Boletin nº2 Fie Intersal

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Boletín nº 2

BOLETÍN INFORMATIVO Nº 2 enero 2018

programa de gestión sanitaria para la acuicultura


Boletín nº2

ÍNDICE 03

EL PROGRAMA EN CIFRAS

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RESULTADOS DESTACADOS

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NOTICIAS

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PRINCIPALES RESULTADOS AÑOS 2016-2017

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PROYECTOS A FINANCIAR POR EL APORTE PRIVADO Y A EJECUTAR DURANTE LOS AÑOS 2018-2019

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PROYECTOS A FINANCIAR POR EL APORTE PÚBLICO Y A EJECUTAR DURANTE EL AÑO 2018

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EMPRESAS ASOCIADAS AL PROYECTO

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Boletín nº 2

programa en cifras

16 6

líneas de investigación definidas en llamados

211

invitaciones a participar

50

PhD evaluadores en múltiples disciplinas

22

propuestas de investigación recibidas

5

instituciones en promedio conforman cada propuesta

208

investigadores

12

proyectos seleccionados (54, 5%)

16 M$USD

en propuestas de investigación recibidas

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resultados destacados Biología de Piscirickettsia salmonis • Consolidación de un Cepario Nacional de P. salmonis con dos unidades espejo en la Pontificia Universidad Católica de Valparaíso en Valparaíso, y Universidad Austral de Chile en Valdivia. • Secuenciación y cierre de 20 genomas de aislados de la bacteria que consolidan dos grandes genogrupos (LF-89 y EM-90), pero que indicarían la potencial existencia de a lo menos uno adicional. • Establecimiento de un trabajo colaborativo estable con el mayor Centro de Recursos Biológicos (DSMZ) del mundo (localizado en Braunschweig, Alemania), para potenciar la sustentabilidad del Cepario y dilucidar el ciclo de vida de la bacteria. • Generación de un manual operativo que facilita el manejo de la bacteria en el laboratorio.

Biología Caligus rogercresseyi • Consolidación del Laboratorio de Referencia de Caligus que se encuentra a cargo del primer cepario de esta especie y banco genético para el monitoreo de la diversidad genómica y su asociación con la resistencia farmacológica, ubicado en la estación de Dichato de la Universidad de Concepción.

Respuesta del hospedador • Se definieron intervalos de referencia para parámetros hematológicos, gasometría sanguínea, endocrinología y bioquímica sanguínea en las tres especies salmonídeas cultivadas en Chile. Se elaboró un Manual de Patología Clínica. • La patogénesis de Piscirickettsiosis en post-smolt de salmón del Atlántico

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Boletín nº 2 experimentalmente infectados con P. salmonis LF-89 y EM-90 es diferente. Los peces PS-EM-90 mostraron mortalidad acumulada más alta y menor tiempo a la muerte. • Las lesiones tisulares tempranas determinaron la alteración de la funcionalidad renal (CRE) y hepática (ALT, AST, PTO, ALB). • P. salmonis fue detectada en branquias de ambos grupos de peces cohabitantes a los 21 dpi, confirmando a las branquias como principal vía de ingreso. • La comparación de expresión de genes de respuesta inmune contra Piscirickettsiosis en post-smolt de salmón del Atlántico experimentalmente infectados con LF-89 y EM-90 revela diferencias asociada con patogenicidad • La respuesta inflamatoria exacerbada incrementaría la susceptibilidad de los peces, determinando altas cargas bacterianas, severas lesiones patológicas y baja tasa de sobrevivencia. • El perfil transcriptómico de post-smolt de salmón del Atlántico infectados con P. salmonis revela una estrategia para evadir la respuesta inmune adaptativa y modificar la inmunidad celular autónoma: • La señalización DC-SIGN yTLR5 converge a nivel NF-kB para modular la respuesta de citoquinas. • P. salmonis modula la respuesta inmune humoral y mediada por células. • P. salmonis induce una significativa reorganización del citoesqueleto. • P. salmonis promueve la sobrevivencia y proliferación celular y disminuye la apoptosis. Además en todas las líneas de investigación se han generado publicaciones científicas relevantes. En resumen, de un número inicial de 61 preguntas claves para SRS y Caligus, un total de 23 preguntas han sido, total o parcialmente, identificadas con respuestas obtenidas a partir de este proyecto. Esto significa que aún existe un 62% de vacíos que requieren de investigaciones aplicadas, y que esperamos sean resueltas con los proyectos recientemente adjudicados.

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Boletín nº2

Noticias 1ª reunión de difusión para las empresas socias del Proyecto FIE «Programa para la gestión sanitaria en la Acuicultura» organizado por INTESAL.

