Dr. Δημήτριος Αντωνίου, Χειρουργός, PhD(Hon), FRCS
H Μοριακή Βιολογία των Μεταλλάξεων του SARSCoV-2
ΑΘΗΝΑ 2022
ΔΙΑΘΕΣΗ ΤΟΥ ΒΙΒΛΙΟΥ Το βιβλίο διατίθεται αποκλειστικά από τον συγγραφέα ΜΑΖΙ με το ήδη κυκλοφορούν, δεδομένου ότι και τα δύο αποτελούν ενιαίο σύνολο. Το κόστος των βιβλίων είναι 25+25 ευρώ και σας αποστέλλονται με αντικαταβολή, το κόστος της οποίας προστίθεται στην παραπάνω τιμή. Οι παραγγελίες σας γίνονται εδώ: Δημ. Αντωνίου, ιατρός, Δημ. Βώκου 6, Χαλκίδα ΤΚ 34132 τηλ. 693 93 64 918 και dr.dim.antoniou@gmail.com
ΠΕΡΙΕΧΟΜΕΝΑ 1) Οι Επιστολές μου στον Πρωθυπουργό τον από την έναρξη των εμβολιασμών, για τον κίνδυνο εμφάνισης μεταλλάξεων λόγω των εμβολίων…………………………………………………………………………….σελ …3-5 2) Στοιχεία κυτταρικής λειτουργίας………………………………………………….6-8 3) Η Χημική Δομή και Λειτουργία των DNA, RNA μορίων. «Μεταγραφή» και «Μετάφραση» των DNA-RNA. Παραγωγή Πρωτεϊνών………………σελ……9-25 4) Γενικά περί Μεταλλάξεων δια του Μηχανισμού Template Switching Recombination στην διαδικασία DNA-repair………………………………σελ. 26-38 5) ΟΙ IOI: Είδη, Χημική δομή και δράση των (DNA, RNA Ioί, Ρετροϊοί, Reverse Transcription, mRNA Kορονοϊοί………………………………………………σελ.39-50 6) SARS-CoV-2 m RNA κορονοϊός και η δράση του στον άνθρωπο….σελ.51-58 7) Η Πρωτεΐνη Spike (S-protein) του SARS-CoV-2 κορονοΪού….σελ……59-70 8) Ο Γενετικός Ανασυνδυασμός των Ιών δια Template Switching ως μηχανισμός Μετάλλαξής των. Είδη ανασυνδυασμού: Γαμικός και μη-γαμικός (DNA-RNA repair)…………………………………………………………………………..σελ…71-82 9) Non-homologous end joining (NHEJ) and homologous recombination (HR) DNA-REPAIR σε Ανθρώπινα και Ιικά κύτταρα…………………………………σελ.83-86 10) V(D)J recombination σε Ανθρώπινα Ανοσολογικά κύτταρα….σελ.87-88 11) ΜΕΤΑΛΛΑΚΤΙΚΟΣ ΑΝΑΣΥΝΔΥΑΣΜΟΣ (TEMPLATE SWITCHING) ΣΤΟΝ SARSCoV-2………………………………………………………………………………………..σελ.89-93 12) Το αρχικό στέλεχος Wuhan-1 του SARS-CoV-2. Η μοριακή δομή το………………………………………………………………………………………………σελ.94-96 13) Το Alpha στέλεχος (variant) του SARS-CoV-2…………………σελ.97-100 14) Το Βetta στέλεχος (variant) του SARS-CoV-2…………………σελ.101-103 15) ο Gamma στέλεχος (variant) του SARS-CoV-2…………………σελ.104-107 16) ο Delta στέλεχος (variant) του SARS-CoV-2……………………….σελ.108-110 17) Το Omicron στέλεχος (variant) του SARS-CoV-2…………………σελ.111-128 18) Βιβλιογραφία…………………………………………………………………….σελ.129 19) Ο Εξελικτικός προσαρμοστικός ρόλος των μεταλλάξεων κατά τον Charles Darwin. Παραδείγματα……………………………………………………………σελ.130-7 20) ΠΩΣ ΔΗΜΙΟΥΡΓΟΥΝ ΤΙΣ ΜΕΤΑΛΛΑΞΕΙΣ ΤΟΥ SARS-CoV-2 TA mRNA ΕΜΒΟΛΙΑ?.............................................................................σελ.138-146 21) OI VECTOR IOI KAI H ΓΕΝΕΤΙΚΗ ΘΕΡΑΠΕΙΑ………………….σελ.147-154 22) μηχανισμός «γενετικής θεραπείας» δια του tracrRNA…..σελ.155-157 ΠΑΡΑΡΤΗΜΑ Η χρήση των ανθρώπινων εμβρυϊκών κυττάρων (ΗΕK-293 και PER.C6 TetR Cell Lines) στην Παρασκευή των εμβολίων Astra Zeneca και Johnson & Johnson, αντίστοιχα. Ένα μοναδικό ιστορικό ντοκουμέντο……………………….σελ.
