Geografisk visualisering til COVID-19-overvågning Danmarks COVID-19-testresultater samles i en database. Herfra bliver de anvendt til adskillige formål. Når testresultaterne kobles med yderligere data, herunder med x- og y-koordinater, kan data indgå i geografiske analyser eller illustrationer. AF JONAS KÄHLER, STATENS SERUM INSTITUT
COVID-19 står for: “Coronavirus Disease 2019”. Statens Serum Institut (SSI) er ansvarlig for over vågningen af COVID-19 i Danmark. COVID-19- testresultater fra både private og offentlige leve randører samles i den Danske Mikrobiologiske Database (MiBa) og bliver herfra anvendt til adskil lige formål, herunder smitteopsporing, forskning, rapportering til det nationale beredskab, overvåg ning i dashboards på SSI’s hjemmeside, analyser af forskellige genåbningsscenarier (Modelgruppen), samt lokale indsatser fx i kommunerne. MiBa og COVID-line-list Dataintegrations- og Analysesekretariatet (DIAS) på SSI har ansvaret for at udvikle og drifte det automatiske overvågningssystem for COVID-19. MiBa er hoveddatakilden bag COVID-19-overvåg ningen. COVID-19-testresultater fra MiBa samles i COVID-line-listen, der er en database, som indeholder alle relevante variable, som anvendes ifm. overvågningen, herunder positive, negative eller inkonklusive testresultater. Data kobles med yderligere data fra en række andre datakilder bl.a. CPR-registret for information om bo pælsadresse og x- og y-koordinater til anvendelse i forbindelse med geografiske analyser eller illustrationer. GIS og epidemier Geografisk visning har altid været centralt i overvågning og bekæmpelse af smitsomme sygdomme. Informationen om sygdom, tid og sted er yderst relevant, når det kommer til overvågning af infektionssygdomme fx i for bindelse med udbrudshåndtering, forskning og lignende.
4
GEOFOR U M • JU NI 2 0 2 1
Ekstra medvind til GIS COVID-19-pandemien medførte lige fra starten et stort behov for at få offentliggjort relevant data til borgere, regioner og kommuner. Anvendelsen af GIS i forbindelse med overvågningen fik i den forbindelse ekstra medvind. Dels har der været efterspørgsel på kort, der viser smittetal (incidens, positiv procent) eller testaktivitet (testincidens) som generel formidling til offentligheden. Der har også været et behov bl.a. i kommunerne for at få vist deres smittetal på et mere detaljeret niveau. For bedre at kunne vurdere smitteniveau og effekt af indsatser lokalt har kommunerne haft behov for at få data for både udvalgte geografiske områder og for mere generelle geografier såsom kvadratnet. Ydermere har SSI anvendt detaljerede kortvis ninger på individniveau til overvågning af udbrud og opsporing af smittekæder i forbindelse med COVID-19-pandemien. SSI valgte at bruge ESRIs Coronavirus Response package, som er en tjeneste til statslige og offentlige myndigheder. Pakken giver SSI adgang til både ArcGIS online og ArcGIS Pro. Yderligere kunne SSI via pakken følge med i, hvordan andre statslige sundhedsmyndigheder anvender det samme software til præsentation af deres natio nale COVID-19-overvågning. COVID-19 dashboards I august 2020 lancerede SSI det første COVID- 19-dashboard med nøgletal, kort og figurer vedr. COVID-19-pandemien i Danmark på kommunalt >>
