Reflexiones 2 el diseño inteligente aminoácidos by H.C. Elías

REFLEXIONES

El Diseño Inteligente H.C. ELÍAS Aminoácidos

H.C. ELÍAS

EL DISEÑO INTELIGENTE AMINOÁCIDOS H.C. ELÍAS

Extracto del libro: “En el Nombre de HVHI” ©H.C. Elías Registro Indautor 03-2014-12183114500-01

El ADN, el ARNm y los Aminoácidos El ácido desoxirribonucleico, abreviado como ADN, es un ácido nucléico que contiene instrucciones genéticas usadas en el desarrollo y funcionamiento de todos los organismos vivos conocidos y algunos virus, y es responsable de su transmisión hereditaria. El papel principal de la molécula de ADN es el almacenamiento a largo plazo de información. Muchas veces el ADN es comparado con un código ya que contiene las instrucciones necesarias para construir otros componentes de las células como las proteínas y las moléculas de ARN. Los segmentos de ADN que llevan esta información genética son llamados genes, pero las otras secuencias de ADN tienen propósitos estructurales o toman parte en la regulación del uso de esta información genética. Desde el punto de vista químico, el ADN es un polímero de nucleótidos, es decir, un polinucleótido. Un polímero es un compuesto formado por muchas unidades simples conectadas entre sí, como si fuera un largo tren formado por vagones. En el ADN, cada vagón es un nucleótido, y cada nucleótido, a su vez, está formado por un azúcar (la desoxirribosa), una base nitrogenada (que puede ser adenina→A, timina→T, citosina→C guanina→G) y un grupo fosfato que actúa como enganche de cada vagón con el siguiente. Lo que distingue a un vagón (nucleótido) de otro es, entonces, la base nitrogenada, y por ello la secuencia del ADN se especifica nombrando sólo la secuencia de sus bases. La disposición secuencial de estas cuatro bases a lo largo de la cadena (el ordenamiento de los cuatro tipos de vagones a lo largo de todo el tren) es la que codifica la información genética: por ejemplo, una secuencia de ADN puede ser ATGCTAGATCGC... En los organismos vivos el ADN se presenta como una doble cadena de nucleótidos, en la que las dos hebras están unidas entre sí por unas conexiones denominadas puentes de hidrógeno. Para que la información que contiene el ADN pueda ser utilizada por la maquinaria celular, debe copiarse en primer lugar en unos trenes de nucleótidos, más cortos y con unas unidades diferentes, llamados ARN. Las moléculas de ARN se copian exactamente del ADN mediante un proceso denominado transcripción. Una vez procesadas en el núcleo celular, las moléculas de ARN pueden salir al citoplasma para su utilización posterior. La información contenida en el ARN se interpreta usando el código genético, que especifica la secuencia de los aminoácidos de las proteínas, según una correspondencia de un triplete de nucleótidos (codón) para cada aminoácido. Esto es, la información genética (esencialmente: qué proteínas se van a producir en cada momento del ciclo de vida de una célula) se halla codificada en las secuencias de nucleótidos del ADN y debe traducirse para poder funcionar. Tal traducción se realiza usando el código genético a modo de diccionario. El diccionario "secuencia de nucleótido-secuencia de aminoácidos" permite el ensamblado de largas cadenas de aminoácidos (las proteínas) en el citoplasma de la célula. Por ejemplo, en el caso de la secuencia de ADN indicada antes (ATGCTAGATCGC...), la ARN polimerasa utilizaría como molde la cadena complementaria de dicha secuencia de ADN (que sería TAC-GAT-CTA-GCG-...) para transcribir una molécula de ARNm que se leería AUG-CUA-GAU-CGC-.... Explicare esto más ampliamente, si de un lado de la hélice de ADN se encuentra una A, enfrente de ella solo puede haber una T y viceversa, de modo similar, si lo que hay en una hebra de la hélice es una G, su correspondiente del lado opuesto será una C. Por eso la cadena complementaria de la secuencia ATGCTAGATCGC es TACGATCTAGCG, y es esta secuencia

la que al final en el ARNm aparece transcrita nuevamente usando sus correspondientes respectivas, solo que con ciertas diferencias, una es que la Timina-T ha sido sustituida por otro nucleótido denominado Uracilo-U, y ahora van a formar cadenas en grupos de tres. Bajo estas consideraciones es que, como ya vimos renglones arriba, el ARNm vinculado a la cadena ejemplo que usamos de ADN se leería AUG-CUA-GAU-CGC. Es de esta manera que se constituyen los aminoácidos como cadenas de tres nucleótidos y de forma similar las proteínas como cadenas de aminoácidos. A manera de ejemplo, el aminoácido Lisina (LYS), se forma por dos grupos de tres nucleótidos (AAA-AAG).

