INHOUDSOPGAVE
1
INLEIDING.................................................................................................................................11
1.1
DEFINIËRING MICROBIOLOGIE .....................................................................................11
1.2
INDELING VAN DE ORGANISMEN .................................................................................12
1.2.1
DE MEERCELLIGE ORGANISMEN ....................................................................................12
1.2.2
DE ÉÉNCELLIGE ORGANISMEN .......................................................................................13
1.2.2.1 De bacteriën ..............................................................................................................13 1.2.2.2 De gisten ....................................................................................................................13 1.2.2.3 De protozoa ...............................................................................................................13 1.2.3 1.3
DE VIRUSSEN ..................................................................................................................13
HET BELANG VAN MICRO-ORGANISMEN ..................................................................14
1.3.1
NEGATIEVE ROL ..............................................................................................................14
1.3.2
POSITIEVE ROL ...............................................................................................................14
2
DE BACTERIE ..........................................................................................................................16
2.1
DOELSTELLINGEN VAN DIT HOOFDSTUK .................................................................16
2.2
VRAGEN VOOR ZELFEVALUATIE .................................................................................16
2.3
DE STRUCTUUR VAN DE BACTERIE............................................................................16
2.3.1
DE BACTERIËLE WAND OF PEPTIDOGLYCAAN OF CELWAND .........................................17
2.3.1.1 Bouw van de bacteriêle wand of peptidoglycaan of celwand ............................17 2.3.1.2 Belang van de bacteriële celwand .........................................................................18 2.3.2
DE CELMEMBRAAN..........................................................................................................19
2.3.3
HET CYTOPLASMA ..........................................................................................................20
2.3.4
PLASMIDEN .....................................................................................................................20
2.3.5
HET KERNMATERIAAL OF DNA ......................................................................................21
2.4
DE INDELING VAN DE BACTERIËN ..............................................................................21
2.4.1
INDELING NAAR VORM ....................................................................................................21
2.4.2
INDELING NAAR BEWEEGLIJKHEID..................................................................................21
2.4.3
INDELDING IN FUNCTIE VAN DE GRAM-KLEURING .........................................................21
2.4.4
INDELING NAAR ZUURSTOFGEBRUIK ..............................................................................21
2.4.4.1 OBLIGAAT AEROBEN ............................................................................................21 2.4.4.2 FACULTATIEF AEROBEN-ANAEROBEN ...........................................................21 2.4.4.3 OBLIGAAT ANAEROBEN .......................................................................................22 2.5
DE RELATIE GASTHEER-BACTERIE ............................................................................22
2.5.1
COMMENSALISME ...........................................................................................................22
2.5.2
PARASITISME ..................................................................................................................22
2.5.3 3
SAPROFITISME ................................................................................................................22
BESMETTINGSLEER .............................................................................................................23
3.1
DOELSTELLINGEN VAN DIT HOOFDSTUK .................................................................23
3.2
VRAGEN VOOR ZELFEVALUATIE .................................................................................23
3.3
EVOLUTIE VAN DE INFECTIEHAARD ...........................................................................23
3.3.1
DE VIRULENTIE................................................................................................................24
3.3.1.1 Het kapsel ..................................................................................................................24 3.3.1.2 Toxines .......................................................................................................................24 3.3.1.3 Vermenigvuldigingskracht .......................................................................................25 3.3.1.4 Endosporenvorming .................................................................................................26 3.3.1.5 Fimbriae .....................................................................................................................26 3.3.1.6 Flagel ..........................................................................................................................26 3.3.2
HET AANTAL BACTERIËN IN DE INFECTIEHAARD ............................................................27
3.3.3
DE BESMETTINGSWEG....................................................................................................27
3.3.4
DE IMMUNITEIT VAN DE PATIËNT ....................................................................................27
3.3.5
DE WEERSTAND VAN DE PATIËNT ..................................................................................28
3.4
VERDEDIGINGSMECHANISMEN VAN DE GASTHEER.............................................28
3.4.1
BARRIÈRES .....................................................................................................................28
3.4.1.1 De huid .......................................................................................................................28 3.4.1.2 Neus en farynx ..........................................................................................................29 3.4.1.3 De mond.....................................................................................................................29 3.4.1.4 De luchtwegen ..........................................................................................................29 3.4.1.5 Het maag-darmstelsel ..............................................................................................29 3.4.1.6 Het urinair stelsel ......................................................................................................30 3.4.1.7 De vrouwelijke genitale tractus...............................................................................30 3.4.2
