Evolução de Resistências

Evolução de Resistências 2014-2016 e Ecologia Microbiana 2016

Serviço de Patologia Clínica - Microbiologia

, epe U nidade Local de Saúde de M at osinhos

Serviço de Patologia Clínica - Microbiologia

Evolução de Resistências e Carta Microbiológica 2016 Os dados apresentados correspondem a resultados globais de estirpes isoladas no nosso laboratório no período de 01/01/2016 a 31/12/2016, tendo sido excluídos os rastreios de colonização.

O estudo da evolução de resistências foi efectuado, nos últimos três anos, em estirpes invasivas (sangue e LCR - à semelhança do ECDC).

Verificou-se que: — nas estirpes de Klebsiella pneumoniae e Escherichia coli há uma diminuição de resistência às quinolonas; no entanto, é maior a resistência aos carbapenemes; — o número de infecções por Klebsiella pneumoniae tem vindo a crescer nos últimos anos, assim como as estirpes produtoras de ESBL e de carbapenemases — no último ano aumentaram 3% e 2,6% respectivamente; — a resistência à ciprofloxacina, à ceftazidima e à piperacilina/tazobactam aumentou mais de 10% nas estirpes de Pseudomonas aeruginosa (n<30); — no Streptococcus pneumoniae (n<20) não foi detectada resistência elevada à penicilina; contudo, a resistência aos macrólidos subiu 10% e à levofloxacina 3,7%; — as bacteriemias por Staphylococcus aureus diminuíram, mas houve um agravamento da resistência à meticilina — de 33,3% em 2015 para 36,7% em 2016.

A equipa da microbiologia: Médicas: Mª João Soares e Valquíria Alves Técnicas Superiores: Antónia Read, Filipa Carneiro e Margarida Monteiro Técnicos: Amadeu Gomes, Clara Barros, Márcia Neto, Mª José Couto, Patrícia Monteiro, Sónia Carvalho e Telma Dias

Metodologia utilizada: Para a elaboração das cartas microbiológicas e da ecologia hospitalar foi utilizada, como critério na eliminação de duplicados, a Norma M-39 da CLSI, tendo sido considerado o 1º isolado do ano de cada doente.

Para a avaliação da evolução de resistências em estirpes identificadas em amostras invasivas, a eliminação dos duplicados foi efectuada com base no perfil de susceptibilidade aos antimicrobianos, isto é, cada fenótipo diferente só foi contabilizado uma vez.

Considerámos como “fenótipo diferente” quer a presença de uma diferença major no antibiograma de um isolado face aos restantes, desde que esta diferença fosse relevante (por exemplo SAMS para SAMR; Enterobacteriaceae não produtoras de carbapenemases para produtoras; etc.), quer a existência de, pelo menos, uma diferença major e duas diferenças minor de um isolado face aos restantes.

Ecologia Microbiana 2016 BACTÉRIAS AERÓBIAS Escherichia coli Klebsiella pneumoniae Pseudomonas aeruginosa Staphylococcus aureus Proteus mirabilis Enterococcus faecalis Haemophilus influenzae Staphylococcus epidermidis Streptococcus pneumoniae Enterobacter cloacae complex Staphylococcus spp.

Gardnerella vaginalis Klebsiella oxytoca Morganella morganii Staphylococcus saprophyticus Streptococcus agalactiae Enterococcus faecium Ureaplasma urealyticum Staphylococcus hominis Streptococcus grupo anginosus Citrobacter spp.

Bacteroides fragilis Bacilos Gram + (outros) Enterobacter aerogenes Serratia marcescens Streptococcus grupo mitis Moraxella catarrhalis Cocos Gram+ (outros) Aeróbios Gram - (outros) Providencia stuartii Enterobacteriaceae (outras) Bacteroides grupo fragilis (outros) Prevotella spp.

Campylobacter spp.

Actinomyces spp.

Streptococcus b-hemolitico (outros) Bacteroides thetaiotaomicron Chlamydia trachomatis Raoultella planticola Prevotella bivia Propionibacterium spp.

Enterococcus spp.

Outros anaeróbios Mycoplasma hominis Acinetobacter baumannii Clostridium perfrigens Streptococcus grupo sanguinis Neisseria gonorrhoeae Stenotrophomonas maltophilia Salmonella spp.

Streptococcus grupo bovis

Legionella pneumophila Streptococcus grupo salivarius Clostridium spp.

Fusobacterium spp.

Finegoldia magna Anaerococcus prevotii

Bordetella pertussis Peptostreptococcus spp.

