Haiglalabori kogemus

Haiglalabori kogemus: koroonakriisiga on võimalik toime tulla

Koroonaepideemia algusest on Regionaalhaigla labor teinud molekulaarseid uuringuid koroonaviirushaiguse tuvastamiseks. Neil kuudel oli haiglalabori üks suurimaid proovikivisid, kuidas saavutada võimalikult lühike ooteaeg tulemust ootavate raskete patsientide jaoks. Uuringute arvu suurendamisest keerukamaks osutus probleem saavutada lühem aeg proovivõtust vastuseni.

D r M a r g e K ü t t

Küsis: Krista Kiin

Fotod: Regionaalhaigla

Koroonaviiruse laboridiagnostika võimalustest ja perspektiividest räägib Regionaalhaigla labori juhataja dr Marge Kütt.

Kuidas COVID-19 diagnoositakse? Haigustekitaja diagnoosimise kuldne standard on SARS-CoV-2 RNA määramine reaalaja pöördtrans kriptaas-polümeraasahelreaktsiooni teel (rRT-PCR). Tegemist on RNA viirusega, sihtmärkgeenideks on eri testides E, N, S ja RdRP geenid. Soovitatavalt testitakse vähemalt kahe sihtmärkgeeni suhtes. Regionaalhaigla laboris kasutatav test määrab E,N ja RdRP geene. Materjal võetakse eelistatult ninaneelust või kurgust. See meetod võimaldab tuvastada viiruse olemasolu patsiendil ja annab tunnistust nakkusohtlikkusest.

Kui palju tehti Regionaalhaigla laboris koroonaviirus haiguse uuringuid eriolukorra ajal? Tegime üle 7500 SARS-CoV-2 RNA uuringu, neist 1,2% olid positiivsed. Uuritavate hulgas oli nii sümp tomaatilisi patsiente erakorralise meditsiini osakonnast ja kiirabi poolt kodus võetud proove, aga ka kliiniliste nähtudeta inimesi.

Kui kiiresti saab laborist SARS-Co-V-2 vastuse? Test on aeganõudev, algab RNA eraldusprotsessiga ja enamik selliseid teste võtavad aega 4–6 tundi.

Kas perspektiivis on seda aega võimalik lühendada? Tegemist ei ole elupäästva uuringu, vaid nakkushaiguse tekitaja kindlaksmääramiseks mõeldud uuringuga, seega ei pea test olema kiirelt teostatav. Kuna testi tulemus määrab aga patsiendi isolatsioonivajaduse ja edasise käsit luse haiglas, on surve kiiremateks tulemusteks suur.

Olemas on ka molekulaarseid teste, mis võtavad aega alla tunni ja teevad erakorraliste haigete käsit luse haiglas palju sujuvamaks. Probleemiks on nende testide kõrgem hind ja praegusel ajal ka nende piira tud tarned, mis sunnivad meid haiglas kokku leppima kindlad reeglid, millistel patsientidel on õigustatud ja vajalik selle testi kasutus.

Kas PCR-meetodiga võib ka valepositiivset ja -nega tiivset tulemust ette tulla? Jah, võib küll. Kõik laborimeetodid võivad eksida, ka molekulaarsed meetodid.

Valepositiivsete testide põhjuseks võib olla proo vimaterjalide või labori tööpindade saastatus määratava tekitajaga. See on keeruline olukord, kuid professionaalsed laborid suudavad selle vea avastada ja vastavalt reageerida. Kui materjal on saastunud juba proovivõtul, siis kahjuks laboris seda avastada pole võimalik.

Valenegatiivsetel tulemustel on põhjus enamasti proovivõtus – kas materjali on võetud liiga pindmi selt, seda on säilitatud valedes tingimustes või liiga kaua enne analüüsimist, samuti kui proov on võe tud liiga vara või juba haiguse hilisjärgus. Hilisjärgus soovitatakse ülemistest hingamisteedest kogutud materjalile lisaks uurida ka materjali alumistest hinga misteedest (röga, bronhi aspiraat või bronhiloputusvedelik). Kui viirus muteerub, tekib samuti olukord, kus mitte kõik PCR-meetodid ei ole seda võimelised enam määrama.