El Jueves 30 de Noviembre se llevó a cabo la primera reunión de difusión del proyecto FIE para las empresas socias. En esa instancia se presentaron y discutieron los principales resultados del proyecto, así como también las líneas que están en proceso de adjudicación. Esta reunión contó con la presencia de los investigadores a cargo de las principales líneas del proyecto, representantes de las empresas socias del proyecto, Sernapesca y Subpesca.

Taller sobre Ceparios Oficiales del Proyecto FIE «Programa para la gestión sanitaria en la Acuicultura».

El martes 19 de diciembre se llevó a cabo el Taller sobre Ceparios Oficiales, que tuvo

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como objetivo conocer y discutir sobre los avances en la constitución de los Ceparios Oficiales de P. salmonis y de C. rogercresseyi establecidos en el marco del Programa para la gestión sanitaria de la Acuicultura ejecutado por el Sernapesca. Uno de los principales focos de la discusión fue el diseño de un modelo de sustentabilidad a largo plazo de los Ceparios.

1ª reunión de difusión del Proyecto FIE «Programa para la gestión sanitaria en la Acuicultura» organizado por Sernapesca.

El Miércoles 21 de Diciembre se realizó la primera reunión de difusión de resultados del Proyecto FIE para público en general. Esta fue una excelente instancia para conocer los resultados del proyecto, así como las nuevas líneas financiadas por aportes públicos y privados.


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Estatus de los mandatos y pagos de los socios del Proyecto.

De las 26 empresas participantes en el Proyecto, 16 ya han enviado a Intesal el mandato para acogerse a la Ley de Incentivo Tributario. Por otro lado, 11 han realizado los pagos correspondiente al año 2017. Del aporte de la industria para el año 2017 (M$ 1 132 000), aún falta por ingresar el 28% de lo comprometido.

Pagado

Por pagar

28% MM$316

72% MM$815

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Principales resultados 2016-2017

Línea de Farmacología (Inv. Prin.: Betty San Martín, Laboratorio de Farmacología Veterinaria, Universidad de Chile, www.farmaco. veterinaria.uchile.cl. bsmartin@udechile.cl)

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Principales resultados 2016-2017

Línea de Farmacología Evaluación de la potencia microbiológica de las pre-mezclas de alimento con florfenicol y oxitetraciclina utilizadas en el tratamiento de Piscirickettsiosis.

Se evaluó la potencia microbiológica de 20 premezclas de antibióticos (6 de oxitetraciclina y 14 de florfenicol) frente a Piscirickettsia salmonis.

Evaluación del porcentaje de pureza de florfenicol y oxitetraciclina declarado en las pre- mezclas de alimento utilizadas en el tratamiento de Piscirickettsiosis.

Evaluación de la estabilidad de florfenicol y oxitetraciclina en los alimentos medicados.

Los estudios de estabilidad se utilizan para evaluar cómo la calidad de un medicamento varía con el tiempo por la influencia de diferentes factores ambientes, por ejemplo, temperatura, luz y humedad. En este estudio se evaluó la estabilidad de diferentes alimentos medicados con florfenicol y oxitetraciclina mediante el método de estabilidad acelerada.

Se evaluaron 20 premezclas de florfenicol y 8 de oxitetraciclina para medir la pureza, referida al porcentaje efectivo del principio activo puro en la masa total de antibióticos.

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Boletín nº2 Determinación de la concentración mínima inhibitoria (CMI) clínica de aislados de Piscirickettsia salmonis frente a oxitetraciclina y florfenicol.

Se llevaron a cabo estudios PK/PD (modelos farmacocinéticos/ farmacodinámicos) para definir las dosis más adecuadas de oxitetraciclina y florfenicol frente a Piscirickettsia salmonis . Para estos estudios previamente se estimó la Concentración Mínima Inhibitoria (CMI) clínica de esta bacteria frente a los antibióticos señalados. Impacto: Mejoramiento del proceso de fabricación de alimento medicado. Definir la vida útil post-venta de los piensos medicados, en relación a las condiciones de almacenamiento. Mejoramiento de regímenes de dosificación, minimizar la selección y la diseminación de bacterias resistentes.

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Principales resultados 2016-2017

Línea Respuesta del Hospedador (Inv. Prin.: Ricardo Enríquez, Laboratorio de Biotecnología y Patología Acuática, Universidad Austral de Chile, www. uach.cl. renrique@uach.cl)

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Principales resultados 2016-2017

Línea Respuesta del Hospedador Describir y cuantificar parámetros de respuesta inmune en salmón Atlántico desafiado por cohabitación con los aislados LF-89 y EM-90 de Piscirickettsia salmonis.