Fig. 1 Estructura química del ADN: dos cadenas de nucleótidos conectadas mediante puentes de hidrógeno, que aparecen como líneas punteadas

Para determinar de forma simple los aminoácidos que se forman a partir del ARNm, consideremos la cantidad de combinaciones posibles de 4 elementos, en este caso U-G-A-C, de tres en tres. De la estadística sabemos que el número de combinaciones posibles de cuatro elementos en secuencias de tres es de 4³, es decir 64. Entonces usemos la siguiente tabla para visualizar estas combinaciones:

U UUU UUG UUA UUC

G UGU UGG UGA UGC

A UAU UAG UAA UAC

C UCU UCG UCA UCC

U G A C

GUU GUG GUA GUC

GGU GGG GGA GGC

GAU GAG GAA GAC

GCU GCG GCA GCC

U G A C

AUU AUG AUA AUC

AGU AGG AGA AGC

AAU AAG AAA AAC

ACU ACG ACA ACC

U G A C

CUU CUG CUA CUC

CGU CGG CGA CGC

CAU CAG CAA CAC

CCU CCG CCA CCC

U G A C

Tabla 1 Tabla de combinaciones posibles de los 4 nucle贸tidos del ARNm, de tres en tres Aqu铆 cada color representa al conjunto de codones (cadenas de 3 nucle贸tidos) que constituyen el amino谩cido correspondiente,

1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20

A R N D C K M F P Q E G H I L S T W Y V INICIO PARADA

ALA ARG ASN ASP CYS LYS MET PHE PRO GLN GLU GLY HIS ILE LEU SER THR TRP TYR VAL MET UAG

GCU CGC AAU GAU UGU AAA AUG UUU CCU CAG GAA GGC CAU AUU UUG UCU ACU UGG UAU GUU AUG UAA

GCG CGA AAC GAC UGC AAG UUC CCG CAA GAG GGA CAC AUA UUA UCG ACG UAC GUG

GCA CGG

GCC CGU

CCA

CCC

GGG

GGU

AUC CUU UCA ACA

CUG UCC ACC

GUA

GUC

AGA

AGG

CUA AGU

CUC AGC

UGA

Tabla 2 En esta tabla se muestran 20 aminoácidos donde uno actúa como código de inicio y tres codones independientes de “stop” Bien, hasta aquí no he descrito nada que vaya más allá de lo que se sabe y puede ser encontrado en cualquier publicación relativa al tema. Pero es en este punto donde comienza una visión diferente que surge de una idea que tuve al darme cuenta que era curioso que justamente hubieran 20 aminoácidos y 2 códigos de “stop” básicos (ya que el tercero es una versión permutada del primero) no participantes en la conformación de cada aminoácido, es decir, en total 22, justo el mismo número que la cantidad de letras del “alefato” hebreo. Además tampoco pensé que se tratara de una casualidad el que cuatro letras o nucleótidos en grupos de tres intervinieran en el código de la vida, ya que el Tetragramatón del NOMBRE revelado de Di-s contiene de igual forma cuatro letras (HVHI), y solo tres de ellas son diferentes. Así que pensé ¿por qué no sustituir cada nucleótido del ARNm por una letra del NOMBRE revelado de Di-s? Desde luego había más de una forma posible de llevar a cabo esta asociación, y como a priori no podía saber si arrojarían resultados diferentes, y si ocurría así, cuantas o cuales serían

interesantes, o incluso consistentes, no tuve otra opción que realizar cada combinación posible. Después de un arduo trabajo observé que solo una arrojaba resultados interesantes y contenía una riqueza enorme en información codificada. A continuación iré presentando los resultados que obtuve y lo más importante, la manera y criterios que utilice para encontrarlos. Pero antes de dar inicio a esta gran aventura a través del código oculto en el Nombre revelado de Di-s HVHI y los principios de orden que encierra reflejados en una bella composición numérica, diré que si alguien está interesado en probar que efectivamente la combinación que utilizo es la única que arroja resultados consistentes, puede repetir todo el proceso descrito en las subsecuentes páginas con cada combinación posible y se dará cuenta por sí mismo de que estoy en lo correcto, ya que no le veo ningún sentido el incluir en el presente trabajo el desarrollo de esas posibilidades alternas en virtud de que no arrojan nada que valga la pena mencionar. Como lo mencioné anteriormente la única asociación que arrojó gran cantidad de información codificada fue la siguiente: U-H

G-V

A-H

C-I

Desde luego esta relación no está basada en sus propiedades químicas, ya que de ser así, la asociación natural habría sido U-H y C-H, puesto que U y C son bases pirimidinas y por tanto intercambiables, o análogamente con bases purinas, G-H y A-H.