ΠΡΟΛΟΓΟΣ Από τον Ιανουάριο μέχρι τον Μάρτιο του 2021 έστειλα τρείς επιστολές στον Πρωθυπουργό κι όλες τις αρμόδιες Ελληνικές Αρχές , προειδοποιώντας τους ότι η-εν μέσω πανδημίας- έναρξη των εμβολιασμών στην Ελλάδα, με τα εμβόλια κατά του αρχικού στελέχους Wuhan-1 του SARS-CoV-2 από τις αρχές Ιανουαρίου 2021, θα προκαλέσει την εμφάνιση ανθεκτικών στα εμβόλια μεταλλάξεων του αρχικού στελέχους Wuhan-1 του SARS-CoV-2. Φυσικά αγνοήθηκα, με αποτέλεσμα, την ταχυτάτη και ραγδαία εμφάνιση των διαδοχικών μεταλλάξεων Αlpha, Beta, Gamma, Delta και Omicron, μεταλλάξεων, προϊούσας αυξημένης νοσηρότητας και μολυσματικότητας. Μια αναδρομική εκτίμηση της κατάστασης αυτής, αποκαλύπτει ότι, ενώ το, χωρίς εμβολιασμούς 2020, είχαμε καταγεγραμμένα μόνο 150.000 κρούσματα και 4.500 θανάτους από τον SARS-CoV-2, στο τέλος του έτους 2021, με πλήρως εμβολιασμένο το 75% του ελληνικού πληθυσμού, είχαμε 1.500.000 κρούσματα και 23.000 θανάτους!, ενώ οι παρενέργειες αυτοτελώς κι αποκλειστικά από τα εμβόλια, είναι αμέτρητες και σε κάθε περίπτωση, δολίως ακαταχώρητες. Ταυτόχρονα, από την 27-01-2021, ημέρα δημοσίευσης της πρώτης σχετικής μελέτης από τα Πανεπιστήμια Rockefeller και Bethesda των ΗΠΑ, μέχρι και το καλοκαίρι του ιδίου έτους, δημοσιεύτηκαν 100άδες μελέτες, όλες των οποίων πιστοποιούσαν στατιστικά-επιδημιολογικά, αλλά και με in vitro μελέτες, ότι ο ορός των εμβολιασμένων ή των ληψάντων θεραπευτικά μονοκλωνικά αντισώματα κατά του φυσικού Wuhan-1 SARSCoV-2, ο οποίος (ορός) περιείχε κυρίως «δεσμευτικά» αντισώματα κατά της πρωτεΐνης S του φυσικού ιού ή των εμβολίων, αντί να «εξουδετερώνει» ή «δεσμεύει» τον φυσικό κορονοϊό Wuhan-1 SARS-CoV-2, τον μετάλλασε στα εκάστοτε επικρατούντα μεταλλαγμένα στελέχη του!, ενώ ταυτόχρονα οι εμβολιασμένοι έφεραν πολλαπλάσιο ιικό φορτίο μεταλλάξεων αυτού των μηεμβολιασμένων!. Όλα τα επιστημονικά αυτά αδιαμφισβήτητα δεδομένα κατέληγαν ευθέως στο συμπέρασμα ότι οι συγκεκριμένοι εμβολιασμοί με τα mRNA εμβόλια, είναι οι μοναδικές αιτίες πρόκλησης των – εξ’ ορισμούανθεκτικών στα εμβόλια αυτά μεταλλάξεων! με προοδευτικά αυξανόμενη νοσηρότητα και μεταδοτικότητα, οι οποίες προστιθέμενες στις αυτοτελείς παρενέργειες των εμβολίων, ήταν υπεύθυνες για τις καθημερινές εκατόμβες των νεκρών στην Ελλάδα (κι αναλογικά και σε όλες τις χώρες της Γής) κι εξηγούσαν το «παράξενο» γεγονός της ραγδαίας αύξησης