La genómica al alcance de la mano del ganadero

El laboratorio nacional Genexa está incorporando la tecnología necesaria para realizar estudios genómicos al ganado bovino . Su directora y co fundadora,

Licenciada en

Biología Rosina Fossati explicó a la Revista Ganadería detalles de la misma , costos aproximados de los estudios, tiempos y mínimos necesarios. En definitiva, con una pequeña muestra de pelo de un animal se podrá acceder a información sobre su futuro desempeño productivo.

Hace un año nacía en el área de genética molecular con foco en el área agropecuaria y alimentos, Genexa, una empresa de servicios y nuevos desarrollos en la materia.

Su directora y co fundadora, Rosina Fossati, es Licenciada en Biología en la Facultad de Ciencias Biológicas y tiene una especialización en ciencia animal en la Universidad de Davis, California, "siempre tuve afinidad por el sector agro" dijo a Revista Ganadería de la Asociación Rural del Uruguay.

Experiencia en la materia

Todo el equipo de trabajo de Genexa proviene de un laboratorio de servicios que durante muchos años desarrolló su actividad tanto en el sector humano como agropecuario.

"Tenemos mucha experiencia en desarrollo de nuevos productos así como en el servicio de rutina tanto en la detección de patógenos, detección de marcadores asociados a la performance de un animal, tipificación de marcadores de tipo Microsatélites con fines de registro y parentesco tanto en plantas como en animales así como otros" explicó la bióloga.

Su trabajo se basa principalmente en las plataformas de secuenciación masiva, secuenciación capilar, PCR en tiempo real y PCR en tiempo final. "Nuestras bases de datos de perfiles animales ascienden a más de 200.000 animales de los cuales un gran porcentaje le corresponde a la Asociación Rural del Uruguay" aseguró.

Incorporando la genómica

El propósito de Genexa es estar a la vanguardia de nuevos desarrollos, nuevas plataformas de servicios y nuevas oportunidades de negocios, "es por eso que planificamos cada año participar en congresos internacionales con éste fin" explica Rosina Fossati.

La Licenciada en Biología Rosina Fossati explicó detalles de funcionamiento del servicio de análisis genómico

De la genómica, sobre todo en bovinos, se comenzó a hablar hace mas de 10 años en los congresos de la Sociedad Internacional de Genética Animal "sobre todo con fines de utilizar la misma con el fin de poder realizar las evaluaciones genéticas en razas de leche" explica y agrega que "posteriormente se fueron armando los chips (o arreglos) de miles de marcadores para razas de carne".

Con el tiempo, las principales empresas desarrolladoras de chips, Illumina y ThermoFisher fueron desarrollando chips de menor densidad, mas amigables por su tamaño y con información adicional de detección de marcadores asociados a performance y enfermedades así como de marcadores utilizados para identidad y parentesco.

"Dado que uno de nuestros principales productos es la tipificación de marcadores para identidad y parentesco, comenzamos a estudiar el mercado tanto a nivel regional como local ya que empezamos a ver como una amenaza la presencia de éstos chips con bastante mas información que la que nosotros brindamos actualmente con nuestro estudio" reconoce la técnica. Debido al alto costo de la inversión inicial en la plataforma, así como de los insumos del ensayo, resultaba muy difícil competir con empresas internacionales.

"En el año 2018 directores de la Asociación Rural del Uruguay se acercaron al laboratorio para plantearnos la migración del estudio actual de identidad y parentesco al de parentesco a través de chips de mediana densidad con el propósito de brindarle al productor no solo ese análisis sino toda la información necesaria para poder, junto con la experiencia del Instituto Nacional de Investigación Agropecuaria (INIA), realizar las evaluaciones genómicas" recordó.

Desde ese momento, comenzaron un largo trabajo de investigación sobre las posibles plataformas y negociación de precios "de manera de poder llegar a valores que resulten viables para el productor" asegura la Licenciada que agregó "en la actualidad, nos encontramos en proceso de compra de la plataforma y acopiando las primeras muestras para su análisis".

La información genómica

Los tipos de chips varían en su contenido y en su densidad y depende lo que el productor quiera saber, se seleccionará el chip a estudiar.

"Un chip bovino de mediana densidad (50.000 marcadores) incluye marcadores utilizados para evaluaciones genómicas, marcadores para performance y enfermedades y marcadores recomendados por la Sociedad Internacional de Genética Animal para parentesco bovino" explica la técnica.

El estudio tiene un 99% de exactitud.

Operativa y costos

El laboratorio recibe muestras del animal a partir de cualquier tipo de material biológico, "se ingresa en nuestro sistema de gestión de muestras y continúa el proceso de extracción de ADN, amplificación, digestión e hibridación para luego cargar en el chip dentro del equipo. Se procesan de a 96 muestras y se estima un plazo de 10 días hábiles" explica Rosina Fossati.

Los costos del estudio van a depender siempre de la cantidad de muestras que envíe el cliente "pero se trata de valores competitivos" .

Como la plataforma permite correr de a 96 muestras, aquel productor que lleve fracciones menores, deberá esperar a que se complete el número, por lo que los plazos para recibir los resultados del estudio se extenderán.