Fig. 2 Composición química de las bases nitrogenadas del ADN y del ARNm Utilizando las asociaciones elegidas donde U se corresponde con H, G con V, A con H y C con I, sustituí las letras HVHI por sus correspondientes en la Tabla 1, haciendo esto se obtiene la siguiente tabla:

H HHH HHV HHH HHI

V HVH HVV HVH HVI

H HHH HHV HHH HHI

I HIH HIV HIH HII

H V H I

VHH VHV VHH VHI

VVH VVV VVH VVI

VHH VHV VHH VHI

VIH VIV VIH VII

H V H I

HHH HHV HHH HHI

HVH HVV HVH HVI

HHH HHV HHH HHI

HIH HIV HIH HII

H V H I

IHH IHV IHH IHI

IVH IVV IVH IVI

IHH IHV IHH IHI

IIH IIV IIH III

H V H I

Tabla 3 Tabla equivalente con las letras del TETRAGRAMATÓN en lugar de su correspondiente nucleótido Reescribiendo cada aminoácido en términos de sus nucleótidos pero utilizando ahora las letras correspondientes del Nombre Sagrado, tenemos lo siguiente:

ALA ARG ASN ASP CYS LYS MET PHE PRO GLN GLU GLY HIS ILE LEU SER THR TRP TYR VAL

VIH IVI HHH VHH HVH HHH HHV HHH IIH IHV VHH VVI IHH HHH HHV HIH HIH HVV HHH VHH

VIV IVH HHI VHI HVI HHV

HHV

HHH

HHI IIV IHH VHV VVH IHI HHH HHH HIV HIV HHI VHV

VIH IVV

VII IVH

IIH

III

VVV

VVH

HHI IHH HIH HIH

IHV HII HII

VHH

VHI

HVH

HVV

IHH HVH

IHI HVI

Tabla 4 Composición de cada uno de los 20 aminoácidos en términos de las letras HVHI, junto con los dos códigos de “stop” básicos no participantes de forma activa en la conformación de cada uno de los 20 aminoácidos (parte inferior de la tabla)

Cada letra hebrea no solo representa en sí misma un sonido particular y específico, sino también un valor numérico. Hay tres tipos de valor numérico que cada letra puede tener, valor absoluto, valor ordinal y valor reducido. Sustituyendo ahora cada grupo de tres letras por la suma de los valores de cada una de ellas de acuerdo a su valor numérico ordinal que en este caso es H-5, V-6, I-10 en la Tabla 4, obtuve la siguiente tabla de valores asociados a cada aminoácido así como de los 2 códigos básicos de “stop”.

ALA ARG ASN ASP CYS LYS MET PHE PRO GLN GLU GLY HIS ILE LEU SER THR TRP TYR VAL

21 26 15 16 16 15 16 15 25 21 16 22 20 15 16 20 20 17 15 16

22 21 20 21 21 16 20 26 20 17 17 25 15 15 21 21 20 17 16

21 22

26 21

20 20 20 20

21 25 25

20 16

25 21

15 Tabla 5

De un detallado análisis se pueden desprender varias cosas, la primera es que el número menor que aparece es el 15, mientras que el mayor el 30, sin embargo como veremos a continuación no todos los números entre ambos participan, sino que faltan algunos:

solo estos 10 números resultan de las combinaciones de 3 de VHI

15 20 25 30

16 21 26

17 22

1 2 3

Números faltantes 19 23, 24 27,28,29

Tabla 6

Claramente se observa cómo se forman 4 bloques, el primero de 4 números, el segundo de 3, el tercero de 2 y el cuarto de 1. Además entre el primero y segundo bloque falta un número, el 19, entre el segundo y el tercero faltan 2, el 23 y el 24, entre el tercero y el cuarto, los faltantes son 3, el 27, 28 y 29.