των νοσούντων και νεκρών παγκοσμίως από τον SARS-CoV-2, σε εκθετική συνάρτηση με την αύξηση των εμβολιασμών! Στο παρόν βιβλίο, περιγράφονται «διδακτικά», ο μοριακός μηχανισμός Template-Switching Recombination στα πλαίσια των μοριακών μηχανισμών Non-homologous end joining (NHEJ) and Ηomologous recombination (HR) DNA-repair (και V(D)J) εμφάνισης όλων των μορφών,
γαμικών και μη-, μεταλλάξεων στους ιούς και ιδιαίτερα αυτών του SARS-CoV2, καθώς και η συγκριτική μοριακή δομή και σύσταση όλων των μέχρι τούδε εμφανισθέντων μεταλλάξεων του SARS-CoV-2., ως μια ιστορική καταχώρηση ενός ασύλληπτου επιστημονικού εγκλήματος κατά της Ανθρωπότητας, διαπραττομένου υπό των «Ιατρών» και «πολιτικών» Στο παράρτημα του βιβλίου περιλαμβάνεται η αυθεντική ένορκη κατάθεση την 16-05-2001 στον FDA των ΗΠΑ Professor Alex van der Eb του Πανεπιστημίου του Leiden της Ολλανδίας ο οποίος, μαζί με τον μεταπτυχιακό ερευνητή Frank Graham, στο εργαστήριο του πρώτου, ανέπτυξαν το 1973 την κυτταρική σειρά ΗΕK-293 από εμβρυϊκά νεφρικά κύτταρα εκτρωτικού ανθρώπινου εμβρύου το έτος 1972, πάνω στην οποία (σειρά) αναπτύχθηκε το 2020 το αντι-SARS-CoV-2 εμβόλιο της Astra Zeneca (ChAdOX1-S, recombinant). Αντίστοιχα, το αντι-SARS-CoV-2 εμβόλιο της Johnsons & Johnson (Αd26, Cov2-S, recombinant), παρήχθη το 2020 πάνω στην κυτταρική σειρά PER.C6 TetR Cell Line, από ανθρώπινα εμβρυϊκά κύτταρα αμφιβληστροειδούς χιτώνα το 1995! ενός εκτρωτικού εμβρύου 18 εβδομάδων του έτους 1985, επίσης στο εργαστήριο του Alex van der Eb. Αμφότερες οι κυτταρικές αυτές σειρές, είχαν «αθανατοποιηθεί» με την επιμόλυνσή των εμβρυϊκών κυττάρων (με recombinant DNA technology) με τον DNA αδενοϊό οροτύπου 5. Τέλος, ως ιοί-φορείς (virus vectors) του mRNA του SARS-CoV-2 στα εμβόλια αυτά, χρησιμοποιήθηκαν οι αδενοϊοί ChAdOX1 (Χιμπατζή) (Astra Zeneca) και οροτύπου 26 (Johnsons & Johnson) αντίστοιχα.
αυτο-διπλασιασμού του, παραγομένων έτσι 23Χ2=46 χρωματοσωμάτων (στα γαμετικά κύτταρα) ή 46Χ2=92 μορίων DNA (στα σωματικά κύτταρα), κατά την διάρκεια της διαίρεσης του κυττάρου «γονέα» («μίτωσης») σε δύο θυγατρικά του, έκαστον των οποίων περιλαμβάνει τελικά 23 «μονήρη» ή «διπλά» χρωματοσώματα αντίστοιχα. (*) ευκαρυωτικά είναι τα υψηλής λειτουργικής πολυπλοκότητας, διαφοροποίησης κι εξέλιξης κύτταρα, όπως του ανθρώπου, ζώων, φυτών και μυκήτων (τα οποία λέγονται και «πρώτιστα»).
