Cron贸 metros Evolutivos
M. en C. Yadira Siu Rodas
DISTANCIA EVOLUTIVA •
La distancia evolutiva entre dos organismos se puede medir
por las diferencias en la secuencia de aminoácidos o nucleótidos de macromoléculas homólogas aisladas de cada uno de ellos. Las diferencias son proporcionales al número de cambios
mutacionales estables fijados en el DNA que codifica esa molécula en ambos organismos. La evolución se produce cuando las mutaciones quedan
fijadas en las diferentes poblaciones, el resultado es la biodiversidad.
CRONÓMETRO MOLECULAR ADECUADO Estar distribuida universalmente en el grupo elegido para ser
estudiado
Deben ser funcionalmente homólogos en cada organismo
(función idéntica)
Poderse alinear apropiadamente las dos moléculas para
identificar regiones homologas y variaciones en la secuencia
Cambiar a una velocidad proporcional a la distancia
filogenética. (cuanto mayor sea ésta menor será la velocidad de cambio).
MOLÉCULAS EVALUADAS COMO CRONÓMETROS MOLECULARES Varios citocromos Proteínas de hierro y azufre como las ferredoxinas Otras proteínas RNAs ribosómicos* ATPasa* *Los mejores
RNAS RIBOSÓMICOS COMO CRONÓMETROS EVOLUTIVOS
ESTRUCTURA DEL RIBOSOMA 3 moléculas de RNA ribosómico Procariontes 5S, 16S, 23S
Tanto el 16S como el 23S tienes secuencias que pueden ser
utilizadas como cronómetros moleculares.
El 16S es más manejable experimentalmente, se ha usado
más
(16S procariontes, 18S eucariontes; provienen de la subunidad pequeña ribosomal).
PROYECTO BASE DE DATOS DEL RIBOSOMA Tiene 24000 secuencias alineadas
16000 16S
8000 18S http://rdp.cme.msu.edu/
Alineamiento y anรกlisis de secuencias
Cรกlculo de la distancia evolutiva
Ă rbol filogenĂŠtico
1 3 . 0 8 0 . 0
3 2 . 0
0.08 0.15 0.29
Secuencias exclusivas de una comunidad (rúbrica o signatura) Frecuencia en: Secuencia
posición
rúbrica
aprox
CACYYG
Archaea
Bacteria
Eukaria
315
0
>95
0
AAACUCAAA
910
3
100
0
AAACUUAAAG
910
100
0
100
YUYAAUUG
960
100
<1
100
CAACCYYCR
1110
0
>95
0
UCCCUG
1380
>95
0
100
UACACACCG
1400
0
>99
100
CACACACCG
1400
100
0
0