Obtengamos ahora el total de los 10 números participantes, esto es 15+16…+30=210, pero también hagámoslo con los 6 números no participantes, 19+23…+29=150 y por último sumémoslos todos 210+150=360 El valor reducido de la suma de los 10 números participantes es 3, el de los 6 números no participantes 6 y el de ambos 9. Por otra parte el total de números involucrados es 16 cuyo valor reducido es 7. Estos tres números [3, 6, 9] son muy importantes pues se les considera como fundamentales dentro de la métrica con la que fue formado el universo. El que la suma de los valores reducidos de los números participantes más los que no participan en la conformación de los 20 aminoácidos sea 9, justamente el número faltante para completar el conjunto 3,6,9 sugiere que tan importantes son los números participantes como los no participantes. Otra observación que bien vale la pena realizar en este punto es que 150 puede obtenerse del producto de 50 x 3, 210 del producto 30 x 7 y 360 de 30 x12. Si observamos el conjunto de factores 3,7,12 son valores que coinciden perfectamente con la cantidad de letras contenidas en los tres subconjuntos en los que se dividen las 22 letras hebreas. Se dice que hay tres letras madres, siete dobles y 12 elementales. Y desde luego no es coincidencia. Por último el que juntas sumen 360 y que este número corresponda a los 360° que tiene un círculo, nos indica justamente eso, que ambas son parte del todo y por tanto deben ser tratadas con la misma importancia. Sabiendo que Di-s revela tanto a través de su palabra como a través de su silencio considero que vale la pena ir un poco más allá en lo referente al conjunto de números no participantes en las cadenas que conforman los 20 aminoácidos. De la tabla 6 sabemos que el conjunto de estos números es {19,23,24,27,28,29}. Lo primero y obvio que observamos es que no se obtienen de la suma de los valores de las combinaciones de las tres letras del Tetragramaton VIH tomando en cuenta sus valores ordinales. Pero ¿qué sucedería si en vez de considerar sus valores ordinales tomáramos en cuenta sus valores reducidos? Esto significaría que “H” seguiría valiendo 5, “V” 6, pero “I” en vez de valer 10, valdría 1. La siguiente tabla muestra que la única manera de obtener estos valores es agregando, al menos una letra más, es decir, mientras que los números participantes se conforman de combinaciones de 3 letras de las 4 que componen el Tetragramatón, los números no participantes se componen de 4 o más bajo el esquema de valor reducido;

VALORES REDUCIDOS I- 1 H-5 V-6 19 VVV-I 23 VHV-I VVV-H IVV-V 24 VVV-V 27 IVI-I VIV-H VHI-V 28 IVV-V 29 VHV-VV VVV-VH IVV-VI

18+1 17+6 18+5 22+1 18+6 21+6 22+5 26+1 22+6 17+6+6 18+6+5 22+6+1

Tabla 7 Como se puede observar en esta tabla, efectivamente se requiere de la combinación de grupos de 3 letras utilizadas en los números participantes más una o dos letras individuales. La cantidad de elementos participantes en cada número se alterna justamente en la secuencia 1,3,1,3... ó equivalentemente, un elemento para el 19, tres para el 23, uno para el 24, 3 para el 27, 1 para el 28 y 3 para el 29. Mientras que el conjunto de números {19, 23, 24, 27, 28} requieren un solo elemento o letra adicional a la triada asociada a los números participantes para obtener la suma representada, el 29 requiere de dos. Lo siguiente será marcar en las tablas 3 y 1 las triadas de letras participantes en la tabla 7,

H HHH HHV HHH HHI

V HVH HVV HVH HVI

H HHH HHV HHH HHI

I HIH HIV HIH HII

H V H I

VHH VHV VHH VHI

VVH VVV VVH VVI

VHH VHV VHH VHI

VIH VIV VIH VII

H V H I

HHH HHV HHH HHI

HVH HVV HVH HVI

HHH HHV HHH HHI

HIH HIV HIH HII

H V H I

IHH IHV IHH IHI

IVH IVV IVH IVI

IHH IHV IHH IHI

IIH IIV IIH III

H V H I

Tabla 8

U UUU UUG UUA UUC

G UGU UGG UGA UGC

A UAU UAG UAA UAC

C UCU UCG UCA UCC

U G A C

GUU GUG GUA GUC

GGU GGG GGA GGC

GAU GAG GAA GAC

GCU GCG GCA GCC

U G A C

AUU AUG AUA AUC

AGU AGG AGA AGC

AAU AAG AAA AAC

ACU ACG ACA ACC

U G A C

CUU CUG CUA CUC

CGU CGG CGA CGC

CAU CAG CAA CAC

CCU CCG CCA CCC

U G A C Tabla 9

Ahora, en función de esta información reescribiré la tabla 7. Veremos claramente los elementos necesarios involucrados para lograr completar los valores de los números no participantes, tanto en términos de triadas (codones) como en nucleótidos independientes. 19