Se estudió y comparó la expresión de genes (e.g. interferón gamma, factor de necrosis tumoral alfa, interleuquina 1 beta, 8 , 10, 12 beta, 15, y 18, complejo histocompatibilidad clase 2, entre otros) relacionados a las etapas tempranas y tardías de la infección con Piscirickettsia salmonis, utilizando post-smolts de salmón Atlántico enfrentados por cohabitación a las cepas LF-89 y EM-90.

Perfil transcriptómico de la respuesta inmune en salmón del Atlántico desafiados con los aislados LF-89 y EM-90 de P. salmonis mediante RNA-Seq

Se describió comparativamente el perfil transcripcional de la respuesta en riñón de post-smolt de salmón del Atlántico infectados con las cepas LF-89 y EM90 de Piscirickettsia salmonis mediante secuenciación RNA-Seq.

Establecimiento de parámetros de respuesta inmune en salmón del Atlántico y Trucha arcoíris desafiados con Caligus rogercresseyi.

Se estableció el efecto de la infestación por Caligus rogercresseyi sobre los niveles de expresión transcripcional de marcadores de respuesta inmune en salmón del

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Boletín nº 2 Atlántico (Salmo salar) y trucha arcoíris (Oncorhynchus mykiss) en condiciones experimentales.

en peces sobrevivientes de los desafíos por cohabitación con Piscirickettsia salmonis y Renibacterium salmoninarum.

Perfiles de respuesta inmune y de estrés a nivel transcriptómico en peces desafiados con R. salmoninarum.

Impacto: Se ha generado conocimiento fundamental para comprender el mecanismo de acción de la bacteria sobre el hospedador, lo que potencialmente permitirá la creación de vacunas, alternativas terapéuticas y moduladoras del sistema inmune, entre otras aplicaciones.

Se describieron los perfiles de la respuesta inmune y de estrés a nivel transcriptómico en peces desafiados con Renibacterium salmoninarum.

Perfiles de respuesta inmune a nivel transcriptómico que abarca la inmunidad innata y adquirida, asociados a la sobrevivencia de S. salar a la infección con P. salmonis y R. salmoninarum.

Se describieron los perfiles de la respuesta inmune y de estrés a nivel transcriptómico

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Principales resultados 2016-2017

Línea Piscirickettsiosis (Inv. Prin.: Sergio Marshall, Laboratorio de Genética e Inmunología Molecular , Pontificia Universidad Católica de Chile, www. pucv.cl. sergio.marshall@pucv.cl)

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Principales resultados 2016-2017

Línea Piscirickettsiosis Desarrollo de un manual operativo para cultivar Piscirickettsia salmonis en laboratorio.

Se desarrolló un manual operativo y estandarizado, que se publicó en una versión preliminar, que incluye los procedimientos para el muestreo, aislamiento, crecimiento y mantención de P. salmonis en laboratorio.

Caracterización de aislados de Piscirickettsia salmonis mediante secuenciación masiva, análisis bioinformáticos y filogenéticos.

Se caracterizaron 35 aislados mediante la secuenciación de los marcadores 16S e ITS, con los cuales se generó el análisis filogenético de las variantes secuenciadas. Actualmente se cuenta con 20 genomas cerrados, y el resto en proceso.

Rol de la salinidad del agua en la viabilidad y virulencia de P. salmonis.

Se realizaron desafíos por cohabitación en Salmo salar a dos salinidades y utilizando dos aislados de P. salmonis, evaluándose la mortalidad acumulada al final del ensayo. Además se evaluaron algunos marcadores de respuesta inmune innata.

Screening de potenciales vectores biológicos, mecánicos o huéspedes intermediarios.

Se evaluaron potenciales vectores de P. salmonis a través de los marcadores moleculares 16S, ITS y 18S. Se realizó además análisis metagenómicos con el gen 18S para evaluar la diversidad de eucariotas unicelulares asociados a los centros de cultivo y que pudieran actuar como reservorios de la bacteria.

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Boletín nº2 Evidencia fisiológica que P. salmonis produce sideróforos y utiliza fierro de diferentes fuentes.

Se evaluó el crecimiento de P. salmonis y la producción de sideróforos en condiciones de limitación de fierro. Existen evidencias que los distintos aislados producen distintas concentraciones de sideróforos.

Impacto: Consolidación del cepario oficial de P. salmonis que permitirá realizar ciencia fundamental y aplicada en Piscirickettsiosis. Generación de conocimiento básico para comprender la patogenia y epidemiología de la Piscirickettsiosis.