VERDEDIGINGSMECHANISMEN TEGEN BINNENGEDRONGEN MICRO-ORGANISMEN.....31
3.4.2.1 ASPECIFIEKE FACTOREN....................................................................................31 3.4.2.2 SPECIFIEKE FACTOREN ......................................................................................31 3.4.3
ANDERE VERDEDIGINGSMECHANISMEN ........................................................................32
3.4.3.1 Filtersystemen ...........................................................................................................32 3.4.3.2 Interferon....................................................................................................................32 4
DIAGNOSTIEK EN BEHANDELING ....................................................................................33
4.1
DOELSTELLINGEN VAN DIT HOOFDSTUK .................................................................33
4.2
VRAGEN VOOR ZELFEVALUATIE .................................................................................33
4.3
MICROBIOLOGISCHE TECHNIEKEN ............................................................................34
4.3.1
HET MICROBIOLOGISCH ONDERZOEK ............................................................................34
4.3.1.1 De Gram-kleuring .....................................................................................................34 4.3.1.2 De Ziehl-Neelsen-kleuring.......................................................................................35 4.3.2
DE CULTUUR ...................................................................................................................35
4.3.2.1 Algemeen principe ....................................................................................................35 4.3.2.2 De hemocultuur.........................................................................................................36 4.3.2.3 De urinecultuur ..........................................................................................................36 4.3.2.4 De sputumcultuur .....................................................................................................37 4.3.2.5 De cultuur van cerebrospinaal vocht .....................................................................38 4.4
ANTIBIOTICA .......................................................................................................................38
4.4.1
SPECIFIEKE EIGENSCHAPPEN VAN ANTIBIOTICA ...........................................................38
4.4.1.1 Selectiviteit.................................................................................................................38 4.4.1.2 Het spectrum .............................................................................................................38 4.4.1.3 De bacteriële gevoeligheid ......................................................................................39 4.4.2
WERKINGSMECHANISMEN VAN ANTIBIOTICA .................................................................41
4.4.3
DE KEUZE VAN HET ANTIBIOTICUM.................................................................................42
4.4.4
MISBRUIK VAN ANTIBIOTICA ...........................................................................................42
4.4.4.1 Misbruiken .................................................................................................................42 4.4.4.2 Gevolgen....................................................................................................................42 4.4.5
RESISTENTIE ...................................................................................................................43
4.4.5.1 Natuurlijke resistentie...............................................................................................43 4.4.5.2 Verworven resistentie ..............................................................................................43 5
SYSTEMATIEK VAN BACTERIËN ......................................................................................46
5.1
DOELSTELLINGEN VAN DIT HOOFDSTUK .................................................................46
5.2
VRAGEN VOOR ZELFEVALUATIE .................................................................................46
5.3
GRAM-POSITIEVE KOKKEN ............................................................................................47
5.3.1
STAFYLOKOKKEN ............................................................................................................47
5.3.1.1 Staphylococcus aureus ...........................................................................................48 5.3.1.2 Staphylococcus epidermidis ...................................................................................49 5.3.1.3 Staphylococcus saprophyticus ...............................................................................49 5.3.2
STREPTOKOKKEN ...........................................................................................................49
5.3.2.1 Streptococcus pyogenes .........................................................................................50 5.3.2.2 Streptococcus agalactiae ........................................................................................50 5.3.2.3 Streptococcus pneumoniae of pneumokok ..........................................................51 5.3.2.4 Viridans mondstreptokokken ..................................................................................51 5.3.2.5 Enterokokken ............................................................................................................51 5.4
GRAM-POSITIEVE BACILLEN .........................................................................................52
5.4.1
BACILLUS ........................................................................................................................52
5.4.1.1 Bacillus anthracis ......................................................................................................52 5.4.1.2 Bacillus cereus ..........................................................................................................53 5.4.2
CLOSTRIDIUM SPP. .........................................................................................................53
5.4.2.1 Clostridium botulinum ..............................................................................................53 5.4.2.2 Clostridium difficile ...................................................................................................54
5.4.2.3 Clostridium perfringens ............................................................................................54 5.4.2.4 Clostridium tetani ......................................................................................................55 5.4.3
MYCOBACTERIA ..............................................................................................................56
5.4.3.1 Mycobacterium tuberculosis of de Bacil van Koch (BK) .....................................56 5.4.3.2 Mycobacterium leprae .............................................................................................57 5.4.4