GGG-C

GGG-G

AGG-G UGG-G GGU-G GGA-G GUG-G GAG-G

AGG-GG UGG-GG GGU-GG GGA-GG GUG-GG GAG-GG

GGG-U/A

GGG-GU/GA

GCG-C GGC-C CGG-C

GCG-GC GGC-GC CGG-GC

CGC-C CCG-C GCC-C

GCG-U/A GGC-U/A CGG-U/A

GCG-G GGC-G CGG-G

UGC-G UCG-G GCU-G GCA-G GUC-G GAC-G ACG-G AGC-G CGU-G CUG-G CAG-G CGA-G

Tabla 10

En la tabla se ve claramente el paralelismo entre los números participantes de 2 en dos. En particular el 19 con el 24, el 23 con el 29 y el 27 con el 28. Utilizaré esta información en la tabla 2 para indicar los aminoácidos involucrados con estos números. ALA ARG ASN ASP CYS LYS MET PHE PRO GLN GLU GLY HIS ILE LEU SER THR TRP TYR VAL MET UAG

GCU CGC AAU GAU UGU AAA AUG UUU CCU CAG GAA GGC CAU AUU UUG UCU ACU UGG UAU GUU AUG UAA

GCG CGA AAC GAC UGC AAG UUC CCG CAA GAG GGA CAC AUA UUA UCG ACG UAC GUG

GCA CGG

GCC CGU

CCA

CCC

GGG

GGU

AUC CUU UCA ACA

CUG UCC ACC

GUA

GUC

AGA

AGG

CUA AGU

CUC AGC

UGA

Tabla 11 Como claramente podemos ver en esta tabla, los aminoácidos involucrados son: ALA

ARG

ASP

CYS

PRO

GLN

GLU

GLY

LEU

SER

THR TRP

En la siguiente tabla escribiré cada aminoácido asociado a su número no participante, en términos de sus triadas o codones y el nucleótido o nucleótidos adicionales asociados

VAL

19 GLY

GGC

GGA

GGG-C

GGU

GLY

GGC

GGA

GGG-G

GGU

28 ARG CGC ALA GCU GLY GGC-G

CGA GCG-G GGA

CGG-G GCA GGG

CGU GCC GGU

AGA

AGG

23 ARG TRP GLY VAL GLU ALA

CGC UGG-G GGC-C GUU GAA GCU

CGA

CGG-C

CGU

GGA-G GUG-G GAG-G GCG-C

GGG-U/A GUA

GGU-G GUC

GCA

GCC

ARG TRP GLY VAL GLU ALA

CGC UGG-GG GGC-GC GUU GAA GCU

CGA

CGG-GC

CGU

GGA-GG GUG-GG GAG-GG GCG-GC

GGG-GU/A GUA

GGU-GG GUC

GCA

GCC

AGA

AGG-G

AGA

AGG-GG

27 ARG PRO ALA GLY CYS SER VAL ASP THR LEU GLN

CGC-C CCU GCU-G GGC-U/A UGU UCU GUU GAU ACU UUG CAG-G

CGA-G CCG-C GCG-U/A GGA UGC-G UCG-G GUG GAC-G ACG-G UUA CAA

CGG-U/A CCA GCA-X GGG

CGU-G CCC GCC-C GGU

AGA

AGG

UCA GUA

UCC GUC-G

AGU

AGC-G

ACA CUU

ACC CUG-G

CUA

CUC

Tabla 12

Esta tabla muestra claramente cual o cuales codones de cada aminoácido están ligados a uno o más nucleótidos. Por ejemplo en el aminoácido GLN (ubicado al final de la tabla) formado por los codones CAG y CAA, es en su primer codón CAG que el nucleótido G actúa. El siguiente paso fue agrupar en diferentes tablas, una para cada aminoácido la información presentada en la tabla 12 y determinar las cadenas de nucleótidos que actúan sobre cada aminoácido de forma externa. ALA ALA ALA ALA

GCU GCU-G GCU GCU

GCG-C GCG-U/A GCG-G GCG-GC

GCA GCA-G GCA GCA

GCC GCC-C GCC GCC Tabla 13

Representación gráfica vinculada a la tabla anterior ALA U/A G GCU

GCG

GCA

GCC

G Fig. 3 En la figura se indican los nucleótidos que actúan sobre cada codón formando cadenas directas, estos son los que comparten la misma posición relativa, es decir, los que están arriba, abajo, a la derecha y a la izquierda. Sin embargo el total de cadenas de nucleótidos que actúan de forma conjunta sobre el aminoácido se forman no solo de la acción en “cadenas” directas, sino también en cadenas mixtas, las cuales se forman de toda combinación posible de los nucleótidos individuales. La única restricción en la secuencia de cada cadena es respetar el orden de los codones dentro del aminoácido. De aquí se establecen las secuencias de nucleótidos que actúan sobre el aminoácido ALA -C--G--GC-GUGC GAGC GCGC GGGC GGCGC Tabla 14

En color morado está marcada la cadena que incluye la acción de dos nucleótidos simultáneamente sobre un mismo codón. Los primeros tres renglones de la tabla indican “cadenas” directas, en tanto que el resto proviene de cadenas mixtas. Para el aminoácido ALA tenemos 8 cadenas, 3 del tipo directo, 4 del tipo mixto sencillo y uno del tipo mixto con un doble.