Εικόνα 4. Η διαίρεση του κυττάρου. O ρυθμός διαίρεσης του κυττάρου κι ο συνοδός διπλασιασμός του DNA του, καθώς κι ο τελικός αριθμός των νέων κυττάρων, αυτό-ρυθμίζονται με τις ορμόνες «χαλόνες» που τα ίδια παράγουν, ώστε ο πληθυσμός των νέων «θυγατέρων» κυττάρων να βρίσκεται σε ισορροπία με τους θανάτους των «γηρασμένων»
Εικόνα 11. Η «αντικατοπτρική» μεταγραφή (transcription) του RNA στον πυρήνα του ανθρώπινου κυττάρου, με πρότυπο (καλούπι) το DNA αυτού, δια του ενζύμου DNA-dependent RNA-polymerase. Το «template strade» της εικόνας είναι ένα τμήμα του DNA.
κυττάρων εκάστου ιστού κι οργάνου. Η ισορροπία αυτή χάνεται, όταν το DNA έχει «μεταλλαχθεί» δηλ. έχει αλλάξει η χημική σύσταση και λειτουργία των φυσιολογικών «γονιδίων» του (*), είτε από εξωτερική ακτινοβολία, είτε από εσωτερικούς και εν πολλοίς αγνώστους παράγοντες, όπως συμβαίνει στα μεταλλαγμένα «ογκογονίδια των καρκινικών κυττάρων». Το κύτταρο, με το μεταλλαγμένο DNA, είτε πεθαίνει, είτε υπερ-πολλαπλασιάζεται ανώμαλα εις βάρος των φυσιολογικών, όπως στον καρκίνο. (*) γονίδια είναι τμήματα του DNA, τα οποία «κωδικοποιούν» για μια ορισμένη πρωτεΐνη, η οποία προσδίδει στο συγκεκριμένο όν ένα συγκεκριμένο εξωτερικό μορφο-λειτουργικό χαρακτηριστικό (βλ. παρακάτω).
Εικόνα 5. Αυτοδιπλασιασμός του DNA και του κυττάρου (διαίρεση του κυττάρου): Η διπλή έλικα του «γονεϊκού» DNA διασπάται με τα ένζυμα helicase and topo¬iso¬merase, παραγομένων δύο μονής έλικας ημι-DNA. Το ένα ημιDNA συμπληρώνεται στο πλήρες διπλής έλικας «DNA leading strand» αντίγραφο, δια του ενζύμου DNA polymerase. Μια άλλη DNA polymerase συνδέεται με το έτερον (μονής έλικας) ημι-DNA, παράγουσα χωριστά DNA τμήματα (λεγόμενα Okazaki fragments), τα οποία συνδέονται μεταξύ των σε πλήρες διπλής έλικας DNA με το ένζυμο ligase.
Η «αντικατοπτρική» μεταγραφή (transcription) του RNA στον πυρήνα του ανθρώπινου κυττάρου, με πρότυπο (καλούπι) το DNA αυτού, δια του ενζύμου DNA-dependent RNA-polymerase.
H αναπαραγωγή του m RNA των ιών, γίνεται δια του ιικού ενζύμου RNAdependent RNA polymerases (RdRp), το οποίο χρησιμοποιεί το ιικό mRNA ως πρότυπο «καλούπι» (template) για την αυτό-αντιγραφή του.
Holiday Junction είναι ένα σημείο χωρικής διευθέτησης 4 «διπλής έλικας» ζεθγών («βραχίονες») DNA ή RNA. Ο σχηματισμός αυτός είναι ένα κρίσιμο στάδιο στην διαδικασία επιδιόρθωσης δια του ανασυνδυασμού «επδιόρθωσης» βλαβέντων DNA ή RNA (DNA repair recpmbination).