LISTERIA MONOCYTOGENES ..........................................................................................57
5.4.5
CORYNEBACTERIUM DIFTERIAE .....................................................................................58
5.4.6
LACTOBACILLUS ACIDOPHILUS .......................................................................................58
5.4.7
BIFIDOBACTERIUM ..........................................................................................................59
5.5
GRAM-NEGATIEVE KOKKEN ..........................................................................................60
5.5.1
NEISSERIA GONORRHOEAE OF GONOKOK .....................................................................60
5.5.2
NEISSERIA MENINGITIDIS OF MENINGOKOK ...................................................................60
5.5.3
MORAXELLA CATHARRALIS ............................................................................................61
5.6
GRAM-NEGATIEVE COCCOBACILLEN ........................................................................61
5.6.1
BRUCELLA .......................................................................................................................61
5.6.2
BORDETELLA PERTUSSIS ...............................................................................................62
5.7
GRAM-NEGATIEVE BACILLEN .......................................................................................63
5.7.1
ENTEROBACTERIACEAE .................................................................................................63
5.7.1.1 Coliformen .................................................................................................................63 5.7.1.2 NIET – COLIFORMEN.............................................................................................65 5.7.2
NIET-ENTEROBACTERIACEAE ........................................................................................67
5.7.2.1 Haemophilus .............................................................................................................67 5.7.2.2 Pseudomonas aeruginosa ......................................................................................68 5.7.2.3 Bacteroïdes ...............................................................................................................69 5.7.2.4 Legionella...................................................................................................................69 5.8
GRAM-NEGATIEVE KOMMAVORMIGEN ......................................................................69
5.8.1
CAMPYLOBACTER JEJUNI EN COLI .................................................................................69
5.8.2
VIBRIO CHOLERAE ..........................................................................................................69
5.9
GRAM-NEGATIEVE SCHROEFVORMIGEN ..................................................................70
5.9.1
SPIROCHAETALES ...........................................................................................................70
5.9.1.1 Treponema pallidum ................................................................................................70 5.9.1.2 Borrelia burgdorferi...................................................................................................71 5.9.1.3 Leptospira ..................................................................................................................71 5.9.2 5.10
HELICOBACTER PYLORI ..................................................................................................71
ATYPISCHE BACTERIËN .................................................................................................72
5.10.1
MYCOPLASMA PNEUMONIAE ..........................................................................................72
5.10.2
CHLAMYDIA .....................................................................................................................72
5.10.2.1
Chlamydia psittaci ................................................................................................72
5.10.2.2
Chlamydia trachomatis ........................................................................................73
5.10.2.3 6
Chlamydia pneumoniae .......................................................................................73
ALGEMENE VIROLOGIE .......................................................................................................74
6.1
DOELSTELLINGEN VAN DIT HOOFDSTUK .................................................................74
6.2
VRAGEN VOOR ZELFEVALUATIE .................................................................................74
6.3
SAMENSTELLING EN MORFOLOGIE VAN HET VIRUS ............................................75
6.4
VERSCHILLEN TUSSEN VIRUSSEN EN BACTERIËN ...............................................77
6.5
VERMENIGVULDIGING VAN VIRUSSEN ......................................................................78
6.5.1
ADSORPTIE, PENETRATIE EN ONTMANTELING...............................................................78
6.5.2
VERMENIGVULDIGING VAN DNA-VIRUSSEN ..................................................................78
6.5.2.1 De vroege periode ....................................................................................................78 6.5.2.2 De late periode ..........................................................................................................79 6.5.3
VERMENIGVULDIGING VAN RNA-VIRUSSEN ..................................................................79
6.5.4
VERMENIGVULDIGING VAN BACTERIOFAGEN ................................................................80
6.6
INVLOED VAN FYSISCHE EN CHEMISCHE FACTOREN .........................................81
6.6.1
TEMPERATUUR ...............................................................................................................81
6.6.2
ZUURTEGRAAD ...............................................................................................................81
6.6.3
STRALINGEN ...................................................................................................................81
6.6.4
CHEMISCHE FACTOREN ..................................................................................................82
6.7
MICROBIOLOGISCHE TECHNIEKEN ............................................................................82
6.7.1
MICROSCOPISCH ONDERZOEK .......................................................................................82
6.7.2
DE CULTUUR OF KWEEK .................................................................................................82
6.7.2.1 Proefdieren ................................................................................................................82 6.7.2.2 Bebroede kippeneieren of kippenembryo’s ..........................................................82 6.7.2.3 Cel- en weefselculturen ...........................................................................................82 6.7.3
