Quels tests sont validés pour le dépistage, le diagnostic et le suivi du COVID 19

Quels tests sont validés pour le dépistage, le diagnostic et le suivi du COVID-19?

Djazouli Med Lamine.

Réponse

Indication des tests :

• Patients avec des symptômes évocateurs de Covid-19hospitalisés pour une pneumopathie avec signes de gravité (pneumopathie hypoxémiante). • Personnels de santé avec symptômes évocateurs de Covid-19qui doivent être dépistés prioritairement afin de limiter la diffusion nosocomiale. • • Patients présentant une symptomatologie respiratoire hospitalisés en réanimation (Syndrome de détresse respiratoire aiguë SDRA). • Femmes enceintes symptomatiques quel que soit le terme de la grossesse (1,2).

- Critères liés à une situation :

•Résidents dans les établissements médico-sociaux. •Professionnels travaillant dansdes établissements d’incarcération etétablissements médico-sociaux. •Patient hospitalisé pourune autre cause et devenant symptomatique (toux ou fièvre ou dyspnée). •Donneurs d’organes, de tissus oude cellules souches hématopoïétiques. •Exploration d’un foyer de cas possibles (en particulier en collectivités de personnes âgées). Au sein de ce type de collectivité, le nombre de tests est limité à3 par unité (4).

Types de tests de détection du coronavirus :

Permettant de détecter le virus SARS-Cov-2, responsable de l’épidémieCovid-19 et la confirmation biologique du diagnostic.

Test PCR :

Le test diagnostique dit«PCR» ou «virologique»(«polymerase chain reaction») (5), le plus utilisé consiste à la mise en évidence du génomedu virus par la technologieRT-PCR(amplification génique après transcription inverse) sur des frottis nasopharyngés par: → Un prélèvement nasopharyngé(gorge, nez, nasopharynx) qui se fait parun médecin ou une infirmière à l’aide d’un petit écouvillon (goupillon) inséré dans le nez et qui peut être associé à un prélèvement au niveaudes voies respiratoires basses (crachats.). Il s’agit d’un test facile à effectuer, non invasifmais désagréable pour le patient. Laspécificitéde ce test est de 100% mais on ignore sa sensibilité → "l’excrétion de virus peut durerjusqu’à 6semaines après l’apparition des symptômes. Publiée le 19avril sur le site Clinical Infectious Diseases et rapporté par l’INSERM.

Tests rapides :

Il s’agit de nouveaux tests moléculaires rapides (45minutes) et ultrarapides (15minutes) sont en cours d’évaluation par le Centre national de référence des virus des infections respiratoires avec des performances analytiques (sensibilité et spécificité) variables. On parle de “tests rapides d’orientation diagnostiques” ou “TRODs”. Ils sontprésentés sous un format unitaire (11). La réalisation d’un diagnostic sérologique par une goutte de sang permet la détection de la réponse immunitaire post-infectieuse symptomatique ou asymptomatique type humoral

(détection des anticorps IgM, IgG et éventuellement IgA) (4).

→ Chez du personnel d’hébergement collectif (établissements sociaux et médico-sociaux, prisons, casernes, résidences universitaires, internats…) non symptomatique. → Chez les professionnels soignants non symptomatiques.

Des tests sérologiques automatisés de type ELISA (enzyme linked immunosorbent assay) (4).

Le taux élevé d’anticorps capables de neutraliser le SARS-CoV-2 apparaît dans un délai

de 07 à 14 jours à compter du début des symptômes.

Test salivaire :

Les chercheurs ambitionnent le développement d’une version à grand public de dépistage EasyCov. → Test salivaire de diagnostic du SARS-CoV-2 EasyCov avec un tube fermé de 0,5ml contenant l’ensemble des réactifs nécessaires à une révélation de la présence du virus. Il consiste à prélever de la salive, l’un des principaux vecteurs du virus, et de la placer avec les réactifs à 65°C pendant 30 minutes. Phase d’essai (à partir du 11 avril 2020). → Le personnel soignant peut alors lire le résultat à l’œil nu.

Les tests basés sur les acides nucléiques se sont avérés être une méthode fiable pour diagnostiquer l’infection par la COVID-19 en détectant le virus lui-même, tandis que les tests sérologiques peuvent être utiles pour évaluer la population ayant contracté la maladie en détectant les anticorps développés contre le virus.

Examens courants :

• Lymphopénie(inférieure à 1 500lymphocytes par ml) retrouvée dans 83% des cas; et qui reflète la gravité de l’infection par le SARS-CoV-2. • Thrombopénie(inférieure à 150000plaquettes par ml) dans 36% des cas; • Leucopénie(inférieure à 1 500leucocytes par ml) retrouvée dans 33% des cas

Références

1. Cahier des charges définissant les modalités d’évaluation des performances des tests sérologiques détectant les anticorps dirigés contre le SARS-CoV-2 • avril 2020. 2. Conseil ScientifiqueCOVID-19. Avis du 2 avril 2020: État des lieux du confinement et critères de sortie ; 2020. 3. European Commission. Communication from the Commission: Guidelines on COVID-19 in vitro diagnostic tests and their performance (15.04.20); 2020. 4. Guo, L., et al. (2020). "Profiling Early Humoral Response to Diagnose Novel Coronavirus Di-sease (COVID-19)." Clin Infect Dis. 5. Détection du génome du coronavirusSARS-CoV-2 par technique de transcription inverse suivie d’une amplification. Saint Denis la Plaine: Haute Autorité de Santé. Avis n°2020.0020/AC/SEAP du 6mars 2020 du collège de la HAS relatif à l’inscription sur la LAP mentionnée à l’article L. 162-1-7 du CSS 7. Haveri, A., et al. (2020). "Serological and molecular findings during SARS-CoV-2 infection : the first case study in Finland, January to February 2020." Euro Surveill 25(11). 8. Ministère des solidarités et de la santé, Ministère de l’intérieur. Circulaire du 09avril 2020: Déploiement des nouvelles capacités de tests de dépistage. 9. Pan, Y., et al. (2020). “Serological immunochromatographic approach in diagnosis with SARS-CoV-2 infected COVID-19 patients.” J Infect. 10. World Health Organisation. Advice on the use of point-of-care immunodiagnostic tests for COVID-19 ; 2020. 11. Zhong, L., et al. (2020). "Detection of serum IgM and IgG for COVID-19 diagnosis." Sci China Life Sci.