ARG ARG ARG ARG

CGC CGC-C CGC CGC

CGA CGA-G CGA CGA

CGG-C CGG-U/A CGG-G CGG-GC

CGU CGU-G CGU CGU

AGA AGA AGA AGA

AGG-G AGG AGG AGG-GG

Tabla 15 ARG

CGC

CGA

U/A

CGG

CGU

AGA

AGG

G Fig.4 CG G GCGG CGUG CGAG

CGUGGG CGAGGG CGUGG CGAGG CGCGG

CGCGGG CGGGG CGGGGG CGGCGG CGGCGGG

Tabla 16 Nuevamente en color morado están marcadas las acciones de dos simultáneamente.

o más nucleótidos

Sobre el aminoácido ARG actúan 5 cadenas directas, 5 mixtas sencillas y 4 mixtas con un doble y 1 mixta con dos dobles en total 15.

GLY GLY GLY GLY GLY GLY

GGC GGC GGC-C GGC-U/A GGC-G GGC-GC

GGA GGA GGA-G GGA GGA GGA-GG

GGG-C GGU GGG-G GGU GGG-U/A GGU-G GGG GGU GGG GGU GGG-GU/A GGU-GG Tabla 17 GLY U/A G

G C

GGC G

GGA

GGG

GGU

GU/A

U/A GC

Fig. 5 CGCG CGGG

CGGUG CGGAG

CGCGG CGGGG CGUGG CGAGG CGGUGG CGGAGG

UGCG UGGG UGUG UGAG UGGUG UGGAG AGCG AGGG AGUG AGAG AGGUG AGGAG UGCGG UGGGG UGUGG UGAGG UGGUGG UGGAGG AGCGG AGGGG AGUGG AGAGG AGGUGG AGGAGG

GGCG GGGG GGUG GGAG GGGUG GGGAG

GGCGG GGGGG GGUGG GGAGG GGGUGG GGGAGG

GCGCG GCGGG GCGUG GCGAG GCGGUG GCGGAG

GCGCGG GCGGGG GCGUGG GCGAGG GCGGUGG GCGGAGG

CGGCG CGGGG CGGUG CGGAG CGGGUG CGGGAG

UGGCG GGGCG GCGGCG AGGCG GGGGG GCGGGG UGGGG GGGUG GCGGUG AGGGG GGGAG GCGGAG UGGUG GGGGUG GCGGGUG UGGAG GGGGAG GCGGGAG AGGUA AGGAG UGGGUG UGGGAG AGGGUG AGGGAG CGGCGG UGGCGG GGGCGG GCGGCGG CGGGGG AGGCGG GGGGGG GCGGGGG CGGUGG UGGGGG GGGUGG GCGGUGG CGGAGG AGGGGG GGGAGG GCGGAGG CGGGUGG UGGUGG GGGGUGG CGGGAGG UGGAGG GGGGAGG AGGUAG AGGAGG UGGGUGG UGGGAGG AGGGUGG AGGGAGG

CGUG CGAG G U A C G GCGGGUGG GCGGGAGG

Tabla 18 En el caso del aminoácido GLY tenemos 7 “cadenas” sencillas directas, 2 sencillas con 4 dobles, 14 mixtas sencillas, 50 mixtas con un doble, 40 mixtas con dos dobles, 14 mixtas con tres dobles. En total 127. TRP TRP

UGG-G UGG-GG

Tabla 19 TRP

G UGG

Fig. 6 G GG Tabla 20 Para el aminoácido TRP solo se tienen 2 cadenas directas, una sencilla y otra con un doble. VAL VAL VAL

GUU GUU GUU

GUG-G GUG GUG-GG

GUA GUA GUA

GUC GUC-G GUC Tabla 21

VAL

GUU

GUG

GUA

GUC

GG Fig. 7 G GG G GG GGG Tabla 22 Se trata de 2 cadenas directas sencillas, una directa con un doble, una mixta sencilla y una mixta con un doble, en total 5 cadenas. GLU GLU

GAG-G GAG-GG

Tabla 23 GLU

G GAG

GG Fig 8

G GG

Este aminoรกcido solo cuenta con dos cadenas una directa sencilla y una doble El restante grupo de aminoรกcidos sรณlo tienen cadenas directas sencillas con uno o dos elementos.