TEMPLATE SWITCHING RECOMBINATION
Post-replication repair pathways that operate in gap-filling. Α. Απεικονίζεται ο επιδιορθωτικός ανασυνδυασμός ενός ρηγέντος DNA, δια την συμμετοχής των RecFOR, RecA, ssDNA, RuvABC και Holiday junction. Η «αδελφική» μονή έλικα DNA, προέρχεται από τον διπλασιασμό της ομόλογης ακέραιας (uγιούς) έλικας του βλαβέντος DNA: Homologous recombination is initiated by RecFOR promoted RecA binding to ssDNA gaps. The RecA filament on ssDNA signals induction of the SOS DNA damage response and initiates strand invasion of the gap with the duplex DNA of the sister chromosome. Resolution of a double Holliday junction by RuvABC restores an intact chromosome. B. Mηχανισμός DNA «επιδιόρθωσης» δια template switching recombination. Translesion synthesis involving the exchange of Pol II, IV or V for the replicative Pol III polymerase can fill gaps, especially those caused by template lesions. C. A cross-fork template switch pathway can provide an alternative template for nascent strands. Due to mispairing of nascent strands in the annealing step, this pathway can lead to RecA-independent rearrangements between tandem direct repeats. This mechanism can also lead to crossovers between sister chromosome (see Fig. 3). https://europepmc.org/article/PMC/5538584 Template Switching by RNA Polymerase II In Vivo: Evidence and Implications from a Retroviral System Abstract
Transfection of retrovirus packaging cells with linear DNA from a retroviral vector missing the 3′ long terminal repeat (3′ LTR) results in production of infectious virus. Analysis of the newly formed proviruses indicates that restoration of the 3′ LTR sequences necessary for reverse transcription and integration occurred due to endto-end template switching by mammalian RNA polymerase II (RNAP II) in the packaging cells. These observations argue that RNAP II can utilize double-strand breaks and gaps in DNA to generate “recombinant” transcripts in vivo and suggest a mechanism for mutation and recombination of retroviruses (βλ. εικόνες …στις επόμενες σελίδες).
Template Switching by RNA Polymerase II In Vivo: Evidence and Implications from a Retroviral System
Figure 1. Experimental Scheme for Detecting the Hybrid Transcripts In Vivo
Figure 2. Analysis of Recombinant Proviruses
Figure 3. Control for the A2 Template Ligation in the Packaging Cells
Figure 4. Testing the Role of the LTR Promoter in the Switch-Over Product Formation
και το mRNA του ιού μαζί με το περίβλημά του και τελικά πολλοί πλήρεις ιοί, που βγαίνουν από το κύτταρο του ξενιστή και επιμολύνουν κι άλλα κύτταρα αυτού, με τον κύκλο αυτό να αυτό-αναπαράγεται. Με την έννοια αυτή, το κύτταρα κι ο οργανισμός εν γένει του ξενιστή, είναι μια «ανθρώπινη χίμαιρα» δεδομένου ότι αποτελείται από δύο- γενετικά- ξένα μεταξύ του DNA και RNAs.
Εικόνα 16. Η δράση των Ρετροϊών στα ανθρώπινα κύτταρα του ξενιστή των.
Εικόνα 17. Η «αντίστροφη μεταγραφή» (reverse transcription) του RNA ιού HIV του AIDS. To RNA του ιού «μεταγράφεται» στο αντικατοπτρικό του DNA κι αυτό
Mechanism of reverse transcription in HIV. Step numbers will not match up.