Kui usaldusväärsed on kiirtestid ning kas on plaanis nende rohkemat kasutamist? Kiirteste on kahte liiki: antigeeni määravad kiirtes tid ja antikeha määravad kiirtestid. Antigeeni määravad kiirtestid ei asenda PCR-meetodeid, need tuleks viimastega üle kontrollida. Seega neil puudub otsene kliiniline näidustus, kuna üksi ei ole nad diagnostili sed.

Antikehade kiirteste on hetkel turul üle saja ja neid tuleb järjest juurde. Probleem on neis aga selles, et kii resti välja töötatud testid ei ole standardiseeritud, sageli ei ole võimalik tuvastada, millise valgu vastast IgG- või IgM-test määrab. Sellega kaasneb asjaolu, et eri kiirtes tidega võib samal patsiendil samal ajal samast materjalist saada erinevaid tulemusi. Ka tuleb arvestada, et hetkel pakutavatest testidest ei vasta ükski kodus kasutamise nõuetele. Tootja märge, et tegemist on „professionaalse testiga“ või „mõeldud professionaalseks kasutamiseks“, tähendab sisuliselt seda, et testi võib teha vaid pädev meditsiiniasutus ning test pole lubatud laiale elanikkon nale koduseks kasutamiseks.

Keerukas koht on seegi, mida antikehade olemas olu või puudumise alusel otsustada. Praeguseni puuduvad tõenduspõhised andmed immuunsuse tekkimise ning selle püsimise aja kohta.

Seega ei näe nende testide kasutamiseks kliinilist põhjendust ja haiglas ei ole neil kindlasti kohta. Ka äsja avaldatud Euroopa Komisjoni teatis 2020/C 122 1/01 „Suunis COVID-19 in vitro diagnostika seadmete ja nende toimivuse kohta“ ei soovita kiirteste ning märgib, et seadusega on keelatud teha kutsealaseks kasutamiseks ette nähtud seadmed tavakasutajatele kättesaadavaks näiteks apteekida ja interneti kaudu.

Mida tasuks veel märkida koroonaviirushaiguse testi mise või diagnoositud patsientide suhtes? Kirjanduses on viiteid asümptomaatiliste nakatu nute kohta, seetõttu on toimunud ka asümptomaati

Molekulaardiagnostika bioanalüütikute tiim.

liste töötajate testimine koostöös Terviseametiga ning kõiki plaaniliselt hospitaliseeritavaid patsiente on kontrollitud SARS-CoV-2 RNA esinemise suhtes. Meie ei ole laborile teadaolevalt asümptomaatilist positiiv set juhtu tuvastanud.

Mis on tööplaanis eesseisva sügise ja oletatava uue koroonalaine ootuses? Kas ja milliseid muutusi selleks ajaks labori töös võib oodata? Regionaalhaigla labor on suurendanud seadmeparki, et vajaduse korral testida rohkem ja paindlikumalt. Oleme valmis muutma töökorraldust vastavalt tekki vale vajadusele. Meil on kogemus, kuidas tulla toime katkevate tarneahelate ja ebakindla varustatuse kor ral. Kindlasti oleme rohkem valmis reageerima kiiresti muutuvatele vajadustele. Oleme epideemia jooksul aidanud ka teistel SARS-CoV-2 RNA testimisega tege levatel laboritel lahendada keerukaid patsiendijuhtumeid ja tuua selgust kontaminatsioonikahtlastesse olukordadesse. Tänaseks on meil läbiproovitud meeskond, mis on selle keeruka aja kõige olulisem tulemus. Kui on olemas inimesed, kelle professionaalsust võid usaldada ja kes on valmis panustama olukorra lahendusse mak simaalselt, siis on kriisiga võimalik toime tulla.