PRO CYS SER ASP THR LEU GLN

CCU UGU UCU GAU ACU UUG CAG-G

CCG-C UGC-G UCG-G GAC-G ACG-G UUA CAA

CCA

CCC

UCA

UCC

AGU

AGC-G

ACA CUU

ACC CUG-G

CUA

CUC

Tabla 24 PRO CYS SER ASP THR LEU GLN

C G GG G G G G Tabla 25

Dado que las cadenas son diferentes, es decir, directas o mixtas, sencillas y dobles, seguramente realizarán funciones distintas. Dado que estas cadenas no forman parte de los aminoácidos pero sí del ADN, deben estar presentes en los segmentos del ADN no codificante y por tanto realizar funciones asociadas a esta sección del ADN. Las cadenas son de longitud variable, conteniendo cada una de ellas 1,2,3,4,5,6,7 u 8 elementos. Antes de continuar haré un paréntesis para hablar un poco acerca del ADN no codificante y lo que actualmente se sabe de él. El genoma humano contiene unos 30.000 genes. Se consideran genes las regiones del genoma que codifican para proteínas, esto es, las regiones que se transcriben para generar ARN mensajero que luego se traducen en proteínas en los ribosomas. En promedio los genes tienen un tamaño de 3.000 nucleótidos o bases. Teniendo en cuenta que el total del genoma asciende a 3,164.7 millones de bases, la suma de todos los genes supone sólo un 2% del genoma. Por tanto, el 98% del genoma humano es ADN no-codificante, o lo que es lo mismo, no contiene información relevante para la síntesis de proteínas. En su gran mayoría, se desconoce la función del ADN no-codificante, aunque se sabe que en él se localiza el ADN regulador. Éste consiste en regiones del ADN (también llamadas regiones reguladoras) que controlan cuánto, cuándo y dónde se produce el proceso de transcripción de un gen. Este control de la transcripción o, lo que es lo mismo, de la expresión génica, llevado a cabo por las regiones reguladoras es fundamental para la diferenciación celular. Así, a pesar de que

todas las células de un individuo contengan el mismo genoma, lo que hace que un tipo celular sea distinto de otro es el conjunto específico de genes activos que se expresan en cada célula. Para ello, en cada tipo celular se transcribe sólo una fracción de esos 30.000 genes. De este modo, tipos celulares muy distintos como, por ejemplo, una célula del páncreas y otra del corazón, activan un subconjunto altamente especializado de genes y en gran medida diferente entre ambas células y del de otros tipos celulares. A pesar del papel fundamental del ADN regulador en el control de la expresión génica, su identificación en el genoma es extremadamente difícil. El principal motivo es que su código o lenguaje es desconocido. Esto contrasta con las regiones codificantes cuyo código genético es perfectamente conocido (por ejemplo AUG codifica para el aminoácido METmetionina). De hecho, la estimación actual sobre el número de genes en el genoma de humano de 30.000, se basa en parte en la capacidad de predecir la existencia de genes basándose en dicho código genético. Esto es imposible para las regiones reguladoras, lo que hace difícil actualmente predecir dónde se localizan esas regiones en el genoma y cuál es la información que contienen. Una región reguladora está formada por un fragmento de ADN no-codificante de tamaño variable (entre unas pocas bases y cientos de ellas) al que se unen, dependiendo del tamaño, unos pocos o un gran número de factores de transcripción. En los casos en que la unión de dichos factores a la región reguladora favorece la transcripción de un gen, se le denomina potenciador o enhancer. Si por el contrario la impide, a la región reguladora se le denomina silenciador o silencer. Los genes contienen regiones de ADN llamadas promotores, que controlan el inicio de la transcripción, ya que son los lugares donde se une la ARN polimerasa para iniciar la transcripción. Las regiones reguladoras modulan la expresión génica interactuando con los promotores de los genes. Así, los enhancers o los silencers potencian o previenen el reclutamiento de la ARN polimerasa al promotor de un gen, favoreciendo o bloqueando la transcripción génica. A las regiones reguladoras se les denomina elementos en cis (o cis-reguladores) ya que están en la misma cadena de ADN que los genes. A los factores de transcripción que se unen a los elementos cis-reguladores se les denomina reguladores en trans. Así, la configuración-cis de un gen consiste en el conjunto de regiones reguladoras que operan sobre él.