Εικόνα 5. Το πλήρες mRNA του SARS-CoV-2 κορονοϊού, αποτελούμενο από τα τμήματα (αντιστοιχούντα σε αντίστοιχες περιοχές του 5μελούς πρωτεϊνικού του περιβλήματος), ORF1a, ORF1b, S (spike), E, M,N και τα δύο αντίθετα άκρα του 5`-UTR και 3`-UTR. Taxonomy: Group IV ((+)single-stranded RNA, ssRNA); Coronviridae; Coronavirinae; Betacoronavirus; Sarbecovirus; Severe Acut Respiratory Cornavirus 2 (SARS-CoV-2) Virion: Enveloped, spherical, 60 to 140 nm in diameter with 9 to 12 nm spikes Genome: ~ 30 kb positive-sense, ssRNA RNA Transcript: 5’-cap, 3’-poly-A tail Proteome: 10 proteins Transmission: Links to seafood and animal market cases suggest animal-tohuman transmission. Sustained human-to-human transmission observed in later cases. Phylogeny: Closely related to bat-SL-CoVZC45 and bat-SL-CoVZX21. Reference Genome: GenBank: MN908947; PMID: 31978945; CDC-2019-nCoV https://www.biosyn.com/tew/Structure-of-Coronavirus-nCoV-2019-2020.aspx
Σχηματική εικόνα του γονιδιώματος της πρωτεΐνης S (S1+S2) (και της ίδιας της πρωτεΐνης S) στο mRNA του SARS-CoV-2. To διαμεμβρανικό τμήμα (transmembrane domain) της S2, απεικονίζεται με χρώμα purple. Tα σημεία ενζυματικού» διαχωρισμού (cleavage sites) απεικονίζονται με τα βέλη.
Α) Σχηματική εικόνα του γονιδιώματος (mRNA) της πρωτεΐνης S (και της ίδιας της πρωτεΐνης S) στο mRNA του SARS-CoV-2 και των υποπεριοχών της S1 (NTD+RBD) και S2 (S2`+FP+HR1+CH+CD+HR2+TM+CT), όπου «FP» (fusion protein) είναι η περιοχή |αγκυροβόλησης» της S πάνω στο κύτταρο-ξενιστή. Β) Η πρωτεΐνη S και η RBD περιοχή της σε ανοιχτή (αριστερά) και κλειστή (δεξιά) διάταξη.
Απεικόνιση της μετάλλαξης Omicron του SARS-CoV-2. (A) Oι μεταλλάξεις (σε όλο το γονιδίωμα της πρωτεΐνης S (S1+S2). Στην μετάλλαξη Omicron προστίθενται στις μεταλλάξεις της περιοχής RBD της S1 της μετάλλαξης Delta και μεταλλάξεις στην περιοχή NTD της περιοχής S1, (B), (C) Οι μεταλλάξεις της Omicron πάνω στην 3ταγή δομή της πρωτεΐνης S, (D) Η περιοχή RBD της Omicron με τις μεταλλάξεις της απεικονιζόμενες ως κόκκινα σφαιρίδια.
Γαμικός πολλαπλασιαστικός ανασυνδυασμός (proliferative sexual recombination): a) Συνδυαστική επιμόλυνση του «ξενιστή» με δύο διαφορετικούς RNA ιούς (κόκκινο και μπλέ), το RNA των οποίων ανταλλάσσεται μεταξύ των δια του μηχανισμού template switching, κατά την διάρκεια του πολλαπλασιασμού των στο κύτταρο του «ξενιστή», δια του ενζύμου του «ξενιστή» RNA-dependent RNA polymerase (RdRp), b) Συνδυαστική επιμόλυνση του «ξενιστή» με δύο διαφορετικούς RNA ρετροϊούς (κόκκινο και μπλέ), οι οποίοι «ανάδρομα μεταγράφονται» (reverse transcription) (δια του ενζύμου των reverse transcriptase) σε ένα «ετερόζυγο» DNA, το οποίο ενσωματώνεται στο DNA του «ξενιστή». Στην συνέχεια, το «ετερόζυγο» αυτό ιικό DNA μεταγράφεται (δια του ενζύμου του DNAdependent transcriptase) σε μια σειρά από «ετερόζυγα» ιικά RNAs, τα οποία υφίστανται μια δεύτερη «ανάδρομη μεταγραφή», κατά την διάρκεια της οποίας επισυμβαίνει μια template switching ανταλλαγή γενετικού υλικού μεταξύ των, η οποία καταλήγει σε ένα δεύτερο «ετερόζυγο» provirus DNA, το οποίο τελικά «μεταφράζεται» κι αυτό σε τελικούς RNA ιούς, c) Reassortment. Γαμικός πολλαπλασιαστικός Ανασυνδυασμός δια της ανταλλαγής ολόκληρων
