e dal paziente. Verrà inviato un kit per la raccolta di un campione di sangue, che potrà essere effettuato da personale sanitario autorizzato. Personal Genomics offre il servizio di prelievo di sangue presso laboratori di analisi convenzionati.
Invio dei risultati Il Report Clinico contenente l’analisi dettagliata delle eventuali predisposizioni genetiche rilevate, sarà inviato al medico che ha prescritto l’analisi. Il Report Clinico, in lingua inglese, è anonimizzato e riporta soltanto il Codice di Identificazione della paziente. I tempi di refertazione previsti sono di 20 gg lavorativi dall’arrivo del campione in laboratorio.
Ritiro del campione Una volta eseguito il prelievo sarà sufficiente contattare Personal Genomics che si occuperà di ritirare il campione e consegnarlo presso i laboratori siti in Verona per dare inizio al processo di analisi genetica.
SERVIZIO DI CONSULENZA GENETICA Personal Genomics offre il servizio di consulenza genetica pre-test e post-test che permette di supportare il medico nel fornire un servizio quanto più completo possibile nella diagnosi delle malattie genetiche. La consulenza genetica è finalizzata a chiarire il significato, i limiti, l’attendibilità, la specificità del test genetico, e ad acquisire il consenso
alla sua esecuzione, secondo quanto previsto dal Garante della Privacy. È di fondamentale importanza, quindi, accompagnare chi richiede un test genetico alla piena comprensione di quest’ultimo nella fase pre-test, e, in seguito, sostenere lo stesso richiedente nell’accettazione dei risultati ottenuti.
Per maggiori informazioni visitare in sito www.personalgenomics.it Personal Genomics Srl Via Roveggia, 43b 37136 Verona (VR) Italy T. +39 045 8202351 © 2018 Personal Genomics Srl . I dati e le immagini sono indicativi e possono essere variati in ogni momento senza preavviso