Fig.8

En esta figura se representan un gen A (verde oscuro) y un complejo génico B de tres genes (flechas azules oscuras) contiguos en el genoma. Los puntos rojos representan aisladores (Insulators, I) mientras que los rectángulos son regiones reguladoras. El rectángulo verde es un enhancer (E) del gen A, mientras que los rectángulos azules claros son regiones reguladoras de los genes del complejo B (E, enhancer; S, silencers). Los distintos colores encuadrando los diferentes elementos reguladores representan su actividad en diferentes tipos celulares. Los aisladores generan dos paisajes reguladores distintos , uno pequeño en torno al promotor del gen A donde se encuentra el elemento regulador asociado a este gen, y el otro abarcando desde el primer intron del gen A hasta el final del complejo B y que contiene el resto de elementos reguladores en azul claro. El elemento regulador encuadrado en rosa y localizado en el segundo intron del gen A activa a larga distancia a los tres genes del complejo A y por ello se denomina Locus Control Region (LCR). El aislador (I) en el primer intron del gen A impide que este LCR active también a este gen. El elemento regulador entre el gen A y el complejo génico B es un enhancer (E) específico del primer gen del complejo, mientras que los otros dos elementos reguladores de la derecha son silencers (S) específicos para cada uno de los dos otros genes restantes.

De esta información se desprende que al menos uno y a lo más los cuatro tipos de cadenas descritos anteriormente participan en las regiones reguladoras del ADN en la zona del ADN no codificante. Recientes investigaciones realizadas en Rusia, proponen que el ADN no codificante no solo contiene regiones reguladoras que indican a los genes cuanto, cuando y donde actuar, sino también contienen información que permite la formación de micro agujeros de gusano a través de los cuales se puede acceder a grandes acervos de información. Así que suponiendo que no todos los tipos de cadenas participan en las funciones reguladoras, las restantes podrían intervenir en la formación de micro agujeros de gusano. Y aún de forma más audaz quizá los cuatro tipos participen en ambos solo que en combinaciones diferentes. Más adelante retomaremos este asunto ya que con lo visto hasta aquí no hay criterios suficientes que permitan especular sobre el tema, proponiendo alguna hipótesis específica. Lo importante es no perder de vista está maravilla de simetría que surge dentro de los aminoácidos responsables de la vida y que aparece o se hace evidente al asociar sus codones con el NOMBRE sagrado HVHI. Simetría por demás asombrosa que obviamente demuestra un diseño inteligente y codificado dentro del NOMBRE HVHI en los 20 ladrillos que sustentan la vida y aún más, tanto en el ADN codificante, como en el ADN no codificante, pues como dije al inicio de esta sección, hay tanta revelación en lo que Di-s habla como en lo que calla. Pero las sorpresas están lejos de terminar aquí, entusiasmado por la simetría de estos resultados, se me ocurrió determinar la cantidad de veces que aparecía cada valor asociado a la triada de letras dentro de cada bloque, es decir, su frecuencia.

En otras palabras, estoy determinando el número de veces que aparece, por ejemplo, la triada HHH, cuya valor ordinal numérico es 5+5+5=15 en la tabla 3. Es fácil darnos cuenta que aparece 8 veces. Haciendo lo mismo con los demás miembros de cada bloque obtenemos la siguiente tabla

Valor

15 16 17 18

frecuencia (# de veces que aparece en la tabla de aminoácidos- Tabla 3)

8 12 6 1

primer Bloque 27

20 21 22

12 12 3

25 26

6 3

total y valor reducido

segundo bloque 27

total y valor reducido tercer bloque total y valor reducido cuarto bloque total y valor reducido

64 Tabla 26 Nuevamente encontramos una simetría hermosa puesto que el valor reducido (valor que se obtiene sumando cada componente de un número por ej. 27 2 + 7 = 9) de cada uno de los tres primeros bloques coincide y es justamente 9. Ahora si sumáramos los cuatro valores reducidos correspondientes a cada uno de los bloques (9,9,9,1), obtendríamos el número 28, cuyo valor reducido es 10 y por tanto 1, justamente el valor reducido asociado a la frecuencia del cuarto bloque. Regresando a la tabla 7 y realizando un proceso similar al anterior notamos que en los valores asociados al ADN no codificante, la frecuencia de los números que la conforman es:

# básico

Frecuencia

Total

número reducido

#secundario 1

Total

Tabla 27 Nuevamente aparecen los números que hemos definido como fundamentales en la conformación de nuestro universo el 3, el 6 y la suma de ambos, el 9. De esta forma queda manifiesto el excelso orden y por tanto diseño inteligente detrás del ADN, tanto en su faceta codificante como en la no codificante.