TOTAIS:

TOTAL 2170 664 380 327 309 283 153 145 114 87 82 77 75 74 71 69 69 66 65 59 48 48 38 37 37 36 35 34 34 33 32 31 29 28 26 24 22 20 19 19 19 17 17 16 15 15 14 13 13 12 11 8 8 8 7 6 5 4 3 6180

% 35,11% 10,74% 6,15% 5,29% 5,00% 4,58% 2,48% 2,35% 1,84% 1,41% 1,33% 1,25% 1,21% 1,20% 1,15% 1,12% 1,12% 1,07% 1,05% 0,95% 0,78% 0,78% 0,61% 0,60% 0,60% 0,58% 0,57% 0,55% 0,55% 0,53% 0,52% 0,50% 0,47% 0,45% 0,42% 0,39% 0,36% 0,32% 0,31% 0,31% 0,31% 0,28% 0,28% 0,26% 0,24% 0,24% 0,23% 0,21% 0,21% 0,19% 0,18% 0,13% 0,13% 0,13% 0,11% 0,10% 0,08% 0,06% 0,05% 100%

Ecologia Microbiana 2016 FUNGOS

4 403

% 62,28% 11,17% 5,71% 5,21% 5,21% 4,71% 3,23% 1,49% 0,99% 100%

PARASITAS Giardia lamblia Cryptosporidium parvum Plasmodium spp.

Plasmodium falciparum Enterobius vermicularis Trichomonas vaginalis TOTAIS:

TOTAL 16 14 1 1 3 1 36

% 44,44% 38,89% 2,78% 2,78% 8,33% 2,78% 100%

MICOBACTÉRIAS Mycobacterium tuberculosis complex Mycobacterium avium complex Mycobacterium kansasii Outras micobactérias TOTAIS:

TOTAL 39 8 4 14 65

% 60,00% 12,31% 6,15% 21,54% 100%

TOTAL 90 70 33 22 17 15 14 13 12 11 8 4 3 3 1 1 317

% 28,39% 22,08% 10,41% 6,94% 5,36% 4,73% 4,42% 4,10% 3,79% 3,47% 2,52% 1,26% 0,95% 0,95% 0,32% 0,32% 100%

TOTAL 4357 1466 403 317 255 102 65 36 7001

% 62,23% 20,94% 5,76% 4,53% 3,64% 1,46% 0,93% 0,51% 100%

Candida albicans Candida glabrata Aspergillus fumigatus Candida parapsilosis Candida spp. (outras) Candida tropicalis Outros fungos Aspergillus spp.

TOTAL 251 45 23 21 21 19 13 6

Pneumocystis jiroveci TOTAIS:

VÍRUS Influenza A Sincicial Respiratório Citomegálico Rotavírus Influenza B Herpes simples 1 Parainfluenza 3 Herpes simples 2 Adenovírus Varicela Zoster Metapmeumovirus Enterovírus Parvovírus B19 Parainfluenza 2 Epstein-Barr HH6

TOTAIS: MICRORGANISMOS Aeróbios Gram negativo Aeróbios Gram positivo Fungos Vírus Anaeróbios Micoplasmas/Chlamydia Micobactérias Parasitas TOTAIS:

Escherichia coli

Klebsiella pneumoniae

Proteus mirabilis

Enterobacter cloacae complex

Pseud. aeruginosa

Staphylococcus aureus

Enterococcus faecalis

Enterococcus faecium

Estirpes hospitalares mais prevalentes (% de Susceptibilidade) - 2016

310

217

70

46

175

151

117

64

Ampicilina

42

Amoxi.-Ác.clavulânico

78

56 41

100

13

77

76

76

Oxacilina

55

Cefotaxima

94

52

96

72 80

Ceftazidima

79

Piperacilina -Taz.

89

Meropenem/Imip.

100 92/93 100

100 77 82

Ertapenem

99,7

91

100

100

Gentamicina

89

66

80

96

93

Amicacina

94

70

92

96

94

38

99

72

Aminoglicosídeos

Outros Nitrofurantoína

99

Cotrimoxazol

75

54

66

96

Ciprofloxacina

82

56

71

89

99 99 75

Linezolide

100

100

100

Vancomicina

100

99

66

100

Colistina < 50% de sensibilidade entre 50 e 80% de sensibilidade >80% de sensibilidade Resistências Naturais

Serviço de Patologia Clínica - Microbiologia l ULS Matosinhos - Hospital Pedro Hispano