RNA τμημάτων, μεταξύ δύο (κόκκινο και μπλέ) «τμηματικών» ιών, ήτοι ιών που αποτελούνται από πολλά ξεχωριστά τμήματα RNAs. Etienne Simon-Loriere1 and Edward C. Holmes 1,2 https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC3324781/
Γαμικός πολλαπλαστιαστικός Ανασυνδυασμός μεταξύ των δύο ελίκων RNA του ιδίου ιού, ήτοι του προτύπου (template strand) και του «εμβρυϊκού (nascent strand), το οποίο σχηματίζεται δια της «μεταγραφής» του πρώτου δια του ενζύμου RdRp. Κατά την διάρκεια της «μεταγραφής» αυτής, το «εμβρυϊκό» RNA διαχωρίζεται από το πρότυπο και προσκολλάται σε ένα νέο ομόλογο RNA υπόστρωμα, συνεχίζοντας την μεταγραφή του με νέο πρότυπο το τελευταίο. Ομόλογο υπόστρωμα (homologous template) είναι το νέο υπόστρωμα, όταν έχει γενετική συγγένεια με το αρχικό πρότυπο RNA υπόστρωμα, αλλιώς λέγεται «μη-ομόλογο». https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC3324781/
Non-homologous end joining (NHEJ) and homologous recombination (HR) DNA-REPAIR σε Ανθρώπινα και Ιικά κύτταρα
Non-homologous end joining (NHEJ) and homologous recombination (HR) REPAIR in mammals during DNA double-strand break.
V(D)J recombination σε Ανθρώπινα Ανοσολογικά κύτταρα
V(D)J recombination (ο μηχανισμός αυτός συνδυάζει τις: "variable" (V)
Οι μεταλλάξεις του αρχικού Wuhan-1 SARS-CoV-2 με την μορφή ενός «φυλογενετικού δέντρου», με τις χωρικές αποστάσεις των αντιστοιχούντων στις «γενετικές των αποστάσεις» (α-συγγένειες), επιτυγχανομένου με το Nextstrain την 01-12-2021, από την by Emma Hodcroft (available at https://nextstrain.org/groups/neherlab/ncov/21K.Omicron) . Το «δέντρο» ξεκινά από το κέντρο, το οποίο απεικονίζει τις «αρχαιότερες» γενετικές ακολουθίες γονιδίων του m RNA του ιού, και οι οποίες στην
https://journals.asm.org/doi/10.1128/mBio.01188-21 Evolutionary Tracking of SARS-CoV-2 Genetic Variants Highlights an Intricate Balance of Stabilizing and Destabilizing Mutations Authors: Jobin John Jacob, https://doi.org/10.1128/mBio.01188-21
https://www.isaaa.org/kc/cropbiotechupdate/article/default.asp?ID=1830 8
Albino tiger, λόγω μιας μετάλλαξης.
Albino Λιοντάρι
Εξαίρεση του παραπάνω «σωματικού» Oculocutaneous albinism ή ΙΑ, είναι ο «οφθαλμικός» αλφισμός (ocular albinism), ο οποίος κληρονομείται δια μιας «κυρίαρχης» (dominant) μετάλλαξης στο «γενετικό» χρωματόσωμα X και γι’ αυτό εμφανίζεται συχνότερα στους άνδρες που έχουν ένα Χ κι ένα Υ χρωματόσωμα και σπανιότερα στις γυναίκες που έχουν δύο Χ χρωματοσώματα.
Οφθαλμο-Δερματικός Αλφισμός τύπου ΙΑ, λόγω μεταλλάξεων στο «σωματικό χρωματόσωμα αρ.11.