ANTIGEENDETECTIE .......................................................................................................83
6.7.4
MOLECULAIRE TECHNIEKEN ...........................................................................................83
6.8 7
INDELING VAN VIRUSSEN...............................................................................................83 BESPREKING VAN ENKELE VIRUSSEN ..........................................................................85
7.1
DOELSTELLINGEN VAN DIT HOOFDSTUK .................................................................85
7.2
VRAGEN VOOR ZELFEVALUATIE .................................................................................85
7.3
PAPOVAVIRIDAE ................................................................................................................85
7.3.1 7.4
HUMAAN PAPILLOMA VIRUS ............................................................................................85
DE HERPESVIRIDAE .........................................................................................................87
7.4.1
HERPES SIMPLEX VIRUS .................................................................................................87
7.4.1.1 Type 1.........................................................................................................................87 7.4.1.2 Type 2.........................................................................................................................87 7.4.2
HET HERPES ZOSTER-VARICELLA VIRUS .......................................................................87
7.4.3
HET CYTOMEGALIEVIRUS (CMV) ...................................................................................87
7.4.4
HET EPSTEIN-BARR VIRUS (EBV) .................................................................................88
7.5
POXVIRIDAE OF POKKENVIRUSSEN ...........................................................................88
7.5.1
VARIOLA ..........................................................................................................................88
7.5.2
VACCINIA .........................................................................................................................88
7.6
VIRALE HEPATITIS ............................................................................................................88
7.6.1
HEPATITIS A ....................................................................................................................88
7.6.2
HEPATITIS B ....................................................................................................................89
7.6.3
HEPATITIS C....................................................................................................................89
7.6.4
HEPATITIS D....................................................................................................................89
7.6.5
HEPATITIS E ....................................................................................................................89
7.7
PICORNAVIRIDAE ..............................................................................................................90
7.7.1
DE ENTEROVIRIDAE ........................................................................................................90
7.7.1.1 Het poliovirus.............................................................................................................90 7.7.1.2 De coxsackie A- en B-virussen ..............................................................................90 7.7.2 7.8
DE RHINOVIRIDAE ...........................................................................................................90
DE PARAMYXOVIRIDAE ...................................................................................................90
7.8.1
HET MAZELENVIRUS .......................................................................................................90
7.8.2
HET BOFVIRUS ................................................................................................................91
7.9
DE ORTHOMYXOVIRIDAE ................................................................................................91
7.10
RETROVIRIDAE...................................................................................................................92
7.11
CALICIDAEVIRIDAE ...........................................................................................................93
7.11.1 7.12
REOVIRIDAE ........................................................................................................................94
7.12.1 8
NORWALKVIRUS ..............................................................................................................93 ROTAVIRUS .....................................................................................................................94
PRIONEN ..................................................................................................................................95
8.1
DOELSTELLINGEN VAN DIT HOOFDSTUK .................................................................95
8.2
VRAGEN VOOR ZELFEVALUATIE .................................................................................95
8.3
NAAMGEVING .....................................................................................................................95
8.4
STRUCTUUR ........................................................................................................................96
8.5
CLASSIFICATIE...................................................................................................................96
8.6
WERKINGSMECHANISME ...............................................................................................96
8.7
OVERDRAAGBAARHEID ..................................................................................................97
8.7.1
FAMILIAAL........................................................................................................................98
8.7.2
INFECTIEUS .....................................................................................................................98
8.7.3
VERTICAAL ......................................................................................................................98
8.7.4
EXPERIMENTEEL .............................................................................................................98
8.8
PATHOGENESE ..................................................................................................................98
8.9
ZIEKTEBEELD .....................................................................................................................99
8.10
BEHANDELING .................................................................................................................100
8.10.1
PREVENTIE ....................................................................................................................100
8.10.2 9
TOEKOMSTPERSPECTIEVEN.........................................................................................100
BRONNEN...............................................................................................................................101