Para mais informações consultar o site da ULSM

Beta - lactâmicos

Total de Estirpes

1859

447

239

41

49

47

205

175

70

(73% urinárias)

Enterococcus faecalis

(99% urinárias)

Staphylo. saprophyticus

Staphylococcus aureus

(45% pele e tecidos moles, 19% sangue, 12% respiratórias, 12%urinárias)

Pseudomonas aeruginosa

(47% urinárias, 22% pele e tecidos moles, 19% respiratórias)

Klebsiella oxytoca

36

(85% urinárias)

(89 % urinárias)

Citrobacter koseri

(78 % urinárias)

Morganella morganii

(63% urinárias)

Enterobacter cloacae complex

(79% urinárias)

Proteus mirabilis

(89% urinárias)

Klebsiella pneumoniae

(92% urinárias)

Escherichia coli

Estirpes da comunidade mais prevalentes (% de Susceptibilidade) - 2016

166

Beta - lactâmicos Ampicilina

54

Amoxi.-Ác.clavulânico

82

67 67

100

86

94

92 80

Oxacilina Cefurox.- Acetil/Sódica

90

69

96

Cefotaxima

96

72

98

85

76

78

85

92

96

Ceftazidima

81

Piperacilina -Taz.

81

Meropenem/Imip.

87 91

73

Aminoglicosídeos Gentamicina

94

79

85

98

80

97

98

93

83

Outros Nitrofurantoína

99

100

Cotrimoxazol

80

72

75

95

62

94

94

Ciprofloxacina

86

69

77

88

57

97

89

98 69

Clindamicina

70

Ác. Fusídico

91

Fosfomicina

99

73

< 50% de sensibilidade entre 50 e 80% de sensibilidade >80% de sensibilidade Resistências Naturais Serviço de Patologia Clínica - Microbiologia l ULS Matosinhos - Hospital Pedro Hispano Para mais informações consultar o site da ULSM

96

99

Estirpes invasivas de E.coli

Proporção (%)

40%

R Ciprofloxacina

Estirpes produtoras ESBL

20%

Estirpes produtoras de carbapenemases R Carbapenemes 0% 139 2014

140 2015

124 2016

Número de estirpes estudadas/Ano

ULS - Matosinhos Hospital Pedro Hispano - Microbiologia

Estirpes invasivas de K.pneumoniae

Proporção (%)

60,0%

50,0%

R Ciprofloxacina

40,0%

Estirpes produtoras ESBL

30,0%

R Carbapenemes

20,0%

Estirpes produtoras de carbapenemases

10,0%

0,0% 55 2014

69 2015

73 2016

Número de estirpes estudadas/Ano

ULS - Matosinhos Hospital Pedro Hispano - Microbiologia

Estirpes invasivas de Pseudomonas aeruginosa 40,0% 35,0%

Ciprofloxacina

Proporção R (%)

30,0%

Ceftazidima

25,0%

Imipenem

20,0% 15,0%

Meropenem

10,0%

Pip-Taz

5,0% 0,0% 18 2014

22 2015

26 2016

Número de estirpes estudadas/Ano

ULS - Matosinhos Hospital Pedro Hispano - Microbiologia

Estirpes invasivas de Streptococcus pneumoniae 20,0% 18,0%

Proporção R (%)

16,0% 14,0%

Penicilina Elevada 12,0%

Penicilina Intermédia 10,0%

Eritromicina

8,0%

Levofloxacina

6,0% 4,0% 2,0% 0,0% 26 2014

23 2015

27 2016

Número de estirpes estudadas/Ano

ULS - Matosinhos Hospital Pedro Hispano - Microbiologia

Estirpes invasivas de MRSA 100,0% 90,0%

Proporção (%) de MRSA

80,0% 70,0% 60,0% 50,0% 40,0% 30,0% 20,0% 10,0% 0,0% 77 2014

78 2015

68 2016

Número de estirpes estudadas/Ano

ULS - Matosinhos Hospital Pedro Hispano - Microbiologia

Hemoculturas Taxa de Positividade e de Contaminação (2005-2016)

20000

18,0% Total Colheitas

16,3%

18000

Nº Total frascos colhidos

16000

16,5%

16,0%

16,0%

% Positivas

14,9%

14,8%

14,6% 14,0%

14000 12,0% 12000 10,0% 10000 8,0% 8000 6,0% 6000 4,0%

4000

2,0%

2000 0

0,0% 2005

Total Positivas

2006

2007

2010

2015

2016

ULS - Matosinhos Hospital Pedro Hispano Microbiologia

% Contaminação