O ΒΑΣΙΚΟΣ ΜΗΧΑΝΙΣΜΟΣ ΠΡΟΚΛΗΣΗΣ ΜΕΤΑΛΛΑΞΕΩΝ ΑΠΟ ΤΑ m RNA ΕΜΒΟΛΙΑ ΚΑΤΑ ΤΟΥ SARS-CoV-2 Tα mRNA εμβόλια, όπως έχουμε επανειλημμένως πεί, παράγουν μέσα στα κύτταρα των εμβολιασμένων και με την αμοιβαία συμμετοχή των τελευταίων, την πρωτεΐνη S του φυσικού κορονοϊού SARS-CoV-2, εναντίον της οποίας ο οργανισμός του εμβολιασθέντα παράγει-θεωρητικά- αντι-S αντισώματα (χημική ανοσία) και Τα+, ΝΚ κυτταροτοξικά ανοσολογικά κύτταρα (κυτταρική ανοσία), τα οποία θα αδρανοποιήσουν –πάντα θεωρητικά- και τον φυσικό κορονοϊό, στην περίπτωση μόλυνσης του εμβολιασθέντα απ’ αυτόν. Κανείς όμως δεν έχει-περιέργως- σκεφθεί, ότι ο εμβολιασθείς παράγει αντισώματα κι εναντίον του mRNA μορίου του εμβολίου, το οποίο είναι το ΙΔΙΟ με το m RNA του φυσικού κορονοϊού, με αποτέλεσμα, τα αντισώματα αυτά να «σπάζουν» την αλυσίδα των βάσεων του mRNA του φυσικού ιού. Συνέπεια της βλάβης αυτής του mRNA του φυσικού ιού, είναι ο τελευταίος να κινητοποιεί τους μηχανισμούς «επιδιόρθωσης» (repair) του mRNA του, ήτοι βασικά τους Non-homologous end Joining (NHEJ) and homologous template switching recombination (HR), με αποτέλεσμα να προκαλούν τις μεταλλάξεις «επιδιόρθωσης» του φυσικού κορονοϊού. Την ιδέα αυτή την έχω καταθέσει στα πανεπιστήμια Bethesda και Rockefeller των USA και ζήτησα να την εξετάσουν, δια την ανίχνευσης των αντι-mRNA αντισωμάτων αυτών στον ορό των εμβολιασθέντων, την απομόνωσή των και την διαπίστωση της πρόκλησης εξ` αυτών μεταλλάξεων στον φυσικό SARS-CoV-2 σε in vitro καλλιέργειες του τελευταίου με τα αντισώματα αυτά.
Η γενετική βλάβη που προκαλούν τα αντι-mRNA αντισώματα του εμβολιασθέντα (με mRNA εμβόλια κατά του SARS-CoV-2 ιού), στο mRNA του φυσικού SARS-CoV2. Η διαδικασία «επιδιόρθωσης» τοης βλάβης αυτής (δια των μηχανισμών Nonhomologous end Joining (NHEJ) and homologous template switching recombination (HR) του φυσικού ιού) προκαλούνται οι γνωστές μας μεταλλάξεις του τελευταίου.
ΕΙΚΟΝΕΣ ΓΟΝΙΔΙΑΚΗΣ ΘΕΡΑΠΕΙΑΣ
Ο βασικός μηχανισμός της γονιδιακής θεραπείας (gene therapy). 1. O DNA αδενοϊός φορέας (DNA virus vector) με το «DNA-θεραπευτικό γονίδιο» (transgene) εργαστηριακά ενσωματωμένο στο DNA του (recombinant technology) συνδέεται με την κυτταρική μεμβράνη-στόχο (κατά κανόνα δια ειδικών αντι-κυτταρικών υποδοχέων που έχουν συνδεθεί στον vector), 2. O vector εισέρχεται στον πυρήνα του κυττάρου-στόχου, 3. Η πυρηνική μεμβράνη (capsid) του vector αποσυντίθεται, 4. απελευθερουμένου έτσι του «DNA-θεραπευτικού γονιδίου» (transgene) μέσα στον πυρήνα του κυττάρουστόχου, όπου, 5. «μεταφράζεται» (transcribed) στο αντίστοιχο mRNA, το οποίο στην συνέχεια, 6. εξέρχεται του πυρήνα στο κυτταρόπλασμα του κυττάρου-στόχου, στα ριβοσώματα (ribosomes) του οποίου, συνθέτει την ελλείπουσα «θεραπευτική» πρωτεΐνη του ελλείποντος ή δυσλειτουργικού εγγενούς γονιδίου. https://www.sarepta.com/science/gene-therapy-engine
Γονιδιακή Θεραπεία δια DNA adenoviruses-vectors.
Γονιδιακή Θεραπεία δια DNA adenoviruses-vectors.