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Propuestas a financiar aporte privado CALIGUSLIFE: INVESTIGACIÓN CIENTÍFICA DE EXCELENCIA PARA LA COMPRENSIÓN DE LA BIOLOGÍA DE CALIGUS ROGERCRESSEYI Y SU APLICACIÓN EN ESTRATEGIAS DE CONTROL DE LA CALIGIDOSIS EN LA INDUSTRIA DEL SALMÓN.

Monto Proyecto: $ 795 818 000 Plazo ejecución: 18 meses Principales Objetivos: 1. Establecer los parámetros poblacionales y rasgos de historia de vida C. rogercresseyi bajo distintas condiciones de temperatura, salinidad y origen biogeográfico, así como el rol de los reservorios ícticos circundantes a los centros de cultivo. 2. Comprender los patrones de dinámica poblacional de C. rogercresseyi en las Regiones X y XI mediante modelamiento epidemiológico - matemático que permita predecir cargas parasitarias en el tiempo y evaluar estrategias de prevención y control de la Caligidosis. 3. Decodificar el pangenoma de C. rogercresseyi mediante tecnologías y análisis bioinformáticas. 4. Evidenciar las bases moleculares e identificar biomarcadores de la resistencia farmacológica de C. rogercresseyi frente a los principales antiparasitarios utilizados en la industria del salmón, así como la exploración de nuevos blancos terapéuticos y factores de virulencia.

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EPIDEMIOLOGÍA DE SRS Y CÁLIGUS: UNA APROXIMACIÓN EPIDEMIOLÓGICA INTEGRADA PARA LA DETECCIÓN TEMPRANA Y DIAGNÓSTICO, Y CONTROL DE LA TRANSMISIÓN DE PISCIRICKETTSIA SALMONIS Y MANEJO DE CÁLIGUS EN CULTIVO DE SALMÓN DEL ATLÁNTICO EN CHILE.

Monto Proyecto: $ 737 000 000 Plazo ejecución: 18 meses Principales Objetivos: 1. Caracterizar el desarrollo temprano de SRS en condiciones de campo y la relación con signos clínicos inespecíficos y cambios de comportamiento de los peces. 2. Estimar la sensibilidad, especificidad y valores predictivos de las pruebas comerciales utilizadas para el diagnóstico de la infección por P. salmonis. 3. Desarrollar un modelo epidemiológico para simular la transmisión de P. salmonis dentro de un centro de cultivo. 4. Estimar la relación entre la presión de infección de P. salmonis entre centros de cultivo bajo distintas condiciones oceanográficas y distancias marítimas entre centros vecinos. 5. Estudiar la interacción entre cargas de Caligus y la infección por P. salmonis dentro y entre centros de cultivos, además de establecer umbrales de abundancia basados en criterios sanitarios. 6. Implementar resultados en un kit de herramientas epidemiológicas online para el apoyo en la toma de decisiones sanitarias.

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Propuestas a financiar aporte público PROYECTO

INSTITUCIÓN PRINCIPAL

MONTO ($)

PLAZO EJECUCIÓN

Identificación, ponderación y validación en terreno de factores predictivos para el éxito de tratamientos antiparasitarios por inmersión por medio de un panel de expertos.

UDEC-INCAR

114.985.000

14 meses

Integrated epidemiological studies on Salmon Rickettsial Syndrome and Caligus.

AUSVET

924.771.404

13 meses

Efectos de la calidad, robustez y bienestar de smolts en la resistencia a Piscirickettsia salmonis.

AVS

149.000.000

12 meses

Estatus inmune de Salmo salar en condiciones de campo y su relación con la infección por P. salmonis: Bases para la incorporación de péptidos inmunomoduladores en dieta como nuevos medicamentos contra el patógeno y el SRS.

PUCV

884.924.000

13 meses

Optimización de los esquemas terapéuticos de oxitetraciclina y florfenicol administrados a través de los alimentos en los centros de cultivo de salmones en la etapa final del ciclo productivo en mar.

FARMAVET-UChile

450.000.000

12 meses

Modulación de la inmunidad nutricional como estrategia de resistencia de salmones a la infección con Piscirickettsia salmonis.

INTA-UChile

239.390.000

15 meses

Continuidad del cepario de Piscirickettsia salmonis.

PUCV

296.496.000

13 meses

Continuidad del cepario de C. rogercresseyi.

INCAR-UDEC

298.570.000

13 meses

Determinación de indicadores de mortalidad y uso de antibióticos.

EPIVET-UNTEC

90.000.000

13 meses

Mesa consultiva Proyecto FIE.

ACUAIM

70.000.000

13 meses

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empresas asociadas al proyecto

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Escríbenos a fie@intesal.cl

fie.intesal.cl

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